Enterobacteriaceae - Enterobacteriaceae - Wikipedia
![]() | tento článek potřebuje další citace pro ověření.Březen 2009) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) ( |
Enterobacteriaceae | |
---|---|
![]() | |
Citrobacter freundii, jeden člen rodiny | |
Vědecká klasifikace ![]() | |
Doména: | Bakterie |
Kmen: | Proteobakterie |
Třída: | Gammaproteobakterie |
Objednat: | Enterobacterales |
Rodina: | Enterobacteriaceae Rahn, 1937 |
Rody[1] | |
Viz text |
Enterobacteriaceae je velký rodina z Gramnegativní bakterie. Poprvé jej navrhl Rahn v roce 1936 a nyní zahrnuje více než 30 rodů a více než 100 druhů. Jeho klasifikace nad úroveň rodiny je stále předmětem debaty, ale jedna klasifikace ji řadí do pořadí Enterobacterales třídy Gammaproteobakterie v kmeni Proteobakterie.[2][3][4][5]
Enterobacteriaceae zahrnuje spolu s mnoha neškodnými symbionty, mnoho známějších patogeny, jako Salmonella, Escherichia coli, Klebsiella, a Shigella. Mezi další bakterie způsobující onemocnění v této rodině patří Enterobacter a Citrobacter. Členy Enterobacteriaceae mohou být triviálně označované jako enterobakterie nebo „enterické bakterie“,[6] protože několik členů žije ve střevech zvířat. Ve skutečnosti je etymologií rodiny enterobakterie s příponou pro označení rodiny (aceae) - ne po rod Enterobacter (což by bylo „Enterobacteraceae“) - a typ rodu je Escherichia.
Morfologie
Členy Enterobacteriaceae jsou bacily (ve tvaru tyče) a jsou obvykle 1–5 μm dlouhé. Obvykle se na krevním agaru objevují jako šedé až velké šedé kolonie, i když některé mohou exprimovat pigmenty.
Většina jich má mnoho bičíky se pohybovali, ale několik rodů je nemotorných. Většina členů Enterobacteriaceae má peritrichózní typ I. fimbrie podílí se na adhezi bakteriálních buněk k jejich hostitelům.
Nejsou výtrus -formování.
Metabolismus
Stejně jako ostatní proteobakterie mají i enterobakterie Gramnegativní skvrny,[7] a jsou fakultativní anaeroby, kvasící cukry k výrobě kyselina mléčná a různé další konečné produkty. Většina také snižuje dusičnan na dusitany, i když existují výjimky. Na rozdíl od většiny podobných bakterií Enterobacteriaceae obecně chybí cytochrom c oxidáza, i když existují výjimky.
Reakce katalázy se u Enterobacteriaceae liší.
Ekologie
Mnoho členů této rodiny je normálními členy střevní mikrobiota u lidí a jiných zvířat, zatímco ostatní se nacházejí ve vodě nebo v půdě, nebo jsou paraziti na různých zvířatech a rostlinách.
Modelové organismy a zdravotní význam
Escherichia coli je jedním z nejdůležitějších modelové organismy, a jeho genetika a biochemie byly pečlivě studovány.
Některé enterobakterie jsou důležité patogeny, např. Salmonellanebo Shigella např. protože vyrábějí endotoxiny. Endotoxiny se nacházejí v buněčné stěně a uvolňují se, když buňka zemře a buněčná stěna se rozpadne. Někteří členové Enterobacteriaceae produkují endotoxiny, které po uvolnění do krevního oběhu po lýze buněk způsobují systémovou zánětlivou a vazodilatační odpověď. Nejzávažnější formou je endotoxický šok, který může být rychle smrtelný.
Rody
Platně zveřejněné rody
Následující rody byly platně zveřejněny, mají tedy označení „Stál v nomenklatuře“. Rok, kdy byl rod navržen, je uveden v závorkách za názvem rodu.
