Fosfolipáza D1 - Phospholipase D1 - Wikipedia

PLD1
Identifikátory
AliasyPLD1fosfolipáza D1, CVDD
Externí IDOMIM: 602382 MGI: 109585 HomoloGene: 116234 Genové karty: PLD1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 3 (lidský)
Chr.Chromozom 3 (lidský)[1]
Chromozom 3 (lidský)
Genomic location for PLD1
Genomic location for PLD1
Kapela3q26.31Start171,600,404 bp[1]
Konec171,810,950 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PLD1 215724 at fs.png

PBB GE PLD1 177 at fs.png

PBB GE PLD1 215723 s at fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

5337

18805

Ensembl

ENSG00000075651

ENSMUSG00000027695

UniProt

Q13393

Q9Z280

RefSeq (mRNA)

NM_001130081
NM_002662

NM_001164056
NM_008875
NM_001368667

RefSeq (protein)

NP_001123553
NP_002653

n / a

Místo (UCSC)Chr 3: 171,6 - 171,81 MbChr 3: 27,94 - 28,13 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Fosfolipáza D1 (PLD1) je enzym že u lidí je kódován PLD1 gen,[5][6] ačkoli analogy se nacházejí v rostlinách, houbách, prokaryotech a dokonce i virech.[7]

Dějiny

Možnost PLD1 byla poprvé zmíněna v roce 1947 autory Hanahan a Chaikoff v Berkeley, když popisovali mrkvový enzym, který by mohl „[split] cholin z fosfolipidy."[8] PLD poprvé odvodili u savců v roce 1975 Saito a Kanfer, kteří zaznamenali jeho aktivitu u potkanů.[9] PLD byl nejprve klonován z HeLa buňka cDNA v roce 1995, zatímco savčí PLD1 byl poprvé klonován z krysy v roce 1997.[7]

Funkce

Místo hydrolýzy na fosfatidylcholinu pomocí PLD1

Fosfatidylcholin (PC) specifické fosfolipázy D (PLD) ES 3.1.4.4 katalyzovat hydrolýza PC k výrobě kyselina fosfatidová (PA) a cholin. Řada agonisté jednající skrz Receptory spojené s G proteinem a receptorové tyrosinkinázy stimulovat tuto hydrolýzu. Aktivita PLD specifická pro PC byla zahrnuta do mnoha buněčných cest, včetně obchodování s membránami, signální transdukce, srážení krevních destiček, mitóza, apoptóza a vytváření kapiček cytoplazmatických lipidů.[6][7][10][11]

Obchodování s membránami

Bylo prokázáno, že PLD1 se sdružuje v plazmatická membrána, pozdě endozom,[12] časný endozom a Golgiho aparát.[7][9] Existují důkazy, že PA je schopen pomáhat při negativním zakřivení membrány kvůli tomu, že její hlavní skupina je menší než v mnoha jiných lipidech.[7] Jeden experiment s PLD1 knockoutem ukázal významné snížení počtu událostí exocytotické fúze, z čehož vyplývá silná role v exocytóze.[13]

Transdukce signálu

PLD1 může hrát roli v některých buňkách v endocytóza signálních receptorů nebo exocytóza signálních molekul. Například jeden experiment v B buňky ukázaly, že omezení PLD1 vedlo k významně snížené endocytóze receptoru B buněk.[12] Další experiment ukázal, že vyřazení PLD1 může bránit schopnosti myší vylučovat katecholaminy, molekuly, které jsou nezbytné pro vezikulární komunikaci v těle.[13]

Struktura

Savčí PLD1 má několik domén pro aktivátory, inhibitory a katalýzu, které sdílí s PLD2. Domény pro aktivaci i inhibici jsou označovány jako domény phox homologie (PX) a pleckstrinové homologie (PH). Katalytická doména se skládá ze dvou oblastí HKD, tak pojmenovaných pro tři z aminokyselin, které jsou klíčové při katalýze. Tyto domény jsou konzervovány napříč mnoha organismy.[7][9] Existují dva varianty spoje proteinu, PLD1a a PLD1b, ale nezdá se, že by se lokalizovaly jinak.[7]

