Methylmalonyl CoA epimeráza - Methylmalonyl CoA epimerase
| methylmalonyl CoA epimeráza | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| EC číslo | 5.1.99.1 | ||||||||
| Databáze | |||||||||
| IntEnz | IntEnz pohled | ||||||||
| BRENDA | Vstup BRENDA | ||||||||
| EXPASY | Pohled NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Vstup KEGG | ||||||||
| MetaCyc | metabolická cesta | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB struktur | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Genová ontologie | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| methylmalonyl CoA epimeráza | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||
| Symbol | MCEE | ||||||
| Gen NCBI | 84693 | ||||||
| HGNC | 16732 | ||||||
| OMIM | 608419 | ||||||
| RefSeq | NM_028626 | ||||||
| UniProt | Q96PE7 | ||||||
| Další údaje | |||||||
| EC číslo | 5.1.99.1 | ||||||
| Místo | Chr. 2 p13.3 | ||||||
| |||||||
Methylmalonyl CoA epimeráza (ES 5.1.99.1, methylmalonyl-CoA racemáza, methylmalonyl koenzym A racemáza, DL-methylmalonyl-CoA racemáza, 2-methyl-3-oxopropanoyl-CoA 2-epimeráza [nesprávné]) je enzym zahrnutý do něčeho, zůčastnit se čeho katabolismus mastných kyselin který je v člověku zakódován pomocí „MCEE“ gen umístěný na chromozom 2. Běžně a nesprávně je označován jako „methylmalonyl-CoA racemáza“. Není to racemase protože CoA skupina má dalších 5 stereocentra.
Struktura
„MCEE“ gen nachází se v oblasti 2p13 a obsahuje 4 exony a kóduje a protein , která má velikost přibližně 18 kDa a je umístěna k mitochondriální matice.[1] Existuje několik přirozených variant v aminokyselinových sekvencích. Struktura proteinu MCEE byla vyřešena pomocí Rentgenová krystalografie [2] při rozlišení 1,8 angstromu.
Funkce
Gen MCEE kóduje enzym, který přeměňuje D- a L-methylmalonyl-CoA během degradace aminokyseliny s rozvětveným řetězcem, liché mastné kyseliny o délce řetězce a další metabolity. Z hlediska biochemie katalyzuje reakci, která se mění (S)-methylmalonyl-CoA do (R) forma.[3][4] Tento enzym katalýzy následující chemická reakce
- (S) -methylmalonyl-CoA (R) -methylmalonyl-CoA
Methylmalonyl CoA epimeráza hraje důležitou roli v katabolismu mastné kyseliny s uhlíkovými řetězy liché délky. V katabolismu sudého řetězce nasycené mastné kyseliny, β-oxidační dráha rozkládá mastné acyl-CoA molekuly v opakovaných sekvencích čtyř reakcí za vzniku jedné acetyl CoA za opakovanou sekvenci. To znamená, že pro každé kolo β-oxidace je mastný acyl-Co-A zkrácen o dva uhlíky. Pokud by mastná kyselina začala s párným počtem uhlíků, mohl by tento proces rozložit celou nasycenou mastnou kyselinu na jednotky acetyl-CoA. Pokud by mastná kyselina začala s lichým počtem uhlíků, β-oxidace by rozložila mastný acyl-CoA dolů, dokud by tři uhlík propionyl-CoA je vytvořen. Aby se to změnilo na metabolicky užitečné sukcinyl-CoA, jsou zapotřebí tři reakce. Propionyl-CoA je nejprve karboxylován na (S) -methylmalonyl-CoA enzymem Propionyl-CoA karboxyláza. Methylmalonyl CoA epimeráza poté katalyzuje přesmyk (S) -methylmalonyl-CoA do (R) se tvoří v reakci, která používá a vitamin B12 kofaktor a rezonančně stabilizovaný karbanion středně pokročilí.[Citace je zapotřebí ] (R) -methylmalonyl-CoA se poté převede na sukcinyl-CoA v reakci katalyzované methylmalonyl-CoA mutáza.
Působí jako obecná základna, enzym abstrahuje proton z β-uhlíku (R) -methylmalonyl-CoA. To má za následek vznik karbaniontového meziproduktu, ve kterém je α-uhlík stabilizován rezonancí. Enzym pak působí jako obecná kyselina k protonaci β-uhlíku, což vede k tvorbě (S) -methylmalonyl-CoA.
Klinický význam
Mutace v příčinách genu MCEE nedostatek methymalonyl-CoA epimerázy (MCEED),[5] vzácný autosomálně recesivní vrozená chyba metabolismu v metabolismu aminokyselin aminokyseliny s rozvětveným řetězcem valin, leucin, a isoleucin. U pacientů s MCEED se může objevit život ohrožující novorozenec metabolická acidóza, hyperamonémie, potíže s krmením, a kóma.
Reference
- ^ „MCEE - Methylmalonyl-CoA epimeráza, mitochondriální prekurzor - Homo sapiens (člověk) - MCEE gen a protein“. www.uniprot.org.
- ^ Evropa, Proteinová datová banka v. „PDB 3rmu structure summary‹ Protein Data Bank in Europe (PDBe) ‹EMBL-EBI“. www.ebi.ac.uk.
- ^ Mazumder R, Sasakawa T, Kaziro Y, Ochoa S (říjen 1962). "Metabolismus kyseliny propionové ve zvířecích tkáních. IX. Methylmalonyl koenzym A racemáza". The Journal of Biological Chemistry. 237: 3065–8. PMID 13934211.
- ^ Overath P, Kellerman GM, Lynen F, Fritz HP, Keller HJ (1962). „[O mechanismu přesmyku methylmalonyl-Co A na sukcinyl-Co A. II. Pokusy o mechanismu působení methylmalonyl-Co A izomerázy a methylmalonyl-Co A racemázy]“. Biochemische Zeitschrift. 335: 500–18. PMID 14482843.
- ^ Bikker H, Bakker HD, Abeling NG, Poll-The BT, Kleijer WJ, Rosenblatt DS, Waterham HR, Wanders RJ, Duran M (červenec 2006). „Homozygotní nesmyslná mutace v genu pro methylmalonyl-CoA epimerázu (MCEE) vede k mírné methylmalonové acidurii“. Lidská mutace. 27 (7): 640–3. doi:10.1002 / humu.20373. PMID 16752391. S2CID 5821956.
externí odkazy
- methylmalonyl-CoA + epimeráza v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
