Království (biologie) - Kingdom (biology)

ŽivotDoménaKrálovstvíKmenTřídaObjednatRodinaRodDruh
Hierarchie biologická klasifikace je osm hlavních taxonomické hodnosti. A doména obsahuje jedno nebo více království. Mezilehlé menší hodnocení se nezobrazí.

v biologie, království (latinský: regnum, množné číslo regna) je druhá nejvyšší taxonomická hodnost, přímo pod doména. Království jsou rozdělena do menších skupin zvaných phyla.

Některé učebnice ze Spojených států a Kanady tradičně používaly systém šest království (Animalia, Plantae, Houby, Protista, Archaea / Archeobakterie a Bakterie / Eubacteria), zatímco učebnice v zemích jako Velká Británie, Indie, Řecko, Brazílie a další země používají pouze pět království (Animalia, Plantae, Houby, Protista a Monera ).

Některé nedávné klasifikace založené na moderních kladistika výslovně opustili pojem „království“ s tím, že tradiční království tomu tak není monofyletický, tj. neskladají se ze všech potomků společného předka.

Definice a související pojmy

Když Carl Linné představil systém založený na hodnostech nomenklatura do biologie v roce 1735 dostala nejvyšší hodnost jméno „království“ a následovaly ji další čtyři hlavní nebo hlavní hodnosti: třída, objednat, rod a druh.[1] Později byly zavedeny další dvě hlavní řady, které vytvářely posloupnost království, kmen nebo rozdělení, třída, objednávka, rodina, rod a druh.[2] V roce 1990 hodnost doména byl představen nad království.[3]

Předpony lze přidat tak subkingdom (subregnum) a infrakingdom (také známý jako infraregnum) jsou dvě řady bezprostředně pod královstvím. Superkingdom lze považovat za ekvivalent domény nebo říše nebo za nezávislou hodnost mezi královstvím a doménou nebo subdoménou. V některých klasifikačních systémech další hodnost větev (Latinský: ramus) lze vložit mezi subkingdom a infrakingdom, např. Protostomie a Deuterostomie v klasifikaci Cavalier-Smith.[4]

Dějiny

Dvě království života

Klasifikace živých věcí na zvířata a rostliny je starodávná. Aristoteles (384–322 př. N. L.) Klasifikoval druhy zvířat ve svém Dějiny zvířat, zatímco jeho žák Theophrastus (c. 371 – c. 287 př. n. l.) napsal paralelní dílo Historia Plantarum, na rostlinách.[5]

Carl Linné (1707–1778) položil základy moderní doby biologická nomenklatura, nyní regulováno Kódy nomenklatury, v roce 1735. Rozlišoval dvě království živých věcí: Regnum Animale ('zvíře království “) a Regnum Vegetabile ("rostlinné království" pro rostliny ). Linné také zahrnuto minerály ve svém klasifikačním systému je umístil do třetího království, Regnum Lapideum.

 
Život
 

Regnum Animale (zvířata)

 
 

Regnum Vegetabile („zelenina“ / rostliny)

 
 
Neživot
 

Regnum Lapideum (minerály)

 
 
 

Tři království života

Haeckelova původní koncepce (1866) tří království života, včetně nového království Protista. Všimněte si zahrnutí sinice Nostoc s rostlinami.

V roce 1674 Antonie van Leeuwenhoek, často nazývaný „otec mikroskopie“, poslal královská společnost z Londýna kopie jeho prvních pozorování mikroskopických jednobuněčných organismů. Do té doby byla existence takových mikroskopických organismů zcela neznámá. Navzdory tomu Linné nezahrnul do své původní taxonomie žádné mikroskopické tvory.

Nejprve byly mikroskopické organismy klasifikovány v živočišné a rostlinné říši. V polovině 19. století však bylo mnoha lidem jasné, že „existující dichotomie rostlinné a živočišné říše [se stala] na jejích hranicích rychle rozmazaná a zastaralá“.[6]

V roce 1860 John Hogg navrhl třetí království života Protoctista složený ze „všech nižších tvorů nebo primárních organických bytostí“.[6] V roce 1866 Ernst Haeckel také navrhl třetí království života, Protista, pro „neutrální organismy“ nebo „království primitivních forem“, které nebyly ani zvířecí, ani rostlinné. Haeckel několikrát revidoval obsah tohoto království, než se rozhodl rozdělit na základě toho, zda jsou organismy jednobuněčné (Protista) nebo mnohobuněčné (zvířata a rostliny).[6]

 
Život
 

Království Protista nebo Protoctista

 
 

Království Plantae

 
 

Království Animalia

 
 
 

Čtyři království

Vývoj mikroskopie odhalil důležité rozdíly mezi těmi organismy, jejichž buňky nemají odlišnost jádro (prokaryoty ) a organismy, jejichž buňky mají odlišné jádro (eukaryoty ). V roce 1925 Édouard Chatton zavedl výrazy „prokaryot“ a „eukaryot“ k odlišení těchto organismů.[7]

