Replikační protein A - Replication protein A
Replikační protein A | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
(heterotrimer) | |||||||||||||
![]() Toto je obraz lidského replikačního proteinu A. Od PDB: 1L1O Proteopedia protein A Replikace protein A | |||||||||||||
Funkce | poškozená vazba DNA, vazba jednovláknové DNA | ||||||||||||
|

Replikační protein A (RPA) je hlavní protein který se váže na jednořetězcové DNA (ssDNA) v eukaryotický buňky.[1][2] In vitro „RPA vykazuje mnohem vyšší afinitu k ssDNA než RNA nebo dvouvláknová DNA.[3]
V době replikace DNA „RPA brání jednořetězcové DNA (ssDNA) v navíjení zpět na sebe nebo ve vytváření sekundárních struktur. To udržuje DNA odvinutou, aby ji polymeráza replikovala. RPA se také váže na ssDNA během počáteční fáze homologní rekombinace, důležitý proces v Oprava DNA a profáze I. z redukční dělení buněk.
Přecitlivělost na látky poškozující DNA může být způsobena mutacemi v genu RPA.[4] Stejně jako jeho role v replikaci DNA to udržuje ssDNA ve vazbě na sebe (samo se doplňující), takže výsledná nukleoprotein vlákno pak může být vázáno Rad51 a jeho kofaktory.[5]
RPA se také váže na DNA během oprava nukleotidové excize proces. Tato vazba stabilizuje opravný komplex během procesu opravy. Je vyvolán bakteriální homolog jednořetězcový vazebný protein (SSB).
Struktura
RPA je a heterotrimer, složený z podjednotek RPA1 (podjednotka 70 kDa), RPA2 (podjednotka 32 kDa) a RPA3 (podjednotka 14 kDa). Tři podjednotky RPA obsahují čtyři Sklady OB (vazba oligonukleotidů / oligosacharidů), na které se váže RPA jednořetězcová DNA.[2][3] RPA sdílí mnoho funkcí s CST komplex heterotrimer, ačkoli RPA má jednotnější poměr 1: 1: 1 stechiometrie.[6]
Viz také
Reference
- ^ Wold, MS (1997). „Replikační protein A: heterotrimerní, jednořetězcový protein vázající DNA potřebný pro metabolismus eukaryotické DNA“. Roční přehled biochemie. 66 (1): 61–92. doi:10,1146 / annurev.biochem. 66.1.61. PMID 9242902.
- ^ A b Chen R, Wold MS (2014). „Replikační protein A: jednovláknový první reagující DNA: dynamické interakce DNA umožňují replikačnímu proteinu A nasměrovat jednovláknové DNA meziprodukty do různých drah pro syntézu nebo opravu“. BioEssays. 36 (12): 1156–1161. doi:10.1002 / bies.201400107. PMC 4629251. PMID 25171654.
- ^ A b Flynn RL, Zou L (2010). „Oligonukleotidové / oligosacharidové vazebné skládací proteiny: rostoucí rodina strážců genomu“. Kritické recenze v biochemii a molekulární biologii. 45 (4): 266–275. doi:10.3109/10409238.2010.488216. PMC 2906097. PMID 20515430.
- ^ Zou, Yue; Liu, Yiyong; Wu, Xiaoming; Shell, Steven M. (01.08.2006). „Funkce lidského replikačního proteinu A (RPA): od replikace DNA po poškození DNA a stresové reakce“. Journal of Cellular Physiology. 208 (2): 267–273. doi:10.1002 / jcp.20622. ISSN 0021-9541. PMC 3107514. PMID 16523492.
- ^ Xuan, L; Wolf-Dietrich, H (2008). „Homologní rekombinace při opravě DNA a toleranci poškození DNA“. Cell Research. 18 (99): 99–113. doi:10.1038 / cr.2008.1. PMC 3087377. PMID 18166982.
- ^ Lue NF, Zhou R, Chico L, Mao N, Steinberg-Neifach O, Ha T (2013). „Komplex CST s omezením telomer má neobvyklou stechiometrii, umožňuje multipartitní interakci s G-Tails a rozkládá struktury G-ocasu vyššího řádu“ (PDF). Genetika PLOS. 9 (1): e1003145. doi:10.1371 / journal.pgen.1003145. PMC 3536697. PMID 23300477.