Ephrin B2 - Ephrin B2

EFNB2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2HLE, 2I85, 2VSK, 2VSM, 2WO2, 3GXU, 4UF7
Identifikátory
Aliasy	EFNB2, EPLG5, HTKL, Htk-L, LERK5, ephrin B2
Externí ID	OMIM: 600527 MGI: 105097 HomoloGene: 3019 Genové karty: EFNB2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	106,535,662 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	8,661,242 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita virového receptoru; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na receptory; • vazba na efrinový receptor; • aktivita protein tyrosinkinázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • ohnisková adheze; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • Schafferův kolaterál - CA1 synapse; • glutamátergická synapse; • integrální součást presynaptické membrány; • integrální součást membrány postsynaptické hustoty;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • morfogeneze krevních cév; • negativní regulace množení keratinocytů; • regulace chemotaxe; • signalizace buňka-buňka; • anatomická struktura morfogeneze; • Kostimulace T buněk; • vývoj lymfatických cév; • vývoj nervového systému; • buněčná migrace zapojená do klíčení angiogeneze; • vývoj mnohobuněčných organismů; • buněčná adheze; • morfogeneze nefrického kanálu; • angiogeneze; • morfogeneze zvířecích orgánů; • virový vstup; • pozitivní regulace diferenciace buněk srdečního svalu; • GO: virový proces 0022415; • morfogeneze žilních krevních cév; • pozitivní regulace morfogeneze aorty; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • signální dráha receptoru efrinu; • axonové vedení; • negativní regulace vývoje projekce neuronů; • peptidyl-tyrosin fosforylace; • sestava presynapse; • regulace hladin receptoru neurotransmiteru postsynaptické membrány; • regulace internalizace receptoru postsynaptického neurotransmiteru; • pozitivní regulace neuronové smrti;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1948
	13642
	ENSG00000125266
	ENSMUSG00000001300
	P52799
	P52800
	NM_004093; NM_001372056; NM_001372057; NM_001372058
	NM_010111; NM_001368299
	NP_004084; NP_001358985; NP_001358986; NP_001358987
	NP_034241; NP_001355228
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ephrin-B2 je protein že u lidí je kódován EFNB2 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje člena ephrin (EPH) rodina. Efriny a receptory související s EPH tvoří největší podrodinu receptorových proteinů-tyrosin kináz a byly zapojeny do zprostředkování vývojových událostí, zejména v nervovém systému a v erytropoéza. Na základě jejich struktur a sekvenčních vztahů jsou efriny rozděleny do třídy ephrin-A (EFNA), které jsou ukotveny k membráně glykosylfosfatidylinositolovou vazbou, a třídy ephrin-B (EFNB), což jsou transmembránové proteiny. Tento gen kóduje efrin třídy EFNB, který se váže na EPHB4 a EPHA3 receptory.^[6]

Rakovina

Gen EFNB2 byl pozorován progresivně downregulovaný v Lidsky papillomavirus -pozitivní neoplastické keratinocyty odvozeno z děložního čípku preneoplastické léze na různých úrovních malignity.^[7] Z tohoto důvodu je EFNB2 pravděpodobně spojen s tumorigenezí a může být potenciálním prognostickým markerem pro děložní děložní hrdlo. preneoplastické léze postup.^[7]

Interakce

EFNB2 bylo prokázáno komunikovat s EPHA3^[8]^[9] a EPHB1 v optický chiasm rozvoj.^[10]

Bylo také prokázáno, že EFNB2 slouží jako receptor pro Virus Hendra a Nipah zprostředkování vstup během infekce do buňky.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125266 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001300 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bonaldo MF, Yu MT, Jelenc P, Brown S, Su L, Lawton L, Deaven L, Efstratiadis A, Warburton D, Soares MB (září 1994). "Výběr cDNA pomocí chromozomově specifických genomových klonů: aplikace na lidský chromozom 13". Lidská molekulární genetika. 3 (9): 1663–73. doi:10,1093 / hmg / 3,9,1663. PMID 7833926.
^ „Entrez Gene: EFNB2 ephrin-B2“.
^ ^A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). „Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů“. J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602.
^ Cerretti DP, Vanden Bos T, Nelson N, Kozlosky CJ, Reddy P, Maraskovsky E, Park LS, Lyman SD, Copeland NG, Gilbert DJ (listopad 1995). „Izolace LERK-5: ligand receptoru tyrosin kináz souvisejících s ef.“. Molekulární imunologie. 32 (16): 1197–205. doi:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID 8559144.
^ Lackmann M, Mann RJ, Kravets L, Smith FM, Bucci TA, Maxwell KF, Howlett GJ, Olsson JE, Vanden Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (červen 1997). „Ligand pro kinázu související s EPH (LERK) 7 je upřednostňovaný ligand s vysokou afinitou pro receptor HEK.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (26): 16521–30. doi:10.1074 / jbc.272.26.16521. PMID 9195962.
^ Williams SE, Mann F, Erskine L, Sakurai T, Wei S, Rossi DJ, Gale NW, Holt CE, Mason CA, Henkemeyer M (září 2003). „Ephrin-B2 a EphB1 zprostředkovávají divergenci axonů sítnice v optickém chiasmu“. Neuron. 39 (6): 919–35. doi:10.1016 / j.neuron.2003.08.017. PMID 12971893.
^ Bonaparte MI, Dimitrov AS, Bossart KN, Crameri G, Mungall BA, Bishop KA, Choudhry V, Dimitrov DS, Wang LF, Eaton BT, Broder CC (červenec 2005). „Ephrin-B2 ligand je funkční receptor pro virus Hendra a virus Nipah“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (30): 10652–7. doi:10.1073 / pnas.0504887102. PMC 1169237. PMID 15998730.

