CDK5R1 - CDK5R1

CDK5R1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1H4L, 1UNG, 1UNH, 1UNL, 3O0G
Identifikátory
Aliasy	CDK5R1, CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, cyklin-dependentní kináza 5, regulační podjednotka 1 (p35), cyklin-dependentní kináza 5 regulační podjednotka 1
Externí ID	OMIM: 603460 MGI: 101764 HomoloGene: 31200 Genové karty: CDK5R1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	32,491,253 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	80,481,184 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita proteinkinázy; • vazba iontů vápníku; • vazba na efrinový receptor; • kadherinová vazba; • GO: 0016534 aktivita aktivátoru proteinu serin / threonin kinázy závislá na cyklinu; • kinázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba protein kinázy; • aktivita aktivátoru proteinové serin / threonin kinázy; • vazba proteázy; • aktinová vazba; • vazba ionotropního glutamátového receptoru; • vazba alfa-tubulinu; • vazba beta-tubulinu; • vazba aktinového vlákna; • aktivita aktivátoru proteinkinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota; • intracelulární membránou vázaná organela; • růstový kužel; • neuromuskulární spojení; • dendritická páteř; • axon; • tělo neuronových buněk; • dendrit; • komplex holoenzymu protein-kinázy 5 závislý na cyklinu; • perinukleární oblast cytoplazmy; • kontraktilní vlákno; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • buněčná membrána; • mikrotubuly; • neuronová projekce; • presynapse;
Biologický proces	• pozitivní regulace aktivity proteinkinázy; • regulace neuronové diferenciace; • Signální dráha acetylcholinového receptoru spojená s G-proteinem; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • regulace organizace aktinového cytoskeletu; • vývoj embryí; • rytmický proces; • signální dráha receptoru efrinu; • adheze neuronů mezi buňkami; • regulace organizace mikrotubulárního cytoskeletu; • migrace neuronů; • vývoj mozečku; • pozitivní regulace aktivity proteinové serin / threonin kinázy; • pozitivní regulace neuronového apoptotického procesu; • vývoj mozku; • signální dráha ionotropního glutamátového receptoru; • tvorba vrstvy v mozkové kůře; • peptidyl-serinová fosforylace; • neuronová diferenciace; • buněčná proliferace; • peptidyl-threoninová fosforylace; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • vývoj neuronové projekce; • mozková kůra radiálně orientovaná migrace buněk; • axonální fasciculace; • vývoj hipokampu; • negativní regulace prodloužení axonu; • regulace morfogeneze dendritické páteře; • regulace makroautofagie; • vynikající zrání olivového jádra; • pozitivní regulace zástavy buněčného cyklu; • pozitivní regulace cílení proteinů na membránu; • axonové vedení; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • serinová fosforylace STAT proteinu; • organizace mikrotubulů cytoskeletu; • vývoj embryí končící narozením nebo líhnutím vajec; • pozitivní regulace polymerace mikrotubulů; • pozitivní regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kinázy; • regulace cyklu synaptických vezikul; • aktivace aktivity proteinkinázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8851
	12569
	ENSG00000176749
	ENSMUSG00000048895
	Q15078
	P61809
	NM_003885
	NM_009871
	NP_003876
	NP_034001
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aktivátor kinázy 5 závislý na cyklinu 1 je enzym že u lidí je kódován CDK5R1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem (p35) je neuronově specifický aktivátor cyklin-dependentní kináza 5 (CDK5); aktivace CDK5 je nutná pro správný vývoj centrálního nervového systému. Forma p35 tohoto proteinu je proteolyticky štěpena calpain, generování formuláře p25. Štěpení p35 na p25 vede k přemístění proteinu z periferní oblasti buňky do jaderné a perinukleární oblasti. P25 dereguluje aktivitu CDK5 prodloužením jeho aktivace a změnou jeho buněčného umístění. Forma p25 se hromadí v mozkových neuronech pacientů s Alzheimerovou chorobou. Tato akumulace koreluje se zvýšením aktivity kinázy CDK5 a může vést k aberantně fosforylovaným formám proteinu tau spojeného s mikrotubuly, což přispívá k Alzheimerova choroba.^[6]

