Alfa katalytická podjednotka DNA polymerázy - DNA polymerase alpha catalytic subunit - Wikipedia

POLA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1K0P, 1K18, 1N5G, 4Q5V, 4QCL, 4Y97, 5EXR, 5IUD
Identifikátory
Aliasy	POLA1, NSX, POLA, p180, polymeráza (řízená DNA), alfa 1, polymeráza (DNA) alfa 1, katalytická podjednotka, DNA polymeráza alfa 1, katalytická podjednotka, VEODS
Externí ID	OMIM: 312040 MGI: 99660 HomoloGene: 6802 Genové karty: POLA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	24,996,986 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	93,632,155 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • 4 vazby železa, 4 síry; • aktivita nukleotidyltransferázy; • vazba nukleosidů; • vazba klastru železo-síra; • vazba chromatinu; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • vazba protein kinázy; • Aktivita DNA řízené DNA polymerázy; • vazba nukleotidů; • Vazba DNA; • Vazba počátku replikace DNA; • vazba purinových nukleotidů; • aktivita heterodimerizace proteinu; • jednořetězcová vazba DNA; • vazba pyrimidinových nukleotidů;
Buněčná složka	• jaderný obal; • jaderná matice; • jádro; • chromatin; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • cytoplazma; • cytosol; • alfa DNA polymeráza: komplex primázy;
Biologický proces	• Syntéza DNA zapojená do opravy DNA; • prodlužování pramene; • regulace transkripce podílející se na přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu; • replikace DNA; • prodloužení předního vlákna; • buněčná proliferace; • GO: virový proces 0022415; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí nehomologního spojování konců; • Prodloužení řetězce DNA zapojené do replikace DNA; • Replikace DNA, syntéza RNA primeru; • údržba telomer prostřednictvím semi-konzervativní replikace; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • Zahájení replikace DNA; • Oprava DNA; • oprava nukleotidovou excizí; • Syntéza DNA zapojená do opravy excize poškození UV zářením; • zahájení mitotické replikace DNA; • syntéza primeru RNA zapojeného do replikace mitotické DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5422
	18968
	ENSG00000101868
	ENSMUSG00000006678
	P09884
	P33609
	NM_016937; NM_001330360; NM_001378303
	NM_008892
	NP_001317289; NP_058633; NP_001365232
	NP_032918
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Alfa katalytická podjednotka DNA polymerázy je enzym že u lidí je kódován POLA1 gen.^[5]

Sdílený peptid vázající primasu v archaeal PolD a eukaryotickém Polα

Funkce

Tento gen kóduje katalytickou podjednotku p180 DNA polymerázy α-primázy. Pol α je omezený procesivita a chybí mu 3 ′ exonukleáza aktivita pro korektury chyb. Není tedy vhodný pro efektivní a přesné kopírování dlouhých šablon (na rozdíl od Pol Delta a Epsilon). Místo toho hraje v replikaci omezenější roli. Pol α je zodpovědný za zahájení replikace DNA při počátcích replikace (na předním i zaostávajícím řetězci) a během syntézy Okazaki fragmenty na zaostávajícím vlákně. Komplex Pol α (komplex pol α-DNA primázy) se skládá ze čtyř podjednotek: katalytická podjednotka POLA1, regulační podjednotka POLA2, a malé a velké primasové podjednotky PRIM1 a PRIM2. Jakmile primáza vytvořila RNA primer, Pol α začne replikaci prodlužováním primeru ~ 20 nukleotidy.