V roce 1938 Herbert F. Copeland navrhl klasifikaci čtyř království vytvořením románu Království Monera prokaryotických organismů; jako revidovaný kmen Monera z Protisty zahrnoval organismy nyní klasifikované jako Bakterie a Archaea. Ernst Haeckel, ve své knize z roku 1904 Zázraky života, umístili modrozelené řasy (nebo Phycochromacea) do Monery; toto by postupně získalo uznání a modrozelené řasy by se v kmeni klasifikovaly jako bakterie Sinice.[6][7]

V šedesátých letech Roger Stanier a C. B. van Niel propagovali a popularizovali dřívější práci Édouarda Chattona, zejména v jejich příspěvku z roku 1962 „Koncept bakterie“; tím se poprvé vytvořila hodnost nad královstvím - a superkingdom nebo říše- s systém dvou říší prokaryot a eukaryot.[7] Systém dvou říší by později byl rozšířen na třídoménový systém Archea, bakterií a eukaryot.[8]

 
Život
ŘíšeProkaryota
 

Království Monera

 
 
ŘíšeEukaryota
 

Království Protista nebo Protoctista

 
 

Království Plantae

 
 

Království Animalia

 
 
 
 

Pět království

Rozdíly mezi houby a jiné organismy považované za rostliny už někteří dávno poznali; Haeckel přesunul houby z Plantae do Protisty po jeho původní klasifikaci,[6] ale byl v tomto oddělení do značné míry ignorován vědci své doby. Robert Whittaker uznal další království pro Houby. Výsledný systém pěti království, navržený v roce 1969 Whittakerem, se stal populárním standardem a s určitým vylepšením se stále používá v mnoha pracích a tvoří základ pro nové systémy s více královstvími. Je založen hlavně na rozdílech v výživa; jeho planety byly většinou mnohobuněčné autotrofy, jeho mnohobuněčný Animalia heterotrofy a jeho mnohobuněčné houby saprotrofy.

Zbývající dvě království, Protista a Monera, zahrnovala jednobuněčné a jednoduché buněčné kolonie.[9] Systém pěti království lze kombinovat se systémem dvou říší. V systému Whittaker zahrnoval Plantae některé řasy. V jiných systémech, jako je Lynn Margulis Systém pěti království, rostliny zahrnovaly pouze suchozemské rostliny (Embryophyta ) a Protoctista má širší definici.[10]

Život
ŘíšeProkaryota
 

Království Monera

 
 
ŘíšeEukaryota
 

Království Protista nebo Protoctista

 
 

Království Plantae

 
 

Království Houby

 
 

Království Animalia

 
 
 

Po zveřejnění Whittakerova systému se model pěti království začal běžně používat v učebnicích biologie pro střední školy.[11] Ale navzdory vývoji ze dvou království na pět mezi většinou vědců někteří autoři až v roce 1975 pokračovali v používání tradičního systému dvou království se zvířaty a rostlinami, rozdělením rostlinné říše na subkultury Prokaryota (bakterie a sinice), Mycota (houby a předpokládaní příbuzní) a Chlorota (řasy a suchozemské rostliny).[12]

Šest království

V roce 1977 Carl Woese a kolegové navrhli základní dělení prokaryot na Eubacteria (později nazývané Bacteria) a Archaebacteria (později nazývané Archaea), založené na ribozomální RNA struktura;[13] toto by později vedlo k návrhu tři „domény“ života, Bacteria, Archaea a Eukaryota.[3] V kombinaci s modelem pěti království to vytvořilo model šesti království, kde království Monera je nahrazeno královstvími Bacteria a Archaea.[14] Tento model šesti království se běžně používá v nedávných učebnicích biologie pro střední školy v USA, ale dostal kritiku za kompromis současného vědeckého konsensu.[11] Ale rozdělení prokaryot do dvou království zůstává v provozu s nedávným sedm království schéma Thomase Cavalier-Smitha, i když se primárně liší tím, že Protista je nahrazen Prvoci a Chromista.[15]

 
Život
 
ŘíšeProkaryota
 

Království Eubakterie (Bakterie)

 
 

Království Archeobakterie (Archaea)

 
 
 
 
ŘíšeEukaryota
 

Království Protista nebo Protoctista

 
 

Království Plantae

 
 

Království Houby

 
 

Království Animalia

 
 
 
 
 

Osm království

Thomas Cavalier-Smith v té době podpořil konsenzus, že rozdíl mezi Eubakterie a Archeobakterie byla tak velká (zejména s ohledem na genetickou vzdálenost ribozomálních genů), že prokaryoty musely být rozděleny do dvou různých království. Poté se rozdělil Eubakterie do dvou subkultur: Negibakterie (Gram negativní bakterie) a Posibakterie (Gram pozitivní bakterie). Technologický pokrok v elektronové mikroskopii umožnil separaci Chromista z Plantae království. Chloroplast chromistů se skutečně nachází v lumen endoplazmatické retikulum místo v cytosol. Navíc obsahují pouze chromisty chlorofyl c. Od té doby bylo do království Chromista integrováno mnoho nefotosyntetických kmenů protistů, o nichž se předpokládalo, že sekundárně ztratili své chloroplasty.

