Replikační protein A1 - Replication protein A1

RPA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1EWI, 1FGU, 1JMC, 1L1O, 2B29, 2B3G, 4IJH, 4IJL, 4IPC, 4IPD, 4IPG, 4IPH, 4LUO, 4LUV, 4LUZ, 4LW1, 4LWC, 4NB3, 4O0A, 4R4C, 4R4I, 4R4O, 4R4Q, 4R4T, 5E7N, 5EAY
Identifikátory
Aliasy	RPA1, HSSB, MST075, REPA1, RF-A, RP-A, RPA70, replikační protein A1
Externí ID	OMIM: 179835 MGI: 1915525 HomoloGene: 2208 Genové karty: RPA1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	1,900,082 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	75,348,324 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba kovových iontů; • jednořetězcová vazba DNA; • poškozená vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba telomerické DNA na vlákno bohaté na G; • jednořetězcová telomerická vazba DNA; • sekvenčně specifická vazba DNA;
Buněčná složka	• Tělo PML; • nukleoplazma; • Komplex faktoru replikace DNA; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • buněčné jádro; • místo poškození DNA;
Biologický proces	• Replikace DNA závislá na DNA; • oprava nukleotidovou excizí, vyplnění mezery DNA; • DNA rekombinace; • oprava křížového propojení mezi řetězci; • bezchybná syntéza překladu; • Fáze G1; • syntéza překladu náchylná k chybám; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • replikace DNA; • regulace buněčné reakce na teplo; • oprava nesouladu; • syntéza překladů; • oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA; • Reakce poškození DNA, detekce poškození DNA; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 3'-k lézi; • oprava nukleotidovou excizí, řez DNA, 5'-k lézi; • oprava nukleotidovou excizí, stabilizace preincision komplexu; • oprava nukleotidovou excizí; • Oprava DNA; • oprava základní excize; • regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí homologní rekombinace; • oprava nukleotidovou excizí, preincision komplexní sestava; • lokalizace proteinu do chromozomu; • údržba telomer; • údržba telomer prostřednictvím semi-konzervativní replikace; • G1 / S přechod mitotického buněčného cyklu; • Odvíjení DNA zapojené do replikace DNA; • údržba telomer prostřednictvím telomerázy; • GO: 0007126 meiotický buněčný cyklus;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6117
	68275
	ENSG00000132383
	ENSMUSG00000000751
	P27694
	Q8VEE4
	NM_002945; NM_001355120; NM_001355121
	NM_001164223; NM_026653
	NP_002936; NP_001342049; NP_001342050
	NP_001157695; NP_080929
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Replikační protein A 70 kDa DNA vázající podjednotka je protein že u lidí je kódován RPA1 gen.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že replikační protein A1 komunikovat s:

