Seznam bakteriálních objednávek - List of bacterial orders

Tento článek uvádí seznam objednávky z Bakterie.^[1][2][3]

Kmen Aktinobakterie

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Aktinobakterie.

Třída Acidimicrobiia

• Acidimicrobiales Vychází Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997. Zhi, Li & Stackebrandt 2009

Třída Aktinobakterie

• Acidothermales Sen a kol. 2014
• Catenulisporales Donadio a kol. 2015
• Streptomycetales Kampfer 2015
• Geodermatophilales Sen a kol. 2014
• Frankiales Sen a kol. 2014
• Nakamurellales Sen a kol. 2014
• Druh Kineosporiales Kampfer 2015
• Mikrokokaly Prevot 1940 [Actinomycetales; Bifidobacteriales; Arthrobacteria]
• Propionibacteriales Patrick & McDowell 2015
• Streptosporangiales Goodfellow 2015
• Jiangellales Tang a kol. 2015
• Glycomycetales Labeda 2015
• Micromonosporales Genilloud 2015 [Actinoplanales]
• Pseudonocardiales Labeda & Goodfellow 2015
• Corynebacteriales Goodfellow & Jones 2015 [Mykobakterie]

Třída Coriobacteriia

• Coriobacteriales Stackebrandt a kol. 1997 vychází. Gupta a kol. 2013
• Eggerthellales Gupta a kol. 2013

Třída Nitriliruptoria

• Egibacterales Zhang a kol. 2015
• Egicoccales Zhang a kol. 2015
• Euzebyales Kurahashi a kol. 2010
• Nitriliruptorales Sorokin a kol. 2009

Třída Rubrobakterie

• Rubrobacterales Rainey a kol. 1997

Třída Termoleofilie

• Gaiellales Albuquerque a kol. 2012
• Solirubrobacterales Reddy & Garcia-Pichel 2009
• Termoleofily Reddy & Garcia-Pichel 2009

Kmen Aquificae

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Aquificae.

Třída Aquificae

• Aquificales Reysenbach 2002 vychází. Gupta & Lali 2013
• Desulfurobacteriales Gupta & Lali 2014

Kmen Armatimonadetes

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Armatimonadetes.

Třída Armatimonadia

• Armatimonadales Tamaki a kol. 2011

Třída Chthonomonadetes

• Chthonomonadales Lee a kol. 2011

Třída Fimbriimonadia

• Fimbriimonadales Im a kol. 2012

Kmen Bacteroidetes

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Bacteroidetes.

Třída Bakteroidie

• Bacteroidales Krieg 2012

Třída Balneolia

• Balneolales Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016

Třída "Chitinophagia "

• "Chitinophagales " Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016

Třída Cytofágie

• Cytophagales Leadbetter 1974

Třída Flavobakterie

• Flavobacteriales Bernardet 2012

Třída Rhodotermie

• Rhodothermales Munoz, Rossello-Mora & Amann 2016

Třída "Saprospiria "

• "Saprospirales " Hahnke a kol. 2016

Třída Sfingobakterie

• Sphingobacteriales Kämpfer 2012

Kmen Chlamydie

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Chlamydie.

Třída Chlamydie

• Chlamydiales Storz & Page 1971 se mění. Everett a kol. 1999
• Parachlamydiales Gupta a kol. 2016

Kmen Chlorobi

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Chlorobi.

Třída Chlorobia

• Chlorobiales Gibbons & Murray 1978

Třída Ignavibakterie

• Ignavibacteriales Iino a kol. 2010

Kmen Chloroflexi

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Chloroflexi.

Třída Anaerolineae

• Anaerolineales Yamada a kol. 2006

Třída Ardenticatenia

• Ardenticatenales Kawaichi a kol. 2013

Třída Caldilineae

• Caldilineales Yamada a kol. 2006

Třída Chloroflexie

• Chloroflexales Gupta a kol. 2013
• Herpetosiphonales Gupta a kol. 2013
• Kallotenuales Cole a kol. 2013

Třída Dehalococcoidia

• Dehalococcoidales Löffler a kol. 2013

Třída Ktedobakterie

• Ktedobacterales korigovat. Cavaletti a kol. 2007 vydat. Yabe a kol. 2010
• Thermogemmatisporales Yabe a kol. 2011

Třída Termomikrobie

• Sphaerobacterales Stackebrandt, Rainey & Ward-Rainey 1997
• Thermomicrobiales Garrity & Holt 2002

Třída Termoflexie

• Thermoflexales Dodsworth a kol. 2014

Kmen Chrysiogenetes

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Chrysiogenetes.