Nakonec byli objeveni někteří protisté postrádající mitochondrie.[16] Protože bylo známo, že mitochondrie jsou výsledkem endosymbióza a proteobakterium, předpokládalo se, že tyto amitochondriátové eukaryoty byly primitivně, což znamenalo důležitý krok dovnitř eukaryogeneze. Výsledkem bylo, že tito amitochondriátní protisté byli odděleni od protistického království, což vedlo ke vzniku superkratství a království Archezoa. Tento superkingdom byl proti Metakaryota superkingdom, seskupující dalších pět eukaryotických království (Animalia, Prvoci, Houby, Plantae a Chromista ). Toto bylo známé jako Hypotéza Archezoa, který byl od té doby opuštěn;[17] pozdější schémata nezahrnovala propast Archezoa – Metakaryota.[4][15]

 
Život
 
SuperkingdomProkaryota
 

Království Eubakterie

 
 

Království Archeobakterie

 
 
 
 
SuperkingdomArchezoa †
 

Království Archezoa †

 
 
 
 
SuperkingdomMetakaryota †
 

Království Prvoci

 
 

Království Chromista

 
 

Království Plantae

 
 

Království Houby

 
 

Království Animalia

 
 
 
 
 

† Již není uznáván taxonomy.

Šest království (1998)

V roce 1998 Cavalier-Smith zveřejnil model šesti království,[4] který byl revidován v následujících dokumentech. Verze zveřejněná v roce 2009 je uvedena níže.[18][A][19] Cavalier-Smith již nepřijal důležitost základního rozdělení Eubacteria-Archaebacteria, které předložil Woese a další a které podpořil nedávný výzkum.[20] Království Bakterie (jediné království říše Prokaryota ) byla rozdělena do dvou dílčích království podle jejich membránových topologií: Unibakterie a Negibakterie. Unibakterie byly rozděleny na kmen Archeobakterie a Posibakterie; přechod bimembranózní-unimembranózní byl považován za mnohem zásadnější než dlouhá větev genetické vzdálenosti archebakterií, která nemá žádný zvláštní biologický význam.

Cavalier-Smith nepřijímá požadavek na taxony monofyletický (v jeho terminologii „holophyletic“) platný. Definuje Prokaryota, Bacteria, Negibacteria, Unibacteria a Posibacteria jako platné parafyla (proto „monofyletický“ ve smyslu, který používá tento termín) taxony, označující důležité inovace biologického významu (s ohledem na koncept biologického výklenek ).

Stejným způsobem jeho paraphyletic království Protozoa zahrnuje předky Animalia, Fungi, Plantae a Chromista. Pokroky fylogenetických studií umožnily Cavalierovi-Smithovi uvědomit si, že všechny fyly byly považovány za archezoans (tj. primitivně amitochondriátové eukaryoty) ve skutečnosti sekundárně ztratily mitochondrie, obvykle jejich transformací na nové organely: Hydrogenosomy. To znamená, že všechny živé eukaryoty jsou ve skutečnosti metakaryoty, podle významu termínu, který uvedl Cavalier-Smith. Někteří z členů zaniklého království Archezoa, jako kmen Microsporidia, byli přeřazeni do království Houby. Jiní byli přeřazeni do království Prvoci, jako Metamonada který je nyní součástí infrakingdomu Excavata.

Protože Cavalier-Smith umožňuje parafylově, níže uvedený diagram je „organizační schéma“, nikoli „schéma předků“, a nepředstavuje evoluční strom.

 
Život
 
ŘíšeProkaryota
 

Království Bakterie - zahrnuje Archeobakterie jako součást subkingdom

 
 
 
 
ŘíšeEukaryota
 

Království Prvoci - např. Amébozoa, Choanozoa, Excavata

 
 

Království Chromista - např. Alveolata, kryptofyty, Heterokonta (Hnědé řasy, Diatomy atd.), Haptophyta, Rhizaria

 
 

Království Plantae - např. glaukofyty, Červené a zelené řasy, suchozemské rostliny

 
 

Království Houby

 
 

Království Animalia

 
 
 
 
 

Sedm království

Cavalier-Smith a jeho spolupracovníci revidovali svou klasifikaci v roce 2015. V tomto schématu znovu zavedli rozdělení prokaryot do dvou království, Bakterie (=Eubakterie ) a Archaea (=Archeobakterie ). To je založeno na konsensu v EU Taxonomický obrys bakterií a archaeí (TOBA) a Katalog života.[15]

 
Život
 
ŘíšeProkaryota
 

Království Bakterie

 
 

Království Archaea

 
 
 
 
ŘíšeEukaryota
 

Království Prvoci - např. Amébozoa, Choanozoa, Excavata

 
 

Království Chromista - např. Alveolata, kryptofyty, Heterokonta (Hnědé řasy, Diatomy atd.), Haptophyta, Rhizaria

 
 

Království Plantae - např. glaukofyty, Červené a zelené řasy, suchozemské rostliny

 
 

Království Houby

 
 

Království Animalia

 
 
 
 
