Aktinin alfa 1 - Actinin alpha 1

ACTN1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EYI, 2EYN, 2N8Z, 2N8Y
Identifikátory
Aliasy	ACTN1, BDPLT15, aktinin alfa 1
Externí ID	OMIM: 102575 MGI: 2137706 HomoloGene: 55553 Genové karty: ACTN1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	68,979,440 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	80,260,371 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku; • aktivita homodimerizace proteinu; • vazba iontového kanálu; • vázání vinculinu; • vazba kovových iontů; • integrinová vazba; • vazba aktinového vlákna; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislá na ligandu; • dvouvláknová vazba RNA; • aktinová vazba; • strukturní složka postsynapse;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčná projekce; • pseudopodia; • membrána; • mezibuněčné spojení; • ohnisková adheze; • prohrábnout; • buněčná membrána; • intracelulární; • stresové vlákno; • extracelulární oblast; • buněčné spojení; • Z disk; • okraj kartáče; • aktinové vlákno; • fascia adherens; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • lumen destiček alfa granule; • sarkoméra; • extracelulární; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • negativní regulace pohybu buněčných složek; • organizace aktinových vláken; • tvorba sítě aktinových vláken; • degranulace krevních destiček; • tvorba krevních destiček; • sestava svazku aktinových vláken; • sestava ohniskové adheze; • tvorba aktinového zesítění; • morfogeneze krevních destiček; • agregace krevních destiček; • aktivace krevních destiček; • regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou; • organizace postsynapse; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	87
	109711
	ENSG00000072110
	ENSMUSG00000015143
	P12814
	Q7TPR4
	NM_001102; NM_001130004; NM_001130005
	NM_134156; NM_001346669; NM_001379075; NM_001379076
	NP_001093; NP_001123476; NP_001123477; NP_001093.1
	NP_001333598; NP_598917; NP_001366004; NP_001366005
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Alfa-aktinin-1 je protein že u lidí je kódován ACTN1 gen.^[5]

Funkce

Alfa aktininy patří k spektrin genová nadčeleď, která představuje různorodou skupinu cytoskeletální proteiny, včetně alfa a beta spektrinů a dystrofiny. Alfa aktinin je aktin -vázací protein s více rolemi v různých typech buněk. V nesvalových buňkách se cytoskeletální izoforma nachází podél mikrofilament svazky a spojky typu adherens, kde se podílí na vazbě aktinu na membránu. Naproti tomu jsou kostní, srdeční a izoformy hladkého svalstva lokalizovány na Z-disk a analogická hustá tělesa, kde pomáhají ukotvit myofibrilární aktinová vlákna. Tento gen kóduje nesvalovou cytoskeletální izoformu alfa aktininu a mapuje se na stejné místo jako strukturně podobný gen erythroidního beta spektrinu.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že aktinin, alfa 1 komunikovat s:

Viz také

Aktinin

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072110 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015143 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Youssoufian H, McAfee M, Kwiatkowski DJ (červenec 1990). „Klonování a chromozomální lokalizace lidského genu pro cytoskeletální alfa-aktinin odhaluje vazbu na gen pro beta-spektrin“. Jsem J Hum Genet. 47 (1): 62–72. PMC 1683765. PMID 2349951.
^ „Entrez Gene: ACTN1 aktinin, alfa 1“.
^ ^A ^b Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (září 2002). „Aktivátory p35 a p39 závislé na cyklin-dependentní kináze 5 a p39 interagují s alfa-podjednotkou Ca2 + / kalmodulin-dependentní protein kinázy II a alfa-aktinin-1 způsobem závislým na vápníku“. J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.
^ Gonzalez AM, Otey C, Edlund M, Jones JC (prosinec 2001). "Interakce hemidesmosomové složky a členů rodiny aktininů". J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4197–206. PMID 11739652.
^ Bunn RC, Jensen MA, Reed BC (duben 1999). „Proteinové interakce s proteinem vázajícím transportér glukózy GLUT1CBP, které poskytují spojení mezi GLUT1 a cytoskeletem“. Mol. Biol. Buňka. 10 (4): 819–32. doi:10,1091 / mbc. 10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.
^ Vallenius T, Luukko K, Mäkelä TP (duben 2000). „CLP-36 PDZ-LIM protein se asociuje s nesvalovým alfa-aktininem-1 a alfa-aktininem-4“. J. Biol. Chem. 275 (15): 11100–5. doi:10.1074 / jbc.275.15.11100. PMID 10753915.
^ Bauer K, Kratzer M, Otte M, de Quintana KL, Hagmann J, Arnold GJ, Eckerskorn C, Lottspeich F, Siess W (prosinec 2000). „Lidský CLP36, protein PDZ-domény a LIM-domény, se váže na alfa-aktinin-1 a asociuje se s aktinovými vlákny a stresovými vlákny v aktivovaných krevních destičkách a endoteliálních buňkách“. Krev. 96 (13): 4236–45. PMID 11110697.
^ Feng S, Reséndiz JC, Christodoulides N, Lu X, Arboleda D, Berndt MC, Kroll MH (leden 2002). „Patologické smykové napětí stimuluje tyrosinovou fosforylaci alfa-aktininu spojeného s glykoproteinovým komplexem Ib-IX“. Biochemie. 41 (4): 1100–8. doi:10.1021 / bi0156005. PMID 11802708.
^ Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda W, Takeuchi M, Takai Y (únor 2003). „ADIP, nový protein vázající afadin a alfa-aktinin lokalizovaný na spojích adherenů buňka-buňka“. J. Biol. Chem. 278 (6): 4103–11. doi:10,1074 / jbc.M209832200. PMID 12446711.
^ Reinhard M, Zumbrunn J, Jaquemar D, Kuhn M, Walter U, Trueb B (květen 1999). „Alfa-aktininové vazebné místo zyxinu je nezbytné pro subcelulární lokalizaci zyxinu a nábor alfa-aktininu“. J. Biol. Chem. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.
^ Li B, Trueb B (září 2001). „Analýza interakce alfa-aktinin / zyxin“. J. Biol. Chem. 276 (36): 33328–35. doi:10,1074 / jbc.M100789200. PMID 11423549.
^ Besco JA, Hooft van Huijsduijnen R, Frostholm A, Rotter A (2006). "Intracelulární substráty mozkem obohaceného receptorového proteinu tyrosin fosfatázy rho (RPTPrho / PTPRT)". Brain Res. 1116 (1): 50–7. doi:10.1016 / j.brainres.2006.07.122. PMID 16973135.