Třída Chrysiogenetes

• Chrysiogenales Garrity & Holt 2002

Kmen Sinice

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Sinice.

Třída Gloeobakterie

• Gloeobacterales Cavalier-Smith 2002

Třída Phycobacteria

• Chroococcidiopsidales
• Chroococcales Cavalier-Smith 2002
• Nostocales [Stigonematales]
• Oscillatoriales
• Pleurocapsales
• Pseudanabenales
• Spirulinales
• Synechokoky

Kmen Deferribacteres

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Deferribacteres.

Třída Deferribacteres

• Deferribacterales Huber & Stetter 2002

Kmen Deinococcus-Thermus

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Deinococcus-Thermus.

Třída Deinokoky

• Deinococcales Rainey a kol. 1997 (radio rezistentní mikrokoky)
• Thermales Rainey & da Costa 2002

Kmen Dictyoglomi

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Dictyoglomi.

Třída Dictyoglomi

• Dictyoglomales Patel 2012

Kmen Elusimikrobie

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Elusimikrobie.

Třída "Blastocatellia "

• "Blastocatellales " Pascual a kol. 2015

Třída Elusimikrobie

• Elusimicrobiales Geissinger a kol. 2010

Třída "Endomikrobie "

• "Endomicrobiales " Zheng a kol. 2016

Kmen Fibrobakterie

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Fibrobakterie.

Třída "Chitinispirillia "

• "Chitinispirillales " Sorokin a kol. 2016

Třída Chitinivibrionia

• Chitinivibrionales Sorokin a kol. 2014

Třída Fibrobakterie

• "Fibromonadales " Abdul Rahman a kol. 2016
• Fibrobacterales Španělsko a kol. 2012

Kmen Firmicutes

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Firmicutes.

Třída Erysipelotrichia

• Eggerthiales
• Erysipelotrichales Ludwig a kol. 2010

Třída Thermolithobacteria

• Thermolithobacterales

Třída Tissierellia

• Tissierelliales

Třída Bacilli

• Bacillales
• Lactobacillales Ludwig a kol. 2010
• Podtřída Mollicutes
  • Acholeplasmatales
  • Anaeroplasmatales
  • Entomoplasmatales Tully a kol. 1993
  • Haloplasmatales
  • Mycoplasmatales

Třída Clostridia

• Halanaerobiales Rainey a Zhilina 1995
• Natranaerobiales
• Thermoanaerobacteriales Wiegel 2010
• Podtřída Negativicutes
  • Selenomonadales Marchandin a kol. 2010

Kmen Fusobakterie

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Fusobakterie.

Třída Fusobakterie

• Fusobacterales Staley & Whitman 2012

Kmen Gemmatimonadetes

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Gemmatimonadetes.

Třída Gemmatimonadetes

• Gemmatimonadales Zhang a kol. 2003

Třída Longimikrobie

• Longimicrobiales Pascual a kol. 2016

Kmen Lentisphaerae

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Lentisphaerae.

Třída Lentisphaeria

• Lentisphaerales Cho a kol. 2004 vychází. Choi a kol. 2013
• Victivallales Cho a kol. 2004

Třída Oligosphaeria

• Oligosphaerales Qiu a kol. 2013

Kmen Nitrospirae

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Nitrospirae.

Třída Nitrospiria

• "Nitrospirales "

Kmen Planctomycetes

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Planctomycetes.

Třída Phycisphaerae

• Phycisphaerales Fukunaga a kol. 2010
• Tepidisphaerales Kovaleva et al. 2015

Třída "Planctomycetia "

• "Brocadiales " Jetten a kol. 2011
• Planctomycetales Schlesner & Stackebrandt 1987 vychází. Oddělení 2011

Kmen Proteobakterie

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Proteobakterie.