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132383 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000751 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Kelly TJ (Duben 1993). "Klonování, nadměrná exprese a genomové mapování 14-kDa podjednotky lidského replikačního proteinu A". J Biol Chem. 268 (9): 6131–8. PMID 8454588.
^ Wong JM, Ionescu D, Ingles CJ (leden 2003). „Interakce mezi BRCA2 a replikačním proteinem A je ohrožena mutací predisponující k rakovině v BRCA2“. Onkogen. 22 (1): 28–33. doi:10.1038 / sj.onc.1206071. PMID 12527904.
^ Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (srpen 2000). „Replikační protein A fyzicky interaguje s proteinem Bloomova syndromu a stimuluje jeho aktivitu helikázy“. J. Biol. Chem. 275 (31): 23500–8. doi:10,1074 / jbc.M001557200. PMID 10825162.
^ Opresko PL, von Kobbe C, Laine JP, Harrigan J, Hickson ID, Bohr VA (říjen 2002). „Telomere-binding protein TRF2 se váže na a stimuluje helikázy Wernerova a Bloomova syndromu“. J. Biol. Chem. 277 (43): 41110–9. doi:10,1074 / jbc.M205396200. PMID 12181313.
^ Moens PB, Kolas NK, Tarsounas M, Marcon E, Cohen PE, Spyropoulos B (duben 2002). „Časový průběh a chromozomální lokalizace proteinů souvisejících s rekombinací při meióze u myší jsou kompatibilní s modely, které mohou vyřešit časné interakce DNA-DNA bez vzájemné rekombinace.“ J. Cell Sci. 115 (Pt 8): 1611–22. PMID 11950880.
^ ^A ^b ^C ^d ^E ^F Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (březen 2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.
^ Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (únor 2001). „Lidský homolog proteinu pro opravu MutY (hMYH) fyzicky interaguje s proteiny podílejícími se na opravě excize DNA na bázi dlouhé náplasti“. J. Biol. Chem. 276 (8): 5547–55. doi:10,1074 / jbc.M008463200. PMID 11092888.
^ Romanova LY, Willers H, Blagosklonny MV, Powell SN (prosinec 2004). „Interakce p53 s replikačním proteinem A zprostředkovává potlačení homologní rekombinace“. Onkogen. 23 (56): 9025–33. doi:10.1038 / sj.onc.1207982. PMID 15489903.
^ Riva F, Zuco V, Vink AA, Supino R, Prosperi E (prosinec 2001). „Řez DNA indukovaný UV zářením a nábor nukleárního antigenu proliferujících buněk do opravných míst se vyskytuje nezávisle na interakci proteinu A p53-replikace v buňkách p53 divokého typu a buňkách mutovaného ovariálního karcinomu“. Karcinogeneze. 22 (12): 1971–8. doi:10.1093 / carcin / 22.12.1971. PMID 11751427.
^ Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (březen 1999). „Poškození DNA zprostředkované replikací kamptotecinem indukuje fosforylaci RPA pomocí DNA-dependentní protein kinázy a disociuje komplexy RPA: DNA-PK“. EMBO J.. 18 (5): 1397–406. doi:10.1093 / emboj / 18.5.1397. PMC 1171229. PMID 10064605.
^ ^A ^b Bochkareva E, Korolev S, Lees-Miller SP, Bochkarev A (duben 2002). „Struktura RPA trimerizačního jádra a jeho role v vícestupňovém mechanismu vázání DNA RPA“. EMBO J.. 21 (7): 1855–63. doi:10.1093 / emboj / 21.7.1855. PMC 125950. PMID 11927569.
^ Bochkareva E, Frappier L, Edwards AM, Bochkarev A (únor 1998). „Podjednotka RPA32 lidského replikačního proteinu A obsahuje jednořetězcovou doménu vázající DNA“. J. Biol. Chem. 273 (7): 3932–6. doi:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID 9461578.
^ Unsal-Kaçmaz K, Chastain PD, Qu PP, Minoo P, Cordeiro-Stone M, Sancar A, Kaufmann WK (duben 2007). „Lidský komplex Tim / Tipin koordinuje reakci kontrolního bodu Intra-S na UV záření, která zpomaluje přemísťování replikační vidlice“. Mol. Buňka. Biol. 27 (8): 3131–42. doi:10.1128 / MCB.02190-06. PMC 1899931. PMID 17296725.
^ Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (srpen 2005). „53BP1 je spojen s replikačním proteinem A a je vyžadován pro hyperfosforylaci RPA2 po poškození DNA“. Onkogen. 24 (35): 5423–30. doi:10.1038 / sj.onc.1208710. PMID 15856006.
^ Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (říjen 1995). „Interakce mezi faktorem opravy DNA XPA a replikačním proteinem A se jeví nezbytná pro opravu excize nukleotidů“. Mol. Buňka. Biol. 15 (10): 5396–402. doi:10,1128 / mcb.15.10.5396. PMC 230789. PMID 7565690.

