REV3L - REV3L

REV3L
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3ABD, 3ABE, 3VU7, 4EXT, 4GK0, 4GK5
Identifikátory
Aliasy	REV3L„POLZ, REV3, REV3 podobné, DNA řízená polymerázová zeta katalytická podjednotka
Externí ID	OMIM: 602776 MGI: 1337131 HomoloGene: 48147 Genové karty: REV3L
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	111,483,715 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	39,875,211 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • Vazba DNA; • 4 vazby železa, 4 síry; • aktivita nukleotidyltransferázy; • vazba klastru železo-síra; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Aktivita DNA řízené DNA polymerázy; • Aktivita 3'-5 'exonukleázy;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • jádro; • buněčné jádro; • komplex zeta DNA polymerázy;
Biologický proces	• Replikace DNA závislá na DNA; • syntéza překladu náchylná k chybám; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • replikace DNA; • Oprava DNA; • syntéza překladů; • hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5980
	19714
	ENSG00000009413
	ENSMUSG00000019841
	O60673
	Q61493
	NM_001286431; NM_001286432; NM_002912; NM_001372078
	NM_011264
	NP_001273360; NP_001273361; NP_002903; NP_001359007
	NP_035394
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein bez reverze 3-like (REV3L) také známý jako DNA polymeráza zeta katalytická podjednotka (POLZ) je enzym že u lidí je kódován REV3L gen.^[5]^[6]^[7]

Podjednotka Rev3 interaguje s Rev7 a tvoří Pol ζ, a Polymeráza rodiny B.. Pol ζ chybí 3 'až 5' exonukleáza činnost a je umírněný věrnost polymeráza. Nemůže přidávat nukleotidy napříč lézemi DNA, přesto se může rozšířit od primerů s terminálními neshodami. Díky tomu je Pol in velmi důležitý syntéza překladů (TLS), protože může působit ve shodě s jinými TLS polymerázami, které se mohou přidat přes lézi a dokončit bypass léze. Většina polymeráz má potíže s rozšiřováním neshod, protože se nemohou správně vázat na neshodující DNA. Místo umírání buněk tedy může přežít, i když s mutací, která může nebo nemusí být škodlivá, a proto se věří, že Pol ζ je hybnou silou evoluce.^{[Citace je zapotřebí ]}

Interakce

Bylo prokázáno, že REV3L komunikovat s MAD2L2.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000009413 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019841 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gibbs PE, McGregor WG, Maher VM, Nisson P, Lawrence CW (červenec 1998). „Lidský homolog genu Saccharomyces cerevisiae REV3, který kóduje katalytickou podjednotku DNA polymerázy zeta“. Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (12): 6876–80. doi:10.1073 / pnas.95.12.6876. PMC 22668. PMID 9618506.
^ Morelli C, Mungall AJ, Negrini M, Barbanti-Brodano G, Croce CM (březen 1999). "Alternativní sestřih, genomová struktura a jemná chromozomová lokalizace REV3L". Cytogenet Cell Genet. 83 (1–2): 18–20. doi:10.1159/000015157. PMID 9925914. S2CID 45239336.
^ "Entrez Gene: REV3L REV3-like, katalytická podjednotka DNA polymerázy zeta (kvasinky)".
^ Murakumo Y, Roth T, Ishii H, Rasio D, Numata S, Croce CM, Fishel R (únor 2000). „Lidský homolog REV7, který interaguje s katalytickou podjednotkou hREV3 polymerázy zeta a proteinem hMAD2 kontrolního bodu sestavy vřetena“. J. Biol. Chem. 275 (6): 4391–7. doi:10.1074 / jbc.275.6.4391. PMID 10660610.
^ Murakumo Y, Ogura Y, Ishii H, Numata S, Ichihara M, Croce CM, Fishel R, Takahashi M (září 2001). „Interakce s proteiny hREV1, hREV3 a hREV7 náchylné k chybám po replikaci“. J. Biol. Chem. 276 (38): 35644–51. doi:10,1074 / jbc.M102051200. PMID 11485998.