Podkmen Acidobakterie

Třída Acidobakterie

• Acidobacteriales Cavalier-Smith 2002

Třída Holofágy

• Acanthopleuribacterales Fukunaga a kol. 2008
• Holophagales Fukunaga a kol. 2008

Třída Solibakterie

• "Solibacterales "
• "Bryobacterales "

Třída Alphaproteobacteria

• Caulobacterales Henrici & Johnson 1935
• Holosporales Szokoli a kol. 2016
• "Kopriimonadales " Kwon a kol. 2005c
• Kordiimonadales Kwon a kol. 2005
• Magnetococcales Bazylinski a kol. 2013
• Micropepsales Harbison a kol. 2016
• "Pelagibacterales " Grote a kol. 2012
• Rhizobiales Kuykendall 2006
• Rhodobacterales Garrity, Bell & Lilburn 2006 [Parvularculales]
• Rhodospirillales Pfennig & Truper 1971
• Rhodothalassiales Venkata Ramana a kol. 2014
• Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939 vychází. Dumler a kol. 2001
• Sphingomonadales Yabuuchi & Kosako 2006
• Sneathiellales Kurahashi a kol. 2008

Třída Betaproteobakterie

• Burkholderiales
• "Ferritrophicales " Weiss a kol. 2007
• "Ferrovales " Johnson, Hallberg & Hedrich 2014
• "Gallionellales " Weiss a kol. 2007 (bakterie železa)
• Hydrogenophilales Garrity, Bell & Lilburn 2006
• Methylophilales Garrity, Bell & Lilburn 2006
• Neisseriales
• Nitrosomonadales
• "Procabacteriales " Garrity, Bell & Lilburn 2003
• Rhodocykly Garrity, Bell & Lilburn 2006
• Sulfuricellales Watanabe, Kojima & Fukui 2015

Třída Gammaproteobacteria

• Acidiferrobacterales Kojima, Shinohara a Fukui 2015
• Acidithiobacillales
• Aeromonadales
• Alteromonadales
• Arenicellales Teramoto, Yagyu a Nishijima 2015
• Cardiobacteriales Garrity, Bell & Lilburn
• Cellvibrionales Spring a kol. 2015
• Chromatiales
• Enterobacterales Adeolu a kol. 2016
• Immundisolibacterales Corteselli, Aitken & Singleton 2017
• Legionellales
• Methylococcales
• Nevskiales
• Oceanospirillales
• Orbaly Kwong & Moran 2013
• Pasteurellales
• Pseudomonadales
• Salinisphaerales
• Thiotrichales
• Vibrionales
• Xanthomonadales

Třída deltaproteobakterií

• Bradymonadales Wang a kol. 2015
• Desulfarculales
• Desulfobacterales
• Desulfovibrionales
• Desulfurellales
• Desulfuromonadales
• Myxokoky (plodící klouzavé bakterie)
• Syntrophobacterales

Třída Epsilonproteobakterie

• Campylobacterales
• Nautiliales
• Arcobacter
• Helicobacter

Třída Oligoflexia

• Bacteriovoracales Hahn a kol. 2017
• Bdellovibrionales Garrity, Bell & Lilburn 2006
• Oligoflexales Nakai a kol. 2014
• Silvanigrellales Hahn a kol. 2017

Kmen "Spirochaetia"

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Spirochety.

Třída Spirochety

• Brachyspirales korigovat. Gupta a kol. 2014
• Brevinematales Gupta a kol. 2014
• Leptospirales Gupta a kol. 2014
• Spirochaetales Buchanan 1917 emend. Gupta a kol. 2013

Kmen Synergistetes

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Synergistetes.

Třída Synergistia

• Synergistales Jumas-Bilak a kol. 2009

Kmen Thermodesulfobacteria

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Thermodesulfobacteria.

Třída Thermodesulfobacteria

• Thermodesulfobacteriales Hatchikian, Ollivier & Garcia 2002

Kmen Thermotogae

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Thermotogae.

