Polynukleotid adenylyltransferáza - Polynucleotide adenylyltransferase
| polynukleotid adenylyltransferáza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 2.7.7.19 | ||||||||
| Číslo CAS | 9026-30-6 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
v enzymologie, a polynukleotid adenylyltransferáza (ES 2.7.7.19 ) je enzym že katalyzuje the chemická reakce
- ATP + RNA-3'OH pyrofosfát + RNApA-3'OH
Tedy dva substráty tohoto enzymu jsou ATP a RNA, zatímco jeho dva produkty jsou pyrofosfát a RNA s extra adenosin nukleotid na jeho 3 'konci.
Pojmenování
Tento enzym patří do rodiny transferázy, konkrétně ty, které přenášejí fosfor obsahující nukleotid skupiny (nukleotidyltransferázy ). The systematické jméno této třídy enzymů je ATP: polynukleotid adenylyltransferáza.
Mezi další běžně používaná jména patří:
- NTP polymeráza
- RNA adenylační enzym
- AMP polynukleotidylexotransferáza
- ATP-polynukleotid adenylyltransferáza
- ATP: polynukleotidylexotransferáza
- Poly (A) polymeráza
- Poly (A) syntetáza
- Polyadenylátová nukleotidyltransferáza
- Polyadenylát polymeráza
- Polyadenylát syntetáza
- Polymeráza kyseliny polyadenylové
- Polyadenylová polymeráza
- Terminální riboadenylát transferáza
- Poly (A) hydroláza
- Faktory tvorby RNA
- PF1
- Adenosintrifosfát: adenylyltransferáza ribonukleové kyseliny
Funkce
Tento enzym je zodpovědný za přidání 3' polyadeninový ocas na nově syntetizovaný pre-messenger RNA (pre-mRNA) molekula během procesu genová transkripce. Protein je konečným přírůstkem k velkému proteinový komplex který také obsahuje menší sestavy známé jako faktor štěpení a polyadenylační specificity (CPSF) a stimulační faktor štěpení (CtSF) a jeho vazba je nezbytným předpokladem pro štěpení 3 'konce pre-mRNA. Po odštěpení 3 'signalizační oblasti, která řídí sestavení komplexu, přidává polyadenylát polymeráza (PAP) polyadeninový konec na nový 3' konec.
Rychlost přidávání PAP adenin nukleotidy je závislá na přítomnosti jiného regulačního proteinu, PABPII (protein vázající polyadenin II). Prvních několik nukleotidů přidaných PAP se přidává velmi pomalu, ale krátký ocas polyadeninu je poté vázán PABPII, což urychluje rychlost přidávání adeninu PAP. Konečný ocas je dlouhý asi 200-250 adeninových nukleotidů.
PAP je fosforylovaný podle faktor podporující mitózu, klíčový regulátor buněčný cyklus. Vysoké hladiny fosforylace snižují aktivitu PAP.
Strukturální studie
Ke konci roku 2007, 27 struktur byly pro tuto třídu enzymů vyřešeny pomocí PDB přístupové kódy 1AV6, 1B42, 1BKY, 1EAM, 1EQA, 1F5A, 1FA0, 1JSZ, 1JTE, 1JTF, 1P39, 1Q78, 1Q79, 1V39, 1VFG, 1VP3, 1VP9, 1VPT, 2GA9, 2GAF, 2HHP, 2O1P, 2Q66, 2VP3, 3MAG, 3MCT, a 4DCG.
Reference
- August JT, Ortiz PJ, Hurwitz J (prosinec 1962). „Inkorporace ribonukleotidů závislých na ribonukleové kyselině. I. Čištění a vlastnosti enzymu“. J. Biol. Chem. 237: 3786–93. PMID 13965521.
- Edmonds M, Abrams R (1960). „Polynukleotidová biosyntéza: tvorba sekvence adenylátových jednotek z adenosintrifosfátu enzymem z jader brzlíku“. J. Biol. Chem. 235 (4): 1142–1149.
- Gottesman ME, Canellakis ES (1966). "Terminální nukleotidyltransferázy jader telecího brzlíku". J. Biol. Chem. 241 (19): 4339–52. PMID 4288534.
- Krakow Js; Coutsogeorgopoulos C; Canellakis ES (1962). "Studie o začlenění deoxyribonukleové kyseliny". Biochim. Biophys. Acta. 55 (5): 639–50. doi:10.1016/0006-3002(62)90842-9. PMID 14459258.
- Mans RJ, Walter TJ (1971). „Přeneste syntézu oligoadenylátu aktivovanou RNA u sazenic kukuřice. II Specifičnost primeru, substrátu a kovu a velikost produktu“. Biochim. Biophys. Acta. 247 (1): 113–21. doi:10.1016/0005-2787(71)90814-8. PMID 4946277.
- Sheldon R, Jurale C, Kates J (1972). "Detekce sekvencí kyseliny polyadenylové ve virové a eukaryotické RNA (polu (U) -celulózové kolony-poly (U) filtry-skleněné vlákno-buňky HeLa-bakteriofág T4)". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 69 (2): 417–21. doi:10.1073 / pnas.69.2.417. PMC 426470. PMID 4501121.
- Colgan DF, Murthy KG, Prives C, Manley JL (listopad 1996). "Regulace poly (A) polymerázy pomocí buněčného cyklu fosforylací". Příroda. 384 (6606): 282–5. Bibcode:1996 Natur.384..282C. doi:10.1038 / 384282a0. PMID 8918882. S2CID 4304275.
