RNASEH1 - RNASEH1

RNASEH1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2QK9, 2QKB, 2QKK, 3BSU
Identifikátory
Aliasy	RNASEH1, H1RNA, RNH1, PEOB2, ribonukleáza H1
Externí ID	OMIM: 604123 MGI: 1335073 HomoloGene: 2202 Genové karty: RNASEH1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	3,558,333 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	28,659,589 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita nukleázy; • aktivita endonukleázy; • Aktivita hybridní ribonukleázy RNA-DNA; • aktivita ribonukleázy; • aktivita hydrolázy; • vazba iontů hořčíku; • vazba kovových iontů; • Vazba RNA; • vazba nukleové kyseliny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny; • RNA katabolický proces; • Replikace DNA, odstranění RNA primeru; • Hydrolýza fosfodiesterové vazby RNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, endonukleolytická;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	246243
	19819
	ENSG00000171865
	ENSMUSG00000020630
	O60930
	E9QLN8
NM_001286834; NM_001286837; NM_002936; NM_001378271; NM_001378272;
	NM_001378273
	NM_001286865; NM_011275
NP_001273763; NP_001273766; NP_002927; NP_001365200; NP_001365201;
	NP_001365202
	NP_001273794; NP_035405
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ribonukleáza H1 také známý jako RNáza H1 je enzym že u lidí je kódován RNASEH1 gen.^[5]^[6]^[7] RNáza H1 je nespecifická endonukleáza a katalyzuje štěpení RNA pomocí hydrolytického mechanismu.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171865 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020630 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ribonukleáza H1“.
^ ten Asbroek AL, van Groenigen M, Jakobs ME, Koevoets C, Janssen B, Baas F (červen 2002). „Ribonukleáza H1 se mapuje na chromozom 2 a má v lidském genomu alespoň tři lokusy pseudogenu.“ Genomika. 79 (6): 818–23. doi:10.1006 / geno.2002.6776. PMID 12036296.
^ Nowotny M, Gaidamakov SA, Ghirlando R, Cerritelli SM, Crouch RJ, Yang W (říjen 2007). „Struktura lidské RNázy H1 v komplexu s hybridem RNA / DNA: pohled na reverzní transkripci HIV“. Mol. Buňka. 28 (2): 264–76. doi:10.1016 / j.molcel.2007.08.015. PMID 17964265.

Další čtení

Nowotny M, Cerritelli SM, Ghirlando R a kol. (2008). „Specifické rozpoznávání hybridů RNA / DNA a zvýšení aktivity lidské RNázy H1 pomocí HBD“. EMBO J.. 27 (7): 1172–81. doi:10.1038 / emboj.2008.44. PMC 2323259. PMID 18337749.
Lima WF, Wu H, Nichols JG a kol. (2003). „Lidská RNáza H1 používá jeden tryptofan a dva lysiny k umístění enzymu na 3'-DNA / 5'-RNA konec heteroduplexního substrátu.“. J. Biol. Chem. 278 (50): 49860–7. doi:10,1074 / jbc.M306543200. PMID 14506260.
Lima WF, Rose JB, Nichols JG a kol. (2007). "Poziční vliv spirálové geometrie heteroduplexního substrátu na katalýzu lidské RNázy H1". Mol. Pharmacol. 71 (1): 73–82. doi:10,1124 / mol. 106,025429. PMID 17028157. S2CID 27765676.
Lima WF, Nichols JG, Wu H a kol. (2004). „Strukturální požadavky na katalytické místo heteroduplexního substrátu pro katalýzu lidskou RNázou H1“. J. Biol. Chem. 279 (35): 36317–26. doi:10,1074 / jbc.M405035200. PMID 15205459.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2005). „Signální sekvence a lapač klíčových slov in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA s oligopohraničením“. DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Wu H, Lima WF, Crooke ST (1999). "Vlastnosti klonované a exprimované lidské RNázy H1". J. Biol. Chem. 274 (40): 28270–8. doi:10.1074 / jbc.274.40.28270. PMID 10497183.
Frank P, Braunshofer-Reiter C, Pöltl A, Holzmann K (1998). "Klonování, subcelulární lokalizace a funkční exprese lidské RNázy HII". Biol. Chem. 379 (12): 1407–12. doi:10.1515 / bchm.1998.379.12.1407. PMID 9894807. S2CID 19692186.
Wu H, Lima WF, Zhang H a kol. (2004). „Stanovení úlohy lidské RNázy H1 ve farmakologii antisense léčiv podobných DNA“. J. Biol. Chem. 279 (17): 17181–9. doi:10,1074 / jbc.M311683200. PMID 14960586.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Lima WF, Wu H, Nichols JG a kol. (2003). „Aktivita lidské RNázy H1 je regulována jedinečným redoxním přepínačem vytvořeným mezi sousedními cysteiny“. J. Biol. Chem. 278 (17): 14906–12. doi:10,1074 / jbc.M211279200. PMID 12473655.
ten Asbroek AL, van Groenigen M, Nooij M, Baas F (2002). „Zapojení lidských ribonukleáz H1 a H2 do variace odpovědi buněk na antisense fosforothioátové oligonukleotidy“. Eur. J. Biochem. 269 (2): 583–92. doi:10.1046 / j.0014-2956.2001.02686.x. PMID 11856317.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Cerritelli SM, Crouch RJ (1998). "Klonování, exprese a mapování ribonukleáz H člověka a myši v souvislosti s bakteriální RNázou HI". Genomika. 53 (3): 300–7. doi:10.1006 / geno.1998.5497. PMID 9799596.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Cerritelli SM, Frolova EG, Feng C a kol. (2003). "Neschopnost produkovat mitochondriální DNA vede k embryonální letalitě u myší bez Rnaseh1." Mol. Buňka. 11 (3): 807–15. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00088-1. PMID 12667461.
Lima WF, Rose JB, Nichols JG a kol. (2007). "Lidská RNáza H1 rozlišuje mezi jemnými variacemi ve struktuře heteroduplexního substrátu". Mol. Pharmacol. 71 (1): 83–91. doi:10,1124 / mol 106,025015. PMID 17028158. S2CID 24995048.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O60930 (Lidská ribonukleáza H1 (RNASEH1)) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171865 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020630 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: ribonukleáza H1“.

[pmid12036296-6] ten Asbroek AL, van Groenigen M, Jakobs ME, Koevoets C, Janssen B, Baas F (červen 2002). „Ribonukleáza H1 se mapuje na chromozom 2 a má v lidském genomu alespoň tři lokusy pseudogenu.“ Genomika. 79 (6): 818–23. doi:10.1006 / geno.2002.6776. PMID 12036296.

[pmid17964265-7] Nowotny M, Gaidamakov SA, Ghirlando R, Cerritelli SM, Crouch RJ, Yang W (říjen 2007). „Struktura lidské RNázy H1 v komplexu s hybridem RNA / DNA: pohled na reverzní transkripci HIV“. Mol. Buňka. 28 (2): 264–76. doi:10.1016 / j.molcel.2007.08.015. PMID 17964265.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]