Třída Thermotogae

• Kosmotogales Bhandari & Gupta 2014
• "Mesoaciditogales Itoh a kol. 2015
• Petrotogales Bhandari & Gupta 2014
• Thermotogales Reysenbach 2002 vychází. Bhandari & Gupta 2014

Kmen Verukomikrobie

Tato část uvádí seznam objednávky z Bakterie v rámci kmen Verukomikrobie.

• "Methylacidiphilales " Op den Camp 2009

Třída "Spartobakterie "

• "Chthoniobacterales " Sangwan a kol. 2004
• "Xiphinematobacterales "

Třída Opitutae

• Opitutales Choo a kol. 2007
• Puniceicoccales Choo a kol. 2007

Třída Verrucomicrobiae

• Verrucomicrobiales Ward-Rainey a kol. 1996 vydáno. Yoon a kol. 2008

Seznam kandidátů Phyla

• "Gracilibacteria" Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidát GN02)
• "Saccharibacteria" Albertsen a kol. 2013 (Kmen kandidáta TM7)
• "Microgenomates" Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidátů OP11)
• "Parcubacteria" Rinke a kol. 2013 (Kandidátský kmen OD1)
• "Melainabacteria" Di Rienzi a kol. 2013
• „Aegiribacteria“ Hamilton a kol. 2016
• "Hydrogenedentes" Rinke a kol. 2013 (Kandidátský kmen NKB19)
• "Kryptonia" Castelle 2013
• "Zixibacteria" Castelle 2013
• „Cloacimonetes“ Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidát WWE1)
• "Latescibacteria" Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidát WS3)
• „Marinimicrobia“ Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidáta SAR406; kandidát kmen Marine skupina A)
• „Omnitrophica“ Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidátů OP3)
• „Kiritimatiellae“ Spring a kol. 2016
• „Aminicenantes“ Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidátů OP8)
• „Calescamantes“ Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidátů EM19)
• "Atribacteria" Dodsworth a kol. 2013 (Kmen kandidátů OP9)
• "Poribakterie" Fiesler a kol. 2004
• "Aerophobetes" Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidáta CD12; BHI80-139)
• "Abawacabacteria" Anantharaman a kol. 2016
• „Absconditabacteria“ Hug a kol. 2016b (kandidátská divize Sulphur River 1)
• "Berkelbacteria" Wrighton a kol. 2014 (Kmen kandidátů ACD58)
• „Caldiserica“ Mori a kol. 2009
• Acetotermie Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidátů OP1)
• Endoecteinascidia
• Tektomikrobie Wilson a kol. 2014
• Fervidibakterie Rinke a kol. 2013 (Kmen kandidátský OctSpa1-106)
• „Peregrinibacteria“ Brown a kol. 2015 (Kmen kandidáta PER)
• "Coatesbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• „Dadabacteria“ Hug a kol. 2016
• „Delongbacteria“ Anantharaman a kol. 2016
• "Desantisbacteria" Probst a kol. 2016
• „Dojkabacteria“ Wrighton a kol. 2016
• „Doudnabacteria“ Anantharaman a kol. 2016
• "Edwardsbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Eisenbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Firestonebacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Fischerbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Fraserbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Glassbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• „Zlaté bakterie“ Hernsdorf a kol. 2017
• "Handelsmanbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Hydrothermae" Jungbluth, Amend & Rappe 2016
• "Kapabacteria" Kantor a kol. 2015
• "Katanobakterie" Hug a kol. 2016b (Kandidátská divize WWE3 bakteriální)
• "Lindowbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Margulisbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• Modulibacteria (kandidátský kmen KSB3)
• "Nitrospinae" Lucker a kol. 2013
• "Raymondbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• „Riflebacteria“ Anantharaman a kol. 2016
• „Rokubacteria“ Hug a kol. 2016
• "Schekmanbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• Závislé Yeoh et al. 2016 (Kmen kandidátů TM6)
• "Wallbacteria" Anantharaman a kol. 2016
• "Wirthbacteria" Hug a kol. 2016

Reference