Další čtení

Xiao W, Lechler T, Chow BL a kol. (1998). "Identifikace, chromozomální mapování a tkáňově specifická exprese hREV3 kódující domnělou lidskou DNA polymerázu zeta". Karcinogeneze. 19 (5): 945–9. doi:10.1093 / carcin / 19.5.945. PMID 9635887.
Lin W, Wu X, Wang Z (1999). „Předpokládá se, že cDNA plné délky hREV3 kóduje DNA polymerázu zeta pro poškození vyvolané mutagenezí u lidí.“ Mutat. Res. 433 (2): 89–98. doi:10.1016 / s0921-8777 (98) 00065-2. PMID 10102035.
Karayianni E, Magnanini C, Orphanos V, et al. (2000). "Transkripční mapa oblasti chromozomů 6q16 → q21". Cytogenet. Cell Genet. 86 (3–4): 263–6. doi:10.1159/000015356. PMID 10575223. S2CID 39490958.
Murakumo Y, Roth T, Ishii H a kol. (2000). „Lidský homolog REV7, který interaguje s katalytickou podjednotkou hREV3 polymerázy zeta a proteinem hMAD2 kontrolního bodu sestavy vřetena“. J. Biol. Chem. 275 (6): 4391–7. doi:10.1074 / jbc.275.6.4391. PMID 10660610.
Masutani C, Kusumoto R, Iwai S, Hanaoka F (2000). "Mechanismy přesné syntézy transleze lidskou DNA polymerázou eta". EMBO J.. 19 (12): 3100–9. doi:10.1093 / emboj / 19.12.3100. PMC 203367. PMID 10856253.
Kawamura K, O-Wang J, Bahar R a kol. (2001). „Gen náchylný k chybám DNA polymerázy zeta pro katalytickou podjednotku (Rev3) je všudypřítomně exprimován v normálních a maligních lidských tkáních.“ Int. J. Oncol. 18 (1): 97–103. doi:10.3892 / ijo.18.1.97. PMID 11115544.
Murakumo Y, Ogura Y, Ishii H a kol. (2001). „Interakce s proteiny hREV1, hREV3 a hREV7 náchylné k chybám po replikaci“. J. Biol. Chem. 276 (38): 35644–51. doi:10,1074 / jbc.M102051200. PMID 11485998.
Li Z, Zhang H, McManus TP a kol. (2003). „hREV3 je nezbytný pro syntézu náchylnou k chybám náchylnou k poškození DNA v lidských fibroblastech indukovaných UV nebo benzo [a] pyrendiol diopoxidem. Mutat. Res. 510 (1–2): 71–80. doi:10.1016 / S0027-5107 (02) 00253-1. PMID 12459444.
Zhu F, Jin CX, Song T a kol. (2003). "Odpověď lidského genu REV3 na rakovinu žaludku vyvolávající karcinogen N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanidin a jeho role v mutagenezi". Svět J. Gastroenterol. 9 (5): 888–93. doi:10,3748 / wjg.v9.i5.888. PMC 4611392. PMID 12717825.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Ohashi E, Murakumo Y, Kanjo N a kol. (2005). "Interakce hREV1 se třemi lidskými DNA polymerázami z rodiny Y". Geny buňky. 9 (6): 523–31. doi:10.1111 / j.1356-9597.2004.00747.x. PMID 15189446. S2CID 24470762.
Tao WA, Wollscheid B, O'Brien R a kol. (2005). „Kvantitativní analýza fosfoproteomu pomocí dendrimerové konjugační chemie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Nat. Metody. 2 (8): 591–8. doi:10.1038 / nmeth776. PMID 16094384. S2CID 20475874.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000009413 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000019841 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9618506-5] Gibbs PE, McGregor WG, Maher VM, Nisson P, Lawrence CW (červenec 1998). „Lidský homolog genu Saccharomyces cerevisiae REV3, který kóduje katalytickou podjednotku DNA polymerázy zeta“. Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (12): 6876–80. doi:10.1073 / pnas.95.12.6876. PMC 22668. PMID 9618506.

[pmid9925914-6] Morelli C, Mungall AJ, Negrini M, Barbanti-Brodano G, Croce CM (březen 1999). "Alternativní sestřih, genomová struktura a jemná chromozomová lokalizace REV3L". Cytogenet Cell Genet. 83 (1–2): 18–20. doi:10.1159/000015157. PMID 9925914. S2CID 45239336.

[entrez-7] "Entrez Gene: REV3L REV3-like, katalytická podjednotka DNA polymerázy zeta (kvasinky)".

[pmid10660610-8] Murakumo Y, Roth T, Ishii H, Rasio D, Numata S, Croce CM, Fishel R (únor 2000). „Lidský homolog REV7, který interaguje s katalytickou podjednotkou hREV3 polymerázy zeta a proteinem hMAD2 kontrolního bodu sestavy vřetena“. J. Biol. Chem. 275 (6): 4391–7. doi:10.1074 / jbc.275.6.4391. PMID 10660610.

[pmid11485998-9] Murakumo Y, Ogura Y, Ishii H, Numata S, Ichihara M, Croce CM, Fishel R, Takahashi M (září 2001). „Interakce s proteiny hREV1, hREV3 a hREV7 náchylné k chybám po replikaci“. J. Biol. Chem. 276 (38): 35644–51. doi:10,1074 / jbc.M102051200. PMID 11485998.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]