DNA polymeráza eta - DNA polymerase eta

POLH
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2I5O, 4RNM, 4J9O, 4YQW, 4YR0, 4ECX, 4ECS, 4ECT, 2LSK, 4DL5, 4 ECR, 4DL3, 4J9K, 3MR5, 4J9N, 3SI8, 4YP3, 4O3N, 5EWE, 4 ECU, 4DL6, 3MR6, 4RNN, 3MR3, 4ECY, 4O3P, 4RNO, 4ECQ, 4O3O, 4O3S, 4 ECV, 4J9P, 4Q8F, 4ED3, 4ECZ, 4DL2, 4ECW, 3WUP, 5EWF, 4ED7, 4R2, 4EEY, 4ED8, 4J9S, 3JAA, 4J9M, 4J9Q, 3MR2, 3TQ1, 4ED6, 4DL7, 4J9R, 4ED0, 4R3, 4O3Q, 4ED1, 4J9L, 4DL4, 4O3R, 4RU9, 5EWG, 4ED2, 4Q8E, 5KG6, 5 DGB, 5 KFT, 5DG8, 5KFV, 5 KFH, 5KG7, 5KG0, 5KFN, 5KFZ, 5KG1, 5KFX, 5 KFC, 5KFU, 5 KFA, 5KFK, 5KFI, 5KG4, 5KFQ, 5KFO, 5KFE, 5KFD, 5KFG, 5KG2, 5KFR, 5KFP, 5KG3, 5 km / h, 5KFW, 5 DGA, 5KFB, 5DG7, 5 KFF, 5KFJ, 5DG9, 5L9X, 5KG5, 5 kB, 5 KFL, 5KFY
Identifikátory
Aliasy	POLH, RAD30, RAD30A, XP-V, XPV, DNA polymeráza eta, polymeráza (DNA) eta
Externí ID	OMIM: 603968 MGI: 1891457 HomoloGene: 38189 Genové karty: POLH
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	43,620,523 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	46,202,645 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • Vazba DNA; • aktivita nukleotidyltransferázy; • vazba kovových iontů; • poškozená vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita DNA řízené DNA polymerázy;
Buněčná složka	• nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytosol; • replikační vidlice; • místo dvouvláknového zlomu;
Biologický proces	• Syntéza DNA zapojená do opravy DNA; • oprava dimeru pyrimidinu; • Proces biosyntézy DNA; • postreplikační oprava; • bezchybná syntéza překladu; • regulace opravy DNA; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • replikace DNA; • buněčná odpověď na UV-C; • syntéza překladů; • reakce na UV-C; • Oprava DNA; • reakce na záření; • syntéza překladu náchylná k chybám;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5429
	80905
	ENSG00000170734
	ENSMUSG00000023953
	Q9Y253
	Q9JJN0
	NM_001291969; NM_001291970; NM_006502
	NM_030715; NM_001364947
	NP_001278898; NP_001278899; NP_006493
	NP_109640; NP_001351876
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DNA polymeráza eta (Pol η), je protein že u lidí je kódován POLH gen.^[5]^[6]^[7]

DNA polymeráza eta je eukaryotická DNA polymeráza podílí se na Oprava DNA syntézou translesionů. Gen kódující DNA polymerázu eta je POLH, také známý jako XPV, protože ztráta tohoto genu vede k onemocnění xeroderma pigmentosum. Polymeráza eta je obzvláště důležitá pro umožnění přesné translesní syntézy poškození DNA v důsledku ultrafialového záření nebo UV záření.

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny Y specializovaných DNA polymerázy. Kopíruje nepoškozenou DNA s nižší věrností než jiné DNA řízené polymerázy. Přesně však replikuje DNA poškozenou UV zářením; když dimery tyminu Pokud jsou přítomny, vloží tato polymeráza komplementární nukleotidy do nově syntetizované DNA, čímž obchází lézi a potlačuje mutagenní účinek poškození DNA indukovaného UV zářením. Předpokládá se, že je do této polymerázy zapojena hypermutace během přepínání rekombinace třídy imunoglobulinů.^[5]

Obtok 8-oxoguaninu

V době replikace DNA z Saccharomyces cerevisiae chromozóm, oxidační poškození DNA 8-oxoguanin spouští přechod na syntézu translesie DNA polymerázou eta.^[8] Tato polymeráza s přesností replikuje 8-oxoguanin (inzerce a cytosin oproti 8-oxoguaninu) přibližně 94%. Replikace 8-oxoguaninu v nepřítomnosti DNA polymerázy eta je méně než 40%.

