Chloroflexi (kmen) - Chloroflexi (phylum) - Wikipedia
Chloroflexi | |
---|---|
Vědecká klasifikace | |
Doména: | |
(bez hodnocení): | |
Kmen: | Chloroflexi (Garrity a Holt 2002) Hugenholtz a Stackebrandt 2004 |
Třídy | |
Synonyma | |
|
The Chloroflexi nebo Chlorobakterie plocha kmen z bakterie obsahující izoláty s rozmanitostí fenotypů, včetně členů, kteří jsou aerobní termofily, které využívají kyslík a dobře rostou při vysokých teplotách; anoxygenní fototrofy, které používají světlo pro fotosyntéza (zelené nesírové bakterie ); a anaerobní halorespirers, který používá halogenované organické látky (například toxické chlorované etheny a polychlorované bifenyly ) jako akceptory elektronů.
Většina bakterií, pokud jde o rozmanitost, jsou učitelé a skvrna gramnegativní, významné výjimky jsou Firmicutes (nízké G + C. grampozitivní), Aktinobakterie (gram-pozitiva s vysokým G + C) a Deinococcus – Thermus skupina (grampozitivní didermy se silným peptidoglykanem). Naproti tomu členové kmene Chloroflexi jsou monodermy, ale barvení většinou gramnegativní.[1]
Dějiny
Název taxonu byl vytvořen ve vydání 2001 z 1. svazku Bergeyho příručka systematické bakteriologie a je latinské množné číslo jména Chloroflexus, název typ rod kmene, a běžná praxe.[2]
V roce 1987 Carl Woese, považovaný za předchůdce revoluce molekulární fylogeneze, rozdělil Eubacteria do 11 divizí na základě 16S ribozomální RNA (SSU) sekvence a seskupil rody Chloroflexus, Herpetosifon a Thermomikrobium do „zelených nesírných bakterií a příbuzných“,[3][4] který byl dočasně přejmenován na „Chloroflexi“ v prvním dílu Bergeyho manuálu systematické bakteriologie.[5]
Chloroflexi je hluboce se rozvětvující kmen (viz Bakteriální kmen ), bylo považováno v prvním dílu Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, že zahrnuje jedinou třídu se stejným názvem, třídu Chloroflexi.[5] Od roku 2001 však byly díky nově objeveným druhům vytvořeny nové třídy a kmen Chloroflexi je nyní rozdělen takto:[6]
- Chloroflexi Gupta a kol. 2012
- Termomikrobie Hugenholtz & Stackebrandt, 2004
- "Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt, 2004
- Anaerolineae Yamada et al., 2006
- Caldilineae Yamada et al., 2006
- Ktedonobakterie Cavaletti et al., 2007 emend. Yabe et al., 2010
"Dehalococcoidetes „je zástupný název přidělený společností Hugenholtz & Stackebrandt, 2004,[7] po "Dehalococcoides ethenogenes„druh částečně popsaný v roce 1997.[8] První plně popsaný druh byl Dehalogenimonas lykanthroporepellens, Moe a kol. 2009,[9] ale v popisu tohoto druhu nebyla třída oficializována, ani nebyly stanoveny rodiny nebo příkazy, protože tyto dva druhy sdílejí pouze 90% 16S ribozomální RNA identity, což znamená, že by mohli spadat do různých rodin nebo dokonce do objednávek.[9]
Nedávná fylogenetická analýza chloroflexi našla velmi slabou podporu pro seskupování různých tříd, které jsou v současnosti součástí kmene.[10] Šest tříd, které tvoří kmen, netvořilo důsledně dobře podporovanou clade ve fylogenetických stromech založených na zřetězených sekvencích pro velké datové sady proteinů a žádné konzervované podpisové indely byly identifikovány, které byly jedinečně sdíleny celým kmenem.[10] Bylo však zjištěno, že třídy Chloroflexi a Thermomicrobia se seskupují konzistentně jak obvyklými fylogenetickými prostředky, tak identifikací sdílených konzervovaných signálních indelů v 50S ribozomálním proteinu L19 a enzymu UDP-glukóza 4-epimeráza.[10] Bylo navrženo, že kmen Chloroflexi sensu stricto by měla zahrnovat pouze třídy Chloroflexi a Thermomicrobia a další čtyři třídy („Dehalococcoidetes“, „Anaerolineae, Caldilineae a Ktedonobacteria) mohou představovat jednu nebo více nezávislých kmenů větví v sousedství Chloroflexi.[10]
Fylogeneze
Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)[11] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI).[12] Fylogeneze je založena na 16S rRNA založeném na uvolňování LTP 132 o Projekt All-Species Living Tree[13]
Poznámky:
♠ Kmeny nalezené na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LSPN).