 

souhrn

Linné
1735[21]		Haeckel
1866[22]		Chatton
1925[23][24]		Copeland
1938[25][26]		Whittaker
1969[27]		Běda et al.
1977[28][29]		Běda et al.
1990[30]		Cavalier-Smith
1993[31][32][33]		Cavalier-Smith
1998[34][35][36]		Ruggiero et al.
2015[37]
(neošetřeno)(neošetřeno)2 říše2 říše2 říše2 říše3 domény3 superkingdomy2 říše2 říše
2 království3 království(neošetřeno)4 království5 království6 království(neošetřeno)8 království6 království7 království
(neošetřeno)ProtistaProkaryotaMoneraMoneraEubakterieBakterieEubakterieBakterieBakterie
ArcheobakterieArchaeaArcheobakterieArchaea
EukaryotaProtistaProtistaProtistaEukarjaArchezoaPrvociPrvoci
Prvoci
ChromistaChromistaChromista
VegetabiliaPlantaePlantaePlantaePlantaePlantaePlantaePlantae
HoubyHoubyHoubyHoubyHouby
AnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimaliaAnimalia


Klasifikace života na úrovni království je stále široce používána jako užitečný způsob seskupování organismů, bez ohledu na některé problémy s tímto přístupem:

  • Království, jako jsou Prvoci, představují známky spíše než klady, a proto jsou odmítnuty fylogenetická klasifikace systémy.
  • Nejnovější výzkum nepodporuje klasifikaci eukaryot do žádného ze standardních systémů. Od dubna 2010, žádná skupina království není dostatečně podporována výzkumem, aby dosáhla širokého přijetí. V roce 2009 Andrew Roger a Alastair Simpson zdůraznili potřebu pečlivosti při analýze nových objevů: „Při současném tempu změn v našem chápání eukaryotického stromu života bychom měli postupovat opatrně.“[38]

Kromě tradičních království

Zatímco koncept království je nadále používán některými taxonomy, došlo k odklonu od tradičních království, protože již nejsou považována za poskytující kladistický klasifikace, kde je kladen důraz na uspořádání organismů do přirozené skupiny.[39]

Tři oblasti života

Hlavní články: Systém se třemi doménami a Doména (biologie)
BakterieArchaeaEucaryotaAquifexTermotogaCytophagaBacteroidesBacteroides-CytophagaPlanctomycesSiniceProteobakterieSpirochetyGrampozitivní bakterieZelené filantropické bakteriePyrodicticumTermoproteusThermococcus celerMethanococcusMethanobacteriumMethanosarcinaHalofiliEntamoebaeSlizová formaZvířeHoubaRostlinaCiliateBičíkatýTrichomonadMicrosporidiaDiplomonad
A fylogenetický strom na základě rRNA údaje ukazující Woese třídoménový systém. Všechny menší větve lze považovat za království.

Zhruba od poloviny 70. let 20. století se zvyšoval důraz na srovnávání genů na molekulární úrovni (zpočátku ribozomální RNA geny) jako primární faktor při klasifikaci; genetická podobnost byla zdůrazněna kvůli vnějšímu vzhledu a chování. Taxonomické hodnosti, včetně království, měly být skupinami organismů se společným předkem, ať už monofyletický (Všechno potomci společného předka) nebo paraphyletic (jen některé potomci společného předka).[Citace je zapotřebí ]

Na základě těchto studií RNA Carl Woese myšlenkový život lze rozdělit na tři velké divize a označovat je jako model „tří primárních království“ nebo „urkingdom“.[13] V roce 1990 byl název „doména“ navržen pro nejvyšší postavení.[3] Tento termín představuje synonymum pro kategorii panství (lat. Dominium), kterou zavedl Moore v roce 1974.[40] Na rozdíl od Moora Woese a kol. (1990) nenavrhl latinský výraz pro tuto kategorii, což představuje další argument podporující přesně zavedený pojem dominion.[41]Woese rozdělil prokaryoty (dříve klasifikované jako Kingdom Monera) do dvou skupin, tzv Eubakterie a Archeobakterie zdůrazňujíc, že ​​mezi těmito dvěma skupinami existuje stejný genetický rozdíl jako mezi kteroukoli z nich a všemi eukaryoty.

 
Život
 

Doména Bakterie / Eubakterie

 
 

Doména Archaea / Archeobakterie

 
 

Doména Eukarya / Eukaryota

 
 
 

Podle genetických údajů, i když skupiny eukaryotů, jako jsou rostliny, houby a zvířata, mohou vypadat odlišně, jsou si navzájem bližší než s Eubacteria nebo Archaea. Bylo také zjištěno, že eukaryoty jsou více spjaty s Archeaou než s eubakteriemi. Přestože bylo zpochybněno prvenství rozdělení Eubacteria-Archaea, bylo potvrzeno následným výzkumem.[20] Neexistuje shoda na tom, kolik království existuje v klasifikačním schématu navrženém Woeseem.

