Shikimate kináza - Shikimate kinase
| Shikimate kináza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Shikimate kináza z Erwinia chrysanthemi | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | LYŽE | ||||||||
| Pfam | PF01202 | ||||||||
| Pfam klan | CL0023 | ||||||||
| InterPro | IPR000623 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00868 | ||||||||
| SCOP2 | 2shk / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| OPM nadčeleď | 124 | ||||||||
| OPM protein | 1e6c | ||||||||
| |||||||||
| shikimate kináza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Kreslené znázornění shikimate kinázy z Mycobacterium tuberculosis. α-Helices jsou zobrazeny červeně, centrální β-list žlutě a smyčky zeleně | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 2.7.1.71 | ||||||||
| Číslo CAS | 9031-51-0 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Shikimate kináza (ES 2.7.1.71 ) je enzym, který katalyzuje ATP -závislý fosforylace z shikimate za vzniku shikimate 3-fosfátu.[1] Tato reakce je pátým krokem shikimate dráhy,[2] který je používán rostlinami a bakteriemi k syntéze běžného prekurzoru aromatických aminokyselin a sekundárních metabolitů. The systematické jméno této třídy enzymů je ATP: shikimate 3-fosfotransferáza. Mezi další běžně používaná jména patří shikimate kináza (fosforylace), a shikimate kináza II.
Pozadí
Cesta shikimate se skládá ze sedmi enzymatických reakcí fosfoenolpyruvát a erythrose 4-fosfát jsou převedeny na chorismát, běžný prekurzor aromatických aminokyselin fenylalanin, tyrosin, a tryptofan. Aromatické aminokyseliny se používají při syntéze bílkovin a v rostlinách, houbách a bakteriích vedou k řadě dalších specializovaných metabolitů, jako jsou fenylpropanoidy a alkaloidy. Chorismát a několik dalších meziproduktů dráhy slouží jako prekurzory řady dalších metabolitů, jako jsou foláty, chináty a chinony. Čtyři enzymy, které předcházejí shikimate kinase v cestě, jsou DAHP syntáza, 3-dehydrochinát syntáza, 3-dehydrochinát dehydratáza, a shikimát dehydrogenáza a dva, kteří jej následují, jsou EPSP syntáza a chorismát syntáza. U hub a protistů je součástí AROM komplex, ve kterém je pět centrálních kroků shikimate dráhy společně lokalizováno.[3] Cesta se nenachází u lidí a jiných zvířat, která musí získávat aromatické aminokyseliny z potravy.
Aktivita
Reakce katalyzovaná shikimate kinázou je uvedena níže:
Tato reakce zahrnuje přenos fosfátové skupiny z ATP na 3-hydroxylovou skupinu shikimátu. Shikimate kináza má tedy dva substráty, shikimate a ATP a dva produkty, shikimate 3-fosfát a ADP.[4]
Příklady
Lidské proteiny obsahující tuto doménu zahrnují: MAPK7 a THNSL1
Reference
- ^ Morell H, Sprinson DB (únor 1968). "Shikimate kinase isoenzymes in Salmonella typhimurium". The Journal of Biological Chemistry. 243 (3): 676–7. PMID 4866525.
- ^ Herrmann KM, Weaver LM (červen 1999). "The Shikimate Pathway". Roční přehled fyziologie rostlin a molekulární biologie rostlin. 50: 473–503. doi:10.1146 / annurev.arplant.50.1.473. PMID 15012217.
- ^ Arora Verasztó H, Logotheti M, Albrecht R, Leitner A, Zhu H, Hartmann MD (červenec 2020). "Architektura a funkční dynamika pentafunkčního komplexu AROM". Přírodní chemická biologie. 16 (9): 973–978. doi:10.1038 / s41589-020-0587-9. PMID 32632294. S2CID 220375879.
- ^ Hartmann MD, Bourenkov GP, Oberschall A, Strizhov N, Bartunik HD (prosinec 2006). "Mechanismus přenosu fosforylu katalyzovaný shikimate kinázou z Mycobacterium tuberculosis". Journal of Molecular Biology. 364 (3): 411–23. doi:10.1016 / j.jmb.2006.09.001. PMID 17020768.
