MCM6 - MCM6

MCM6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KLQ, 2LE8
Identifikátory
Aliasy	MCM6, MCG40308, Mis5, P105MCM, složka pro údržbu minichromozomů 6
Externí ID	OMIM: 601806 MGI: 1298227 HomoloGene: 4322 Genové karty: MCM6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	135,876,443 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	128,359,664 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• identická vazba na protein; • jednořetězcová vazba DNA; • vazba nukleotidů; • GO: 0004003 aktivita DNA helikázy; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • Vazba počátku replikace DNA; • jednovláknová DNA závislá na ATP závislá 3'-5 'aktivita DNA helikázy;
Buněčná složka	• MCM komplex; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Fáze G1; • replikace DNA; • buněčný cyklus; • Zahájení replikace DNA; • Odvíjení DNA zapojené do replikace DNA; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí replikace vyvolané zlomem; • pre-replikativní sestava komplexu zapojená do replikace DNA jaderného buněčného cyklu; • replikace mitotické DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	4175
	17219
	ENSG00000076003
	ENSMUSG00000026355
	Q14566
	P97311
	NM_005915
	NM_008567; NM_001313695
	NP_005906
	NP_001300624; NP_032593
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Licenční faktor replikace DNA MCM6 je protein že u lidí je kódován MCM6 gen.^[5] MCM6 je jedním z vysoce konzervovaných mini-chromozomových udržovacích proteinů (MCM ), které jsou nezbytné pro zahájení eukaryotický genom replikace.

Funkce

Komplex MCM sestávající z MCM6 (tento protein) a MCM2, 4 a 7 má DNA helikáza činnost a může působit jako Odvíjení DNA enzym. Hexamerní proteinový komplex tvořený proteiny MCM je klíčovou složkou předreplikační komplex (pre-RC) a může se podílet na tvorbě replikačních vidlic a na náboru dalších proteinů souvisejících s replikací DNA. Fosforylace komplexu CDC2 kinázou snižuje aktivitu helikázy, což naznačuje roli v regulaci replikace DNA.^[6] Nedávno bylo prokázáno, že Mcm 6 silně interaguje Cdt1 na definovaných zbytcích mutací těchto cílových zbytků Wei et al. pozorován nedostatek náboru Cdt1 Mcm2-7 do pre-RC.^[7]

Gen

Gen MCM6, MCM6, je vyjádřen na velmi vysoké úrovni. MCM6 obsahuje 18 introny. Jako poslední existují 2 nepřekrývající se alternativy exony. The přepisy Zdá se, že se liší zkrácením 3 'konce, přítomností nebo nepřítomností 2 kazetových exonů, společných exonů s různými hranicemi.

MCM6 produkuje, alternativní sestřih, 3 různé transkripty, všechny s introny, domněle kódující 3 různé proteiny izoformy.

MCM6 obsahuje dva z regulačních regionů pro LCT gen kódující protein laktáza, který se nachází ve dvou z MCM6 introny, přibližně 14 kb (-13910) a 22 kb (-22018) před LCT.^[8] Ukázalo se, že zejména oblast (-13910) funguje in vitro jako zesilovač prvek schopný odlišně aktivovat transkripci LCT promotér.^[9]

Mutace v těchto oblastech jsou spojeny s tolerance laktózy do dospělého života.^[8]^[10]

Interakce

MCM6 bylo prokázáno komunikovat s:

Viz také

Údržba mini chromozomu

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000076003 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026355 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Harvey CB, Wang Y, Darmoul D, Phillips A, Mantei N, Swallow DM (prosinec 1996). "Charakterizace lidského homologu genu pro cyklus buněčného dělení kvasinek, MCM6, který se nachází v sousedství 5 'konce laktázového genu na chromozomu 2q21". FEBS Lett. 398 (2–3): 135–40. doi:10.1016 / S0014-5793 (96) 01189-1. PMID 8977093. S2CID 1323113.
^ „Entrez Gene: MCM6 minichromosome maintenance deficient 6 homolog (S. cerevisiae)“.
^ Wei Z, Liu C, Wu X, Xu N, Zhou B, Liang C, Zhu G (březen 2010). "Charakterizace a stanovení struktury vazebné domény Cdt1 udržování lidských minichromozomů (Mcm) 6". J Biol Chem. 285 (17): 12469–73. doi:10.1074 / jbc.C109.094599. PMC 2857124. PMID 20202939.
^ ^A ^b Enattah NS, Sahi T, Savilahti E, Terwilliger JD, Peltonen L, Järvelä I (únor 2002). "Identifikace varianty spojené s hypolaktázií dospělého typu". Nat. Genet. 30 (2): 233–7. doi:10.1038 / ng826. PMID 11788828. S2CID 21430931.
^ Olds LC, Sibley E (září 2003). „Varianta persistence laktázy DNA zvyšuje aktivitu promotoru laktázy in vitro: funkční role jako regulační prvek cis“. Hučení. Mol. Genet. 12 (18): 2333–40. doi:10,1093 / hmg / ddg244. PMID 12915462.
^ Mattar R, de Campos Mazo DF, Carrilho FJ (2012). „Intolerance laktózy: diagnostické, genetické a klinické faktory“. Clin Exp Gastroenterol. 5: 113–21. doi:10,2147 / CEG.S32368. PMC 3401057. PMID 22826639. „Dvě varianty byly spojeny s perzistencí laktázy ...“
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (březen 2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.
^ ^A ^b Yabuta N, Kajimura N, Mayanagi K, Sato M, Gotow T, Uchiyama Y, Ishimi Y, Nojima H (květen 2003). „Savčí komplex Mcm2 / 4/6/7 tvoří toroidní strukturu“. Geny buňky. 8 (5): 413–21. doi:10.1046 / j.1365-2443.2003.00645.x. PMID 12694531. S2CID 27707848.
^ ^A ^b ^C You Z, Ishimi Y, Masai H, Hanaoka F (listopad 2002). „Role podjednotek Mcm7 a Mcm4 v aktivitě DNA helikázy myšího komplexu Mcm4 / 6/7“. J. Biol. Chem. 277 (45): 42471–9. doi:10,1074 / jbc.M205769200. PMID 12207017.
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ You Z, Komamura Y, Ishimi Y (prosinec 1999). „Biochemická analýza vnitřní aktivity DNA helikázy Mcm4-Mcm6-mcm7“. Mol. Buňka. Biol. 19 (12): 8003–15. doi:10.1128 / MCB.19.12.8003. PMC 84885. PMID 10567526.
^ Ishimi Y, Ichinose S, Omori A, Sato K, Kimura H (září 1996). "Vazba lidských proteinů na udržování minichromozomů s histonem H3". J. Biol. Chem. 271 (39): 24115–22. doi:10.1074 / jbc.271.39.24115. PMID 8798650.
^ Fujita M, Kiyono T, Hayashi Y, Ishibashi M (duben 1997). "In vivo interakce lidských MCM heterohexamerních komplexů s chromatinem. Možné zapojení ATP". J. Biol. Chem. 272 (16): 10928–35. doi:10.1074 / jbc.272.16.10928. PMID 9099751.