V melanocytických buňkách může být exprese genu CDK5R1 regulována MITF.^[7]

Interakce

CDK5R1 bylo prokázáno komunikovat s:

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176749 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048895 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tsai LH, Delalle I, Caviness VS Jr, Chae T, Harlow E (říjen 1994). „p35 je neurálně specifická regulační podjednotka cyklin-dependentní kinázy 5“. Příroda. 371 (6496): 419–23. doi:10.1038 / 371419a0. PMID 8090221. S2CID 4267944.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDK5R1 cyklin-dependentní kináza 5, regulační podjednotka 1 (p35)".
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM a kol. (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.
^ Cheng K, Li Z, Fu WY, Wang JH, Fu AK, Ip NY (srpen 2002). „Pctaire1 interaguje s p35 a je novým substrátem pro Cdk5 / p35“. J. Biol. Chem. 277 (35): 31988–93. doi:10,1074 / jbc.M201161200. PMID 12084709.
^ Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI, Ochoa GC, Tsai LH, De Camilli P (březen 2001). „Amfifyzin 1 váže regulační podjednotku p35 na cyklin-dependentní kinázu (cdk) 5 a je fosforylován cdk5 a cdc2“. J. Biol. Chem. 276 (11): 8104–10. doi:10,1074 / jbc.M008932200. PMID 11113134.
^ Kesavapany S, Lau KF, McLoughlin DM, Brownlees J, Ackerley S, Leigh PN, Shaw CE, Miller CC (leden 2001). „p35 / cdk5 váže a fosforyluje beta-katenin a reguluje interakci beta-katenin / presenilin-1“. Eur. J. Neurosci. 13 (2): 241–7. doi:10.1046 / j.1460-9568.2001.01376.x. PMID 11168528.
^ Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (září 2002). „Aktivátory p35 a p39 závislé na cyklin-dependentní kináze 5 a p39 interagují s alfa-podjednotkou Ca2 + / kalmodulin-dependentní proteinové kinázy II a alfa-aktinin-1 způsobem závislým na vápníku“. J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.
^ Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (říjen 2000). "Identifikace společné asociační oblasti proteinu v neuronálním aktivátoru Cdk5". J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. doi:10,1074 / jbc.M004358200. PMID 10915792.
^ Chen F, Studzinski GP (červen 2001). „Exprese neuronového cyklin-dependentního aktivátoru kinázy 5 p35Nck5a v lidských monocytických buňkách je spojena s diferenciací“. Krev. 97 (12): 3763–7. doi:10.1182 / krev. V97.12.3763. PMID 11389014.
^ Tarricone C, Dhavan R, Peng J, Areces LB, Tsai LH, Musacchio A (září 2001). "Struktura a regulace komplexu CDK5-p25 (nck5a)". Mol. Buňka. 8 (3): 657–69. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4. PMID 11583627.
^ Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (březen 2002). „Proteinový SET váže neuronový aktivátor Cdk5 p35nck5a a moduluje aktivitu Cdk5 / p35nck5a“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7324–32. doi:10,1074 / jbc.M107270200. PMID 11741927.

