Pankreatická ribonukleáza - Pancreatic ribonuclease

Pankreatická ribonukleáza
RNase A.png
Struktura RNázy A
Identifikátory
EC číslo3.1.27.5
Číslo CAS9001-99-4
Databáze
IntEnzIntEnz pohled
BRENDAVstup BRENDA
EXPASYPohled NiceZyme
KEGGVstup KEGG
MetaCycmetabolická cesta
PRIAMprofil
PDB strukturRCSB PDB PDBe PDBsum
Genová ontologieAmiGO / QuickGO
Pankreatická ribonukleáza
Identifikátory
SymbolRNaseA
PfamPF00074
InterProIPR001427
CHYTRÝSM00092
STRÁNKAPDOC00118

Pankreatické ribonukleázy (ES 3.1.27.5, RNáza, RNáza I, RNáza A, pankreatická RNáza, ribonukleáza I, endoribonukleáza I, ribonukleová fosfatáza, alkalická ribonukleáza, ribonukleáza, glykoproteiny genu S., Alkalická ribonukleáza Ceratitis capitata, SLSG glykoproteiny, genu S lokusově specifické glykoproteiny, S-genotyp-assocd. glykoproteiny, ribonukleát 3'-pyrimidino-oligonukleotidohydroláza) jsou pyrimidin -charakteristický endonukleázy nalezené ve velkém množství v slinivka břišní jisté savci a některých plazi.[1]

Konkrétně jsou enzymy zapojeny do endonukleolytického štěpení 3'-fosfomononukleotidy a 3'-fosfooligonukleotidy končící na C-P nebo U-P s 2 ', 3'-cyklickými fosfátovými meziprodukty. Ribonukleáza může uvolnit RNA šroubovice komplexováním s jednořetězcovou RNA; komplex vzniká rozšířenou interakcí kation-aniontů mezi více místy lysin a arginin zbytky enzymových a fosfátových skupin nukleotidů.

Pozoruhodní členové rodiny

Bovinní pankreatická ribonukleáza je nejlépe studovaným členem rodiny a sloužil jako modelový systém v práci související s skládání bílkovin, disulfidová vazba tvorba, protein krystalografie a spektroskopie, a dynamika bílkovin.[2] Lidský genom obsahuje 8 genů, které sdílejí strukturu a funkci s hovězí pankreatickou ribonukleázou, s dalšími 5 pseudogeny. Tato struktura a dynamika těchto enzymů souvisí s jejich rozmanitými biologickými funkcemi.[3]

Mezi další proteiny patřící do nadrodiny pankreatické ribonukleázy patří: bovinní semenný váček a mozkové ribonukleázy; ledviny nesekreční ribonukleázy;[4] ribonukleázy jaterního typu;[5] angiogenin, která indukuje vaskularizaci normálních a maligních tkání; eosinofilní kationtový protein,[6] cytotoxin a helminthotoxin s aktivitou ribonukleázy; a ribonukleáza žabích jater a lektin vázající kyselinu sialovou. Sekvence pankreatických ribonukleáz obsahuje čtyři konzervované disulfidové vazby a tři aminokyselinové zbytky podílející se na katalytické aktivitě.[7]

Lidské geny

Člověk geny kódující proteiny obsahující toto doména zahrnout:

Cytotoxicita

Někteří členové rodiny pankreatických ribonukleáz mají cytotoxický účinky. Savčí buňky jsou před těmito účinky chráněny kvůli své extrémně vysoké hodnotě afinita pro inhibitor ribonukleázy (RI), který chrání buněčnou RNA před degradací pankreatickými ribonukleázami.[8] Pankreatické ribonukleázy, které nejsou inhibovány RI, jsou přibližně stejně toxické jako alfa-sarcin, toxin záškrtu nebo ricin.[9]

Dvě pankreatické ribonukleázy izolované z oocyty z Leopardí žába - amfináza a ranpirnase - nejsou inhibovány RI a vykazují rozdílnou cytotoxicitu proti nádor buňky.[10] Ranpirnase byl studován v Fáze III klinické hodnocení jako kandidát na léčbu mezoteliom, ale studie neprokázala statistickou významnost proti primárním koncovým bodům.[11]

Reference

  1. ^ Beintema JJ, van der Laan JM (1986). "Srovnání struktury želvové pankreatické ribonukleázy se strukturami savčích ribonukleáz". FEBS Lett. 194 (2): 338–343. doi:10.1016/0014-5793(86)80113-2. PMID  3940901. S2CID  21907373.
  2. ^ Marshall GR, Feng JA, Kuster DJ (2008). "Zpět do budoucnosti: ribonukleáza A". Biopolymery. 90 (3): 259–77. doi:10,1002 / bip.20845. PMID  17868092. S2CID  2905312.
  3. ^ Narayanan C, Bernard DN, Bafna K, Gagné D, Chennubhotla CS, Doucet N, Agarwal PK (březen 2018). „Zachování dynamiky spojené s biologickými funkcemi v nadrodině enzymů“. Struktura. 26 (3): 426–436. doi:10.1016 / j.str.2018.01.015. PMC  5842143. PMID  29478822.
  4. ^ Rosenberg HF, Tenen DG, Ackerman SJ (1989). „Molekulární klonování lidského neurotoxinu odvozeného od eosinofilů: člen rodiny genů ribonukleázy“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (12): 4460–4464. doi:10.1073 / pnas.86.12.4460. PMC  287289. PMID  2734298.
  5. ^ Hofsteenge J, Matthies R, Stone SR (1989). "Primární struktura ribonukleázy z prasečích jater, nový člen superrodiny ribonukleázy". Biochemie. 28 (25): 9806–9813. doi:10.1021 / bi00451a040. PMID  2611266.
  6. ^ Rosenberg HF, Ackerman SJ, Tenen DG (1989). „Lidský eosinofilní kationtový protein. Molekulární klonování cytotoxinu a helminthotoxinu s ribonukleázovou aktivitou“. J. Exp. Med. 170 (1): 163–176. doi:10.1084 / jem.170.1.163. PMC  2189377. PMID  2473157.
  7. ^ Raines RT (1998). „Ribonukleáza A“. Chem. Rev. 98 (3): 1045–1066. doi:10.1021 / cr960427h. PMID  11848924.
  8. ^ Gaur, D; Swaminathan, S; Batra, JK (6. července 2001). „Interakce lidské pankreatické ribonukleázy s lidským inhibitorem ribonukleázy. Tvorba cytotoxických variant rezistentních na inhibitory“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (27): 24978–84. doi:10,1074 / jbc.m102440200. PMID  11342552.
  9. ^ Saxena, SK; Rybak, SM; Winkler, G; Meade, HM; McGray, P; Youle, RJ; Ackerman, EJ (5. listopadu 1991). "Srovnání RNáz a toxinů po injekci do oocytů Xenopus". The Journal of Biological Chemistry. 266 (31): 21208–14. PMID  1939163.
  10. ^ Lee JE, Raines RT (2008). „Ribonukleázy jako nová chemoterapeutika: příklad ranpirnázy“. BioDrugs. 22 (1): 53–58. doi:10.2165/00063030-200822010-00006. PMC  2802594. PMID  18215091.
  11. ^ „Výroční zpráva Alfacell 2009“ (PDF). Citováno 2. února 2015.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR001427