Deltaproteobakterie - Deltaproteobacteria - Wikipedia
Deltaproteobakterie | |
---|---|
Desulfovibrio vulgaris | |
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
Kmen: | |
Třída: | Deltaproteobakterie |
Objednávky | |
The Deltaproteobakterie jsou třídou Proteobakterie.[1] Všechno druh této skupiny jsou, jako všichni Proteobakterie, Gramnegativní.
The Deltaproteobakterie zahrnují větev převážně aerobních rodů, tvořících plodnice Myxobakterie které vydání myxospory v nepříznivém prostředí a větev přísně anaerobních rodů, která obsahuje většinu známých síran- (Desulfovibrio, Desulfobacter, Desulfococcus, Desulfonemaatd.) a bakterie snižující síru (např. Desulfuromonas spp.) spolu s několika dalšími anaerobními bakteriemi s odlišnou fyziologií (např. redukující železité železo Geobacter spp. a syntrofický Pelobacter a Syntrophus spp.).
Nedávno byla identifikována patogenní intracelulární deltaproteobakterie.[2]
Bylo navrženo, aby Deltaproteobakterie být rozdělen do čtyř nových phyla: Desulfobacterota, Myxococcota, Bdellovibrionotaa SAR324 (zástupný název čekající na popis typového materiálu).[3]
Fylogeneze
Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN) [4] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)[5]a fylogeneze je založena na 16S rRNA na bázi LTP uvolňování 111 o Projekt „All-Species Living Tree“ [6]
Thiobakterie |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Poznámky:
♠ Kmeny nalezené na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LSPN)
♣ International Journal of Systematic Bacteriology nebo International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB / IJSEM) zveřejnil druhy, které jsou v tisku.
Reference
- ^ „www.ncbi.nlm.nih.gov“. Citováno 2009-03-19.
- ^ Schmitz-Esser S, Haferkamp I, Knab S a kol. (Září 2008). „Lawsonia intracellularis obsahuje gen kódující funkční translokázu ATP / ADP podobnou rickettsii pro využití hostitelem“. J. Bacteriol. 190 (17): 5746–52. doi:10.1128 / JB.00391-08. PMC 2519521. PMID 18606736.
- ^ Waite DW, Chuvochina M, Pelikan C, Parks DH, Yilmaz P, Wagner M, Loy A, Naganuma T, Nakai R, Whitman WB, Hahn MW, Kuever J, Hugenholtz P. (2020). "Návrh na reklasifikaci tříd proteobakterií Deltaproteobakterie a Oligoflexiea kmen Thermodesulfobacteria do čtyř kmenů odrážejících hlavní funkční schopnosti “. Int J Syst Evol Microbiol. 70 (11): 5972–6016. doi:10.1099 / ijsem.0.004213. PMID 33151140.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
- ^ J.P.Euzéby. "Deltaproteobacteria". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Archivovány od originál dne 07.10.2011. Citováno 2013-03-20.
- ^ Sayers; et al. "Deltaproteobacteria". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2013-03-20.
- ^ Projekt „All-Species Living Tree“.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 111 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2013-03-20.
externí odkazy
- Deltaproteobakterie v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)