Další čtení

Peruzzi F, Gordon J, Darbinian N, Amini S (2003). „Tat vyvolaná deregulace neuronové diferenciace a přežití cestou nervového růstového faktoru“. J. Neurovirol. 8 Suppl 2 (2): 91–6. doi:10.1080/13550280290167885. PMID 12491158.
Studzinski GP, Harrison JS (2003). "Neuronový cyklin-dependentní aktivátor kinázy 5 p35Nck5a a aktivita Cdk5 v monocytických buňkách". Leuku. Lymfom. 44 (2): 235–40. doi:10.1080/1042819021000030009. PMID 12688339. S2CID 30242995.
Takahashi M, Tomizawa K, Sato K a kol. (1995). "Nová tau-tubulin kináza z hovězího mozku". FEBS Lett. 372 (1): 59–64. doi:10.1016/0014-5793(95)00955-9. PMID 7556643. S2CID 42295269.
Tang D, Yeung J, Lee KY a kol. (1995). „Izoforma aktivátoru neuronové cyklin-dependentní kinázy 5 (Cdk5)“. J. Biol. Chem. 270 (45): 26897–903. doi:10.1074 / jbc.270.45.26897. PMID 7592934.
Chae T, Kwon YT, Bronson R a kol. (1997). "Myši bez p35, neuronově specifického aktivátoru Cdk5, vykazují defekty kortikální laminace, záchvaty a letalitu dospělých". Neuron. 18 (1): 29–42. doi:10.1016 / S0896-6273 (01) 80044-1. PMID 9010203. S2CID 18685470.
Poon RY, Lew J, Hunter T (1997). "Identifikace funkčních domén v neuronovém aktivačním proteinu Cdk5". J. Biol. Chem. 272 (9): 5703–8. doi:10.1074 / jbc.272.9.5703. PMID 9038181.
Fletcher AI, Shuang R, Giovannucci DR a kol. (1999). „Regulace exocytózy cyklin-dependentní kinázou 5 prostřednictvím fosforylace Munc18“. J. Biol. Chem. 274 (7): 4027–35. doi:10.1074 / jbc.274.7.4027. PMID 9933594.
Patrick GN, Zukerberg L, Nikolic M a kol. (2000). "Konverze p35 na p25 dereguluje aktivitu Cdk5 a podporuje neurodegeneraci". Příroda. 402 (6762): 615–22. doi:10.1038/45159. PMID 10604467. S2CID 4414281.
Ching YP, Qi Z, Wang JH (2000). "Klonování tří nových neuronálních proteinů vázajících se na aktivátor Cdk5". Gen. 242 (1–2): 285–94. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID 10721722.
Kwon YT, Gupta A, Zhou Y a kol. (2000). "Regulace adheze zprostředkované N-kadherinem kinázou p35-Cdk5". Curr. Biol. 10 (7): 363–72. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 00411-5. PMID 10753743. S2CID 16438320.
Lee MS, Kwon YT, Li M a kol. (2000). "Neurotoxicita indukuje štěpení p35 na p25 calpainem". Příroda. 405 (6784): 360–4. doi:10.1038/35012636. PMID 10830966. S2CID 205006589.
Wang X, Ching YP, Lam WH a kol. (2000). "Identifikace společné asociační oblasti proteinu v neuronálním aktivátoru Cdk5". J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. doi:10,1074 / jbc.M004358200. PMID 10915792.
Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI a kol. (2001). „Amfifyzin 1 váže regulační podjednotku p35 na cyklin-dependentní kinázu (cdk) 5 a je fosforylován cdk5 a cdc2“. J. Biol. Chem. 276 (11): 8104–10. doi:10,1074 / jbc.M008932200. PMID 11113134.
Kesavapany S, Lau KF, McLoughlin DM a kol. (2001). „p35 / cdk5 váže a fosforyluje beta-katenin a reguluje interakci beta-katenin / presenilin-1“. Eur. J. Neurosci. 13 (2): 241–7. doi:10.1046 / j.1460-9568.2001.01376.x. PMID 11168528.
Chen F, Studzinski GP (2001). „Exprese neuronového cyklin-dependentního aktivátoru kinázy 5 p35Nck5a v lidských monocytických buňkách je spojena s diferenciací“. Krev. 97 (12): 3763–7. doi:10.1182 / krev. V97.12.3763. PMID 11389014.
Tarricone C, Dhavan R, Peng J a kol. (2001). "Struktura a regulace komplexu CDK5-p25 (nck5a)". Mol. Buňka. 8 (3): 657–69. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4. PMID 11583627.
Rashid T, Banerjee M, Nikolic M (2002). „Fosforylace Pak1 kinázou p35 / Cdk5 ovlivňuje morfologii neuronů“. J. Biol. Chem. 276 (52): 49043–52. doi:10,1074 / jbc.M105599200. PMID 11604394.
Qu D, Li Q, Lim HY a kol. (2002). „Proteinový SET váže neuronový aktivátor Cdk5 p35nck5a a moduluje aktivitu Cdk5 / p35nck5a“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7324–32. doi:10,1074 / jbc.M107270200. PMID 11741927.
Patzke H, Tsai LH (2002). "Kalpainem zprostředkované štěpení aktivátoru cyklin-dependentní kinázy-5 p39 na p29". J. Biol. Chem. 277 (10): 8054–60. doi:10,1074 / jbc.M109645200. PMID 11784720.

