Bacilli - Bacilli
| Bacilli | |
|---|---|
 | |
| Bacillus subtilis, Gramovo barvení | |
Vědecká klasifikace  | |
| Doména: | Bakterie |
| Kmen: | Firmicutes |
| Třída: | Bacilli Ludwig a kol. 2010 |
| Objednávky | |
Bacilli je taxonomické třída z bakterie který zahrnuje dvě objednávky, Bacillales a Lactobacillales, které obsahují několik známých patogenů, jako je Bacillus anthracis (Příčina antrax ). Bacilli jsou téměř výlučně grampozitivní bakterie.[1]
Dvojznačnost
Několik souvisejících konceptů využívá podobná slova a nejednoznačnost může způsobit značný zmatek. Termín "Bacil "(psáno velkými a kurzívou) je také název a rod (Bacillus anthracis), který kromě mnoha jiných rodů spadá do třídy Bacilli.
Slovo "bacil „(nebo jeho množné číslo„ bacily “s malým písmenem b) je také obecný termín k popisu morfologie jakékoli tyčinkovité bakterie. Tento obecný termín neznamená, že subjekt je členem třídy Bacilli nebo rodu Bacil. Nemusí tedy nutně znamenat podobnou skupinu charakteristik. Ne všichni členové třídy Bacilli mají tvar tyče (Staphylococcus je sférický) a existuje mnoho dalších bakterií ve tvaru tyčinky, které nespadají do této třídy (např. Clostridium je ve tvaru tyče, ale taxonomicky velmi odlišný). Obecný pojem „bacil“ navíc nemusí nutně znamenat Grampozitivní barvení společné pro třídu Bacilli. Například, E-coli je bakterie ve tvaru tyčinky, kterou lze popsat jako „bacila“, ale zbarví se Gramnegativní a nepatří do rodu Bacil nebo třída Bacilli. Nějaký mikrobiologové opustili obecný pojem „bacil“ kvůli zmatku, který může vyvolat.
Fylogeneze
Fylogeneze je založena na uvolňování LTP 16S rRNA 132 pomocí Projekt All-Species Living Tree,[2] s aktuálně přijímanou taxonomií založenou na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN),[3] Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)[4]a některá nepotvrzená jména clade z Genomová taxonomická databáze.[5]
| Bacilli |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bacilli část 2 (pokračování)
| Bacilli část 2 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Nezařazené bacily
- „Candidatus Izimaplasma "♠ {" Izimaplasmatales "♥:" Izimaplasmataceae "♥}
- „Candidatus Lumbrikoplazma „♠ {Lumbricoplasmataceae ♠}
- "Rubeoparvulaceae" ♥ {"Rubeoparvulales" ♥}
Poznámky:
♥ Jména clade nebyla podána Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) nebo uvedené v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)
Reference
- ^ Ludwig, Wolfgang; Schleifer, Karl-Heinz; Whitman, William B. (2015). "Třída Bacilli. Listopad". Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria. str. 1. doi:10.1002 / 9781118960608.cbm00033. ISBN 9781118960608.
- ^ „Vydání LTP založené na 16S rRNA 132 (plný strom)“. Projekt All-Species Living Tree. Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2018-07-20.
- ^ J.P.Euzéby. "Bacilli". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2018-07-20.
- ^ Sayers; et al. "Bacilli". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2018-07-20.
- ^ „Taxonomie GTDB“. Genomová taxonomická databáze. Archivovány od originál dne 29. 7. 2018. Citováno 2018-07-20.