Další čtení

Iftode C, Daniely Y, Borowiec JA (1999). „Replikační protein A (RPA): eukaryotický SSB“. Krit. Biochem. Mol. Biol. 34 (3): 141–80. doi:10.1080/10409239991209255. PMID 10473346.
Binz SK, Sheehan AM, Wold MS (2005). "Replikační protein A fosforylace a buněčná odpověď na poškození DNA". Oprava DNA (Amst.). 3 (8–9): 1015–24. doi:10.1016 / j.dnarep.2004.03.028. PMID 15279788.
Dornreiter I, Erdile LF, Gilbert IU, von Winkler D, Kelly TJ, Fanning E (1992). "Interakce DNA polymerázy alfa-primázy s buněčným replikačním proteinem A a SV40 T antigenem". EMBO J.. 11 (2): 769–76. doi:10.1002 / j.1460-2075.1992.tb05110.x. PMC 556510. PMID 1311258.
Erdile LF, Heyer WD, Kolodner R, Kelly TJ (1991). "Charakterizace cDNA kódující 70-kDa jednořetězcovou podjednotku vázající DNA lidského replikačního proteinu A a role proteinu v replikaci DNA". J. Biol. Chem. 266 (18): 12090–8. PMID 2050703.
Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (1995). „Interakce mezi faktorem opravy DNA XPA a replikačním proteinem A se jeví nezbytná pro opravu excize nukleotidů“. Mol. Buňka. Biol. 15 (10): 5396–402. doi:10,1128 / mcb.15.10.5396. PMC 230789. PMID 7565690.
Keshav KF, Chen C, Dutta A (1995). „Rpa4, homolog 34-kilodaltonové podjednotky komplexu replikačního proteinu A“. Mol. Buňka. Biol. 15 (6): 3119–28. doi:10,1128 / mcb.15.6.3119. PMC 230543. PMID 7760808.
Umbricht CB, Griffin CA, Hawkins AL, Grzeschik KH, O'Connell P, Leach R, Green ED, Kelly TJ (1994). „Genomické mapování tří genů lidského replikačního proteinu A (RPA1, RPA2 a RPA3) s vysokým rozlišením“. Genomika. 20 (2): 249–57. doi:10.1006 / geno.1994.1161. PMID 8020972.
Gomes XV, Wold MS (1996). "Funkční domény 70kdaldaltonové podjednotky lidského replikačního proteinu A.". Biochemie. 35 (32): 10558–68. doi:10.1021 / bi9607517. PMID 8756712.
Bochkarev A, Pfuetzner RA, Edwards AM, Frappier L (1997). "Struktura jednořetězcové domény vázající DNA replikačního proteinu A navázaného na DNA". Příroda. 385 (6612): 176–81. doi:10.1038 / 385176a0. PMID 8990123. S2CID 4288187.
Amacker M, Hottiger M, Mossi R, Hübscher U (1997). „Nukleokapsidový protein HIV-1 a replikační protein A ovlivňují syntézu DNA vytěsnění řetězce lentivirové reverzní transkriptázy“. AIDS. 11 (4): 534–6. PMID 9084803.
Cujec TP, Cho H, Maldonado E, Meyer J, Reinberg D, Peterlin BM (1997). „Transaktivátor viru lidské imunodeficience Tat interaguje s holoenzymem RNA polymerázy II“. Mol. Buňka. Biol. 17 (4): 1817–23. doi:10.1128 / MCB.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429.
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (1998). „Identifikace replikace DNA a proteinů buněčného cyklu, které interagují s PCNA“. Nucleic Acids Res. 25 (24): 5041–6. doi:10.1093 / nar / 25.24.5041. PMC 147130. PMID 9396813.
Bochkareva E, Frappier L, Edwards AM, Bochkarev A (1998). „Podjednotka RPA32 lidského replikačního proteinu A obsahuje jednořetězcovou doménu vázající DNA“. J. Biol. Chem. 273 (7): 3932–6. doi:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID 9461578.
Golub EI, Gupta RC, Haaf T, Wold MS, Radding CM (1999). „Interaction of human rad51 recombination protein with single-stranded DNA binding protein, RPA“. Nucleic Acids Res. 26 (23): 5388–93. doi:10.1093 / nar / 26.23.5388. PMC 148005. PMID 9826763.
Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (1999). „Poškození DNA zprostředkované replikací kamptotecinem indukuje fosforylaci RPA pomocí DNA-dependentní protein kinázy a disociuje komplexy RPA: DNA-PK“. EMBO J.. 18 (5): 1397–406. doi:10.1093 / emboj / 18.5.1397. PMC 1171229. PMID 10064605.
Brosh RM, Orren DK, Nehlin JO, Ravn PH, Kenny MK, Machwe A, Bohr VA (1999). „Funkční a fyzická interakce mezi WRN helikázou a lidským replikačním proteinem A.“ J. Biol. Chem. 274 (26): 18341–50. doi:10.1074 / jbc.274.26.18341. PMID 10373438.
Kim ST, Lim DS, Canman CE, Kastan MB (2000). "Specifičnost substrátu a identifikace domnělých substrátů členů rodiny ATM kináz". J. Biol. Chem. 274 (53): 37538–43. doi:10.1074 / jbc.274.53.37538. PMID 10608806.
Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (2000). „Replikační protein A fyzicky interaguje s proteinem Bloomova syndromu a stimuluje jeho aktivitu helikázy“. J. Biol. Chem. 275 (31): 23500–8. doi:10,1074 / jbc.M001557200. PMID 10825162.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000132383 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000751 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8454588-5] Umbricht CB, Erdile LF, Jabs EW, Kelly TJ (Duben 1993). "Klonování, nadměrná exprese a genomové mapování 14-kDa podjednotky lidského replikačního proteinu A". J Biol Chem. 268 (9): 6131–8. PMID 8454588.