♪ Prokaryoty, kde nejsou izolované nebo dostupné žádné čisté (axenické) kultury; tj. nejsou kultivovaní nebo nemohou být udržováni v kultuře po dobu delší než několik sériových pasáží.
Taxonomie
Rod "Candidatus Chlorothrix " Klappenbach & Pierson 2004[17]
- Druh "Candidatus Chlorothrix halophila " Klappenbach & Pierson 2004
Třída Termoflexie Dodsworth a kol. 2014
- Objednat Thermoflexales Dodsworth a kol. 2014
- Rodina Thermoflexaceae Dodsworth a kol. 2014
- Rod Thermoflexus Dodsworth a kol. 2014
- Druh Thermoflexus hugenholtzii Dodsworth a kol. 2014
- Rod Thermoflexus Dodsworth a kol. 2014
- Rodina Thermoflexaceae Dodsworth a kol. 2014
Třída Dehalococcoidia Löffler a kol. 2013 ["Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt 2004]
- Objednat Dehalococcoidales Löffler a kol. 2013
- Rodina Dehalococcoidaceae Löffler a kol. 2013
- Rod Dehalococcoides Löffler a kol. 2013 ["Dehalococcoides" Maymo-Gatell a kol. 1997]
- Druh Dehalococcoides mccartyi Löffler a kol. 2013 ["Dehalococcoides ethenogenes" Maymo-Gatell a kol. 1997]
- Rod Dehalogenimonas Moe a kol. 2009
- Druh D. alkenigignens Bowmann a kol. 2013
- Druh D. formicexedens Key a kol. 2017
- Druh D. lykanthroporepellens Moe a kol. 2009 (typ sp.)
- Rod Dehalococcoides Löffler a kol. 2013 ["Dehalococcoides" Maymo-Gatell a kol. 1997]
- Rodina Dehalococcoidaceae Löffler a kol. 2013
Třída Anaerolineae Yamada a kol. 2006
- Objednat Anaerolineales Yamada a kol. 2006
- Rodina Anaerolineaceae Yamada a kol. 2006
- Rod "Thermanaerothrix " ♠ Gregoire a kol. 2011[18]
- Druh "Thermanaerothrix daxensis " ♠ Gregoire a kol. 2011
- Rod "Brevefilum " ♠ McIlroy a kol. 2017
- Druh "Brevefilum fermentans " ♠ McIlroy a kol. 2017
- Rod "Candidatus Roseilinea " ♠ Thiel a kol. 2016
- Druh "Candidatus Roseilinea gracile " ♠ Thiel a kol. 2016
- Rod Thermomarinilinea Nunoura a kol. 2013
- Druh Thermomarinilinea lacunifontana Nunoura a kol. 2013
- Rod Anaerolinea Sekiguchi a kol. 2003 vychází. Yamada a kol. 2006
- Druh A. thermolimosa Yamada a kol. 2006[14]
- Druh A. thermophila Sekiguchi a kol. 2003[15] (typ sp.)
- Rod Bellilinea Yamada a kol. 2007[16]
- Druh Bellilinea caldifistulae Yamada a kol. 2007[16]
- Rod Flexilinea Sun a kol. 2015
- Druh Flexilinea flocculi Sun a kol. 2015
- Rod Levilinea Yamada a kol. 2006[14]
- Druh Levilinea saccharolytica Yamada a kol. 2006
- Rod Leptolinea Yamada a kol. 2006[14]
- Druh Leptolinea tardivitalis Yamada a kol. 2006
- Rod Longilinea Yamada a kol. 2007[16]
- Druh Longilinea arvoryzae Yamada a kol. 2007
- Rod Ornatilinea Podosokorskaya et al. 2013
- Druh Ornatilinea apprima Podosokorskaya et al. 2013
- Rod Pelolinea Imachi a kol. 2014
- Druh Pelolinea submarina Imachi a kol. 2014
- Rod "Thermanaerothrix " ♠ Gregoire a kol. 2011[18]
- Rodina Anaerolineaceae Yamada a kol. 2006
Třída Ardenticatenia Kawaichi a kol. 2013
- Objednat Ardenticatenales Kawaichi a kol. 2013
- Rodina Ardenticatenaceae Kawaichi a kol. 2013
- Rod "Candidatus Promineofilum " ♠ McIlroy a kol. 2016
- Druh "Candidatus Promineofilum breve " ♠ McIlroy a kol. 2016
- Rod Ardenticatena Kawaichi a kol. 2013
- Druh Ardenticatena maritima Kawaichi a kol. 2013
- Rod "Candidatus Promineofilum " ♠ McIlroy a kol. 2016
- Rodina Ardenticatenaceae Kawaichi a kol. 2013
Třída Caldilineae Yamada a kol. 2006
- Objednat Caldilineales Yamada a kol. 2006
- Rodina Caldilineaceae Yamada a kol. 2006
- Rod Litorilinea Kale a kol. 2013
- Druh Litorilinea aerophila Kale a kol. 2013
- Rod Caldilinea Sekiguchi a kol. 2003
- Druh C. aerophila Sekiguchi a kol. 2003[15] (typ sp.)
