PDE4B - PDE4B

PDE4B
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1F0J, 1RO6, 1RO9, 1ROR, 1 TB5, 1XLX, 1XLZ, 1XM4, 1XM6, 1XMU, 1XMY, 1XN0, 1XOS, 1XOT, 1Y2H, 1Y2J, 2CHM, 2QYL, 3D3P, 3FRG, 3G45, 3GWT, 3HC8, 3HDZ, 3HMV, 3KKT, 3LY2, 3O0J, 3O56, 3O57, 3W5E, 3WD9, 4KP6, 4MYQ, 4NW7, 4WZI, 4X0F
Identifikátory
Aliasy	PDE4B, DPDE4, PDEIVB, fosfodiesteráza 4B
Externí ID	OMIM: 600127 MGI: 99557 HomoloGene: 1953 Genové karty: PDE4B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	66,374,579 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	102,607,259 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba kovových iontů; • Aktivita 3 ', 5'-cyklického nukleotidu fosfodiesterázy; • aktivita hydrolázy; • cAMP vazba; • vazba gama-tubulinu; • vazba iontového kanálu; • aktivita fosforečné diesterové hydrolázy; • Aktivita 3 ', 5'-cyklické-AMP fosfodiesterázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• komplex vápníkového kanálu s napětím; • komplex gama-tubulin; • periferní buňka; • cytosol; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • dendritická páteř; • membrána; • centrosome; • Z disk; • excitační synapse; • synaptický váček;
Biologický proces	• regulace aktivity vápníkového kanálu řízeného vysokým napětím; • homeostáza neutrofilů; • buněčná odpověď na lék; • regulace kontrakce buněk srdečního svalu; • pozitivní regulace produkce interferonu-gama; • signální transdukce; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • pozitivní regulace produkce interleukinu-2; • migrace leukocytů; • negativní regulace relaxace srdečního svalu; • buněčná odpověď na stimul adrenalinu; • Signální dráha receptoru T buněk; • chemotaxe neutrofilů; • cAMP katabolický proces; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5142
	18578
	ENSG00000184588
	ENSMUSG00000028525
	Q07343
	n / a
NM_001037339; NM_001037340; NM_001037341; NM_001297440; NM_001297441;
	NM_001297442; NM_002600
NM_001177980; NM_001177981; NM_001177982; NM_001177983; NM_019840;
	NM_001374780
NP_001032416; NP_001032417; NP_001032418; NP_001284369; NP_001284370;
	NP_001284371; NP_002591; NP_001032418.1; NP_002591.2
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

cAMP-specifická 3 ', 5'-cyklická fosfodiesteráza 4B je enzym že u lidí je kódován PDE4B gen.^[5]

Tento gen je členem cyklického nukleotidu specifického pro cyklický AMP (cAMP) typu IV fosfodiesteráza (PDE) rodina. Cyklické nukleotidy jsou důležití druzí poslové, kteří regulují a zprostředkovávají řadu buněčný reakce na extracelulární signály, jako např hormony, světlo, a neurotransmitery. The cyklické nukleotidové fosfodiesterázy (PDE) regulují buněčné koncentrace cyklických nukleotidů a tím hrají roli v signální transdukci. Tento gen kóduje protein, který specificky hydrolyzuje tábor. Alternativní transkripční varianty sestřihu, různé kódování izoformy, byly charakterizovány.^[5]^[6]

Klinický význam

Byla spojena změněná aktivita tohoto proteinu schizofrenie a bipolární porucha.^[5] Předpokládá se, že PDE4B je podtyp PDE4 zapojený do antipsychotikum účinky Inhibitory PDE4 jako rolipram.^[7] PDE4B je zapojen do dopamin - chování související se stresem.^[8] Nedávno bylo také zjištěno, že moduluje poznání, protože snížení aktivity PDE4B zlepšuje paměť a dlouhodobou plasticitu u myších modelů, což možná podporuje další terapeutické aplikace.^[9]