Klinický význam

Mutace v tomto genu vedou k XPV, variantnímu typu xeroderma pigmentosum, vyznačující se citlivostí na slunce, zvýšeným výskytem rakoviny kůže a na buněčné úrovni opožděnou replikací a hypermutovatelností po UV záření^[9]^[10]

Interakce

Ukázalo se, že POLH komunikovat s PCNA.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170734 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023953 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: POLH polymeráza (řízená DNA), eta".
^ Masutani C, Kusumoto R, Yamada A, Dohmae N, Yokoi M, Yuasa M, Araki M, Iwai S, Takio K, Hanaoka F (červen 1999). „Gen XPV (varianta xeroderma pigmentosum) kóduje lidskou DNA polymerázu eta“. Příroda. 399 (6737): 700–4. Bibcode:1999 Natur.399..700M. doi:10.1038/21447. PMID 10385124. S2CID 4429698.
^ Johnson RE, Kondratick CM, Prakash S, Prakash L (červenec 1999). "mutace hRAD30 ve variantní formě xeroderma pigmentosum". Věda. 285 (5425): 263–5. doi:10.1126 / science.285.5425.263. PMID 10398605.
^ Rodriguez GP, Song JB, Crouse GF (2013). „In vivo bypass 8-oxodG“. PLOS Genet. 9 (8): e1003682. doi:10.1371 / journal.pgen.1003682. PMC 3731214. PMID 23935538.
^ Stary A, Sarasin A (září 2002). „Molekulární mechanismy mutací indukovaných UV zářením, jak je patrné ze studie DNA polymerázy eta v lidských buňkách“. Res. Microbiol. 153 (7): 441–5. doi:10.1016 / S0923-2508 (02) 01343-8. PMID 12405351.
^ Cruet-Hennequart S, Gallagher K, Sokòl AM, Villalan S, Prendergast AM, Carty MP (2010). "DNA polymeráza η, klíčový protein v syntéze translesí v lidských buňkách". DNA polymeráza eta, klíčový protein při syntéze translese v lidských buňkách. Subcelulární biochemie. 50. 189–209. doi:10.1007/978-90-481-3471-7_10. ISBN 978-90-481-3470-0. PMID 20012583.
^ Haracska L, Johnson RE, Unk I, Phillips B, Hurwitz J, Prakash L, Prakash S (listopad 2001). „Fyzikální a funkční interakce lidské DNA polymerázy eta s PCNA“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7199–206. doi:10.1128 / MCB.21.21.7199-7206.2001. PMC 99895. PMID 11585903.