Klinický význam

Kromě své role během replikace DNA hraje POLA1 roli v aktivaci interferonu typu I. Bylo zjištěno, že gen POLA1 je místem mutace vedoucí k Síťovaná pigmentová porucha vázaná na X (XLPDR), OMIM 301220 ). To vede ke změně sestřihu mRNA a snížení exprese proteinu POLA1 na úroveň, která nezhoršuje replikaci DNA. Snížení exprese POLA1 je doprovázeno výrazným snížením cytosolických hybridních molekul RNA: DNA a současnou hyperaktivací dráhy IRF3 s následnou nadprodukcí interferonů typu I.^[6]

Navíc nedostatek POLA1, typický pro XLPDR, také zhoršuje přímou cytotoxicitu NK buněk. Inhibice POLA1 nebo přirozený nedostatek (XLPDR) ovlivňují způsob vylučování lytických granulí směrem k cílovým buňkám. Výsledkem je, že NK buňky u pacientů s XLPDR vykazují funkční nedostatek. Je zajímavé, že nedostatek POLA1 typický pro XLPDR není spojen s žádným poškozením genomu nebo zastavením buněčného cyklu.^[7]^[8]

Zatímco mutace XLPDR sídlí v intronu 13, byly také popsány další somatické mutace v POLA1. Somatická mutace je spojena s hlubším nedostatkem POLA1, s vývojem v X-vázané mentální postižení (XLID). V případě mutací jiných než XLPDR vykazují kromě pacientů s interferonovým podpisem typu I mírné až střední známky intelektuálního postižení, zástava buněčného cyklu, přiměřený nízký vzrůst, mikrocefalie a hypogonadismus.^[9]

Interakce

Ukázalo se, že polymeráza alfa závislá na DNA (Pol α) komunikovat s MCM4 a GINS1,^[7] Protein retinoblastomu,^[10] PARP1^[11]^[12] a RBMS1.^[13]

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101868 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006678 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ "Entrez Gene: POLA1 polymeráza (řízená DNA), alfa 1".
^ Starokadomskyy P, Gemelli T, Rios JJ, Xing C, Wang RC, Li H, Pokatayev V, Dozmorov I, Khan S, Miyata N, Fraile G, Raj P, Xu Z, Xu Z, Ma L, Lin Z, Wang H , Yang Y, Ben-Amitai D, Orenstein N, Mussaffi H, Baselga E, Tadini G, Grunebaum E, Sarajlija A, Krzewski K, Wakeland EK, Yan N, de la Morena MT, Zinn AR, Burstein E (2016). „DNA polymeráza-α reguluje aktivaci interferonů typu I prostřednictvím cytosolické RNA: syntéza DNA“. Přírodní imunologie. 17 (5): 495–504. doi:10.1038 / ni.3409. PMC 4836962. PMID 27019227.
^ ^A ^b Starokadomskyy, Petro; Wilton, Katelynn M .; Krzewski, Konrad; Lopez, Adam; Sifuentes-Dominguez, Luis; Overlee, Bretaň; Chen, Qing; Ray, Ann; Gil-Krzewska, Aleksandra; Peterson, Mary; Kinch, Lisa N. (01.01.2019). "Poruchy NK buněk u X-vázané pigmentové retikulární poruchy". JCI Insight. 4 (21). doi:10.1172 / jci.insight.125688. ISSN 0021-9738. PMC 6948767. PMID 31672938.
^ Starokadomskyy, P .; Sifuentes-Dominguez, L .; Gemelli, T .; Zinn, A. R .; Dossi, M. T .; Mellado, C .; Bertrand, P .; Borzutzky, A .; Burstein, E. (listopad 2017). „Vývoj kožních projevů X-vázané pigmentové retikulární poruchy“. British Journal of Dermatology. 177 (5): e200 – e201. doi:10.1111 / bjd.15586. ISSN 0007-0963. PMC 5640471. PMID 28407217.
^ Van Esch H, Colnaghi R, Freson K, Starokadomskyy P, Zankl A, Backx L, Abramowicz I, Outwin E, Rohena L, Faulkner C, Leong GM, Newbury-Ecob RA, Challis RC, Õunap K, Jaeken J, Seuntjens E , Devriendt K, Burstein E, Low KJ, O'Driscoll M (duben 2019). „Vadná DNA polymeráza α-primáza vede k intelektuálnímu postižení spojenému s X spojenému s těžkou retardací růstu, mikrocefalií a hypogonadismem“. American Journal of Human Genetics. 104 (5): 957–967. doi:10.1016 / j.ajhg.2019.03.006. PMC 6506757. PMID 31006512.
^ Takemura M, Kitagawa T, Izuta S, Wasa J, Takai A, Akiyama T, Yoshida S (listopad 1997). „Fosforylovaný protein retinoblastomu stimuluje DNA polymerázu alfa“. Onkogen. 15 (20): 2483–92. doi:10.1038 / sj.onc.1201431. PMID 9395244.
^ Dantzer F, Nasheuer HP, Vonesch JL, de Murcia G, Ménissier-de Murcia J (duben 1998). „Funkční asociace poly (ADP-ribóza) polymerázy s komplexem DNA polymeráza alfa-primáza: souvislost mezi detekcí zlomení řetězce DNA a replikací DNA“. Nucleic Acids Res. 26 (8): 1891–8. doi:10.1093 / nar / 26.8.1891. PMC 147507. PMID 9518481.
^ Simbulan CM, Suzuki M, Izuta S, Sakurai T, Savoysky E, Kojima K, Miyahara K, Shizuta Y, Yoshida S (leden 1993). „Poly (ADP-ribóza polymeráza stimuluje DNA polymerázu alfa fyzickou asociací). J. Biol. Chem. 268 (1): 93–99. PMID 8416979.
^ Niki T, Galli I, Ariga H, Iguchi-Ariga SM (červen 2000). „MSSP, protein vázající se na počátek replikace v genu c-myc, interaguje s katalytickou podjednotkou DNA polymerázy alfa a stimuluje její polymerázovou aktivitu“. FEBS Lett. 475 (3): 209–12. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01679-3. PMID 10869558.