Inhibitory

AN2728, a bór - obsahujícího kandidáta na drogu, který byl od roku 2015 ve vývoji do Anacor Farmaceutika pro místní léčbu psoriáza a atopická dermatitida (atopický ekzém).^[10]^[11]^[12] hlavně působící na PDE4B.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184588 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028525 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b ^C "Entrezův gen: PDE4B fosfodiesteráza 4B, specifická pro cAMP (fosfodiesteráza E4, homolog dunce, Drosophila)".
^ Swerdlow, Neal R. (2010-08-19). Behaviorální neurobiologie schizofrenie a její léčba. Springer Science & Business Media. ISBN 9783642137174.
^ Porteous DJ, Millar JK, Brandon NJ, Sawa A (prosinec 2011). „DISC1 v 10: propojení psychiatrické genetiky a neurovědy“. Trendy v molekulární medicíně. 17 (12): 699–706. doi:10.1016 / j.molmed.2011.09.002. PMC 3253483. PMID 22015021.
^ Francis, SH; Conti, M; Houslay, MD, eds. (2011). Fosfodiesterázy jako lékové cíle (PDF). Příručka experimentální farmakologie. 204. Springer Berlin Heidelberg. doi:10.1007/978-3-642-17969-3. ISBN 978-3-642-17968-6.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}
^ http://newsdaily.com/2015/08/scientists-researching-brain-disorders-create-super-clever-mice/
^ Anacor AN2728 na webových stránkách Anacor Stránka přístupná 15. května 2015
^ Nazarian R, Weinberg JM (listopad 2009). „AN-2728, inhibitor PDE4 pro potenciální topickou léčbu psoriázy a atopické dermatitidy“. Současný názor na vyšetřovací drogy. 10 (11): 1236–42. PMID 19876791.
^ ^A ^b Moustafa F, Feldman SR (květen 2014). „Přehled inhibice fosfodiesterázy a potenciální role inhibitorů fosfodiesterázy 4 v klinické dermatologii“. Dermatol. Online J.. 20 (5): 22608. PMID 24852768.

Další čtení

Szpirer C, Szpirer J, Rivière M, Swinnen J, Vicini E, Conti M (1995). „Chromozomální lokalizace lidských a krysích genů (PDE4D a PDE4B) kódujících cAMP specifické fosfodiesterázy 3 a 4“. Cytogenetika a genetika buněk. 69 (1–2): 11–4. doi:10.1159/000133927. PMID 7835077.
Bolger GB, Rodgers L, Riggs M (listopad 1994). „Diferenciální exprese CNS alternativních izoforem mRNA savčích genů kódujících cAMP-specifické fosfodiesterázy“. Gen. 149 (2): 237–44. doi:10.1016/0378-1119(94)90155-4. PMID 7958996.
Milatovich A, Bolger G, Michaeli T, Francke U (březen 1994). "Chromozomové lokalizace genů pro pět cAMP-specifických fosfodiesteráz u člověka a myši". Somatická buněčná a molekulární genetika. 20 (2): 75–86. doi:10.1007 / BF02290677. PMID 8009369. S2CID 19182571.
McLaughlin MM, Cieslinski LB, Burman M, Torphy TJ, Livi GP (březen 1993). „Nízko-km, na rolipram senzitivní, cAMP-specifická fosfodiesteráza z lidského mozku. Klonování a exprese cDNA, biochemická charakterizace rekombinantního proteinu a tkáňová distribuce mRNA.“ The Journal of Biological Chemistry. 268 (9): 6470–6. PMID 8384210.
Obernolte R, Bhakta S, Alvarez R, Bach C, Zuppan P, Mulkins M, Jarnagin K, Shelton ER (červenec 1993). „CDNA lidské lymfocytární cyklické-AMP fosfodiesterázy (PDE IV) odhaluje multigenní rodinu“. Gen. 129 (2): 239–47. doi:10.1016/0378-1119(93)90274-7. PMID 8392015.
Bolger G, Michaeli T, Martins T, St John T, Steiner B, Rodgers L, Riggs M, Wigler M, Ferguson K (říjen 1993). „Rodina lidských fosfodiesteráz homologních s produktem učení a paměti genu Drosophila melanogaster jsou potenciálními cíli pro antidepresiva“. Molekulární a buněčná biologie. 13 (10): 6558–71. doi:10.1128 / mcb.13.10.6558. PMC 364715. PMID 8413254.
Huston E, Lumb S, Russell A, Catterall C, Ross AH, Steele MR, Bolger GB, Perry MJ, Owens RJ, Houslay MD (prosinec 1997). „Molekulární klonování a přechodná exprese nové lidské PDE4B cAMP-specifické fosfodiesterázy, HSPDE4B3, v buňkách COS7“. The Biochemical Journal. 328 (Pt 2): 549–58. doi:10.1042 / bj3280549. PMC 1218954. PMID 9371714.
Ma D, Wu P, Egan RW, Billah MM, Wang P (leden 1999). „Transkripce genu pro fosfodiesterázu 4B je aktivována lipopolysacharidem a inhibována interleukinem-10 v lidských monocytech“. Molekulární farmakologie. 55 (1): 50–7. doi:10,1124 / mol. 55,1.50. PMID 9882697.
Secchiero P, Zella D, Curreli S, Mirandola P, Capitani S, Gallo RC, Zauli G (prosinec 2000). „Stěžejní role cyklické nukleosidové fosfodiesterázy 4 při hyperaktivaci CD4 + T buněk zprostředkovaných Tat a replikaci HIV typu 1“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (26): 14620–5. Bibcode:2000PNAS ... 9714620S. doi:10.1073 / pnas.011512398. PMC 18968. PMID 11114167.
Zauli G, Milani D, Mirandola P, Mazzoni M, Secchiero P, Miscia S, Capitani S (únor 2001). „HIV-1 Tat protein down-reguluje expresi transkripčního faktoru CREB v neuronálních buňkách PC12 cestou fosfatidylinositol 3-kinázy / AKT / cyklické nukleosidové fosfodiesterázy“. FASEB Journal. 15 (2): 483–91. doi:10.1096 / fj.00-0354com. PMID 11156964. S2CID 26315564.
Moon E, Lee R, Near R, Weintraub L, Wolda S, Lerner A (únor 2002). „Inhibice PDE3B zvyšuje apoptózu indukovanou inhibitorem PDE4 u podskupiny pacientů s chronickou lymfocytární leukémií.“ Klinický výzkum rakoviny. 8 (2): 589–95. PMID 11839681.
Shepherd M, McSorley T, Olsen AE, Johnston LA, Thomson NC, Baillie GS, Houslay MD, Bolger GB (březen 2003). „Molekulární klonování a subcelulární distribuce nové izoformy fosfodiesterázy specifické pro PDE4B4 cAMP“. The Biochemical Journal. 370 (Pt 2): 429–38. doi:10.1042 / BJ20021082. PMC 1223190. PMID 12441002.
Arp J, Kirchhof MG, Baroja ML, Nazarian SH, Chau TA, Strathdee CA, Ball EH, Madrenas J (listopad 2003). „Regulace aktivace T-buněk fosfodiesterázou 4B2 vyžaduje její dynamickou redistribuci během tvorby imunologické synapsy“. Molekulární a buněčná biologie. 23 (22): 8042–57. doi:10.1128 / MCB.23.22.8042-8057.2003. PMC 262363. PMID 14585965.
Brandenberger R, Wei H, Zhang S, Lei S, Murage J, Fisk GJ, Li Y, Xu C, Fang R, Guegler K, Rao MS, Mandalam R, Lebkowski J, Stanton LW (červen 2004). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Přírodní biotechnologie. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197. S2CID 27764390.
Smith PG, Wang F, Wilkinson KN, Savage KJ, Klein U, Neuberg DS, Bollag G, Shipp MA, Aguiar RC (leden 2005). „Fosfodiesteráza PDE4B omezuje cAMP asociovanou PI3K / AKT závislou apoptózu u difuzního velkobuněčného B-buněčného lymfomu“. Krev. 105 (1): 308–16. doi:10.1182 / krev-2004-01-0240. PMID 15331441.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (listopad 2004). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Molekulární a buněčná proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Millar JK, Pickard BS, Mackie S, James R, Christie S, Buchanan SR, Malloy MP, Chubb JE, Huston E, Baillie GS, Thomson PA, Hill EV, Brandon NJ, Rain JC, Camargo LM, Whiting PJ, Houslay MD „Blackwood DH, Muir WJ, Porteous DJ (listopad 2005). „DISC1 a PDE4B jsou interagující genetické faktory u schizofrenie, které regulují signalizaci cAMP“. Věda. 310 (5751): 1187–91. Bibcode:2005Sci ... 310.1187M. doi:10.1126 / science.1112915. PMID 16293762. S2CID 3060031.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184588 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028525 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b ^C "Entrezův gen: PDE4B fosfodiesteráza 4B, specifická pro cAMP (fosfodiesteráza E4, homolog dunce, Drosophila)".