Další čtení

Flanagan JG, Vanderhaeghen P (1998). "Efriny a Eph receptory v nervovém vývoji". Roční přehled neurovědy. 21: 309–45. doi:10.1146 / annurev.neuro.21.1.309. PMID 9530499.
Zhou R (březen 1998). "Eph receptory a ligandy rodiny". Farmakologie a terapeutika. 77 (3): 151–81. doi:10.1016 / S0163-7258 (97) 00112-5. PMID 9576626.
Holder N, Klein R (květen 1999). "Eph receptory a efriny: efektory morfogeneze". Rozvoj. 126 (10): 2033–44. PMID 10207129.
Wilkinson DG (2000). "Eph receptory a efriny: regulátory vedení a montáže". International Review of Cytology. 196: 177–244. doi:10.1016 / S0074-7696 (00) 96005-4. ISBN 9780123646002. PMID 10730216.
Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (červenec 2000). "Role Eph receptorů a efrinů v segmentovém vzorování". Filozofické transakce Královské společnosti v Londýně. Série B, Biologické vědy. 355 (1399): 993–1002. doi:10.1098 / rstb.2000.0635. PMC 1692797. PMID 11128993.
Wilkinson DG (březen 2001). "Více rolí EPH receptorů a efrinů v nervovém vývoji". Recenze přírody. Neurovědy. 2 (3): 155–64. doi:10.1038/35058515. PMID 11256076.
Bennett BD, Zeigler FC, Gu Q, Fendly B, Goddard AD, Gillett N, Matthews W (březen 1995). "Molekulární klonování ligandu pro EPH-související receptorový protein-tyrosinkináza Htk". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (6): 1866–70. doi:10.1073 / pnas.92.6.1866. PMC 42383. PMID 7534404.
Cerretti DP, Vanden Bos T, Nelson N, Kozlosky CJ, Reddy P, Maraskovsky E, Park LS, Lyman SD, Copeland NG, Gilbert DJ (listopad 1995). „Izolace LERK-5: ligand receptoru tyrosin kináz souvisejících s ef.“. Molekulární imunologie. 32 (16): 1197–205. doi:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID 8559144.
Cerretti DP, Lyman SD, Kozlosky CJ, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Valentine V, Kirstein MN, Shapiro DN, Morris SW (duben 1996). „Geny kódující ligandy tyrosinkinázových receptorů souvisejících s eph LERK-1 (EPLG1, Epl1), LERK-3 (EPLG3, Epl3) a LERK-4 (EPLG4, Epl4) jsou seskupeny na lidském chromozomu 1 a myším chromozomu 3“. Genomika. 33 (2): 277–82. doi:10.1006 / geno.1996.0192. PMID 8660976.
Gale NW, Holland SJ, Valenzuela DM, Flenniken A, Pan L, Ryan TE, Henkemeyer M, Strebhardt K, Hirai H, Wilkinson DG, Pawson T, Davis S, Yancopoulos GD (červenec 1996). „Eph receptory a ligandy obsahují dvě hlavní podtřídy specificity a jsou během embryogeneze recipročně rozčleněny“. Neuron. 17 (1): 9–19. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80276-7. PMID 8755474.
Holland SJ, Gale NW, Mbamalu G, Yancopoulos GD, Henkemeyer M, Pawson T (říjen 1996). "Obousměrná signalizace přes receptor rodiny EPH Nuk a jeho transmembránové ligandy". Příroda. 383 (6602): 722–5. doi:10.1038 / 383722a0. hdl:1807/9444. PMID 8878483.
Ephnomenclature Committee (srpen 1997). "Jednotná nomenklatura pro receptory rodiny Eph a jejich ligandy, efriny. Výbor pro nomenklaturu Eph". Buňka. 90 (3): 403–4. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80500-0. PMID 9267020.
Vogt T, Stolz W, Welsh J, Jung B, Kerbel RS, Kobayashi H, Landthaler M, McClelland M (březen 1998). „Nadexprese Lerk-5 / Eplg5 messenger RNA: nový marker pro zvýšenou tumorigenicitu a metastatický potenciál u lidských maligních melanomů“. Klinický výzkum rakoviny. 4 (3): 791–7. PMID 9533549.
Wang HU, Chen ZF, Anderson DJ (květen 1998). „Molekulární rozlišení a angiogenní interakce mezi embryonálními tepnami a žilkami odhalená ephrinem-B2 a jeho receptorem Eph-B4“. Buňka. 93 (5): 741–53. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81436-1. PMID 9630219.
Nikolova Z, Djonov V, Zuercher G, Andres AC, Ziemiecki A (září 1998). „Specifická a na estrogenu závislá exprese receptorové tyrosinkinázy EphB4 a jejího ligandu ephrin-B2 během morfogeneze mléčné žlázy“. Journal of Cell Science. 111 (18): 2741–51. PMID 9718367.
Torres R, Firestein BL, Dong H, Staudinger J, Olson EN, Huganir RL, Bredt DS, Gale NW, Yancopoulos GD (prosinec 1998). "PDZ proteiny se vážou, shlukují a synapticky kolokalizují s Eph receptory a jejich efrinovými ligandy". Neuron. 21 (6): 1453–63. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80663-7. PMID 9883737.
Lin D, Gish GD, Songyang Z, Pawson T (únor 1999). „Karboxylový konec efrinů třídy B představuje motiv vázající doménu PDZ“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (6): 3726–33. doi:10.1074 / jbc.274.6.3726. PMID 9920925.