- Biostraticola (2008)
- Buttiauxella (1982)
- Cedecea (1981)
- Citrobacter (1932)
- Cronobacter (2008)
- Enterobacillus (2015)
- Enterobacter (1960)
- Escherichia (1919)
- Franconibacter (2014)
- Gibbsiella (2011)
- Izhakiella (2016)
- Klebsiella (1885)
- Kluyvera (1981)
- Kosakonia (2013)
- Leclercia (1987)
- Lelliottia (2013)
- Limnobaculum (2018)
- Mangrovibacter (2010)
- Metakosakonia (2017)
- Phytobacter (2017)
- Pluralibacter (2013)
- Pseudescherichia (2017)
- Pseudocitrobacter (2014)
- Raoultella (2001)
- Rosenbergiella (2013)
- Saccharobacter (1990)
- Salmonella (1900)
- Skandinávie (2020)
- Shigella (1919)
- Shimwellia (2010)
- Siccibacter (2014)
- Trabulsiella (1992)
- Yokenella (1985)
Candidatus rody
- "Candidatus Annandia "
- "Candidatus Arocatia "
- "Candidatus Aschnera "
- "Candidatus Benitsuchiphilus "
- "Candidatus Blochmannia "
- "Candidatus Curculioniphilus "
- "Candidatus Cuticobacterium "
- "Candidatus Doolittlea "
- "Candidatus Gillettellia "
- "Candidatus Gullanella "
- "Candidatus Hamiltonella "
- "Candidatus Hartigia "
- "Candidatus Hoaglandella "
- "Candidatus Ischnodemia "
- "Candidatus Ishikawaella "
- "Candidatus Kleidoceria "
- "Candidatus Kotejella "
- "Candidatus Macropleicola "
- "Candidatus Mikella "
- "Candidatus Moranella "
- "Candidatus Phlomobacter "
- "Candidatus Profftia "
- "Candidatus Purcelliella "
- "Candidatus Regiella "
- "Candidatus Riesia "
- "Candidatus Rohrkolberia "
- "Candidatus Rosenkranzia "
- "Candidatus Schneideria "
- "Candidatus Stammera "
- "Candidatus Tyčinka "
- "Candidatus Tachikawaea "
- "Candidatus Westeberhardia "
Navrhované rody
Následující rody byly účinně, ale ne platně, publikovány, takže nemají „Stání v nomenklatuře“. Rok, kdy byl rod navržen, je uveden v závorkách za názvem rodu.
- Aquamonas (2009)
- Atlantibacter (2016)
- Superficieibacter (2018)
Identifikace
Identifikovat různé rody z Enterobacteriaceae může mikrobiolog provést řadu testů v laboratoři. Tyto zahrnují:[8]
- Fenolová červená
- Trypton vývar
- Fenylalanin agar pro detekci produkce deamináza, který převádí fenylalanin na kyselina fenylpyrohroznová
- Methylová červená nebo Voges-Proskauerovy testy závisí na trávení glukóza. Methylová červeň testuje kyselé konečné produkty. Voges Proskauer testuje výrobu acetylmethylkarbinol.
- Kataláza vyzkoušet na živný agar testy na produkci enzymu katalázy, která štěpí peroxid vodíku a uvolňuje plynný kyslík.
- Oxidázový test na živný agar testy produkce enzymu oxidáza, který reaguje s aromatickým aminem za vzniku fialové barvy.
- Živinové želatinové testy k detekci aktivity enzymu želatináza.
V klinickém prostředí tvoří tři druhy 80 až 95% všech identifikovaných izolátů. Tyto jsou Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, a Proteus mirabilis. Nicméně, Proteus mirabilis je nyní považována za součást Morganellaceae, sesterský clade uvnitř Enterobacterales.
Odolnost proti antibiotikům
Bylo izolováno několik kmenů Enterobacteriaceae, které jsou rezistentní na antibiotika včetně karbapenemy, které jsou často označovány jako „poslední linie antibiotické obrany“ proti rezistentním organismům. Například některé Klebsiella pneumoniae kmeny jsou rezistentní vůči karbapenemu.[9]
Reference
- ^ "Seznam rodů zahrnutých v rodinách - Enterobacteriaceae". Seznam prokaryotických jmen se stáním v nomenklatuře. Citováno 26. června 2016.
- ^ Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley (26. července 2005) [1984 (Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Gammaproteobakterie. Bergeyho příručka systematické bakteriologie. 2B (2. vyd.). New York: Springer. p. 1108. ISBN 978-0-387-24144-9. Britská knihovna č. GBA561951.
- ^ Stránka zipcodezoo Enterobacteriales Archivováno 2014-04-27 na Wayback Machine přístup 9. března 2013
- ^ NCBI Enterobacteriales přístup 9. března 2013
- ^ Taxonomicon Enterobacteriales přístup 9. března 2013
- ^ „Archivovaná kopie“. Archivovány od originál dne 10.12.2011. Citováno 2019-01-26.CS1 maint: archivovaná kopie jako titul (odkaz)
- ^ "Dorlands Medical Dictionary: Enterobacteriaceae". Archivovány od originál dne 28. 8. 2009.
- ^ MacFaddin, Jean F. Biochemické testy pro identifikaci lékařských bakterií. Williams & Wilkins, 1980, s. 441.
- ^ Centra pro kontrolu a prevenci nemocí - Klebsiella Citace: „Stále častěji se vyvinuly bakterie Klebsiella antimikrobiální rezistence, naposledy do třídy antibiotik známých jako karbapenemy. “
externí odkazy
- Enterobacteriaceae genomy a související informace na PATRIC, Centrum bioinformatických zdrojů financované NIAID
- Hodnocení nového počítačově identifikačního programu pro mikroorganismy: adaptace BioBASE pro identifikaci členů čeledi Enterobacteriaceae [1]
- Brown, A.E. (2009). Bensonovy mikrobiologické aplikace: laboratorní příručka pro obecnou mikrobiologii. New York: McGraw-Hill.