Další čtení

Snásel J, Pichová I (1997). „Štěpení proteinů hostitelské buňky proteázou HIV-1“. Folia Biol. (Praha). 42 (5): 227–30. doi:10.1007 / BF02818986. PMID 8997639.
Menko S, Philp N, Veneziale B, Walker J (1998). "Integriny a vývoj: jak mohou tyto receptory regulovat diferenciaci čočky". Ann. N. Y. Acad. Sci. 842: 36–41. doi:10.1111 / j.1749-6632.1998.tb09629.x. PMID 9599291.
Yürüker B, Niggli V (1992). „Alfa-aktinin a vinkulin v lidských neutrofilech: reorganizace během adheze a vztah k aktinové síti“. J. Cell Sci. 101 (2): 403–14. PMID 1629252.
Tokuue Y, Goto S, Imamura M a kol. (1992). „Transfekce cDNA alfa-aktininu z kosterního svalstva kuřete do nesvalových a myogenních buněk: dimerizace není nezbytná pro to, aby se alfa-aktinin váže na mikrofilamenta“. Exp. Cell Res. 197 (2): 158–67. doi:10.1016 / 0014-4827 (91) 90418-T. PMID 1720388.
Shoeman RL, Kesselmier C, Mothes E a kol. (1991). "Nevirové buněčné substráty pro proteázu typu 1 viru lidské imunodeficience". FEBS Lett. 278 (2): 199–203. doi:10.1016 / 0014-5793 (91) 80116-K. PMID 1991513.
Nishiyama M, Ozturk M, Frohlich M a kol. (1990). "Exprese lidského alfa-aktininu v lidském hepatocelulárním karcinomu". Cancer Res. 50 (19): 6291–4. PMID 2169343.
Millake DB, Blanchard AD, Patel B, Critchley DR (1989). „Sekvence cDNA lidského placentárního alfa-aktininu“. Nucleic Acids Res. 17 (16): 6725. doi:10.1093 / nar / 17.16.6725. PMC 318366. PMID 2780298.
Dubernard V, Faucher D, Launay JM, Legrand C (1995). „Identifikace cytoskeletálního proteinu alfa-aktininu jako proteinu vázajícího trombospondin na trombocyty“. FEBS Lett. 364 (2): 109–14. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00362-D. PMID 7750553.
Knudsen KA, Soler AP, Johnson KR, Wheelock MJ (1995). „Interakce alfa-aktininu s adhezním komplexem kadherin / katenin mezi buňkami prostřednictvím alfa-kateninu“. J. Cell Biol. 130 (1): 67–77. doi:10.1083 / jcb.130.1.67. PMC 2120515. PMID 7790378.
Glück U, Ben-Ze'ev A (1995). „Modulace hladin alfa-aktininu ovlivňuje buněčnou motilitu a propůjčuje tumorigenicitu buňkám 3T3“. J. Cell Sci. 107 (7): 1773–82. PMID 7983147.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Egerton M, Moritz RL, Druker B a kol. (1996). "Identifikace 70kD příbuzného proteinu tepelného šoku (Hsc70) a alfa-aktininu-1 jako nových proteinů obsahujících fosfotyrosin v T lymfocytech". Biochem. Biophys. Res. Commun. 224 (3): 666–74. doi:10.1006 / bbrc.1996.1082. PMID 8713105.
Mukai H, Toshimori M, Shibata H a kol. (1997). „Interakce PKN s alfa-aktininem“. J. Biol. Chem. 272 (8): 4740–6. doi:10.1074 / jbc.272.8.4740. PMID 9030526.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Hazan RB, Norton L (1998). „Receptor epidermálního růstového faktoru moduluje interakci E-kadherinu s aktinovým cytoskeletem“. J. Biol. Chem. 273 (15): 9078–84. doi:10.1074 / jbc.273.15.9078. PMID 9535896.
Bunn RC, Jensen MA, Reed BC (1999). „Proteinové interakce s proteinem vázajícím transportér glukózy GLUT1CBP, které poskytují spojení mezi GLUT1 a cytoskeletem“. Mol. Biol. Buňka. 10 (4): 819–32. doi:10,1091 / mbc. 10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.
Reinhard M, Zumbrunn J, Jaquemar D a kol. (1999). „Alfa-aktininové vazebné místo zyxinu je nezbytné pro subcelulární lokalizaci zyxinu a nábor alfa-aktininu“. J. Biol. Chem. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.