Eukaryotické superskupiny

Fylogenetický a symbiogenetický strom živých organismů, ukazující původ eukaryot a prokaryot
Jedna hypotéza eukaryotických vztahů, upravená Simpsonem a Rogerem (2004).[39]

V roce 2004 článek v recenzi Simpsona a Rogera zaznamenal, že Protista byli „a popadnout batoh pro všechny eukaryoty kteří nejsou zvířaty, rostlinami nebo houbami. “Tvrdili, že jako formální hodnosti v klasifikaci by měly být přijímány pouze monofyletické skupiny, a to - zatímco tento přístup byl dříve nepraktický (vyžadoval„ doslova desítky eukaryotických království “'„) - nyní bylo možné rozdělit eukaryoty na„ jen několik hlavních skupin, které jsou pravděpodobně všechny monofyletické “.[39]

Na tomto základě znázorněný diagram (překreslený z jejich článku) ukázal skutečná „království“ (jejich uvozovky) eukaryot.[39] Klasifikaci, která se řídila tímto přístupem, vypracovala v roce 2005 pro Mezinárodní společnost protistologů výbor, který „pracoval ve spolupráci s odborníky z mnoha společností“. Rozdělila eukaryoty do stejných šesti „superskupin“.[42] Publikovaná klasifikace záměrně nepoužívala formální taxonomické hodnosti, včetně klasifikace „království“.

 
Život
 
DoménaBakterie
 

Bakterie

 
 
 
 
DoménaArchaea
 

Archaea

 
 
 
 
DoménaEukaryota
 

Excavata - Rozličný bičíkatý prvoky

 
 

Amébozoa - nejvíce loose améboidy a slizové formy

 
 

Opisthokonta — zvířata, houby, choanoflagellates, atd.

 
 

Rhizaria — Foraminifera, Radiolaria a různé další améboid prvoky

 
 

Chromalveolata — Stramenopiles (Hnědé řasy, Diatomy atd. ), Haptophyta, Kryptophyta (nebo kryptomonády) a Alveolata

 
 

Archaeplastida (nebo Primoplantae ) — Suchozemské rostliny, zelené řasy, červené řasy, a glaukofyty

 
 
 
 
 

V tomto systému jsou mnohobuněčná zvířata (Metazoa ) pocházejí ze stejného předka jako oba jednobuněční choanoflagellates a houby, které tvoří Opisthokonta.[42] Rostliny jsou považovány za vzdáleněji příbuzné zvířatům a houbám.

Avšak ve stejném roce, kdy byla zveřejněna klasifikace Mezinárodní společnosti protistologů (2005), byly vyjádřeny pochybnosti o tom, zda některé z těchto superskupin byly monofyletické, zejména Chromalveolata,[43] a přezkum v roce 2006 zaznamenal nedostatek důkazů pro několik ze šesti navrhovaných superskupin.[44]

Od roku 2010, existuje široká shoda, že Rhizaria patří k Stramenopiles a Alveolata, v clade daboval Superskupina SAR,[45] takže Rhizaria není jednou z hlavních skupin eukaryot.[18][46][47][48][49] Kromě toho se nejeví shoda. Rogozine et al. v roce 2009 poznamenal, že „Hluboká fylogeneze eukaryot je extrémně obtížný a kontroverzní problém.“[50] Od prosince 2010, zdá se, že existuje shoda v tom, že model šesti superskupin navržený v roce 2005 neodráží skutečnou fylogenezi eukaryot, a tedy ani způsob, jakým by měly být klasifikovány, ačkoli neexistuje shoda ohledně modelu, který by jej měl nahradit.[46][47][51]

Viry

The Mezinárodní výbor pro taxonomii virů používá pro klasifikaci virů taxonomickou hodnost "království" (s příponou -virae); ale toto je pod nejvyšší úrovní klasifikace oblast a podrealismus.[52]

Probíhá debata o tom, zda viry lze zahrnout do stromu života. Deset argumentů proti zahrnuje skutečnost, že jsou obligátní intracelulární paraziti ten nedostatek metabolismus a nejsou schopni replikace mimo hostitelskou buňku.[53][54] Dalším argumentem je, že jejich umístění ve stromu by bylo problematické, protože existuje podezření, že viry vznikly vícekrát[Citace je zapotřebí ]a mají zálibu ve sklizni nukleotidových sekvencí od svých hostitelů.

Na druhou stranu argumenty upřednostňují jejich zařazení.[55]Jeden pochází z objevu neobvykle velkých a složitých virů, jako jsou Mimivirus, které vlastní typické buněčné geny.[56]

Viz také

Poznámky

  1. ^ Ve srovnání s verzí Cavalier-Smith publikovanou v roce 2004, alveoláty a rhizarians byly přesunuty z Kingdom Protozoa do Kingdom Chromista.