[pmid12527904-6] Wong JM, Ionescu D, Ingles CJ (leden 2003). „Interakce mezi BRCA2 a replikačním proteinem A je ohrožena mutací predisponující k rakovině v BRCA2“. Onkogen. 22 (1): 28–33. doi:10.1038 / sj.onc.1206071. PMID 12527904.

[pmid10825162-7] Brosh RM, Li JL, Kenny MK, Karow JK, Cooper MP, Kureekattil RP, Hickson ID, Bohr VA (srpen 2000). „Replikační protein A fyzicky interaguje s proteinem Bloomova syndromu a stimuluje jeho aktivitu helikázy“. J. Biol. Chem. 275 (31): 23500–8. doi:10,1074 / jbc.M001557200. PMID 10825162.

[pmid12181313-8] Opresko PL, von Kobbe C, Laine JP, Harrigan J, Hickson ID, Bohr VA (říjen 2002). „Telomere-binding protein TRF2 se váže na a stimuluje helikázy Wernerova a Bloomova syndromu“. J. Biol. Chem. 277 (43): 41110–9. doi:10,1074 / jbc.M205396200. PMID 12181313.

[pmid11950880-9] Moens PB, Kolas NK, Tarsounas M, Marcon E, Cohen PE, Spyropoulos B (duben 2002). „Časový průběh a chromozomální lokalizace proteinů souvisejících s rekombinací při meióze u myší jsou kompatibilní s modely, které mohou vyřešit časné interakce DNA-DNA bez vzájemné rekombinace.“ J. Cell Sci. 115 (Pt 8): 1611–22. PMID 11950880.

[pmid12614612-10] A ^b ^C ^d ^E ^F Kneissl M, Pütter V, Szalay AA, Grummt F (březen 2003). "Interakce a shromáždění myších pre-replikativních komplexních proteinů v kvasinkách a myších buňkách". J. Mol. Biol. 327 (1): 111–28. doi:10.1016 / s0022-2836 (03) 00079-2. PMID 12614612.