externí odkazy

PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro katalytickou podjednotku lidské DNA polymerázy alfa

Další čtení

Pollok S, Stoepel J, Bauerschmidt C, Kremmer E, Nasheuer HP (2003). „Regulace replikace eukaryotické DNA v iniciačním kroku“. Biochem. Soc. Trans. 31 (Pt 1): 266–9. doi:10.1042 / BST0310266. PMID 12546699.
Fisher PA, Korn D (1977). "DNA polymeráza-alfa. Čištění a strukturní charakterizace téměř homogenního enzymu z lidských buněk KB". J. Biol. Chem. 252 (18): 6528–35. PMID 893425.
Dornreiter I, Erdile LF, Gilbert IU, von Winkler D, Kelly TJ, Fanning E (1992). "Interakce DNA polymerázy alfa-primázy s buněčným replikačním proteinem A a SV40 T antigenem". EMBO J.. 11 (2): 769–76. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05110.x. PMC 556510. PMID 1311258.
Coverley D, Kenny MK, Lane DP, Wood RD (1992). „Role lidského jednovláknového proteinu vázajícího DNA HSSB / RPA v rané fázi opravy nukleotidové excize“. Nucleic Acids Res. 20 (15): 3873–80. doi:10.1093 / nar / 20.15.3873. PMC 334061. PMID 1508673.
Popanda O, Thielmann HW (1992). „Funkce DNA polymeráz při opravné syntéze DNA lidských fibroblastů ozářených ultrafialovým zářením“. Biochim. Biophys. Acta. 1129 (2): 155–60. doi:10.1016 / 0167-4781 (92) 90480-N. PMID 1730053.
Collins KL, Kelly TJ (1991). "Účinky T antigenu a replikačního proteinu A na zahájení syntézy DNA DNA polymerázou alfa-primázou". Mol. Buňka. Biol. 11 (4): 2108–15. doi:10.1128 / mcb.11.4.2108. PMC 359898. PMID 1848671.
Martelli AM, Cocco L, Manzoli FA (1991). "O asociaci aktivity DNA polymerázy alfa s jadernou matricí v buňkách HeLa". Cell Biol. Int. Rep. 15 (2): 131–40. doi:10.1016 / 0309-1651 (91) 90104-Q. PMID 1903085.
Pearson BE, Nasheuer HP, Wang TS (1991). „Lidský gen DNA polymerázy alfa: sekvence řídící expresi v buňkách stimulovaných cyklem a sérem“. Mol. Buňka. Biol. 11 (4): 2081–95. doi:10.1128 / mcb.11.4.2081. PMC 359896. PMID 2005899.
Matsumoto T, Eki T, Hurwitz J (1991). „Studie o reakcích iniciace a prodloužení v systému replikace DNA opičího viru 40“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 87 (24): 9712–6. doi:10.1073 / pnas.87.24.9712. PMC 55243. PMID 2175912.
Hsi KL, Copeland WC, Wang TS (1991). „Lidská DNA polymeráza alfa katalytický polypeptid váže ConA a RCA a obsahuje specifické labilní místo na N-konci“. Nucleic Acids Res. 18 (21): 6231–7. doi:10.1093 / nar / 18.21.6231. PMC 332486. PMID 2243771.
