Fusobakterie - Fusobacteria
Fusobakterie | |
---|---|
![]() | |
Fusobacterium novum v tekuté kultuře | |
Vědecká klasifikace ![]() | |
Doména: | Bakterie |
Kmen: | Fusobakterie Garrity & Holt 2012 |
Třída: | Fusobakterie Staley & Whitman, 2012 |
Objednat: | Fusobacteriales Staley & Whitman, 2012 |
Rodiny a rody[1] | |
Fusobakterie jsou povinně anaerobní bez sporeformace Gramnegativní bacily. Od prvních zpráv na konci devatenáctého století se na tyto organismy používají různá jména, někdy se stejným jménem na různé druhy. V poslední době došlo nejen ke změnám nomenklatura, ale také se pokouší rozlišovat mezi druhy, o nichž se předpokládá, že jsou buď patogenní nebo komenzální, nebo obojí. Kvůli jejich asacharolytické Vzhledem k povaze a obecnému nedostatku pozitivních výsledků při rutinních biochemických testech byla laboratorní identifikace fusobakterií obtížná. Uplatnění nových molekulárně biologických technik v taxonomii však zavedlo řadu nových druhů spolu s poddruhem Fusobacterium necrophorum a F. nucleatuma poskytl nové metody identifikace. Zapojení fusobakterií do širokého spektra lidských infekcí způsobujících nekrózu tkání a septikemii bylo uznáno již dlouho a v poslední době byl popsán jejich význam u intraamniotických infekcí, předčasného porodu a tropických vředů.
Od prvních zpráv o fusobakteriích na konci devatenáctého století vedla rozmanitost názvů druhů k určitému zmatku v rodech Fusobacterium a Leptotrichia. Novější metody vyšetřování však vedly k lepšímu pochopení taxonomie s popisem několika nových druhů fusobakterií. Mezi popsané nové druhy patří F. ulcerans z tropických vředů a několika druhů z ústní dutiny. Subspeciace důležitých druhů F. necrophorum a F. nucleatum bylo také možné. Je pravděpodobné, že v budoucnu bude možné taxonomii fusobakterií dále rozvíjet.[2]
Fylogeneze
Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LSPN)[3][4]a fylogeneze je založena na 16S rRNA uvolňování LTP 123 o Projekt All-Species Living Tree.[5]
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Poznámka 1: Druhy nepoužívané v EU Projekt All-Species Living Tree
- Leptotrichiaceae
- Caviibacter abscesus Eisenberg a kol. 2016
- Oceanivirga salmonicida Eisenberg a kol. 2016
- Streptobacillus felis Eisenberg a kol. 2015
- Streptobacillus notomytis Eisenberg a kol. 2015
- Streptobacillus ratti Eisenberg a kol. 2015
- Sneathia amnionii ♠ Harwich a kol. 2012
- Fusobacteriaceae
- Ilyobacter delafieldii Janssen a Harfoot 1991
- Ilyobacter psychrophilus ♠ Qoura & Antranikian 2005a
- Fusobacterium naviforme (Jungano 1909) Moore a Holdeman 1970
- Fusobacterium plautii korigovat. Séguin 1928
- Fusobacterium polysaccharolyticum van Gylswyk 1981
- Fusobacterium prausnitzii (Hauduroy et al. 1937) Moore & Holdeman 1970
- Fusobacterium sulci Cato a kol. 1985
Poznámka 2:
♠ Kmen nalezen na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN
Objevují se nové důkazy, že tyto bakterie mohou způsobovat nebo souviset s rakovinou tlustého střeva. V roce 2011 vyšetřovatelé uvedli přítomnost fusobakterií v tkáni rakoviny tlustého střeva (Genome Res 2012; 22: 292) a nová multicentrická studie poskytuje důkazy o tom, že některé případy - zejména pravostranné - mohou být způsobeny infekcí fusobakteriemi. (1)
1. Bullman S a kol. Science 2017 15. prosince; 358: 1443.
Viz také
Reference
- ^ "Fusobacteriales". Taxonomie NCBI. Bethesda, MD: Národní centrum pro biotechnologické informace. Citováno 3. ledna 2019.
- ^ Bennett, K. W .; Eley, A. (1. října 1993). „Fusobakterie: nová taxonomie a související choroby“. Journal of Medical Microbiology. 39 (4): 246–254. doi:10.1099/00222615-39-4-246. PMID 8411084.[trvalý mrtvý odkaz ]
- ^ J.P.Euzéby. „Fusobacteria“. Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2016-03-20.
- ^ Sayers; et al. „Fusobacteria“. Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2016-03-20.
- ^ Viz Projekt All-Species Living Tree [1]. Data extrahovaná z „16S rRNA založené vydání LTP 123 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2016-03-20.