- Druh C. tarbellica Grégoire et al. 2011[19]
- Rod Litorilinea Kale a kol. 2013
- Rodina Caldilineaceae Yamada a kol. 2006
Třída Ktedonobakterie Cavaletti a kol. 2007 pozměnit. Yabe a kol. 2010 ["Ktedobacteria" (sic) Cavaletti a kol. 2006]
- Objednat Thermogemmatisporales Yabe a kol. 2011
- Rodina Thermogemmatisporaceae Yabe a kol. 2011
- Rod Thermogemmatispora Yabe a kol. 2011[20]
- Druh T. foliorum Yabe a kol. 2011[20]
- Druh T. carboxidivorans Král a král 2014
- Druh T. onikobensis Yabe a kol. 2011[20] (typ sp.)
- Rod Thermogemmatispora Yabe a kol. 2011[20]
- Rodina Thermogemmatisporaceae Yabe a kol. 2011
- Objednat Ktedonobacterales Cavaletti a kol. 2007 ["Ktedobacterales" (sic) Cavaletti a kol. 2006]
- Rodina Ktedonobacteriaceae Cavaletti a kol. 2007 ["Ktedobacteraceae" (sic) Cavaletti a kol. 2006]
- Rod Dictyobacter Yabe a kol. 2017
- Druh Dictyobacter aurantiacus Yabe a kol. 2017
- Rod Ktedonobacter korigovat. Cavaletti a kol. 2007 ["Ktedobacter„(sic) Cavaletti a kol. 2006]
- Druh Ktedonobacter racemifer korigovat. Cavaletti a kol. 2007[21] ["Ktedobacter (sic) racemifer" Cavaletti a kol. 2006]
- Rod Dictyobacter Yabe a kol. 2017
- Rodina Thermosporotrichaceae Yabe a kol. 2010
- Rod Thermosporothrix Yabe a kol. 2010[22]
- Druh T. hazakensis Yabe a kol. 2010
- Druh T. narukonensis Yabe, Sakai a Yokota 2016
- Rod Thermosporothrix Yabe a kol. 2010[22]
- Rodina Ktedonobacteriaceae Cavaletti a kol. 2007 ["Ktedobacteraceae" (sic) Cavaletti a kol. 2006]
Třída Termomikrobie Garrity a Holt 2002 vznikají. Hugenholtz a Stackebrandt 2004
- Rod "Termobaculum " ♠ Botero a kol. 2004[23]
- Druh "Thermobaculum terrenum " ♠ Botero a kol. 2004
- Objednat Sphaerobacterales Stackebrandt a kol. 1997
- Rodina Sphaerobacteraceae Stackebrandt a kol. 1997
- Rod Nitrolancea Sorokin a kol. 2014 ["Nitrolancetus" Sorokin a kol. 2012]
- Druh Nitrolancea hollandica Sorokin a kol. 2014 ["Nitrolancetus hollandicus" Sorokin a kol. 2012]
- Rod Sphaerobacter Demharter a kol. 1989
- Druh Sphaerobacter thermophilus Demharter a kol. 1989[24]
- Rod Nitrolancea Sorokin a kol. 2014 ["Nitrolancetus" Sorokin a kol. 2012]
- Rodina Sphaerobacteraceae Stackebrandt a kol. 1997
- Objednat Thermomicrobiales Garrity a Holt 2002
- Rodina Thermomicrobiaceae Garrity a Holt 2002
- Rod Termorudis Král a král 2014
- Druh T. farmakofila Houghton a kol. 2015
- Druh T. peleae Král a král 2014
- Rod Thermomikrobium Jackson a kol. 1973[25]