Reference

  1. ^ Linnaeus, C. (1735). Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematická nabídka pro třídy, ordiny, rody a druhy.
  2. ^ Viz např. McNeill, J .; et al., eds. (2006). Mezinárodní kodex botanické nomenklatury (Vídeňský kodex) přijatý sedmnáctým mezinárodním botanickým kongresem, Vídeň, Rakousko, červenec 2005 (elektronické vydání). Vídeň: Mezinárodní asociace pro taxonomii rostlin. Archivovány od originál dne 6. října 2012. Citováno 2011-02-20.,„článek 3.1“.
  3. ^ A b C Woese, C.R .; Kandler, O .; Wheelis, M.L. (1990). „Směrem k přirozenému systému: návrh domén Archaea, Bacteria a Eucarya“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS ... 87,4576 W.. doi:10.1073 / pnas.87.12.4576. PMC  54159. PMID  2112744.
  4. ^ A b C Cavalier-Smith, T. (1998). „Revidovaný systém života šesti království“. Biologické recenze. 73 (3): 203–66. doi:10.1111 / j.1469-185X.1998.tb00030.x. PMID  9809012.
  5. ^ Singer, Charles J. (1931). Krátká historie biologie, obecný úvod do studia živých věcí. Oxford: Clarendon Press. OCLC  1197036.
  6. ^ A b C d E Scamardella, Joseph M. (1999). „Ne rostliny ani zvířata: krátká historie původu protozoí, protistů a protoctistů království“. Mezinárodní mikrobiologie. 2 (4): 207–16. PMID  10943416.
  7. ^ A b C Sapp, J. (2005). „Dichotomie Prokaryote-Eukaryote: významy a mytologie“. Recenze mikrobiologie a molekulární biologie. 69 (2): 292–305. doi:10.1128 / MMBR.69.2.292-305.2005. PMC  1197417. PMID  15944457.
  8. ^ Stanier, R.Y. & Van Neil, C.B. (1962). "Koncept bakterie". Archiv für Mikrobiologie. 42 (1): 17–35. doi:10.1007 / BF00425185. PMID  13916221. S2CID  29859498.
  9. ^ Whittaker, R.H. (leden 1969). „Nové koncepty království nebo organismů. Evoluční vztahy jsou lépe reprezentovány novými klasifikacemi než tradičními dvěma královstvími.“ Věda. 163 (3863): 150–60. Bibcode:1969Sci ... 163..150W. CiteSeerX  10.1.1.403.5430. doi:10.1126 / science.163.3863.150. PMID  5762760.
  10. ^ Margulis L, Chapman MJ (2009-03-19). Kingdoms and Domains: An Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth. Akademický tisk. ISBN  9780080920146.
  11. ^ A b Case, Emily (01.10.2008). „Teaching Taxonomy: How many Kingdoms?“. Americký učitel biologie. 472–477. Citováno 2020-07-28.
  12. ^ Palmer, E. Laurence; Fowler, Seymour H (leden 1975). Fieldbook of Natural History (2. vyd.). McGraw-Hill. ISBN  978-0-070-48425-2.
  13. ^ A b Balch, W. E.; Magrum, L.J .; Fox, G. E.; Wolfe, C.R. & Woese, C.R. (srpen 1977). „Starodávná divergence mezi bakteriemi“. J. Mol. Evol. 9 (4): 305–11. Bibcode:1977JMolE ... 9..305B. doi:10.1007 / BF01796092. PMID  408502. S2CID  27788891.
  14. ^ „Šest království“. www.ric.edu. Rhode Island College. Citováno 2020-07-25.
  15. ^ A b C Ruggiero, Michael A .; Gordon, Dennis P .; Orrell, Thomas M .; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C .; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D .; Kirk, Paul M .; Thuesen, Erik V. (2015). „Vyšší klasifikace všech živých organismů“. PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. doi:10.1371 / journal.pone.0119248. PMC  4418965. PMID  25923521.
  16. ^ Cavalier-Smith, Thomas (26. března 1987). „Eukaryoty bez mitochondrií“. Příroda. 326 (6111): 332–333. Bibcode:1987 Natur.326..332C. doi:10.1038 / 326332a0. PMID  3561476.
  17. ^ Poole, Anthony; Penny, David (21. června 2007). „Pohlten spekulacemi“ (PDF). Příroda. 447 (7147): 913. doi:10.1038 / 447913a. PMID  17581566. S2CID  7753492. Archivovány od originál (PDF) dne 6. července 2011. Citováno 15. března 2011.
  18. ^ A b Cavalier-Smith, Thomas (2009). „Kingdom Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree“. Biologické dopisy. 6 (3): 342–345. doi:10.1098 / rsbl.2009.0948. PMC  2880060. PMID  20031978.
  19. ^ Cavalier-Smith, T. (2004). „Pouze šest království života“ (PDF). Sborník Královské společnosti v Londýně B. 271 (1545): 1251–1262. doi:10.1098 / rspb.2004.2705. PMC  1691724. PMID  15306349. Citováno 29. dubna 2010.
