PLCE1 - PLCE1

PLCE1
Protein PLCE1 PDB 2bye.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyPLCE1, NPHS3, PLCE, PPLC, fosfolipáza C epsilon 1
Externí IDOMIM: 608414 MGI: 1921305 HomoloGene: 9478 Genové karty: PLCE1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 10 (lidský)
Chr.Chromozom 10 (lidský)[1]
Chromozom 10 (lidský)
Genomické umístění pro PLCE1
Genomické umístění pro PLCE1
Kapela10q23.33Start94,030,812 bp[1]
Konec94,332,823 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE PLCE1 205112 na fs.png

PBB GE PLCE1 205111 s na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

51196

74055

Ensembl

ENSG00000138193

ENSMUSG00000024998

UniProt

Q9P212

Q8K4S1

RefSeq (mRNA)

NM_001165979
NM_001288989
NM_016341

NM_019588

RefSeq (protein)

NP_001159451
NP_001275918
NP_057425

NP_062534

Místo (UCSC)Chr 10: 94,03 - 94,33 MbChr 19: 38,48 - 38,79 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

1-fosfatidylinositol-4,5-bisfosfátfosfodiesteráza epsilon-1 (PLCE1) je enzym že u lidí je kódován PLCE1 gen.[5][6] Tento gen kóduje fosfolipázový enzym (PLCE1), který katalyzuje hydrolýza z fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát generovat dva sekundy posly: inositol 1,4,5-trifosfát (IP3) a diacylglycerol (DAG). Mutace v tomto genu způsobují časný nástup nefrotický syndrom a byly spojovány s nedostatkem dýchacího řetězce s difuzní mezangiální sklerózou.[7][8]

Struktura

PLCE1 se nachází na q rameno z chromozom 10 na pozici 23,33 a má 39 exony.[7] PLCE1, protein kódovaný tímto genem, se nachází na Golgiho aparát, buněčná membrána a v cytosol. Obsahuje 3 tahy, 15 beta vlákna a 6 alfa šroubovice. PLCE1 obsahuje 260 aminokyselin Ras-GEF doména ve společnosti p. 531-790, 149-aminokyselinová doména PI-PLC X-box na str. 1392-1540, 117 aminokyselinová PI-PLC Y-box doména na str. 1730 - 1846, 101 aminokyselin Doména C2 ve společnosti p. 1856 - 1956, 103 aminokyselinová Ras-asociační 1 doména na str. 2012 - 2114, a 104 aminokyselinová Ras-asociační 2 doména na str. 2135 - 2238. Existuje oblast 79 aminokyselin z p. 1686 - 1764, který je vyžadován pro aktivaci PLCE1 uživatelem RHOA, RHOB, GNA12, GNA13 a G-beta gama. PLCE1 má také Ca2 + kofaktor.[6][9][10] Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu s odlišným kódováním izoformy.[7]

Funkce

PLCE1 patří do fosfolipáza rodina, která katalyzuje hydrolýzu polyfosfoinositidů, jako je fosfatidylinositol-4,5-bisfosfát (PtdIns (4,5) P2) ke generování druhých poslů Ins (1,4,5) P3 a diacylglycerol. Tyto produkty iniciují kaskádu intracelulárních odpovědí, které vedou k buněčnému růstu a diferenciaci a genová exprese. [dodává OMIM][7]

Katalytická aktivita

1-fosfatidyl-1D-myo-inositol 4,5-bisfosfát + H20 = 1D-myo-inositol 1,4,5-trisfosfát + diacylglycerol.[5][6]

Klinický význam

Mutace v tomto genu způsobují časný nástup nefrotický syndrom. Toto onemocnění je charakterizováno proteinurie, otok a difúzní mezangiální sklerózu nebo fokální a segmentální glomeruloskleróza.[7] Mezi příznaky patří ledviny biopsie demonstrovat nespecifické histologické změny, jako je fokální segmentová glomeruloskleróza a difúzní mezangiální proliferace, stejně jako genetické testy odhalující patogenní mutaci S1484L. Difúzní mesangiální proliferace je charakterizována expanzí mesangiální matice bez mezangiální hypercelulárnosti, hypertrofie z podocyty vakuolizované podocyty, zesílené bazální membrány a snížená průchodnost kapilárního lumenu.[11][9][10] Toto onemocnění bylo také spojováno s mitochondriální cytopatie pramenící z nedostatku primárně ovlivňujícího respirační řetězec komplex IV.[8]