- Druh T. carboxidum Král a král 2014
- Druh T. roseum Jackson a kol. 1973
- Rod Termorudis Král a král 2014
- Rodina Thermomicrobiaceae Garrity a Holt 2002
Třída Chloroflexie Gupta a kol. 2013
- Objednat Kallotenuales Cole a kol. 2013
- Rodina Kallotenuaceae Cole a kol. 2013
- Rod Kallotenue Cole a kol. 2013
- Druh Kallotenue papyrolyticum Cole a kol. 2013
- Rod Kallotenue Cole a kol. 2013
- Rodina Kallotenuaceae Cole a kol. 2013
- Objednat Herpetosiphonales Gupta a kol. 2013 ["Herpetosiphonales" Castenholz 2001]
- Rodina Herpetosiphonaceae Gupta a kol. 2013 ["Herpetosiphonaceae" Castenholz 2001]
- Rod Herpetosifon Holt & Lewin 1968
- Druh H. aurantiacus Holt & Lewin 1968[26] ["Herpetosiphon giganteus"]
- Druh H. geysericola Lewin 1970[27][28] ["Lewinella geysericola„ne“Phormidium geysericola" Copeland 1936; "Herpetosiphon geysericolus" (sic) Lewin 1970]
- Rod Herpetosifon Holt & Lewin 1968
- Rodina Herpetosiphonaceae Gupta a kol. 2013 ["Herpetosiphonaceae" Castenholz 2001]
- Objednat Chloroflexales Gupta a kol. 2013
- Rod "Dehalobium " ♠ Wu a kol. 2002[29]
- Druh "Dehalobium chlorocoercia " ♠ Wu a kol. 2002
- Podřád Roseiflexineae Gupta a kol. 2013
- Rodina Roseiflexaceae Gupta a kol. 2013
- Rod "Kouleothrix " ♠ Kohno a kol. 2002
- Druh "Kouleothrix aurantiaca " ♠ Kohno a kol. 2002
- Rod Heliothrix ♦ Pierson a kol. 1986
- Druh Heliothrix oregonensis ♦ Pierson a kol. 1986[30]
- Rod Roseiflexus Hanada a kol. 2002
- Druh Roseiflexus castenholzii Hanada a kol. 2002[31]
- Rod "Kouleothrix " ♠ Kohno a kol. 2002
- Rodina Roseiflexaceae Gupta a kol. 2013
- Podřád Chloroflexineae Gupta a kol. 2013
- Rodina Chloroflexaceae Gupta a kol. 2013
- Rod Candidatus Chloranaerofilum Thiel a kol. 2016
- Druh Candidatus Chloranaerofilum corporosum Thiel a kol. 2016
- Rod Chloroflexus Pierson & Castenholz 1974
- Druh C. Aggregans Hanada a kol. 1995[32]
- Druh C. aurantiacus Pierson & Castenholz 1974[33] (typ sp.)
- Druh C. islandicus Gaisin a kol. 2017
- Rod Candidatus Chloranaerofilum Thiel a kol. 2016
- Rodina Oscillochloridaceae Gupta a kol. 2013
- Rod Candidatus Chloroploca Gorlenko a kol. 2014
- Druh Candidatus Chloroploca asiatica Gorlenko a kol. 2014
- Rod Chloronema ♪ Dubinina a Gorlenko 1975
- Druh Chloronema giganteum ♪ Dubinina a Gorlenko 1975
- Rod Oscillochloris Gorlenko & Pivovarova 1989 vznikají. Keppen a kol. 2000
- Druh O. chrysea ♪ Gorlenko & Pivovarova 1989(typ sp.)