Wang TS, Pearson BE, Suomalainen HA, Mohandas T, Shapiro LJ, Schröder J, Korn D (1985). "Přiřazení genu pro lidskou DNA polymerázu alfa k chromozomu X". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82 (16): 5270–4. Bibcode:1985PNAS ... 82,5270W. doi:10.1073 / pnas.82.16.5270. PMC 390549. PMID 2410918.
Knorre DG, Lavrik OI, Nevinsky GA (1988). "Interakce protein-nukleová kyselina v reakcích katalyzovaných DNA polymerázami". Biochimie. 70 (5): 655–61. doi:10.1016/0300-9084(88)90250-7. PMID 3139084.
Nishida C, Reinhard P, Linn S (1988). „Syntéza opravy DNA v lidských fibroblastech vyžaduje delta DNA polymerázy“. J. Biol. Chem. 263 (1): 501–10. PMID 3335506.
Wong SW, Wahl AF, Yuan PM, Arai N, Pearson BE, Arai K, Korn D, Hunkapiller MW, Wang TS (1988). „Exprese genu alfa pro lidskou DNA polymerázu je závislá na proliferaci buněk a její primární struktura je podobná prokaryotické i eukaryotické replikativní DNA polymerázy.“. EMBO J.. 7 (1): 37–47. doi:10.1002 / j.1460-2075.1988.tb02781.x. PMC 454213. PMID 3359994.
Tsuda M, Masujama M, Katsunuma T (1986). „Inhibice lidské DNA polymerázy alfa alfa 1-antichymotrypsinem“. Cancer Res. 46 (12 Pt 1): 6139–42. PMID 3490907.
Jackson DA, Cook PR (1987). "Různé populace DNA polymerázy alfa v buňkách HeLa". J. Mol. Biol. 192 (1): 77–86. doi:10.1016/0022-2836(86)90465-1. PMID 3820307.
Miller MR, Seighman C, Ulrich RG (1986). „Inhibice replikace DNA a aktivity DNA polymerázy alfa monoklonálními anti- (DNA polymeráza alfa) imunoglobulinovými fragmenty G a F (ab)“. Biochemie. 24 (25): 7440–5. doi:10.1021 / bi00346a061. PMID 4084590.
Bensch KG, Tanaka S, Hu SZ, Wang TS, Korn D (1982). "Intracelulární lokalizace lidské DNA polymerázy alfa s monoklonálními protilátkami". J. Biol. Chem. 257 (14): 8391–6. PMID 7045121.
Tanaka S, Hu SZ, Wang TS, Korn D (1982). "Příprava a předběžná charakterizace monoklonálních protilátek proti lidské DNA polymeráze alfa". J. Biol. Chem. 257 (14): 8386–90. PMID 7085672.
Eckert KA, Kunkel TA (1993). "Přesnost syntézy DNA katalyzovaná lidskou DNA polymerázou alfa a HIV-1 reverzní transkriptázou: účinek reakčního pH". Nucleic Acids Res. 21 (22): 5212–20. doi:10.1093 / nar / 21.22.5212. PMC 310639. PMID 7504813.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101868 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006678 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] "Entrez Gene: POLA1 polymeráza (řízená DNA), alfa 1".