  20. ^ A b Dagan, T .; Roettger, M .; Bryant a Martin, W. (2010). „Sítě genomu zakořenily strom života mezi prokaryotickými doménami“. Biologie genomu a evoluce. 2: 379–92. doi:10.1093 / gbe / evq025. PMC  2997548. PMID  20624742.
  21. ^ Linnaeus, C. (1735). Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematická nabídka pro třídy, ordiny, rody a druhy.
  22. ^ Haeckel, E. (1866). Generelle Morphologie der Organismen. Reimer, Berlín.
  23. ^ Chatton, É. (1925). "Pansporella perplexa. Réflexions sur la biologie et la phylogénie des protozoaires ". Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale. 10-VII: 1–84.
  24. ^ Chatton, É. (1937). Titres et Travaux Scientifiques (1906–1937). Sette, Sottano, Itálie.
  25. ^ Copeland, H. (1938). „Království organismů“. Čtvrtletní přehled biologie. 13: 383–420. doi:10.1086/394568.
  26. ^ Copeland, H. F. (1956). Klasifikace nižších organismů. Palo Alto: Pacific Books. p. 6. doi:10,5962 / bhl.titul.4474.
  27. ^ Whittaker, R. H. (leden 1969). "Nové koncepty království organismů". Věda. 163 (3863): 150–60. Bibcode:1969Sci ... 163..150W. doi:10.1126 / science.163.3863.150. PMID  5762760.
  28. ^ Woese, C. R .; Balch, W. E .; Magrum, L. J .; Fox, G. E .; Wolfe, R. S. (srpen 1977). „Starodávná divergence mezi bakteriemi“. Journal of Molecular Evolution. 9 (4): 305–311. Bibcode:1977JMolE ... 9..305B. doi:10.1007 / BF01796092. PMID  408502.
  29. ^ Woese, C. R .; Fox, G. E. (listopad 1977). "Fylogenetická struktura prokaryotické domény: primární království". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 74 (11): 5088–90. Bibcode:1977PNAS ... 74,5088W. doi:10.1073 / pnas.74.11.5088. PMC  432104. PMID  270744.
  30. ^ Woese, C .; Kandler, O .; Wheelis, M. (1990). „Směrem k přirozenému systému organismů: návrh domén Archaea, Bacteria a Eucarya“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (12): 4576–9. Bibcode:1990PNAS ... 87,4576 W.. doi:10.1073 / pnas.87.12.4576. PMC  54159. PMID  2112744.
  31. ^ Cavalier-Smith, T. (1981). „Království Eukaryote: sedm nebo devět?“. Bio systémy. 14 (3–4): 461–481. doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2. PMID  7337818.
  32. ^ Cavalier-Smith, T. (1992). "Počátky sekundárního metabolismu". Sympozium nadace Ciba. 171: 64–80, diskuse 80–7. PMID  1302186.
  33. ^ Cavalier-Smith, T. (1993). „Prvoky království a jejich 18 kmenů“. Mikrobiologické hodnocení. 57 (4): 953–994. doi:10.1128 / mmbr. 57.4.953-994.1993. PMC  372943. PMID  8302218.
  34. ^ Cavalier-Smith, T. (1998), „Revidovaný systém života šesti království“, Biologické recenze, 73 (03): 203–66, doi:10.1111 / j.1469-185X.1998.tb00030.x, PMID  9809012
  35. ^ Cavalier-Smith, T. (2004), „Pouze šest království života“ (PDF), Sborník Královské společnosti B: Biologické vědy, 271: 1251–62, doi:10.1098 / rspb.2004.2705, PMC  1691724, PMID  15306349, vyvoláno 2010-04-29
  36. ^ Cavalier-Smith T (červen 2010). „Kingdom Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree“. Biol. Lett. 6 (3): 342–5. doi:10.1098 / rsbl.2009.0948. PMC  2880060. PMID  20031978.
  37. ^ Ruggiero, Michael A .; Gordon, Dennis P .; Orrell, Thomas M .; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C .; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D .; Kirk, Paul M .; Thuesen, Erik V. (2015). „Vyšší klasifikace všech živých organismů“. PLOS ONE. 10 (4): e0119248. Bibcode:2015PLoSO..1019248R. doi:10.1371 / journal.pone.0119248. PMC  4418965. PMID  25923521.
  38. ^ Roger, A.J. & Simpson, A.G.B. (2009). "Evoluce: revize kořene stromu eukaryotů". Aktuální biologie. 19 (4): R165–7. doi:10.1016 / j.cub.2008.12.032. PMID  19243692. S2CID  13172971.
  39. ^ A b C d Simpson, Alastair G.B .; Roger, Andrew J. (2004). "Skutečná 'království' eukaryotů". Aktuální biologie. 14 (17): R693 – R696. doi:10.1016 / j.cub.2004.08.038. PMID  15341755. S2CID  207051421.
  40. ^ Moore R.T. (1974). „Návrh na uznání super postavení“ (PDF). Taxon. 23 (4): 650–652. doi:10.2307/1218807. JSTOR  1218807.
  41. ^ Luketa S. (2012). „Nové pohledy na megaklasifikaci života“ (PDF). Protistologie. 7 (4): 218–237.