- Druh O. trichoides ♦ (ex Szafer) Gorlenko & Korotkov 1989 emend. Keppen a kol. 2000 ["Oscillatoria trichoides" (Szafer) Lauterborn 1915]
- Rod Candidatus Chloroploca Gorlenko a kol. 2014
- Rodina Chloroflexaceae Gupta a kol. 2013
- Rod "Dehalobium " ♠ Wu a kol. 2002[29]
Etymologie
Název Chloroflexi je jmenovaný případ neolatinu v mužském množném čísle Chloroflexus, což je název prvního popsaného rodu. Podstatné jméno je kombinací řeckého adjektiva chloros, -a, on (χλωρός, -ά, -όν),[34] což znamená „zelenožlutý“ a latinské mužské pasivní dokonalé příčestí flexus (z flecto),[35] což znamená „ohnuté“.[5] Etymologie s tím nesouvisí chlór, prvek, který objevil v roce 1810 Sir Humphry Davy a pojmenoval podle své světle zelené barvy. Další kmen se stejným kořenem je Chlorobi, zatímco Sinice má kořen cyanos (κύανος), což znamená „modrozelená“.[36]
Na rozdíl od jiných kmenů není ve jménech rodů Chloroflexi žádný kořen motivu a ve skutečnosti mnoho rodů začínajících na „Chloro-"nebo končí na "-chloris" jsou buď sinice nebo chlorobi.
Reference
- ^ Sutcliffe, I. C. (2010). "Pohled na úroveň kmene na architekturu obálky bakteriálních buněk". Trendy v mikrobiologii. 18 (10): 464–470. doi:10.1016 / j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
- ^ Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley (26. července 2005) [1984 (Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Úvodní eseje. Bergeyho příručka systematické bakteriologie. 2A (2. vyd.). New York: Springer. str. 304. ISBN 978-0-387-24143-2. Britská knihovna č. GBA561951.
- ^ Holland L. (22. května 1990). „Běda, Carl v čele revoluce bakteriální evoluce“. Vědec. 4 (10).
- ^ Woese, C. R. (1987). "Bakteriální evoluce". Mikrobiologické recenze. 51 (2): 221–271. doi:10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987. PMC 373105. PMID 2439888.
- ^ A b C Don J. Brenner; Noel R. Krieg; James T. Staley (26. července 2005) [1984 (Williams & Wilkins)]. George M. Garrity (ed.). Úvodní eseje. Bergeyho příručka systematické bakteriologie. 2A (2. vyd.). New York: Springer. str. 304. ISBN 978-0-387-24143-2. Britská knihovna č. GBA561951.
- ^ Zápis bakteriální klasifikace v LPSN; Euzéby, J.P. (1997). „Seznam bakteriálních jmen se stálým názvoslovím: složka dostupná na internetu“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 47 (2): 590–2. doi:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.
- ^ Hugenholtz, P .; Stackebrandt, E. (2004). „Reklasifikace Sphaerobacter thermophilus z podtřídy Sphaerobacteridae v kmeni Actinobacteria do třídy Thermomicrobia (upravený popis) v kmeni Chloroflexi (upravený popis)“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 54 (6): 2049–2051. doi:10.1099 / ijs.0.03028-0. PMID 15545432.
- ^ Maymo-Gatell, X .; Chien, Y .; Gossett, J. M .; Zinder, S. H. (1997). „Izolace bakterie, která reduktivně dechloruje tetrachlorethen na eten“. Věda. 276 (5318): 1568–1571. doi:10.1126 / science.276.5318.1568. PMID 9171062.
- ^ A b Moe, W. M .; Yan, J .; Nobre, M.F .; Da Costa, M. S .; Rainey, F. A. (2009). „Dehalogenimonas lykanthroporepellens gen. Nov., sp. Nov., redukčně dehalogenující bakterie izolovaná z podzemních vod kontaminovaných chlorovaným rozpouštědlem“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 59 (11): 2692–2697. doi:10.1099 / ijs.0.011502-0. PMID 19625421.
- ^ A b C d Gupta, R. S .; Chander, P .; George, S. (2012). "Fylogenetický rámec a molekulární podpisy pro třídu Chloroflexi a její různé subtypy; návrh na rozdělení třídy Chloroflexi. Listopad Do podřádu Chloroflexineae subord. Listopad, který se skládá z emended čeledi Oscillochloridaceae a čeledi Chloroflexaceae fam. Listopad," a podřád Roseiflexineae subord. Nov., obsahující rodinu Roseiflexaceae fam. Nov ". Antonie van Leeuwenhoek. 103 (1): 99–119. doi:10.1007 / s10482-012-9790-3. PMID 22903492.
- ^ J.P.Euzéby. "Chloroflexi". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2018-07-20.
- ^ Sayers; et al. "Chloroflexi". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2014-03-20.
