Sfingobakterie (kmen) - Sphingobacteria (phylum)

Třídu Bacteroidetes viz Sfingobakterie.

Skupina FCB
Bacteroides biacutis 01.jpg
Bacteroides spp.
Vědecká klasifikace
Doména:
Bakterie
(bez hodnocení):
Gracilicutes
Nadkmen:
Skupina FCB
Phyla
Synonyma

Sfingobakterie Cavalier-Smith, 1987[1]

The Skupina FCB je nadkmen z bakterie pojmenoval podle hlavního člena phyla Fibrobakterie, Chlorobi, a Bacteroidetes. Členové jsou považováni za členy a clade kvůli řadě konzervované podpisové indely.[2]

Cavalier-Smith volá ekvivalentní seskupení a kmen jménem Sfingobakterie. Obsahuje třídy Chlorobea (= Chlorobi), Fibrobakterie, Bacteroidetes[A] a Flavobakterie. Tato megaklasifikace však není sledována větší vědeckou komunitou.[3][4][5]

Skupina FCB[2][6][7]
 FCB 
 

 Hydrogenedentes

 
 
 
 
 

 Fermentibakterie

 
 
 

 Gemmatimonadetes

 
 

 Latescibacteria

 
 
 
 
 

 Fibrobakterie

 
 
 

Delfibakterie

 
 
 
 

 Cloacimonetes

 
 

 Zixibakterie

 
 
 
 
 

 Calditrichaeota

 
 

 Marinimikrobie

 
 
Bacteroidetes / Chlorobi
 
 

 Kapabakterie

 
 
 

 Chlorobi

 
 
 

 Bacteroidetes

 
 

 Rhodothermaeota

 
 
 
 
 
 

 Ignavibakterie

 
 

 Kryptonie

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 

Obdobná situace je patrná u Skupina PVC / Planctobacteria.

V tomto roce 2016 je vidět skupina Bacteroidetes-Chlorobi v hnědé barvě strom života použitím ribozomální protein sekvence[8]

Poznámky

  1. ^ Liší se od přijatých Bacteroidetes, které se skládají z Bakteroidie (ekvivalent k Cavalier-Smith's Bacteroidetes), Cytofágie a Flavobakterie a Sfingobakterie.

Reference

  1. ^ Cavalier-Smith, T. (1987). Původ buněk: symbióza mezi geny, katalyzátory a membránami. Cold Spring Harbor Symposia o kvantitativní biologii 52, 805-24, [1], [2].
  2. ^ A b Gupta, R. S. (2004). "Fylogenetické a signální sekvence charakteristiky Fibrobacteres, Chlorobi a Bacteroidetes". Kritické recenze v mikrobiologii. 30 (2): 123–143. doi:10.1080/10408410490435133. PMID  15239383.
  3. ^ Cavalier-Smith T (2006). „Zakořenění stromu života analýzou přechodu“. Biol. Přímo. 1: 19. doi:10.1186/1745-6150-1-19. PMC  1586193. PMID  16834776.
  4. ^ Krieg, N.R .; Ludwig, W .; Whitman, W.B .; Hedlund, B.P .; Paster, B.J .; Staley, J.T .; Ward, N .; Brown, D .; Parte, A. (24. listopadu 2010) [1984 (Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Bergeyho příručka systematické bakteriologie. 4 (2. vyd.). New York: Springer. str. 908. ISBN  978-0-387-95042-6. Britská knihovna č. GBA561951.
  5. ^ Položka klasifikace v LPSN; Euzéby, J.P. (1997). „Seznam bakteriálních jmen se stálým názvoslovím: složka dostupná na internetu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 47 (2): 590–2. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID  9103655.
  6. ^ Emiley A Eloe-Fadrosh et al. 2017, Globální metagenomický průzkum odhalil nový bakteriální kandidát kmen v geotermálních pramenech. Nature Communications 7 · Leden 2016 DOI: 10.1038 / ncomms1047
  7. ^ Kirkegaard, Rasmus Hansen; Dueholm, Morten Simonsen; McIlroy, Simon Jon; Nierychlo, Marta; Kras, Søren Michael; Albertsen, Mads; Nielsen, Per Halkjær (říjen 2016). „Genomické poznatky o členech kandidátského kmene Hyd24-12 běžné v mezofilních anaerobních digestorech“. Časopis ISME. 10 (10): 2352–2364. doi:10.1038 / ismej.2016.43. ISSN  1751-7370. PMID  27058503.
  8. ^ Hug, Laura A .; Baker, Brett J .; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T .; Probst, Alexander J .; Castelle, Cindy J .; Butterfield, Cristina N .; Hernsdorf, Alex W .; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Nataša; Relman, David A .; Finstad, Kari M .; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C .; Banfield, Jillian F. (11. dubna 2016). „Nový pohled na strom života“. Přírodní mikrobiologie. 1 (5): 16048. doi:10,1038 / nmicrobiol.2016,48. PMID  27572647.