Kynurenináza - Kynureninase
kynurenináza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Krystalová struktura Homo sapiens kynurenináza.[1] | |||||||||
Identifikátory | |||||||||
EC číslo | 3.7.1.3 | ||||||||
Číslo CAS | 9024-78-6 | ||||||||
Databáze | |||||||||
IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
PRIAM | profil | ||||||||
PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
Kynurenináza nebo L-kynurenin hydroláza (KYNU) (ES 3.7.1.3 ) je PLP závislý enzym který katalyzuje štěpení kynurenin (Kyn) do kyselina antranilová (Mravenec). Může také jednat 3hKyn (k výrobě 3hAnt ) a některé další (3-arylkarbonyl) -alaniny. Lidé exprimují jeden enzym kynureninázy, který je kódován KYNU gen nachází se na chromozomu 2.[6][7]
KYNU je součástí cesty pro katabolismus z Trp a biosyntéza NAD kofaktory z tryptofan (Trp).
Kynurenináza katalyzuje následující reakci:
- L-kynurenin + H2O = antranilát + L-alanin
Struktura
Kynurenináza patří k třída V skupina aspartátaminotransferáza nadčeleď strukturně homologního pyridoxal 5'-fosfátu (PLP ) závislé enzymy. Dosud byly stanoveny dvě struktury lidské kynureninázy rentgenovou difrakcí s rozlišením 2,0 a 1,7 Á.[1][8] Čtyřicet procent aminokyselin je uspořádáno do alfa šroubovice a dvanáct procent je uspořádáno do beta listů. Ukotvení kynureninového substrátu do aktivního místa naznačuje, že Asn-333 a His-102 jsou zapojeny do vazby na substrát.[1]
Funkce
V reakci KYNU usnadňuje PLP C.β-Cy štěpení vazby. Reakce probíhá podle stejných kroků jako reakce transaminace reakce, ale nehydrolyzuje tautomerizováno Schiffova základna. Navrhovaný reakční mechanismus zahrnuje útok enzymu nukleofil na karbonylovém uhlíku (Cy) tautomerizované 3hKyn-PLP Schiffovy báze. Následuje Cβ-Cy štěpení vazby za vzniku meziproduktu acyl-enzym spolu s tautomerizovaným aduktem Ala-PLP. Hydrolýzou acyl-enzymu se získá 3hAnt.
![]() Reakční mechanismus KYNU. Barevné schéma je následující: KYNU, PLP, názvy substrátů, anorganické molekuly, Skupina 3hAn, Alaina skupina |
Reference
- ^ A b C PDB: 2HZP; Lima S, Khristoforov R, Momany C, Phillips RS (březen 2007). "Krystalová struktura Homo sapiens kynureninase". Biochemie. 46 (10): 2735–44. doi:10.1021 / bi0616697. PMC 2531291. PMID 17300176.
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115919 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026866 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Alberati-Giani D, Buchli R, Malherbe P, Broger C, Lang G, Köhler C, Lahm HW, Cesura AM (červenec 1996). "Izolace a exprese cDNA klonu kódujícího lidskou kynureninázu". Eur. J. Biochem. 239 (2): 460–8. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0460u.x. PMID 8706755.
- ^ Toma S, Nakamura M, Toné S, Okuno E, Kido R, Breton J, Avanzi N, Cozzi L, Speciale C, Mostardini M, Gatti S, Benatti L (květen 1997). "Klonování a rekombinantní exprese krysy a lidské kynureninázy". FEBS Lett. 408 (1): 5–10. doi:10.1016 / S0014-5793 (97) 00374-8. PMID 9180257. S2CID 36265922.
- ^ PDB: 3E9K; Lima S, Kumar S, Gawandi V, Momany C, Phillips RS (leden 2009). „Krystalová struktura komplexu inhibitorů kyseliny kynureninázy-3-hydroxyhippurové Homo sapiens: vhled do molekulárního základu substrátové specificity kynureninázy“. J. Med. Chem. 52 (2): 389–96. doi:10.1021 / jm8010806. PMID 19143568.
Další čtení
- Lima S, Khristoforov R, Momany C, Phillips RS (2007). "Krystalová struktura Homo sapiens kynureninase". Biochemie. 46 (10): 2735–2744. doi:10.1021 / bi0616697. PMC 2531291. PMID 17300176.
- Heyes MP, Chen CY, Major EO, Saito K (1997). „Různé enzymy kynureninové dráhy omezují tvorbu kyseliny chinolinové různými typy lidských buněk“. Biochem. J. 326 (2): 351–6. doi:10.1042 / bj3260351. PMC 1218677. PMID 9291104.
- Rose JE, Behm FM, Drgon T a kol. (2010). „Personalizované odvykání kouření: interakce mezi dávkou nikotinu, závislostí a skóre genotypu při ukončení léčby“. Mol. Med. 16 (7–8): 247–53. doi:10.2119 / molmed.2009.00159. PMC 2896464. PMID 20379614.
- Zhang Y, Zhang KX, He X a kol. (2005). „[Polymorfismus genu kynureninázy v hypertenzní kandidátské chromozomální oblasti je spojen s esenciální hypertenzí]“. Zhonghua Xin Xue Guan Bing Za Zhi. 33 (7): 588–91. PMID 16080802.
- Inada J, Okuno E, Kimura M, Kido R (1984). "Intracelulární lokalizace a charakterizace 3-hydroxykynureninázy v lidských játrech". Int. J. Biochem. 16 (6): 623–8. doi:10.1016 / 0020-711x (84) 90031-4. PMID 6468727.
- Ubbink JB, Vermaak WJ, Bissbort SH (1991). "Vysoce účinný kapalinový chromatografický test úrovní aktivity lidských lymfocytů kynureninázy". J. Chromatogr. 566 (2): 369–75. doi:10.1016/0378-4347(91)80253-9. PMID 1939450.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Magni G, Amici A, Emanuelli M a kol. (2004). "Enzymologie NAD + homeostázy u člověka". Buňka. Mol. Life Sci. 61 (1): 19–34. doi:10.1007 / s00018-003-3161-1. PMID 14704851. S2CID 22041610.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Christensen M, Duno M, Lund AM a kol. (2007). "Xanthurenová acidurie způsobená mutací v KYNU kódující kynureninázu". J. Zdědit. Metab. Dis. 30 (2): 248–55. doi:10.1007 / s10545-007-0396-2. PMID 17334708. S2CID 13295336.
- Walsh HA, Botting NP (2002). "Čištění a biochemická charakterizace některých vlastností rekombinantní lidské kynureninázy". Eur. J. Biochem. 269 (8): 2069–74. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.02854.x. PMID 11985583.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
externí odkazy
- PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidskou kynureninázu