- ^ „Vydání LTP založené na 16S rRNA 132 (plný strom)“. Projekt All-Species Living Tree. Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2018-07-20.
- ^ A b C d E F Yamada, T .; Sekiguchi, Y .; Hanada, S .; Imachi, H .; Ohashi, A .; Harada, H .; Kamagata, Y. (2006). "Anaerolinea thermolimosa sp. listopad., Levilinea saccharolytica gen. nov., sp. listopad. A Leptolinea tardivitalis gen. nov., sp. nov., nové vláknité anaeroby a popis nových tříd Anaerolineae classis nov. A Caldilineae classis nov. V bakteriálním kmeni Chloroflexi ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 56 (6): 1331–1340. doi:10.1099 / ijs.0.64169-0. PMID 16738111.
- ^ A b C Sekiguchi, Y .; Yamada, T .; Hanada, S .; Ohashi, A .; Harada, H .; Kamagata, Y. (2003). "Anaerolinea thermophila gen. nov., sp. listopad. A Caldilinea aerophila gen. nov., sp. nov., nové vláknité termofily, které představují dříve nekultivovanou linii doménových bakterií na úrovni podčeledi “. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53 (6): 1843–1851. doi:10.1099 / ijs.0.02699-0. PMID 14657113.
- ^ A b C d Yamada, T .; Imachi, H .; Ohashi, A .; Harada, H .; Hanada, S .; Kamagata, Y .; Sekiguchi, Y. (2007). "Bellilinea caldifistulae gen. nov., sp. listopad. A Longilinea arvoryzae gen. nov., sp. nov., striktně anaerobní, vláknité bakterie kmene Chloroflexi izolované z konsorcií degradujících methanogenní propionát “. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 57 (10): 2299–2306. doi:10.1099 / ijs.0.65098-0. PMID 17911301.
- ^ Klappenbach, J. A .; Pierson, B. K. (2004). „Fylogenetická a fyziologická charakterizace vláknité anoxygenní fotoautotrofní bakterie 'Candidatus Chlorothrix halophila' Gen. Nov., sp. Listopadu, zotaveno z hypersalinních mikrobiálních podložek “. Archiv mikrobiologie. 181 (1): 17–25. doi:10.1007 / s00203-003-0615-7. PMID 14655000.
- ^ Grégoire, P .; Fardeau, M. L .; Joseph, M .; Guasco, S .; Hamaide, F .; Biasutti, S .; Michotey, V. R .; Bonin, P .; Ollivier, B. (2011). "Izolace a charakterizace Thermanaerothrix daxensis gen. nov., sp. listopadu., termofilní anaerobní bakterie náležející do kmene „Chloroflexi“, izolovaná z hluboké horké zvodnělé vrstvy v povodí Akvitánie. Systematická a aplikovaná mikrobiologie. 34 (7): 494–497. doi:10.1016 / j.syapm.2011.02.004. PMID 21621938.
- ^ Gregoire, P .; Bohli, M .; Cayol, J. -L .; Joseph, M .; Guasco, S .; Dubourg, K .; Cambar, J .; Michotey, V .; Bonin, P .; Fardeau, M. -L .; Ollivier, B. (2010). "Caldilinea tarbellica sp. nov., vláknitá, termofilní, anaerobní bakterie izolovaná z hluboké horké zvodnělé vrstvy v povodí Akvitánie “. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (6): 1436–1441. doi:10.1099 / ijs.0.025676-0. PMID 20584812.
- ^ A b C Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Yokota, A. (2010). "Thermogemmatispora onikobensis gen. nov., sp. listopad. A Thermogemmatispora foliorum sp. nov., izolovaný z opadaného listí na geotermálních půdách a popis Thermogemmatisporaceae fam. Listopad a Thermogemmatisporales ord. Listopad Ve třídě Ktedonobacteria ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (4): 903–910. doi:10.1099 / ijs.0.024877-0. PMID 20495028.
- ^ Cavaletti, L .; Monciardini, P .; Bamonte, R .; Schumann, P .; Rohde, M .; Sosio, M .; Donadio, S. (2006). „Nová linie vláknitých, spórotvorných, grampozitivních bakterií z půdy“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 72 (6): 4360–4369. doi:10.1128 / AEM.00132-06. PMC 1489649. PMID 16751552.