externí odkazy

Aktinin, alfa 1 Informace s odkazy v Brána pro migraci buněk
Člověk ACTN1 umístění genomu a ACTN1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072110 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015143 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2349951-5] Youssoufian H, McAfee M, Kwiatkowski DJ (červenec 1990). „Klonování a chromozomální lokalizace lidského genu pro cytoskeletální alfa-aktinin odhaluje vazbu na gen pro beta-spektrin“. Jsem J Hum Genet. 47 (1): 62–72. PMC 1683765. PMID 2349951.

[6] „Entrez Gene: ACTN1 aktinin, alfa 1“.

[pmid12223541-7] A ^b Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (září 2002). „Aktivátory p35 a p39 závislé na cyklin-dependentní kináze 5 a p39 interagují s alfa-podjednotkou Ca2 + / kalmodulin-dependentní protein kinázy II a alfa-aktinin-1 způsobem závislým na vápníku“. J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.

[pmid11739652-8] Gonzalez AM, Otey C, Edlund M, Jones JC (prosinec 2001). "Interakce hemidesmosomové složky a členů rodiny aktininů". J. Cell Sci. 114 (Pt 23): 4197–206. PMID 11739652.

[pmid10198040-9] Bunn RC, Jensen MA, Reed BC (duben 1999). „Proteinové interakce s proteinem vázajícím transportér glukózy GLUT1CBP, které poskytují spojení mezi GLUT1 a cytoskeletem“. Mol. Biol. Buňka. 10 (4): 819–32. doi:10,1091 / mbc. 10.4.819. PMC 25204. PMID 10198040.

[pmid10753915-10] Vallenius T, Luukko K, Mäkelä TP (duben 2000). „CLP-36 PDZ-LIM protein se asociuje s nesvalovým alfa-aktininem-1 a alfa-aktininem-4“. J. Biol. Chem. 275 (15): 11100–5. doi:10.1074 / jbc.275.15.11100. PMID 10753915.

[pmid11110697-11] Bauer K, Kratzer M, Otte M, de Quintana KL, Hagmann J, Arnold GJ, Eckerskorn C, Lottspeich F, Siess W (prosinec 2000). „Lidský CLP36, protein PDZ-domény a LIM-domény, se váže na alfa-aktinin-1 a asociuje se s aktinovými vlákny a stresovými vlákny v aktivovaných krevních destičkách a endoteliálních buňkách“. Krev. 96 (13): 4236–45. PMID 11110697.

[pmid11802708-12] Feng S, Reséndiz JC, Christodoulides N, Lu X, Arboleda D, Berndt MC, Kroll MH (leden 2002). „Patologické smykové napětí stimuluje tyrosinovou fosforylaci alfa-aktininu spojeného s glykoproteinovým komplexem Ib-IX“. Biochemie. 41 (4): 1100–8. doi:10.1021 / bi0156005. PMID 11802708.

[pmid12446711-13] Asada M, Irie K, Morimoto K, Yamada A, Ikeda W, Takeuchi M, Takai Y (únor 2003). „ADIP, nový protein vázající afadin a alfa-aktinin lokalizovaný na spojích adherenů buňka-buňka“. J. Biol. Chem. 278 (6): 4103–11. doi:10,1074 / jbc.M209832200. PMID 12446711.

[pmid10224105-14] Reinhard M, Zumbrunn J, Jaquemar D, Kuhn M, Walter U, Trueb B (květen 1999). „Alfa-aktininové vazebné místo zyxinu je nezbytné pro subcelulární lokalizaci zyxinu a nábor alfa-aktininu“. J. Biol. Chem. 274 (19): 13410–8. doi:10.1074 / jbc.274.19.13410. PMID 10224105.

[pmid11423549-15] Li B, Trueb B (září 2001). „Analýza interakce alfa-aktinin / zyxin“. J. Biol. Chem. 276 (36): 33328–35. doi:10,1074 / jbc.M100789200. PMID 11423549.

[pmid16973135-16] Besco JA, Hooft van Huijsduijnen R, Frostholm A, Rotter A (2006). "Intracelulární substráty mozkem obohaceného receptorového proteinu tyrosin fosfatázy rho (RPTPrho / PTPRT)". Brain Res. 1116 (1): 50–7. doi:10.1016 / j.brainres.2006.07.122. PMID 16973135.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]