Další čtení

Plachta M, Halas, McIntyre J, Sledziewska-Gojska E (2015). „Rovnovážný stav a stabilita TLS polymerázy eta jsou závislé na buněčném cyklu kvasinek S. cerevisiae“. Oprava DNA. 29: 147–153. doi:10.1016 / j.dnarep.2015.02.015. PMID 25766643.
Skoneczna A, McIn Atyre J, Skoneczny M, Policinska Z, Sledziewska-Gojska E (2007). „Polymeráza eta je krátkodobý proteazomálně degradovaný protein, který je dočasně stabilizován po UV záření v Saccharomyces cerevisiae.“ J. Mol. Biol. 366 (4): 1074–86. doi:10.1016 / j.jmb.2006.11.093. PMID 17198712.
Masutani C, Kusumoto R, Yamada A, Dohmae N, Yokoi M, Yuasa M, Araki M, Iwai S, Takio K, Hanaoka F (1999). „Gen XPV (varianta xeroderma pigmentosum) kóduje lidskou DNA polymerázu eta“. Příroda. 399 (6737): 700–4. Bibcode:1999 Natur.399..700M. doi:10.1038/21447. PMID 10385124. S2CID 4429698.
Johnson RE, Kondratick CM, Prakash S, Prakash L (1999). "mutace hRAD30 ve variantní formě xeroderma pigmentosum". Věda. 285 (5425): 263–5. doi:10.1126 / science.285.5425.263. PMID 10398605.
Masutani C, Kusumoto R, Iwai S, Hanaoka F (2000). "Mechanismy přesné syntézy transleze lidskou DNA polymerázou eta". EMBO J.. 19 (12): 3100–9. doi:10.1093 / emboj / 19.12.3100. PMC 203367. PMID 10856253.
Yamada A, Masutani C, Iwai S, Hanaoka F (2000). „Doplnění defektní syntézy transleze a citlivosti na UV světlo v buňkách variant xeroderma pigmentosum lidskou a myší DNA polymerázou eta“. Nucleic Acids Res. 28 (13): 2473–80. doi:10.1093 / nar / 28.13.2473. PMC 102698. PMID 10871396.
Yuasa M, Masutani C, Eki T, Hanaoka F (2000). "Genomická struktura, chromozomální lokalizace a identifikace mutací v genu pro variantu xeroderma pigmentosum (XPV)". Onkogen. 19 (41): 4721–8. doi:10.1038 / sj.onc.1203842. PMID 11032022.
Itoh T, Linn S, Kamide R, Tokushige H, Katori N, Hosaka Y, Yamaizumi M (2000). „Variabilní heterozygoti Xeroderma pigmentosum vykazují sníženou hladinu regenerace replikativní syntézy DNA v přítomnosti kofeinu po ultrafialovém záření“. J. Invest. Dermatol. 115 (6): 981–5. doi:10.1046 / j.1523-1747.2000.00154.x. PMID 11121129.
Zeng X, Winter DB, Kasmer C, Kraemer KH, Lehmann AR, Gearhart PJ (2001). „DNA polymeráza eta je A-T mutátor při somatické hypermutaci variabilních genů imunoglobulinu“. Nat. Immunol. 2 (6): 537–41. doi:10.1038/88740. PMID 11376341. S2CID 6213513.
Matsuda T, Bebenek K, Masutani C, Rogozin IB, Hanaoka F, Kunkel TA (2001). "Chybovost a specificita lidské a myší DNA polymerázy eta". J. Mol. Biol. 312 (2): 335–46. doi:10.1006 / jmbi.2001.4937. PMID 11554790.
Haracska L, Johnson RE, Unk I, Phillips B, Hurwitz J, Prakash L, Prakash S (2001). „Fyzikální a funkční interakce lidské DNA polymerázy eta s PCNA“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7199–206. doi:10.1128 / MCB.21.21.7199-7206.2001. PMC 99895. PMID 11585903.
Glick E, Vigna KL, Loeb LA (2001). "Mutace v lidské DNA polymerase eta motiv II mění obtok DNA lézí". EMBO J.. 20 (24): 7303–12. doi:10.1093 / emboj / 20.24.7303. PMC 125802. PMID 11743006.
Limoli CL, Giedzinski E, Bonner WM, Cleaver JE (2002). „Zastavení replikace indukované UV zářením ve variantě xeroderma pigmentosum vede k dvouřetězcovým zlomům DNA, tvorbě gama-H2AX a přemístění Mre11“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (1): 233–8. Bibcode:2002PNAS ... 99..233L. doi:10.1073 / pnas.231611798. PMC 117544. PMID 11756691.
Broughton BC, Cordonnier A, Kleijer WJ, Jaspers NG, Fawcett H, Raams A, Garritsen VH, Stary A, Avril MF, Boudsocq F, Masutani C, Hanaoka F, Fuchs RP, Sarasin A, Lehmann AR (2002). "Molekulární analýza mutací v DNA polymerase eta u pacientů s variantou xeroderma pigmentosum". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (2): 815–20. Bibcode:2002PNAS ... 99..815B. doi:10.1073 / pnas.022473899. PMC 117388. PMID 11773631.
Chiapperino D, Kroth H, Kramarczuk IH, Sayer JM, Masutani C, Hanaoka F, Jerina DM, Cheh AM (2002). „Preferenční dezincorporace purinových nukleotidů lidskou DNA polymerázou eta naproti aduktům benzo [a] pyrenu 7,8-diolu 9,10-epoxidu deoxyguanosinu“. J. Biol. Chem. 277 (14): 11765–71. doi:10,1074 / jbc.M112139200. PMID 11821420.
Kusumoto R, Masutani C, Iwai S, Hanaoka F (2002). „Syntéza translese lidskou DNA polymerázou eta napříč lézemi thyminglykolu“. Biochemie. 41 (19): 6090–9. doi:10.1021 / bi025549k. PMID 11994004.
Yavuz S, Yavuz AS, Kraemer KH, Lipsky PE (2002). „Role polymerázy eta při somatické hypermutaci určená analýzou mutací u pacienta s variantou xeroderma pigmentosum“. J. Immunol. 169 (7): 3825–30. doi:10,4049 / jimmunol.169.7.3825. PMID 12244178.
Kannouche P, Fernández de Henestrosa AR, Coull B, Vidal AE, Gray C, Zicha D, Woodgate R, Lehmann AR (2002). „Lokalizace DNA polymeráz eta a iota do replikačního aparátu je úzce koordinována v lidských buňkách“. EMBO J.. 21 (22): 6246–56. doi:10.1093 / emboj / cdf618. PMC 137208. PMID 12426396.
Zheng H, Wang X, Warren AJ, Legerski RJ, Nairn RS, Hamilton JW, Li L (2003). „Nucleotide excision repair- a polymerase eta-mediated error-prone remove of mitomycin C interstrand crosslinks“. Mol. Buňka. Biol. 23 (2): 754–61. doi:10.1128 / MCB.23.2.754-761.2003. PMC 151552. PMID 12509472.
Yang IY, Miller H, Wang Z, Frank EG, Ohmori H, Hanaoka F, Moriya M (2003). "Syntéza savčí translesie DNA napříč aduktem deoxyguanosinu odvozeným od akroleinu. Účast DNA polymerázy eta na syntéze náchylné k chybám v lidských buňkách". J. Biol. Chem. 278 (16): 13989–94. doi:10,1074 / jbc.M212535200. PMID 12584190.
Kannouche P, Fernández de Henestrosa AR, Coull B, Vidal AE, Gray C, Zicha D, Woodgate R, Lehmann AR (2003). „Lokalizace DNA polymeráz eta a iota do replikačního aparátu je úzce koordinována v lidských buňkách“. EMBO J.. 22 (5): 1223–33. doi:10.1093 / emboj / cdf618. PMC 150329. PMID 12606586.