Kromě toho moduluje fosfolipáza C epsilon beta-adrenergní receptor -závislá srdeční kontrakce a bylo zjištěno, že tento protein je nadměrně exprimován během srdeční selhání. Výzkum naznačil, že PLCE1 může tak inhibovat srdeční hypertrofie.[12][9][10]

Interakce

Bylo prokázáno, že PLCE1 má 12 binárních interakce protein-protein včetně 8 společných interakcí. Zdá se, že PLCE1 interaguje RyR2, HRAS, NRAS, a LIMS1.[13]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138193 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024998 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b Lopez I, Mak EC, Ding J, Hamm HE, Lomasney JW (leden 2001). „Nová bifunkční fosfolipáza c, která je regulována Galpha 12 a stimuluje dráhu proteinkinázy aktivovanou Ras / mitogenem“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (4): 2758–65. doi:10,1074 / jbc.M008119200. PMID  11022047.
  6. ^ A b C Song C, Hu CD, Masago M, Kariyai K, Yamawaki-Kataoka Y, Shibatohge M, Wu D, Satoh T, Kataoka T (leden 2001). "Regulace nové lidské fosfolipázy C, PLCepsilon, prostřednictvím membránového cílení pomocí Ras". The Journal of Biological Chemistry. 276 (4): 2752–7. doi:10,1074 / jbc.M008324200. PMID  11022048.
  7. ^ A b C d E „Entrez Gene: PLCE1 fosfolipáza C, epsilon 1“. Tento článek včlení text z tohoto zdroje, který je v veřejná doména.
  8. ^ A b Baskin E, Selda Bayrakci U, Alehan F, Ozdemir H, Oner A, Horvath R, Vega-Warner V, Hildebrandt F, Ozaltin F (červenec 2011). „Deficit dýchacího řetězce projevující se jako difúzní mesangiální skleróza s mutací NPHS3“. Dětská nefrologie. 26 (7): 1157–61. doi:10.1007 / s00467-011-1814-0. PMC  3329966. PMID  21365190.
  9. ^ A b C „PLCE1 - 1-fosfatidylinositol 4,5-bisfosfátfosfodiesteráza epsilon-1 - Homo sapiens (člověk) - gen a protein PLCE1“. www.uniprot.org. Citováno 2018-08-30. Tento článek včlení text dostupný pod CC BY 4.0 licence.
  10. ^ A b C „UniProt: univerzální znalostní databáze proteinů“. Výzkum nukleových kyselin. 45 (D1): D158 – D169. Ledna 2017. doi:10.1093 / nar / gkw1099. PMC  5210571. PMID  27899622.
  11. ^ Hinkes B, Wiggins RC, Gbadegesin R, Vlangos CN, Seelow D, Nürnberg G a kol. (Prosinec 2006). „Poziční klonování odhaluje mutace v PLCE1 odpovědné za variantu nefrotického syndromu, které mohou být reverzibilní“. Genetika přírody. 38 (12): 1397–405. doi:10.1038 / ng1918. PMID  17086182. S2CID  4037950.
  12. ^ Wang H, Oestreich EA, Maekawa N, Bullard TA, Vikstrom KL, Dirksen RT, Kelley GG, Blaxall BC, Smrcka AV (prosinec 2005). „Fosfolipáza C epsilon moduluje srdeční kontrakci závislou na beta-adrenergních receptorech a inhibuje srdeční hypertrofii“. Výzkum oběhu. 97 (12): 1305–13. doi:10.1161 / 01.RES.0000196578.15385.bb. PMID  16293787.
  13. ^ IntAct. www.ebi.ac.uk https://www.ebi.ac.uk/intact/interactions?conversationContext=1. Citováno 2018-08-30. Chybějící nebo prázdný | název = (Pomoc)

Další čtení

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.