Pasteurellaceae - Pasteurellaceae
| Pasteurellaceae | |
|---|---|
 | |
| Haemophilus ducreyi | |
| Vědecká klasifikace | |
| Království: | |
| Kmen: | |
| Třída: | |
| Objednat: | Pasteurellales |
| Rodina: | Pasteurellaceae Castellani & Chalmers, 1919 |
| Rody | |
Actinobacillus | |
The Pasteurellaceae tvoří velkou rodinu gramnegativních bakterie. Většina členů žije jako komenzály na sliznicích ptáků a savců, zejména v horních dýchacích cestách.[3] Typicky jsou to Pasteurellaceae ve tvaru tyče a jsou významnou skupinou fakultativní anaeroby. Jejich biochemické vlastnosti lze odlišit od souvisejících Enterobacteriaceae přítomností oxidáza a od většiny dalších podobných bakterií nepřítomností bičíky.
Bakterie v rodině Pasteurellaceae byly klasifikovány do řady rodů na základě metabolických vlastností, ale tyto klasifikace nejsou obecně přesnými odrazy evolučních vztahů mezi různými druhy. Haemophilus influenzae byl prvním organismem, který měl svůj genom sekvenován a byl intenzivně studován genetickými a molekulárními metodologiemi. Rod Haemophilus je známý lidský patogen spojený s bakteremie, zápal plic, meningitida a venerologický vřed. Mezi další patogenní členy čeledi Pasteurellaceae patří Aggregatibacter, Mannheimia, Pasteurella, a Actinobacillus druh.
Molekulární podpisy a fylogenetická poloha
Srovnávací analýzy genomů Pasteurellaceae identifikovaly velké množství (> 20) konzervované podpisové indely (CSI) v různých důležitých proteinech, které jsou jedinečně sdíleny všemi sekvenovanými druhy / kmeny Pasteurellaceae, ale nenacházejí se v žádných jiných bakteriích. Na základě mnoha dalších CSI, které jsou specifické pro podskupiny druhů Pasteurellaceae, bylo navrženo rozdělit rodinu na nejméně dva subtypy.[4] Jeden navržený clade obsahuje Aggregatibacter, Pasteurella, Actinobacillus succinogenes, Haemophilus influenzae, Haemophilus somnus, a Mannheimia succiniciproducens, zatímco druhý zahrnuje Actinobacillus minor, Actinobacillus pleuropneumoniae, Haemophilus ducreyi, Haemophilus parasuis, a Mannheimia haemolytica.
Molekulární podpisy ve formě CSI byly také použity k vyřešení polyfyletický rozšíření tří hlavních rodů v rámci čeledi Pasteurellaceae: Actinobacillus, Haemophilus, a Pasteurella.[5][6][7] Tyto rody vykazují rozsáhlou polyfylii v celé rodině, nicméně bylo zjištěno, že CSI jsou trvale sdíleny určitými druhy, které tvoří monofyletický skupina v každém příslušném rodu.[5] Distribuce CSI odpovídá sensu stricto clades of "true" Actinobacillus, Haemophilus, a Pasteurella druhy. Protože svědčí o společném původu, předpokládá se, že distribuci CSI lze použít ke stanovení identity rodu, kde druhy, které nesdílejí CSI, lze překlasifikovat jako jiný rod. Bylo také zjištěno, že CSI jsou specifické pro Aggregatibacter a Mannheimia , dva klinicky relevantní rody.[5]
Pasteurellales, spolu s Enterobacterales, jsou z posledních odlišných objednávek v rámci Gammaproteobakterie.[8] Jejich rozlišení od všech ostatních řádů je podporováno přítomností několika konzervovaných podpisových proteinů (CSP), které jsou sdíleny těmito dvěma řády a chybí u všech ostatních bakterií.[8] Pasteurellales také sdílejí další CSP s Enterobacterales, Vibrionales, Aeromonadales, a Alteromonadales, což dodává další rozlišení jejich evolučnímu rozvětvení a fylogenetické poloze mezi velkou třídou Gammaproteobacteria.[8]
Reference
- ^ Parker, Charles Thomas; Garrity, George M. (2018). „Taxonomy of the rod Caviibacterium Adhikary et al. 2018“. doi:10,1601 / tx.31260. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ Parker, Charles Thomas; Garrity, George M. (2018). „Taxonomy of the rod Conservatibacter Adhikary et al. 2018“. doi:10,1601 / tx.31262. Citovat deník vyžaduje
| deník =(Pomoc) - ^ Kokotovic, Branko; Friis, Niels F; Ahrens, Peter (2007). „Mycoplasma alkalescens prokázán v bronchoalveolární laváži skotu v Dánsku“. Acta Veterinaria Scandinavica. 49 (1): 2. doi:10.1186/1751-0147-49-2. ISSN 1751-0147. PMC 1766361. PMID 17204146.
- ^ Naushad, HS; Gupta, RS (leden 2012). "Molekulární podpisy (konzervované indely) v proteinových sekvencích, které jsou specifické pro řád Pasteurellales a rozlišují dva z jeho hlavních subtypů". Antonie van Leeuwenhoek. 101 (1): 105–24. doi:10.1007 / s10482-011-9628-4. PMID 21830122.
- ^ A b C Naushad S, Adeolu M, Goel N, Khadka B, Al-Dahwi A, Gupta RS (2015). „Fylogenomické a molekulární vymezení hlavních členů polyphyletických pasteurellaceae rodů actinobacillus, hemofilus a pasteurella“. Int J Genom. 2015: 198560. doi:10.1155/2015/198560. PMC 4363679. PMID 25821780.
- ^ Olsen I, Dewhirst FE, Paster BJ, Busse HJ (2005) Rodina I. Pasteurellaceae. In: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, edn. 2, svazek 2, str. 851–856. Eds Brenner D. J., Krieg N. R., Garrity G. M., Staley J. T. Springer -: New York.
- ^ Dewhirst FE, Paster BJ, Olsen I, Fraser GJ (1992). "Fylogeneze 54 reprezentativních kmenů druhů z čeledi Pasteurellaceae, jak bylo stanoveno porovnáním 16S rRNA sekvencí". J Bacteriol. 174 (6): 2002–2013. doi:10.1128 / jb.174.6.2002-2013.1992. PMC 205807. PMID 1548238.
- ^ A b C Gao B, Mohan R, Gupta RS (2009). „Fylogenomika a podpisy proteinů objasňují evoluční vztahy mezi Gammaproteobacteria“. Int J Syst Evol Microbiol. 59 (Pt 2): 234–247. doi:10.1099 / ijs.0.002741-0. PMID 19196760.