Halanaerobiales - Halanaerobiales

Halanaerobiales
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Firmicutes
Třída:
Clostridia Rainey 2010
Objednat:
Halanaerobiales Rainey a Zhilina 1995
Rodiny a rody

The Halanaerobiales jsou objednat z bakterie umístěny uvnitř třída Clostridia a zahrnující dvě rodiny, Halanaerobiaceae a Halobacteroidaceae. Původně umístěno do vysoce polyfyletický třída Clostridia, podle NCBI a LPSN, nyní se předpokládá, že leží mimo Firmicutes. Halanaerobiales jsou halofilní povinné anaeroby s fermentačním nebo homoacetogenním metabolizmem.[1]

Fylogeneze

Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)[2] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI)[3]a fylogeneze je založena na uvolňování 106 LTP na bázi 16S rRNA 106 o Projekt All-Species Living Tree.[4]

 
  Halanaerobiaceae
 

Halarsenatibacter silvermanii Switzer Blum a kol. 2010

 
 
 

Halothermothrix orenii Cayol a kol. 1994

 
 
 

Halocella cellulosilytica Simankova a kol. 1994

 
  Halanaerobium
 

?H. alcaliphilum Tsai a kol. 1995

 
 

?H. hydrogeniformans ♠ Brown a kol. 2011

 
 

H. salsuginis Bhupathiraju et al. 1994

 
 
 
 

H. fermentans Kobayashi a kol. 2000

 
 

H. lacusrosei Cayol a kol. 1995

 
 
 
 

H. acetetylicum (Rengpipat et al. 1989) Rainey et al. 1995

 
 

H. sehlinense Abdeljabbar a kol. 2013

 
 
 

H. kushneri Bhupathiraju et al. 1999

 
 
 

H. praevalens Zeikus a kol. 1984

 
 
 

H. congolense Ravot a kol. 1998

 
 

H. saccharolyticum saccharolyticum (Zhilina et al. 1992) Rainey et al. 1995

 
 

H. saccharolyticum senegalense (Cayol a kol. 1994) Rainey a kol. 1995

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  Halobacteroidaceae
 

?Sporohalobacter lortetii (Oren 1984) Oren et al. 1988

 
 
 

Acetohalobium arabaticum Zhilina and Zavarzin 1990

 
 

Selenihalanaerobacter shriftii Switzer Blum a kol. 2001

 
 
 
  Natroniella
 

N. acetigena Zhilina et al. 1996

 
 

N. sulfidigena Sorokin a kol. 2011

 
 
 
 
  Orenia
 

O. marismortui (Oren a kol. 1988) Rainey a kol. 1995

 
 

O. salinaria Mouné a kol. 2000

 
 
 
 

Orenia sivashensis Zhilina a kol. 2000

 
 

Halonatronum saccharophilum Zhilina et al. 2001

 
 
 
 
 
 

Halanaerobaculum tunisiense Hedi a kol. 2009

 
 

Halobacteroides halobius Oren a kol. 1984 [Typ sp.]

 
 
  Halanaerobacter
 

?H. chitinovorans Liaw a Mah 1996

 
 

H. salinarius Mouné a kol. 1999

 
 
 

H. lacunarum (Zhilina et al. 1992) Rainey et al. 1995

 
 

Halobacteroides elegans Zhilina et al. 1997

 
 
 
 
 
 
 
 

Poznámky:
♠ Kmeny nalezené na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LSPN).

Reference

  1. ^ Singh OV (2012). Extremophiles: Udržitelné zdroje a biotechnologické důsledky. John Wiley & Sons. str. 76–79. ISBN  978-1-118-10300-5.
  2. ^ J.P.Euzéby. "Halanaerobiales". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Archivovány od originál dne 27.01.2013. Citováno 2011-11-17.
  3. ^ Sayers; et al. "Halanaerobiales". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2011-06-05.
  4. ^ Projekt All-Species Living Tree.„Vydání LTP založené na 16S rRNA 106 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2011-11-17.

Další čtení

Bardavid, Rahel Elevi; Oren, Aharon (2012). "Aminokyselinové složení bílkovin z anaerobních halofilních bakterií řádu Halanaerobiales". Extremophiles. 16 (3): 567–572. doi:10.1007 / s00792-012-0455-r.