Nitrospirae - Nitrospirae - Wikipedia

Nitrospirae
Vědecká klasifikace
Doména:	Bakterie
Kmen:	Nitrospirae; Garrity & Holt 2001
Třída:	Nitrospiria
Objednat:	Nitrospirales
Rodina:	Nitrospiraceae
Rody
	Candidatus Magnetobacterium Spring a kol. 1993; Candidatus Magnetoovum Lefevre a kol. 2011; Leptospirillum (ex Markosyan 1972) Hippe 2000; Nitrospira Watson a kol. 1986;
Synonyma
	Nitrospiraeota Oren a kol. 2015;

Nitrospirae je kmen bakterií. Obsahuje pouze jednu třídu, Nitrospira, který sám obsahuje jednu objednávku (Nitrospirales) a jedna rodina (Nitrospiraceae). Zahrnuje více rodů, například Nitrospira, největší. První člen tohoto kmene, Přístav Nitrospira, byl objeven v roce 1985.^[1] Druhý člen, Nitrospira moscoviensis, byl objeven v roce 1995.^[2]^[3]

Fylogeneze

Fylogeneze založená na práci Projekt All-Species Living Tree.^[4]

Leptospirillum

	L. ferriphilum Coram a Rawlings 2002

	L. ferrooxidans (ex Markosyan 1972) Hippe 2000 (typ sp.)

Thermodesulfovibrio

T. hydrogeniphilus Haouari a kol. 2009

T. aggregans Sekiguchi a kol. 2008

T. thiophilus Sekiguchi a kol. 2008

	T. islandicus Sonne-Hansen a Ahring 2000

	T. yellowstonii Henry a kol. 1994 (typ sp.)

Taxonomie

Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LSPN)^[5] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI).^[3]

Kmen "Nitrospirae„Garrity & Holt 2001 [Nitrospiraeota Oren et al. 2015]
- Třída Nitrospiria Oren a kol. 2015 [„Nitrospirae“]
  - Objednat "Nitrospirales"
    - Rodina "Nitrospiraceae "
      - Rod "Candidatus Magnetobacterium " Spring a kol. 1993
        Druh "Ca. M. bavaricum " Spring a kol. 1993
        Druh "Ca. M. casensis " Lin a kol. 2014
      - Rod "Candidatus Magnetoovum " Lefevre a kol. 2011
        Druh "Ca. M. mohavensis " Lefevre a kol. 2011
        Druh "Ca. M. chiemensis " Kolinko 2014
      - Rod Leptospirillum (ex Markosyan 1972) Hippe 2000
        Druh L. ferrodiazotrophum ♠ Tyson a kol. 2005
        Druh L. rubarum ♠ Aliaga Goltsman a kol. 2009
        Druh L. thermoferrooxidans Hippe 2000
        Druh L. ferriphilum Coram a Rawlings 2002
        Druh L. ferrooxidans (ex Markosyan 1972) Hippe 2000 (typ sp.)
      - Rod Nitrospira Watson a kol. 1986
        Druh "Ca. N. bockiana " ♠ Lebedeva a kol. 2008
        Druh "Ca. N. inopinata " ♠ Daims a kol. 2015
        Druh "Ca. N. nitrificans " ♠ van Kessel a kol. 2015
        Druh "Ca. N. nitrosa " ♠ van Kessel a kol. 2015
        Druh "Ca. N. salsa " ♠ Haaijer a kol. 2013
        Druh N. calida ♠ Lebedeva a kol. 2011
        Druh N. defluvii ♠ Nowka a kol. 2015 ["Candidatus Nitrospira defluvii " Spieck a kol. 2006]
        Druh N. japonica ♠ Ushiki a kol. 2013
        Druh N. lenta Nowka a kol. 2015
        Druh N. marina Watson a kol. 1986 (typ sp.)
        Druh N. moscoviensis Ehrich a kol. 1995
      - Rod Thermodesulfovibrio Henry a kol. 1994 vydáno. Sekiguchi a kol. 2008
        Druh T. aggregans Sekiguchi a kol. 2008
        Druh T. hydrogeniphilus Haouari a kol. 2009
        Druh T. islandicus Sonne-Hansen a Ahring 2000
        Druh T. thiophilus Sekiguchi a kol. 2008
        Druh T. yellowstonii Henry a kol. 1994 (typ sp.)

Poznámky:
♠ Kmen nalezen na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)

Viz také

Reference

^ Stanley W. Watson; Eberhard Bock; Frederica W. Valois; John B. Waterbury; Ursula Schlosser (1986). „Nitrospira marina gen. Nov. Sp. Nov .: chemolithotrofní bakterie oxidující dusitany“. Arch Microbiol. 144 (1): 1–7. doi:10.1007 / BF00454947. S2CID 29796511.
^ Ehrich S, Behrens D, Lebedeva E, Ludwig W, Bock E (1995). „Nová obligátně chemolithoautotrofní bakterie oxidující dusitany, Nitrospira moscoviensis sp. Nov. A její fylogenetický vztah.“ Arch Microbiol. 164 (1): 16–23. doi:10.1007 / BF02568729. PMID 7646315. S2CID 2702110.
^ ^A ^b Sayers; et al. "Nitrospirae". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2016-03-20.
^ „16S rRNA založené vydání LTP 123 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2016-03-20.
^ J.P.Euzéby. "Nitrospirae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2016-03-20.

Další čtení

Lefevre, Christopher T .; Frankel, Richard B .; Abreu, Fernanda; Lins, Ulysses; Bazylinski, Dennis A. (26. října 2010). „Kulturně nezávislá charakterizace nového, nekultivovaného magnetotaktického člena kmene Nitrospirae“. Mikrobiologie prostředí. 13 (2): 538–549. doi:10.1111 / j.1462-2920.2010.02361.x. PMID 20977572.

externí odkazy

Leptospirillum sp.

Tento bakterie související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Stanley W. Watson; Eberhard Bock; Frederica W. Valois; John B. Waterbury; Ursula Schlosser (1986). „Nitrospira marina gen. Nov. Sp. Nov .: chemolithotrofní bakterie oxidující dusitany“. Arch Microbiol. 144 (1): 1–7. doi:10.1007 / BF00454947. S2CID 29796511.

[2] Ehrich S, Behrens D, Lebedeva E, Ludwig W, Bock E (1995). „Nová obligátně chemolithoautotrofní bakterie oxidující dusitany, Nitrospira moscoviensis sp. Nov. A její fylogenetický vztah.“ Arch Microbiol. 164 (1): 16–23. doi:10.1007 / BF02568729. PMID 7646315. S2CID 2702110.

[NCBI-3] A ^b Sayers; et al. "Nitrospirae". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2016-03-20.

[4] „16S rRNA založené vydání LTP 123 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2016-03-20.

[5] J.P.Euzéby. "Nitrospirae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2016-03-20.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]