[pmid27019227-6] Starokadomskyy P, Gemelli T, Rios JJ, Xing C, Wang RC, Li H, Pokatayev V, Dozmorov I, Khan S, Miyata N, Fraile G, Raj P, Xu Z, Xu Z, Ma L, Lin Z, Wang H , Yang Y, Ben-Amitai D, Orenstein N, Mussaffi H, Baselga E, Tadini G, Grunebaum E, Sarajlija A, Krzewski K, Wakeland EK, Yan N, de la Morena MT, Zinn AR, Burstein E (2016). „DNA polymeráza-α reguluje aktivaci interferonů typu I prostřednictvím cytosolické RNA: syntéza DNA“. Přírodní imunologie. 17 (5): 495–504. doi:10.1038 / ni.3409. PMC 4836962. PMID 27019227.

[:0-7] A ^b Starokadomskyy, Petro; Wilton, Katelynn M .; Krzewski, Konrad; Lopez, Adam; Sifuentes-Dominguez, Luis; Overlee, Bretaň; Chen, Qing; Ray, Ann; Gil-Krzewska, Aleksandra; Peterson, Mary; Kinch, Lisa N. (01.01.2019). "Poruchy NK buněk u X-vázané pigmentové retikulární poruchy". JCI Insight. 4 (21). doi:10.1172 / jci.insight.125688. ISSN 0021-9738. PMC 6948767. PMID 31672938.

[8] Starokadomskyy, P .; Sifuentes-Dominguez, L .; Gemelli, T .; Zinn, A. R .; Dossi, M. T .; Mellado, C .; Bertrand, P .; Borzutzky, A .; Burstein, E. (listopad 2017). „Vývoj kožních projevů X-vázané pigmentové retikulární poruchy“. British Journal of Dermatology. 177 (5): e200 – e201. doi:10.1111 / bjd.15586. ISSN 0007-0963. PMC 5640471. PMID 28407217.

[pmid31006512-9] Van Esch H, Colnaghi R, Freson K, Starokadomskyy P, Zankl A, Backx L, Abramowicz I, Outwin E, Rohena L, Faulkner C, Leong GM, Newbury-Ecob RA, Challis RC, Õunap K, Jaeken J, Seuntjens E , Devriendt K, Burstein E, Low KJ, O'Driscoll M (duben 2019). „Vadná DNA polymeráza α-primáza vede k intelektuálnímu postižení spojenému s X spojenému s těžkou retardací růstu, mikrocefalií a hypogonadismem“. American Journal of Human Genetics. 104 (5): 957–967. doi:10.1016 / j.ajhg.2019.03.006. PMC 6506757. PMID 31006512.

[pmid9395244-10] Takemura M, Kitagawa T, Izuta S, Wasa J, Takai A, Akiyama T, Yoshida S (listopad 1997). „Fosforylovaný protein retinoblastomu stimuluje DNA polymerázu alfa“. Onkogen. 15 (20): 2483–92. doi:10.1038 / sj.onc.1201431. PMID 9395244.

[pmid9518481-11] Dantzer F, Nasheuer HP, Vonesch JL, de Murcia G, Ménissier-de Murcia J (duben 1998). „Funkční asociace poly (ADP-ribóza) polymerázy s komplexem DNA polymeráza alfa-primáza: souvislost mezi detekcí zlomení řetězce DNA a replikací DNA“. Nucleic Acids Res. 26 (8): 1891–8. doi:10.1093 / nar / 26.8.1891. PMC 147507. PMID 9518481.

[12] Simbulan CM, Suzuki M, Izuta S, Sakurai T, Savoysky E, Kojima K, Miyahara K, Shizuta Y, Yoshida S (leden 1993). „Poly (ADP-ribóza polymeráza stimuluje DNA polymerázu alfa fyzickou asociací). J. Biol. Chem. 268 (1): 93–99. PMID 8416979.

[pmid10869558-13] Niki T, Galli I, Ariga H, Iguchi-Ariga SM (červen 2000). „MSSP, protein vázající se na počátek replikace v genu c-myc, interaguje s katalytickou podjednotkou DNA polymerázy alfa a stimuluje její polymerázovou aktivitu“. FEBS Lett. 475 (3): 209–12. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01679-3. PMID 10869558.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]