Další čtení

Ishimi Y, Ichinose S, Omori A, Sato K, Kimura H (1996). "Vazba lidských proteinů na udržování minichromozomů s histonem H3". J. Biol. Chem. 271 (39): 24115–22. doi:10.1074 / jbc.271.39.24115. PMID 8798650.
Holthoff HP, Hameister H, Knippers R (1997). "Nový lidský protein Mcm: homologie s kvasinkovým replikačním proteinem Mis5 a chromozomální umístění". Genomika. 37 (1): 131–4. doi:10.1006 / geno.1996.0530. PMID 8921380.
Tsuruga H, Yabuta N, Hosoya S, Tamura K, Endo Y, Nojima H (1997). „HsMCM6: nový člen lidské rodiny MCM / P1 kóduje protein homologní s štěpnými kvasinkami Mis5“. Geny buňky. 2 (6): 381–99. doi:10.1046 / j.1365-2443.1997.1290327.x. PMID 9286856. S2CID 12997515.
Ishimi Y (1997). „Aktivita DNA helikázy je spojena s proteinovým komplexem MCM4, -6 a -7“. J. Biol. Chem. 272 (39): 24508–13. doi:10.1074 / jbc.272.39.24508. PMID 9305914.
Holthoff HP, Baack M, Richter A, Ritzi M, Knippers R (1998). „Human protein MCM6 on HeLa cell chromatin“. J. Biol. Chem. 273 (13): 7320–5. doi:10.1074 / jbc.273.13.7320. PMID 9516426.
Ohtani K, Iwanaga R, Nakamura M, Ikeda M, Yabuta N, Tsuruga H, Nojima H (1999). "Exprese regulovaná růstem buněk savčích genů MCM5 a MCM6 zprostředkovaná transkripčním faktorem E2F". Onkogen. 18 (14): 2299–309. doi:10.1038 / sj.onc.1202544. PMID 10327050.
You Z, Komamura Y, Ishimi Y (2000). „Biochemická analýza vnitřní aktivity DNA helikázy Mcm4-Mcm6-mcm7“. Mol. Buňka. Biol. 19 (12): 8003–15. doi:10.1128 / MCB.19.12.8003. PMC 84885. PMID 10567526.
Ishimi Y, Komamura-Kohno Y, You Z, Omori A, Kitagawa M (2000). „Inhibice aktivity Mcm4,6,7 helikázy fosforylací s cyklinem A / Cdk2“. J. Biol. Chem. 275 (21): 16235–41. doi:10,1074 / jbc.M909040199. PMID 10748114.
Izumi M, Yanagi K, Mizuno T, Yokoi M, Kawasaki Y, Moon KY, Hurwitz J, Yatagai F, Hanaoka F (2001). „Lidský homolog Saccharomyces cerevisiae Mcm10 interaguje s replikačními faktory a disociuje z nukleárních struktur rezistentních na nukleázy ve fázi G (2)“. Nucleic Acids Res. 28 (23): 4769–77. doi:10.1093 / nar / 28.23.4769. PMC 115166. PMID 11095689.
Lee JK, Hurwitz J (2001). „Procesivní aktivita DNA helikázy komplexů udržujících minichromosomové proteiny 4, 6 a 7 vyžaduje rozvětvené struktury DNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (1): 54–9. Bibcode:2001PNAS ... 98 ... 54L. doi:10.1073 / pnas.98.1.54. PMC 14543. PMID 11136247.
Enattah NS, Sahi T, Savilahti E, Terwilliger JD, Peltonen L, Järvelä I (2002). "Identifikace varianty spojené s hypolaktázií dospělého typu". Nat. Genet. 30 (2): 233–7. doi:10.1038 / ng826. PMID 11788828. S2CID 21430931.
Yanagi K, Mizuno T, You Z, Hanaoka F (2002). „Myší geminin inhibuje nejen interakce Cdt1-MCM6, ale také novou vnitřní aktivitu vázání Cdt1 DNA“. J. Biol. Chem. 277 (43): 40871–80. doi:10,1074 / jbc.M206202200. PMID 12192004.
You Z, Ishimi Y, Masai H, Hanaoka F (2003). „Role podjednotek Mcm7 a Mcm4 v aktivitě DNA helikázy myšího komplexu Mcm4 / 6/7“. J. Biol. Chem. 277 (45): 42471–9. doi:10,1074 / jbc.M205769200. PMID 12207017.
Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / S0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.
Yabuta N, Kajimura N, Mayanagi K, Sato M, Gotow T, Uchiyama Y, Ishimi Y, Nojima H (2004). „Savčí komplex Mcm2 / 4/6/7 tvoří toroidní strukturu“. Geny buňky. 8 (5): 413–21. doi:10.1046 / j.1365-2443.2003.00645.x. PMID 12694531. S2CID 27707848.
Johnson EM, Kinoshita Y, Daniel DC (2003). „Nový člen rodiny proteinů MCM kódovaný lidským genem MCM8, umístěný kontrapodálně k GCD10 v chromozomovém pásmu 20p12.3-13“. Nucleic Acids Res. 31 (11): 2915–25. doi:10.1093 / nar / gkg395. PMC 156728. PMID 12771218.
Ramachandran N, Hainsworth E, Bhullar B, Eisenstein S, Rosen B, Lau AY, Walter JC, LaBaer J (2004). „Self-assembling protein microarrays“. Věda. 305 (5680): 86–90. Bibcode:2004Sci ... 305 ... 86R. doi:10.1126 / science.1097639. PMID 15232106. S2CID 20936301.
Yu Z, Feng D, Liang C (2004). "Párové interakce šesti lidských podjednotek MCM proteinu". J. Mol. Biol. 340 (5): 1197–206. doi:10.1016 / j.jmb.2004.05.024. PMID 15236977.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000076003 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026355 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8977093-5] Harvey CB, Wang Y, Darmoul D, Phillips A, Mantei N, Swallow DM (prosinec 1996). "Charakterizace lidského homologu genu pro cyklus buněčného dělení kvasinek, MCM6, který se nachází v sousedství 5 'konce laktázového genu na chromozomu 2q21". FEBS Lett. 398 (2–3): 135–40. doi:10.1016 / S0014-5793 (96) 01189-1. PMID 8977093. S2CID 1323113.