externí odkazy

GeneReviews / NIH / NCBI / UW vstup na Xeroderma Pigmentosum

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170734 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023953 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: POLH polymeráza (řízená DNA), eta".

[pmid10385124-6] Masutani C, Kusumoto R, Yamada A, Dohmae N, Yokoi M, Yuasa M, Araki M, Iwai S, Takio K, Hanaoka F (červen 1999). „Gen XPV (varianta xeroderma pigmentosum) kóduje lidskou DNA polymerázu eta“. Příroda. 399 (6737): 700–4. Bibcode:1999 Natur.399..700M. doi:10.1038/21447. PMID 10385124. S2CID 4429698.

[pmid10398605-7] Johnson RE, Kondratick CM, Prakash S, Prakash L (červenec 1999). "mutace hRAD30 ve variantní formě xeroderma pigmentosum". Věda. 285 (5425): 263–5. doi:10.1126 / science.285.5425.263. PMID 10398605.

[pmid23935538-8] Rodriguez GP, Song JB, Crouse GF (2013). „In vivo bypass 8-oxodG“. PLOS Genet. 9 (8): e1003682. doi:10.1371 / journal.pgen.1003682. PMC 3731214. PMID 23935538.

[pmid12405351-9] Stary A, Sarasin A (září 2002). „Molekulární mechanismy mutací indukovaných UV zářením, jak je patrné ze studie DNA polymerázy eta v lidských buňkách“. Res. Microbiol. 153 (7): 441–5. doi:10.1016 / S0923-2508 (02) 01343-8. PMID 12405351.

[pmid20012583-10] Cruet-Hennequart S, Gallagher K, Sokòl AM, Villalan S, Prendergast AM, Carty MP (2010). "DNA polymeráza η, klíčový protein v syntéze translesí v lidských buňkách". DNA polymeráza eta, klíčový protein při syntéze translese v lidských buňkách. Subcelulární biochemie. 50. 189–209. doi:10.1007/978-90-481-3471-7_10. ISBN 978-90-481-3470-0. PMID 20012583.

[pmid11585903-11] Haracska L, Johnson RE, Unk I, Phillips B, Hurwitz J, Prakash L, Prakash S (listopad 2001). „Fyzikální a funkční interakce lidské DNA polymerázy eta s PCNA“. Mol. Buňka. Biol. 21 (21): 7199–206. doi:10.1128 / MCB.21.21.7199-7206.2001. PMC 99895. PMID 11585903.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]