  42. ^ A b Adl SM, Simpson AGB, Farmer MA, Andersen RA, Anderson OR, Barta JR, et al. (2005). „Nová klasifikace eukaryot vyšší úrovně s důrazem na taxonomii protistů“. Journal of Eukaryotic Microbiology. 52 (5): 399–451. doi:10.1111 / j.1550-7408.2005.00053.x. PMID  16248873. S2CID  8060916.
  43. ^ Harper, J. T .; Waanders, E. & Keeling, P. J. (2005). „Na monofylii chromalveolátů za použití šesti proteinové fylogeneze eukaryot“ (PDF). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 55 (Pt 1): 487–496. doi:10.1099 / ijs.0.63216-0. PMID  15653923. Archivovány od originál (PDF) dne 11. května 2011.
  44. ^ Parfrey, Laura W .; Barbero, Erika; Lasser, Elyse; Dunthorn, Micah; Bhattacharya, Debashish; Patterson, David J. & Katz, Laura A. (2006). „Hodnocení podpory pro současnou klasifikaci eukaryotické rozmanitosti“. Genetika PLOS. 2 (12): e220. doi:10.1371 / journal.pgen.0020220. PMC  1713255. PMID  17194223.
  45. ^ Burki a kol. 2007, str. 4
  46. ^ A b Burki, Fabien; Shalchian-Tabrizi, Kamran; Minge, Marianne; Skjæveland, Åsmund; Nikolaev, Sergey I .; Jakobsen, Kjetill S. & Pawlowski, Jan (2007). Butler, Geraldine (ed.). „Fylogenomika mění strukturu eukaryotických superskupin“. PLOS ONE. 2 (8): e790. Bibcode:2007PLoSO ... 2..790B. doi:10.1371 / journal.pone.0000790. PMC  1949142. PMID  17726520.
  47. ^ A b Burki, Fabien; Shalchian-Tabrizi, Kamran & Pawlowski, Jan (2008). „Fylogenomika odhaluje novou„ megoskupinu “zahrnující většinu fotosyntetických eukaryot“. Biologické dopisy. 4 (4): 366–369. doi:10.1098 / rsbl.2008.0224. PMC  2610160. PMID  18522922.
  48. ^ Burki, F .; Inagaki, Y .; Brate, J .; Archibald, J. M .; Keeling, P. J .; Cavalier-Smith, T .; Sakaguchi, M .; Hashimoto, T .; et al. (2009). „Rozsáhlé fylogenomické analýzy ukazují, že dvě záhadné linie protistů, Telonemia a Centroheliozoa, souvisí s fotosyntetickými chromalveoláty.“. Biologie genomu a evoluce. 1: 231–238. doi:10.1093 / gbe / evp022. PMC  2817417. PMID  20333193.
  49. ^ Hackett, J.D .; Yoon, H.S .; Li, S .; Reyes-Prieto, A .; Rummele, S.E. & Bhattacharya, D. (2007). „Fylogenomická analýza podporuje monofylii kryptofytů a haptopytů a asociaci Rhizaria s chromalveoláty“. Mol. Biol. Evol. 24 (8): 1702–1713. doi:10,1093 / molbev / msm089. PMID  17488740.
  50. ^ Rogozin, I.B .; Basu, M.K .; Csürös, M. & Koonin, E.V. (2009). „Analýza vzácných genomových změn nepodporuje fylogenezi unikont – bikont a jako místo primárního záření eukaryot naznačuje symbiózu sinic.“. Biologie genomu a evoluce. 1: 99–113. doi:10.1093 / gbe / evp011. PMC  2817406. PMID  20333181.
  51. ^ Kim, E .; Graham, L. E. & Redfield, Rosemary Jeanne (2008). Redfield, Rosemary Jeanne (ed.). „Analýza EEF2 zpochybňuje monofylii Archaeplastida a Chromalveolata“. PLOS ONE. 3 (7): e2621. Bibcode:2008PLoSO ... 3.2621K. doi:10.1371 / journal.pone.0002621. PMC  2440802. PMID  18612431.
  52. ^ „Kód ICTV“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 26. dubna 2020.
  53. ^ Moreira, David; Purificación López-García (2009). "Deset důvodů k vyloučení virů ze stromu života". Příroda Recenze Mikrobiologie. 7 (4): 306–311. doi:10.1038 / nrmicro2108. PMID  19270719. S2CID  3907750.
  54. ^ Luketa, Stefan (2012). „Nové pohledy na megaklasifikaci života“ (PDF). Protistologie. 7 (4): 218–237.
  55. ^ Hegde, Nagendra; Maddur, Mohan S .; Kaveri, Srini V. & Bayry, Jagadeesh (2009). „Důvody pro zařazení virů do stromu života“. Příroda Recenze Mikrobiologie. 7 (8): 615. doi:10.1038 / nrmicro2108-c1. PMID  19561628.
  56. ^ Raoult, Didier; Audic, Stéphane; Robert, Catherine; Abergel, Chantal; Renesto, Patricia; Ogata, Hiroyuki; La Scola, Bernard; Suzan, Marie; Claverie, Jean-Michel (2004). "Sekvence genomu mimiviru 1,2 megabáze". Věda. 306 (5700): 1344–1350. Bibcode:2004Sci ... 306.1344R. doi:10.1126 / science.1101485. PMID  15486256. S2CID  84298461.

Další čtení

  • Pelentier, B. (2007-2015). Empire Biota: komplexní taxonomie, [1]. [Historický přehled.]
  • Peter H. Raven a Helena Curtis (1970), Biologie rostlin, New York: Worth Publishers. [Včasná prezentace systému pěti království.]

externí odkazy