Armatimonadetes - Armatimonadetes
Armatimonadetes | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
(bez hodnocení): | |
Kmen: | Armatimonadetes Tamaki a kol. 2011 |
Třída | |
Armatimonadetes je kmen z gramnegativní bakterie.
Dějiny
Armatimonadetes byl původně popsán pouze na základě prostředí 16S rRNA sekvence genového klonu a byl dočasně pojmenován kandidát kmen OP10. V roce 2011 byl však bakteriální kmen patřící do kmene izolován z vodní rostliny v Japonsku. Druh byl pojmenován Armatimonas rosea a byl prvním členem jeho kmene, rodu a druhu.[1]
Členové
Armatimonas rosea, aerobní chemoheterotrofní bakterie, kmen YO-36T, byla izolována z rhizoplanu vodní rostliny (rákos, Phragmites australis ) obývající sladkovodní jezero v Japonsku.[1]
Chthonomonas calidirosea, aerobik, sacharolytický, obligátně termofilní, pohyblivá, nespórotvorná bakterie, kmen T49 (T), byla izolována z geotermálně zahřáté půdy v Hell's Gate, Tikitere na Novém Zélandu.[2]
Fylogeneze
Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)[3] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)[4]a fylogeneze je založena na 16S rRNA založeném na uvolňování LTP 123 o Projekt All-Species Living Tree.[5]
| |||||||||||||
Taxonomie
- Třída Fimbriimonadia Im a kol. 2012
- Objednat Fimbriimonadales Im a kol. 2012
- Rodina Fimbriimonadaceae Im a kol. 2012
- Rod Fimbriimonas Im a kol. 2012
- Druh Fimbriimonas ginsengisoli Im a kol. 2012
- Rod Fimbriimonas Im a kol. 2012
- Rodina Fimbriimonadaceae Im a kol. 2012
- Objednat Fimbriimonadales Im a kol. 2012
- Třída Armatimonadia Tamaki a kol. 2011
- Objednat Armatimonadales Tamaki a kol. 2011
- Rodina Armatimonadaceae Tamaki a kol. 2011
- Rod Armatimonas Tamaki a kol. 2011
- Druh Armatimonas rosea Tamaki a kol. 2011
- Rod Armatimonas Tamaki a kol. 2011
- Rodina Armatimonadaceae Tamaki a kol. 2011
- Objednat Armatimonadales Tamaki a kol. 2011
- Třída Chthonomonadetes Lee a kol. 2011
- Objednat Chthonomonadales Lee a kol. 2011
- Rodina Chthonomonadaceae Lee a kol. 2011
- Rod Chthonomonas Lee a kol. 2011
- Druh Chthonomonas calidirosea Lee a kol. 2011
- Rod Chthonomonas Lee a kol. 2011
- Rodina Chthonomonadaceae Lee a kol. 2011
- Objednat Chthonomonadales Lee a kol. 2011
Poznámky
Reference
- ^ A b Tamaki, Hideyuki; Tanaka, Yasuhiro; Matsuzawa, Hiroaki; Muramatsu, Mizuho; Meng, Xian-Ying; Hanada, satoshi; Mori, Kazuhiro; Kamagata, Yoichi (2010). „Armatimonas rosea gen. Nov., Sp. Nov., Gramnegativní, aerobní, chemoheterotrofní bakterie nového bakteriálního kmene Armatimonadetes phyl. Nov., Formálně nazývaného kandidátský kmen OP10“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 6): 1442–7. doi:10.1099 / ijs.0.025643-0. PMID 20622056.
- ^ Lee, Kevin C. Y .; Dunfield, Peter F .; Morgan, Xochitl C .; Crowe, Michelle A .; Houghton, Karen M .; Vyssotski, Michail; Ryan, Jason L. J .; Lagutin, Kirill; et al. (2010). „Chthonomonas calidirosea gen. Nov., Sp. Nov., Aerobní, pigmentovaný, termofilní mikroorganismus nové bakteriální třídy, Chthonomonadetes classis. Nov., Nově popsaného kmene Armatimonadetes původně označeného jako kandidátská divize OP10“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 10): 2482–90. doi:10.1099 / ijs.0.027235-0. PMID 21097641.
- ^ J.P.Euzéby. "Armatimonadetes". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Archivovány od originál dne 13.06.2011. Citováno 2016-03-20.
- ^ Sayers; et al. "Armatimonadetes". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2016-03-20.
- ^ Projekt All-Species Living Tree.„16S rRNA založené vydání LTP 123 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2014-03-20.