[entrez-6] „Entrez Gene: MCM6 minichromosome maintenance deficient 6 homolog (S. cerevisiae)“.

[pmid20202939-7] Wei Z, Liu C, Wu X, Xu N, Zhou B, Liang C, Zhu G (březen 2010). "Charakterizace a stanovení struktury vazebné domény Cdt1 udržování lidských minichromozomů (Mcm) 6". J Biol Chem. 285 (17): 12469–73. doi:10.1074 / jbc.C109.094599. PMC 2857124. PMID 20202939.

[Enattah_2002-8] A ^b Enattah NS, Sahi T, Savilahti E, Terwilliger JD, Peltonen L, Järvelä I (únor 2002). "Identifikace varianty spojené s hypolaktázií dospělého typu". Nat. Genet. 30 (2): 233–7. doi:10.1038 / ng826. PMID 11788828. S2CID 21430931.

[pmid12915462-9] Olds LC, Sibley E (září 2003). „Varianta persistence laktázy DNA zvyšuje aktivitu promotoru laktázy in vitro: funkční role jako regulační prvek cis“. Hučení. Mol. Genet. 12 (18): 2333–40. doi:10,1093 / hmg / ddg244. PMID 12915462.

[10] Mattar R, de Campos Mazo DF, Carrilho FJ (2012). „Intolerance laktózy: diagnostické, genetické a klinické faktory“. Clin Exp Gastroenterol. 5: 113–21. doi:10,2147 / CEG.S32368. PMC 3401057. PMID 22826639. „Dvě varianty byly spojeny s perzistencí laktázy ...“

[pmid12614612-11] A ^b ^C ^d ^E ^F Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (březen 2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.

[pmid12694531-12] A ^b Yabuta N, Kajimura N, Mayanagi K, Sato M, Gotow T, Uchiyama Y, Ishimi Y, Nojima H (květen 2003). „Savčí komplex Mcm2 / 4/6/7 tvoří toroidní strukturu“. Geny buňky. 8 (5): 413–21. doi:10.1046 / j.1365-2443.2003.00645.x. PMID 12694531. S2CID 27707848.

[pmid12207017-13] A ^b ^C You Z, Ishimi Y, Masai H, Hanaoka F (listopad 2002). „Role podjednotek Mcm7 a Mcm4 v aktivitě DNA helikázy myšího komplexu Mcm4 / 6/7“. J. Biol. Chem. 277 (45): 42471–9. doi:10,1074 / jbc.M205769200. PMID 12207017.

[pmid16189514-14] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid10567526-15] You Z, Komamura Y, Ishimi Y (prosinec 1999). „Biochemická analýza vnitřní aktivity DNA helikázy Mcm4-Mcm6-mcm7“. Mol. Buňka. Biol. 19 (12): 8003–15. doi:10.1128 / MCB.19.12.8003. PMC 84885. PMID 10567526.

[pmid8798650-16] Ishimi Y, Ichinose S, Omori A, Sato K, Kimura H (září 1996). "Vazba lidských proteinů na udržování minichromozomů s histonem H3". J. Biol. Chem. 271 (39): 24115–22. doi:10.1074 / jbc.271.39.24115. PMID 8798650.

[pmid9099751-17] Fujita M, Kiyono T, Hayashi Y, Ishibashi M (duben 1997). "In vivo interakce lidských MCM heterohexamerních komplexů s chromatinem. Možné zapojení ATP". J. Biol. Chem. 272 (16): 10928–35. doi:10.1074 / jbc.272.16.10928. PMID 9099751.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]