externí odkazy

Člověk CDK5R1 umístění genomu a CDK5R1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176749 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000048895 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8090221-5] Tsai LH, Delalle I, Caviness VS Jr, Chae T, Harlow E (říjen 1994). „p35 je neurálně specifická regulační podjednotka cyklin-dependentní kinázy 5“. Příroda. 371 (6496): 419–23. doi:10.1038 / 371419a0. PMID 8090221. S2CID 4267944.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: CDK5R1 cyklin-dependentní kináza 5, regulační podjednotka 1 (p35)".

[pmid19067971-7] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM a kol. (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

[pmid12084709-8] Cheng K, Li Z, Fu WY, Wang JH, Fu AK, Ip NY (srpen 2002). „Pctaire1 interaguje s p35 a je novým substrátem pro Cdk5 / p35“. J. Biol. Chem. 277 (35): 31988–93. doi:10,1074 / jbc.M201161200. PMID 12084709.

[pmid11113134-9] Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI, Ochoa GC, Tsai LH, De Camilli P (březen 2001). „Amfifyzin 1 váže regulační podjednotku p35 na cyklin-dependentní kinázu (cdk) 5 a je fosforylován cdk5 a cdc2“. J. Biol. Chem. 276 (11): 8104–10. doi:10,1074 / jbc.M008932200. PMID 11113134.

[pmid11168528-10] Kesavapany S, Lau KF, McLoughlin DM, Brownlees J, Ackerley S, Leigh PN, Shaw CE, Miller CC (leden 2001). „p35 / cdk5 váže a fosforyluje beta-katenin a reguluje interakci beta-katenin / presenilin-1“. Eur. J. Neurosci. 13 (2): 241–7. doi:10.1046 / j.1460-9568.2001.01376.x. PMID 11168528.

[pmid12223541-11] Dhavan R, Greer PL, Morabito MA, Orlando LR, Tsai LH (září 2002). „Aktivátory p35 a p39 závislé na cyklin-dependentní kináze 5 a p39 interagují s alfa-podjednotkou Ca2 + / kalmodulin-dependentní proteinové kinázy II a alfa-aktinin-1 způsobem závislým na vápníku“. J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. PMC 6758084. PMID 12223541.

[pmid10915792-12] Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M, Wang JH (říjen 2000). "Identifikace společné asociační oblasti proteinu v neuronálním aktivátoru Cdk5". J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. doi:10,1074 / jbc.M004358200. PMID 10915792.

[pmid11389014-13] Chen F, Studzinski GP (červen 2001). „Exprese neuronového cyklin-dependentního aktivátoru kinázy 5 p35Nck5a v lidských monocytických buňkách je spojena s diferenciací“. Krev. 97 (12): 3763–7. doi:10.1182 / krev. V97.12.3763. PMID 11389014.

[pmid11583627-14] Tarricone C, Dhavan R, Peng J, Areces LB, Tsai LH, Musacchio A (září 2001). "Struktura a regulace komplexu CDK5-p25 (nck5a)". Mol. Buňka. 8 (3): 657–69. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4. PMID 11583627.

[pmid11741927-15] Qu D, Li Q, Lim HY, Cheung NS, Li R, Wang JH, Qi RZ (březen 2002). „Proteinový SET váže neuronový aktivátor Cdk5 p35nck5a a moduluje aktivitu Cdk5 / p35nck5a“. J. Biol. Chem. 277 (9): 7324–32. doi:10,1074 / jbc.M107270200. PMID 11741927.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]