Aplikace

Alzheimerova choroba: Zdá se, že PA, který je částečně produkován PLD1, se podílí na pohybu β-amyloidu, který by mohl předcházet amyloidogenezi.[14]

Rakovina: U některých krysích nádorů s dominantní negativní PLD se nezdá, že tvoří nové kolonie nebo nádory.[7][14]

Trombóza: Zdá se, že myši s knockoutem PLD mají sníženou okluzi, čímž kompenzují trombózu.[7]

Cukrovka typu II: protein PED / PEA15 je často zvýšen u pacientů s diabetem typu II, čímž zvyšuje aktivitu PLD1 a následně zhoršuje inzulin.[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že fosfolipáza D1 komunikovat s:

Inhibitory

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000075651 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000027695 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Park SH, Chun YH, Ryu SH, Suh PG, Kim H (únor 1999). "Přiřazení lidské PLD1 k lidskému chromozomovému pásmu 3q26 fluorescenční in situ hybridizací". Cytogenetika a buněčná genetika. 82 (3–4): 224. doi:10.1159/000015105. PMID  9858822. S2CID  46791637.
  6. ^ A b Hammond SM, Altshuller YM, Sung TC, Rudge SA, Rose K, Engebrecht J a kol. (Prosinec 1995). „Lidská fosfatidylcholin-specifická fosfolipáza D aktivovaná lidským ADP-ribosylačním faktorem definuje novou a vysoce konzervovanou genovou rodinu“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (50): 29640–3. doi:10.1074 / jbc.270.50.29640. PMID  8530346.
  7. ^ A b C d E F G h i j k Selvy PE, Lavieri RR, Lindsley CW, Brown HA (říjen 2011). „Fosfolipáza D: enzymologie, funkčnost a chemická modulace“. Chemické recenze. 111 (10): 6064–119. doi:10.1021 / cr200296t. PMC  3233269. PMID  21936578.
  8. ^ Hanahan DJ, Chaikoff IL (duben 1947). „Lipidy mrkve obsahující fosfor“. The Journal of Biological Chemistry. 168 (1): 233–40. PMID  20291081.
  9. ^ A b C Jenkins GM, Frohman MA (říjen 2005). „Fosfolipáza D: recenze zaměřená na lipidy“. Buněčné a molekulární biologické vědy. 62 (19–20): 2305–16. doi:10.1007 / s00018-005-5195-z. PMID  16143829. S2CID  26447185.
  10. ^ „Entrez Gene: PLD1 fosfolipáza D1, specifická pro fosfatidylcholin“.
  11. ^ Andersson L, Boström P, Ericson J, Rutberg M, Magnusson B, Marchesan D a kol. (Červen 2006). "PLD1 a ERK2 regulují tvorbu kapiček cytosolických lipidů". Journal of Cell Science. 119 (Pt 11): 2246–57. doi:10.1242 / jcs.02941. PMID  16723731. S2CID  1628874.
  12. ^ A b Donaldson JG (září 2009). „Fosfolipáza D v endocytóze a endosomálních recyklačních cestách“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - molekulární a buněčná biologie lipidů. Fosfolipáza D. 1791 (9): 845–9. doi:10.1016 / j.bbalip.2009.05.011. PMC  2731818. PMID  19540357.
  13. ^ A b Tanguy E, Costé de Bagneaux P, Kassas N, Ammar MR, Wang Q, Haeberlé AM a kol. (Srpen 2020). „Mono- a poly-nenasycené kyseliny fosfatidové regulují odlišné kroky regulované exocytózy v neuroendokrinních buňkách“. Zprávy buněk. 32 (7): 108026. doi:10.1016 / j.celrep.2020.108026. PMID  32814056.