- ^ Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Yokota, A. (2009). "Thermosporothrix hazakensis gen. nov., sp. nov., izolovaný z kompostu, popis Thermosporotrichaceae fam. Listopad Ve třídě Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 a upravený popis třídy Ktedonobacteria ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 60 (8): 1794–1801. doi:10.1099 / ijs.0.018069-0. PMID 19767365.
- ^ Botero, L. M .; Brown, K. B .; Brumefield, S .; Burr, M .; Castenholz, R. W .; Young, M .; McDermott, T. R. (2004). "Thermobaculum terrenum gen. nov., sp. listopad: Nefototrofní grampozitivní termofil představující environmentální klonovou skupinu související s Chloroflexi (zelené nesírové bakterie) a Thermomicrobia “. Archiv mikrobiologie. 181 (4): 269–277. doi:10.1007 / s00203-004-0647-7. PMID 14745485.
- ^ Demharter, W .; Hensel, R .; Smida, J .; Stackebrandt, E. (1989). "Sphaerobacter thermophilus gen. nov., sp. listopad. Hluboce zakořeněný člen dělení aktinomycetů izolovaného od termofilně ošetřeného kalu z čistíren odpadních vod “. Systematická a aplikovaná mikrobiologie. 11 (3): 261–266. doi:10.1016 / S0723-2020 (89) 80023-2.
- ^ Jackson, T. J .; Ramaley, R. F .; Meinschein, W. G. (1973). „Thermomicrobium, nový rod extrémně termofilních bakterií“. International Journal of Systematic Bacteriology. 23: 28–36. doi:10.1099/00207713-23-1-28.
- ^ Holt, J. G .; Lewin, R. A. (1968). „Herpetosiphon aurantiacus gen. Et sp. N., nový vláknitý klouzavý organismus“. Journal of Bacteriology. 95 (6): 2407–2408. doi:10.1128 / JB.95.6.2407-2408.1968. PMC 315177. PMID 5669912.
- ^ Copeland, J. J. (1936). "Yellowstone Thermal Myxophyceae". Annals of the New York Academy of Sciences. 36: 4–223. doi:10.1111 / j.1749-6632.1936.tb56976.x.
- ^ Lewin, R. A. (1970). "Nový druh Herpetosiphon (Flexibacterales)". Canadian Journal of Microbiology. 16 (6): 517–520. doi:10,1139 / m70-087. PMID 5423287.
- ^ Wu, Q .; Watts, J. E. M .; Sowers, K. R .; May, H. D. (2002). „Identifikace bakterie, která konkrétně katalyzuje redukční dechloraci polychlorovaných bifenylů dvojnásobně ohraničenými chlory“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 68 (2): 807–812. doi:10.1128 / AEM.68.2.807-812.2002. PMC 126686. PMID 11823222.
- ^ Pierson, B. K .; Giovannoni, S. J .; Stahl, D. A .; Castenholz, R. W. (1985). „Heliothrix oregonensis, gen. Nov., sp. Nov., fototrofní vláknitá klouzavá bakterie obsahující bakteriochlorofyl a“. Archiv mikrobiologie. 142 (2): 164–167. doi:10.1007 / BF00447061. PMID 2412519.
- ^ Hanada, S .; Takaichi, S .; Matsuura, K .; Nakamura, K. (2002). "Roseiflexus castenholzii gen. nov., sp. nov., termofilní, vláknitá, fotosyntetická bakterie, která postrádá chlorosomy ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 1): 187–193. doi:10.1099/00207713-52-1-187. PMID 11837302.
- ^ Hanada, S .; Hiraishi, A .; Shimada, K .; Matsuura, K. (1995). "Chloroflexus aggregans sp. nov., vláknitá fototrofní bakterie, která aktivním klouzavým pohybem vytváří husté agregáty buněk ". International Journal of Systematic Bacteriology. 45 (4): 676–681. doi:10.1099/00207713-45-4-676. PMID 7547286.
- ^ Pierson, B. K .; Castenholz, R. W. (1974). „Fototrofní klouzavá vláknitá bakterie horkých pramenů, Chloroflexus aurantiacus, gen. A sp. Listopad“. Archiv mikrobiologie. 100 (1): 5–24. doi:10.1007 / BF00446302. PMID 4374148.
- ^ χλωρός. Liddell, Henry George; Scott, Robert; Řecko-anglický lexikon na Projekt Perseus
- ^ Lewis & Short ...
- ^ κύανος. Liddell, Henry George; Scott, Robert; Řecko-anglický lexikon na Projekt Perseus