[6] Swerdlow, Neal R. (2010-08-19). Behaviorální neurobiologie schizofrenie a její léčba. Springer Science & Business Media. ISBN 9783642137174.

[7] Porteous DJ, Millar JK, Brandon NJ, Sawa A (prosinec 2011). „DISC1 v 10: propojení psychiatrické genetiky a neurovědy“. Trendy v molekulární medicíně. 17 (12): 699–706. doi:10.1016 / j.molmed.2011.09.002. PMC 3253483. PMID 22015021.

[8] Francis, SH; Conti, M; Houslay, MD, eds. (2011). Fosfodiesterázy jako lékové cíle (PDF). Příručka experimentální farmakologie. 204. Springer Berlin Heidelberg. doi:10.1007/978-3-642-17969-3. ISBN 978-3-642-17968-6.^{[trvalý mrtvý odkaz ]}

[9] ttp://newsdaily.com/2015/08/scientists-researching-brain-disorders-create-super-clever-mice/

[Anacor-10] Anacor AN2728 na webových stránkách Anacor Stránka přístupná 15. května 2015

[Nazarian-11] Nazarian R, Weinberg JM (listopad 2009). „AN-2728, inhibitor PDE4 pro potenciální topickou léčbu psoriázy a atopické dermatitidy“. Současný názor na vyšetřovací drogy. 10 (11): 1236–42. PMID 19876791.

[Moustafa-12] A ^b Moustafa F, Feldman SR (květen 2014). „Přehled inhibice fosfodiesterázy a potenciální role inhibitorů fosfodiesterázy 4 v klinické dermatologii“. Dermatol. Online J.. 20 (5): 22608. PMID 24852768.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]