RFC1 - RFC1

RFC1
Protein RFC1 PDB 2EBU.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyRFC1, A1 omáčka, replikační faktor C podjednotka 1, MHCBFB, RFC, RECC1, A1, RFC140, PO-GA, CANVAS
Externí IDOMIM: 102579 MGI: 97891 HomoloGene: 2187 Genové karty: RFC1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 4 (lidský)
Chr.Chromozom 4 (lidský)[1]
Chromozom 4 (lidský)
Genomic location for RFC1
Genomic location for RFC1
Kapela4p14Start39,287,456 bp[1]
Konec39,366,375 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE RFC1 208021 s at fs.png

PBB GE RFC1 209085 x at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5981

19687

Ensembl

ENSG00000035928

ENSMUSG00000029191

UniProt

P35251

P35601

RefSeq (mRNA)

NM_001204747
NM_002913
NM_001363495
NM_001363496

NM_011258
NM_001347357
NM_001347358

RefSeq (protein)

NP_001191676
NP_002904
NP_001350424
NP_001350425

NP_001334286
NP_001334287
NP_035388

Místo (UCSC)Chr 4: 39,29 - 39,37 MbChr 5: 65,26 - 65,34 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Replikační faktor C podjednotka 1 je protein že u lidí je kódován RFC1 gen.[5][6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je velkou podjednotkou replikační faktor C., což je pět podjednotka DNA polymeráza doplňkový protein. Replikační faktor C je DNA-dependentní ATPáza, která je nutná pro replikaci a opravu eukaryotické DNA. Protein působí jako aktivátor DNA polymeráz, váže se na 3 'konec z primery a podporuje koordinovanou syntézu obou řetězců. Může také hrát roli v telomer stabilita.[6]

Interakce

RFC1 bylo prokázáno komunikovat s:

Klinický význam

Bialelické intronové expanze opakování (řada opakujících se nukleotidových sekvencí) v genu replikačního faktoru C podjednotky 1 (RFC1) může být příčinou cerebelární ataxie, neuropatie, syndrom vestibulární areflexie nebo CANVAS.[17] V poly (A) ocasu prvku AluSx3 v RFC1 je jedenáct opakování sekvence „AAAAG“, která se v rodinném CANVAS stává „AAGGG“ a liší se délkou od sekvence divokého typu. Tato mutace je také přítomna ve vysokém počtu sporadických případů ataxie s pozdním nástupem.[17] Mutantní bialelické intronové opakované expanze neovlivňují expresi RFC1 v periferní a mozkové tkáni pacienta, což naznačuje zjevnou ztrátu funkce tohoto genu.[17]

U pacientů s patogenní expanzí RFC1 se senzorická neuropatie jeví jako převládající rys a u pacientů se mohou také projevit příznaky jako cerebelární dysfunkce, vestibulární postižení a suchý spasmodický kašel, proto se u pacientů s těmito příznaky doporučuje genetické vyšetření.[18]

