Exoribonukleáza - Exoribonuclease

An exoribonukleáza je exonukleáza ribonukleáza, což jsou enzymy, které se degradují RNA odstraněním terminálu nukleotidy buď z 5 'konec nebo 3 'konec molekuly RNA. Enzymy, které odstraňují nukleotidy z 5 'konce, se nazývají 5'-3 'exoribonukleázya nazývají se enzymy, které odstraňují nukleotidy z 3 'konce 3'-5 'exoribonukleázy.
Exoribonukleázy mohou ke štěpení vazby nukleotidů a nukleotidů (které se říká hydrolytická aktivita) používat buď vodu, nebo anorganický fosfát (která se nazývá fosforolytická aktivita). Hydrolytické exoribonukleázy jsou klasifikovány pod EC číslo 3.1 a fosforolytické exoribonukleázy pod číslem ES 2.7.7. Protože fosforolytické enzymy používají k štěpení vazeb anorganický fosfát, uvolňují se nukleotid difosfáty, zatímco hydrolytické enzymy (které používají vodu) se uvolňují nukleotidmonofosfáty.
Exoribonukleázy existují ve všech královstvích života bakterie, archaea, a eukaryoty. Exoribonukleázy se podílejí na degradaci mnoha různých druhů RNA, včetně messenger RNA, přenos RNA, ribozomální RNA a miRNA. Exoribonukleázy mohou být jednotlivé proteiny (např RNáza D nebo RNáza PH ), ale také to mohou být komplexy více proteinů, jako je exosomový komplex (ve kterém jsou zastoupeny čtyři hlavní rodiny exoribonukleáz).
Hlavní rodiny
Rodina | Příklad členů | Rozdělení | Katalytická aktivita |
---|---|---|---|
RNR | RNase R. | Většina bakterií, všechny eukaryoty | 3'-5 'hydrolytický |
RNáza II | |||
Rrp44 | |||
DEDD | RNáza D | Určité bakterie, všechny eukaryoty | 3'-5 'hydrolytický |
RNase T | |||
PM / Scl-100 | |||
Oligoribonukleáza | |||
RBN | RNase BN | Určité bakterie | 3'-5 'hydrolytický |
PDX | PNPase | Všechna království | 3'-5 'fosforolytický |
PM / Scl-75 | |||
RNáza PH | |||
RRP4 | Rrp4 | Všechna eukaryota, nejvíce archaea | 3'-5 'hydrolytický |
5PX | Exoribonukleáza I | Všechny eukaryoty | 5'-3 'hydrolytický |
Exoribonukleáza II |
Viz také
Reference
- Zuo Y; Deutscher MP. (2001). „Superrodiny exoribonukleázy: strukturní analýza a fylogenetická distribuce“. Nucleic Acids Res. 29 (5): 1017–26. doi:10.1093 / nar / 29.5.1017. PMC 56904. PMID 11222749.
externí odkazy
- Exoribonukleázy v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)