Tento článek o gen na lidský chromozom 13 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125266 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001300 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7833926-5] Bonaldo MF, Yu MT, Jelenc P, Brown S, Su L, Lawton L, Deaven L, Efstratiadis A, Warburton D, Soares MB (září 1994). "Výběr cDNA pomocí chromozomově specifických genomových klonů: aplikace na lidský chromozom 13". Lidská molekulární genetika. 3 (9): 1663–73. doi:10,1093 / hmg / 3,9,1663. PMID 7833926.

[entrez-6] „Entrez Gene: EFNB2 ephrin-B2“.

[Rotondo_2015-7] A ^b Rotondo JC, Bosi S, Bassi C, Ferracin M, Lanza G, Gafà R, Magri E, Selvatici R, Torresani S, Marci R, Garutti P, Negrini M, Tognon M, Martini F (duben 2015). „Změny genové exprese v progresi cervikální neoplazie odhalené mikroarray analýzou cervikálních neoplastických keratinocytů“. J Cell Physiol. 230 (4): 802–812. doi:10,1002 / jcp.24808. PMID 25205602.

[pmid8559144-8] Cerretti DP, Vanden Bos T, Nelson N, Kozlosky CJ, Reddy P, Maraskovsky E, Park LS, Lyman SD, Copeland NG, Gilbert DJ (listopad 1995). „Izolace LERK-5: ligand receptoru tyrosin kináz souvisejících s ef.“. Molekulární imunologie. 32 (16): 1197–205. doi:10.1016/0161-5890(95)00108-5. PMID 8559144.

[pmid9195962-9] Lackmann M, Mann RJ, Kravets L, Smith FM, Bucci TA, Maxwell KF, Howlett GJ, Olsson JE, Vanden Bos T, Cerretti DP, Boyd AW (červen 1997). „Ligand pro kinázu související s EPH (LERK) 7 je upřednostňovaný ligand s vysokou afinitou pro receptor HEK.“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (26): 16521–30. doi:10.1074 / jbc.272.26.16521. PMID 9195962.

[10] Williams SE, Mann F, Erskine L, Sakurai T, Wei S, Rossi DJ, Gale NW, Holt CE, Mason CA, Henkemeyer M (září 2003). „Ephrin-B2 a EphB1 zprostředkovávají divergenci axonů sítnice v optickém chiasmu“. Neuron. 39 (6): 919–35. doi:10.1016 / j.neuron.2003.08.017. PMID 12971893.

[11] Bonaparte MI, Dimitrov AS, Bossart KN, Crameri G, Mungall BA, Bishop KA, Choudhry V, Dimitrov DS, Wang LF, Eaton BT, Broder CC (červenec 2005). „Ephrin-B2 ligand je funkční receptor pro virus Hendra a virus Nipah“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (30): 10652–7. doi:10.1073 / pnas.0504887102. PMC 1169237. PMID 15998730.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

Mezibuněčné signální peptidy a proteiny / ligandy
Faktory růstu	Epidermální růstový faktor Fibroblastový růstový faktor Nervový růstový faktor Růstový faktor odvozený z krevních destiček Nadrodina beta transformujícího růstového faktoru Cévní endoteliální růstový faktor
Ephrin	EFNA1 EFNA2 EFNA3 EFNA4 EFNA5 EFNB1 EFNB2 EFNB3
jiný	Adipokin Agouti signální protein Protein související s aguti Angiogenní protein CCN mezibuněčný signální protein Proteiny bohaté na cystein 61 Faktor růstu pojivové tkáně Nadměrně exprimovaný protein nefroblastomu Cytokin Endotelin EDN1 EDN2 EDN3 Ježkový protein Interferon Kinin Protein související s hormony příštítných tělísek Semaforin Somatomedin Metaloproteináza podobná toloidům Faktor nekrózy nádorů Wnt protein
viz také poruchy extracelulárního ligandu