Kvůli diagnostickému překrytí s CANVAS vědci také zkoumali přítomnost expanzí RFC1 u patologicky potvrzených atrofie více systémů (MSA), ale zjistili podobnou frekvenci změn (0,7%) jako zdravá populace, což naznačuje, že RFC1 nemá při tomto onemocnění žádnou roli.[19]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000035928 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029191 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Luckow B, Bunz F, Stillman B, Lichter P, Schütz G (březen 1994). „Klonování, exprese a chromozomální lokalizace 140 kilodaltonové podjednotky replikačního faktoru C od myší a lidí“. Molekulární a buněčná biologie. 14 (3): 1626–34. doi:10.1128 / mcb.14.3.1626. PMC  358521. PMID  8114700.
  6. ^ A b „Entrez Gene: RFC1 replication factor C (activator 1) 1, 145kDa“.
  7. ^ A b Maruyama T, Farina A, Dey A, Cheong J, Bermudez VP, Tamura T a kol. (Září 2002). „Savčí bromodoménový protein, brd4, interaguje s replikačním faktorem C a inhibuje postup do S fáze“. Molekulární a buněčná biologie. 22 (18): 6509–20. doi:10.1128 / mcb.22.18.6509-6520.2002. PMC  135621. PMID  12192049.
  8. ^ Anderson LA, Perkins ND (srpen 2002). „Velká podjednotka replikačního faktoru C interaguje s histon-deacetylázou, HDAC1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 29550–4. doi:10,1074 / jbc.M200513200. PMID  12045192.
  9. ^ Fotedar R, Mossi R, Fitzgerald P, Rousselle T, Maga G, Brickner H a kol. (Srpen 1996). „Konzervovaná doména velké podjednotky replikačního faktoru C váže PCNA a působí jako dominantní negativní inhibitor replikace DNA v buňkách savců“. Časopis EMBO. 15 (16): 4423–33. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00815.x. PMC  452166. PMID  8861969.
  10. ^ Mossi R, Jónsson ZO, Allen BL, Hardin SH, Hübscher U (leden 1997). „Replikační faktor C interaguje s C-koncovou stranou nukleárního antigenu proliferujících buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (3): 1769–76. doi:10.1074 / jbc.272.3.1769. PMID  8999859.
  11. ^ van der Kuip H, Carius B, Haque SJ, Williams BR, Huber C, Fischer T (duben 1999). „Podjednotka p140 vázající DNA replikačního faktoru C je nadregulována v cyklických buňkách a asociuje se s regulačními proteiny buněčného cyklu fáze G1“. Journal of Molecular Medicine. 77 (4): 386–92. doi:10,1007 / s001090050365. PMID  10353443. S2CID  22183443.
  12. ^ Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (říjen 2002). „Proteomický přístup k identifikaci proteinů vázajících proliferující buněčný jaderný antigen (PCNA) v lyzátech lidských buněk. Identifikace lidského komplexu CHL12 / RFCs2-5 jako nového proteinu vázajícího PCNA“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40362–7. doi:10,1074 / jbc.M206194200. PMID  12171929.
  13. ^ Anderson LA, Perkins ND (leden 2003). "Regulace funkce RelA (p65) velkou podjednotkou replikačního faktoru C". Molekulární a buněčná biologie. 23 (2): 721–32. doi:10.1128 / mcb.23.2.721-732.2003. PMC  151544. PMID  12509469.
  14. ^ Ellison V, Stillman B (březen 1998). „Rekonstituce rekombinantního lidského replikačního faktoru C (RFC) a identifikace subkomplexu RFC s aktivitou ATPázy závislou na DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 273 (10): 5979–87. doi:10.1074 / jbc.273.10.5979. PMID  9488738.
  15. ^ Uhlmann F, Cai J, Flores-Rozas H, Dean FB, Finkelstein J, O'Donnell M, Hurwitz J (červen 1996). „Rekonstituce lidského replikačního faktoru C z jeho pěti podjednotek in vitro“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 93 (13): 6521–6. Bibcode:1996PNAS ... 93.6521U. doi:10.1073 / pnas.93.13.6521. PMC  39056. PMID  8692848.
  16. ^ Tomida J, Masuda Y, Hiroaki H, Ishikawa T, Song I, Tsurimoto T a kol. (Duben 2008). „Poškození DNA vyvolané ubikvitylací podjednotky RFC2 komplexu replikačního faktoru C“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (14): 9071–9. doi:10,1074 / jbc.M709835200. PMC  2431014. PMID  18245774.
  17. ^ A b C Cortese A, Simone R, Sullivan R, Vandrovcova J, Tariq H, Yau WY a kol. (Květen 2019). „Oprava autora: Bialelická expanze intronové repetice v RFC1 je častou příčinou ataxie s pozdním nástupem“. Genetika přírody. 51 (5): 920. doi:10.1038 / s41588-019-0422-r. PMC  6730635. PMID  31028356.
  18. ^ Cortese A, Tozza S, Yau WY, Rossi S, Beecroft SJ, Jaunmuktane Z a kol. (Únor 2020). "Cerebelární ataxie, neuropatie, syndrom vestibulární areflexie způsobený opakovanou expanzí RFC1". Mozek. 143 (2): 480–490. doi:10.1093 / brain / awz418. PMC  7009469. PMID  32040566.
  19. ^ Sullivan R, Yau WY, Chelban V, Rossi S, O'Connor E, Wood NW, et al. (Duben 2020). „RFC1 Intronic Repeat Expansions Absent in Pathologically Confirmed Multiple Systems Atrophy“. Poruchy pohybu. 35 (7): 1277–1279. doi:10,1002 / mds.28074. PMID  32333430. S2CID  216129457.

Další čtení