  14. ^ A b Thakur R, Naik A, Panda A, Raghu P (2019-06-04). „Regulace obratu membrány kyselinou fosfatidovou: buněčné funkce a důsledky nemocí“. Hranice v buněčné a vývojové biologii. 7: 83. doi:10,3389 / fcell.2019.00083. PMC  6559011. PMID  31231646.
  15. ^ Ahn BH, Rhim H, Kim SY, Sung YM, Lee MY, Choi JY a kol. (Duben 2002). „alfa-synuklein interaguje s izoenzymy fosfolipázy D a inhibuje aktivaci fosfolipázy D vyvolanou pervanadátem v buňkách lidské embryonální ledviny-293“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (14): 12334–42. doi:10,1074 / jbc.M110414200. PMID  11821392.
  16. ^ A b Lee C, Kim SR, Chung JK, Frohman MA, Kilimann MW, Rhee SG (červen 2000). "Inhibice fosfolipázy D amfifyziny". The Journal of Biological Chemistry. 275 (25): 18751–8. doi:10,1074 / jbc.M001695200. PMID  10764771.
  17. ^ Walker SJ, Wu WJ, Cerione RA, Brown HA (květen 2000). „Aktivace fosfolipázy D1 pomocí Cdc42 vyžaduje oblast inzerce Rho“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (21): 15665–8. doi:10,1074 / jbc.M000076200. PMID  10747870.
  18. ^ Zhang Y, Redina O, Altshuller YM, Yamazaki M, Ramos J, Chneiweiss H a kol. (Listopad 2000). „Regulace exprese fosfolipázy D1 a D2 pomocí PEA-15, nového proteinu, který s nimi interaguje“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (45): 35224–32. doi:10,1074 / jbc.M003329200. PMID  10926929.
  19. ^ Oishi K, Takahashi M, Mukai H, Banno Y, Nakashima S, Kanaho Y a kol. (Květen 2001). „PKN reguluje fosfolipázu D1 přímou interakcí“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (21): 18096–101. doi:10,1074 / jbc.M010646200. PMID  11259428.
  20. ^ Luo JQ, Liu X, Hammond SM, Colley WC, Feig LA, Frohman MA a kol. (Červen 1997). „RalA interaguje přímo s Arf-reagující, PIP2-dependentní fosfolipázou D1“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 235 (3): 854–9. doi:10.1006 / bbrc.1997.6793. PMID  9207251.
  21. ^ Kim JH, Lee SD, Han JM, Lee TG, Kim Y, Park JB a kol. (Červenec 1998). "Aktivace fosfolipázy D1 přímou interakcí s ADP-ribosylačním faktorem 1 a RalA". FEBS Dopisy. 430 (3): 231–5. doi:10.1016 / s0014-5793 (98) 00661-9. PMID  9688545. S2CID  36075513.
  22. ^ Genth H, Schmidt M, Gerhard R, Aktories K, Just I (únor 2003). "Aktivace fosfolipázy D1 pomocí ADP-ribosylovaného RhoA". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 302 (1): 127–32. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 00112-8. PMID  12593858.
  23. ^ Cai S, Exton JH (květen 2001). "Stanovení interakčních míst fosfolipázy D1 pro RhoA". The Biochemical Journal. 355 (Pt 3): 779–85. doi:10.1042 / bj3550779. PMC  1221795. PMID  11311142.
  24. ^ Lewis JA, Scott SA, Lavieri R, Buck JR, Selvy PE, Stoops SL a kol. (Duben 2009). "Návrh a syntéza inhibitorů fosfolipázy D (PLD) selektivních na izoformy. Část I: Dopad alternativních halogenovaných privilegovaných struktur na specificitu PLD1". Dopisy o bioorganické a léčivé chemii. 19 (7): 1916–20. doi:10.1016 / j.bmcl.2009.02.057. PMC  3791604. PMID  19268584.

Další čtení