[pmid11092888-11] Parker A, Gu Y, Mahoney W, Lee SH, Singh KK, Lu AL (únor 2001). „Lidský homolog proteinu pro opravu MutY (hMYH) fyzicky interaguje s proteiny podílejícími se na opravě excize DNA na bázi dlouhé náplasti“. J. Biol. Chem. 276 (8): 5547–55. doi:10,1074 / jbc.M008463200. PMID 11092888.

[pmid15489903-12] Romanova LY, Willers H, Blagosklonny MV, Powell SN (prosinec 2004). „Interakce p53 s replikačním proteinem A zprostředkovává potlačení homologní rekombinace“. Onkogen. 23 (56): 9025–33. doi:10.1038 / sj.onc.1207982. PMID 15489903.

[pmid11751427-13] Riva F, Zuco V, Vink AA, Supino R, Prosperi E (prosinec 2001). „Řez DNA indukovaný UV zářením a nábor nukleárního antigenu proliferujících buněk do opravných míst se vyskytuje nezávisle na interakci proteinu A p53-replikace v buňkách p53 divokého typu a buňkách mutovaného ovariálního karcinomu“. Karcinogeneze. 22 (12): 1971–8. doi:10.1093 / carcin / 22.12.1971. PMID 11751427.

[pmid10064605-14] Shao RG, Cao CX, Zhang H, Kohn KW, Wold MS, Pommier Y (březen 1999). „Poškození DNA zprostředkované replikací kamptotecinem indukuje fosforylaci RPA pomocí DNA-dependentní protein kinázy a disociuje komplexy RPA: DNA-PK“. EMBO J.. 18 (5): 1397–406. doi:10.1093 / emboj / 18.5.1397. PMC 1171229. PMID 10064605.

[pmid11927569-15] A ^b Bochkareva E, Korolev S, Lees-Miller SP, Bochkarev A (duben 2002). „Struktura RPA trimerizačního jádra a jeho role v vícestupňovém mechanismu vázání DNA RPA“. EMBO J.. 21 (7): 1855–63. doi:10.1093 / emboj / 21.7.1855. PMC 125950. PMID 11927569.

[pmid9461578-16] Bochkareva E, Frappier L, Edwards AM, Bochkarev A (únor 1998). „Podjednotka RPA32 lidského replikačního proteinu A obsahuje jednořetězcovou doménu vázající DNA“. J. Biol. Chem. 273 (7): 3932–6. doi:10.1074 / jbc.273.7.3932. PMID 9461578.

[pmid17296725-17] Unsal-Kaçmaz K, Chastain PD, Qu PP, Minoo P, Cordeiro-Stone M, Sancar A, Kaufmann WK (duben 2007). „Lidský komplex Tim / Tipin koordinuje reakci kontrolního bodu Intra-S na UV záření, která zpomaluje přemísťování replikační vidlice“. Mol. Buňka. Biol. 27 (8): 3131–42. doi:10.1128 / MCB.02190-06. PMC 1899931. PMID 17296725.

[pmid15856006-18] Yoo E, Kim BU, Lee SY, Cho CH, Chung JH, Lee CH (srpen 2005). „53BP1 je spojen s replikačním proteinem A a je vyžadován pro hyperfosforylaci RPA2 po poškození DNA“. Onkogen. 24 (35): 5423–30. doi:10.1038 / sj.onc.1208710. PMID 15856006.

[pmid7565690-19] Li L, Lu X, Peterson CA, Legerski RJ (říjen 1995). „Interakce mezi faktorem opravy DNA XPA a replikačním proteinem A se jeví nezbytná pro opravu excize nukleotidů“. Mol. Buňka. Biol. 15 (10): 5396–402. doi:10,1128 / mcb.15.10.5396. PMC 230789. PMID 7565690.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]