DNA polymeráza epsilon - DNA polymerase epsilon - Wikipedia

DNA řízená DNA polymeráza
Identifikátory
EC číslo2.7.7.7
Číslo CAS9012-90-2
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum

DNA polymeráza epsilon je členem DNA polymeráza rodina enzymů nalezených v eukaryoty. Skládá se z následujících čtyř podjednotek: PÓL (centrální katalytická jednotka), POLE2 (podjednotka 2), POLE3 (podjednotka 3) a POLE4 (podjednotka 4). Nedávné důkazy naznačují, že hraje hlavní roli v přední vlákno Syntéza DNA a nukleotid a oprava základní excize.[1][2]

Výzkum provedl studium nukleotidové excize opravné syntézy DNA DNA polymerázou epsilon v přítomnosti PCNA (proliferující buněčný jaderný antigen), RFC (replikační faktor C) a RPA (replikační protein A). Buď DNA polymeráza epsilon nebo Delta DNA polymerázy spolu s DNA ligáza lze použít k opravě UV poškozené DNA. Bylo však zjištěno, že delta DNA polymerázy vyžaduje pro opravu DNA přítomnost jak RFC, tak PCNA. Kromě toho produkuje pouze malé množství produktů s ligovanou DNA. Ukázalo se, že DNA polymeráza epsilon je nejvhodnější pro opravu nukleotidové excize. DNA polymeráza epsilon je nezávislá na PCNA i RFC a produkuje převážně ligované produkty DNA. Bylo také zjištěno, že za jedné podmínky, kdy DNA polymeráza epsilon vyžaduje PCNA a RFC: oprava excize nukleotidů v přítomnosti jednořetězcového vazebného proteinu RPA. PCNA a RFC fungují jako kotva a přímá DNA polymeráza epsilon na šablonu DNA.[3]

Reference

  1. ^ Johnson RE, Klassen R, Prakash L, Prakash S (červenec 2015). „Hlavní role DNA polymerázy δ v replikaci předních i zaostávajících pramenů DNA“. Molekulární buňka. 59 (2): 163–175. doi:10.1016 / j.molcel.2015.05.038. PMC  4517859. PMID  26145172.
  2. ^ Lujan SA, Williams JS, Kunkel TA (září 2016). „DNA polymerázy rozdělují práci replikace genomu“. Trendy v buněčné biologii. 26 (9): 640–54. doi:10.1016 / j.tcb.2016.04.012. PMC  4993630. PMID  27262731.
  3. ^ Shivji MK, Podust VN, Hübscher U, Wood RD (duben 1995). „Nukleotidová excize opravuje syntézu DNA DNA polymerázou epsilon v přítomnosti PCNA, RFC a RPA“. Biochemie. 34 (15): 5011–7. doi:10.1021 / bi00015a012. PMID  7711023.