Lentisphaerae - Lentisphaerae

Lentisphaerae
Vědecká klasifikace
Doména:
Nadkmen:
Kmen:
Lentisphaerae

Cho a kol. 2004
Třídy
Synonyma
  • Lentisphaeraeota Oren a kol. 2015

Lentisphaerae je kmen z bakterie úzce souvisí s Chlamydie a Verukomikrobie.[1][2]

Zahrnuje dvě monotypické objednávky Lentisphaerales a Victivallales. Členy kmene mohou být aerobní nebo anaerobní a spadají pod dva odlišné fenotypy. Jedním z nich je suchozemská střevní mikrobiota ze savců a ptáků. Druhý fenotyp zahrnuje mořské mikroorganismy: sekvence z mikrobiomů ryb a korálů a mořského sedimentu.

Fylogeneze

Fylogeneze založená na práci Projekt All-Species Living Tree.[3]

Oligosphaera ethanolica

Victivallis vadensis

Lentisphaera

L. araneosa

L. marina

Taxonomie

Aktuálně přijímaná taxonomie je založena na Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LSPN)[4] a Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI).[5]

Poznámky:
♠ Kmen nalezen na Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI), ale není uveden v seznamu Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN)

Viz také

Reference

  1. ^ Cho J, Vergin K, Morris R, Giovannoni S (2004). „Lentisphaera araneosa gen. Nov., Sp. Nov, transparentní exopolymer produkující mořské bakterie, a popis nového bakteriálního kmene Lentisphaerae“. Environ Microbiol. 6 (6): 611–21. doi:10.1111 / j.1462-2920.2004.00614.x. PMID  15142250.
  2. ^ Limam RD, Bouchez T, Chouari R a kol. (Říjen 2010). „Detekce Lentisphaerae souvisejících s WWE2 pomocí 16S rRNA genového sekvenování a fluorescence in situ hybridizace ve výluhu skládky“. Umět. J. Microbiol. 56 (10): 846–52. doi:10.1139 / w10-065. PMID  20962908. Archivovány od originál dne 2012-12-16. Citováno 2010-11-04.
  3. ^ „16S rRNA založené vydání LTP 123 (plný strom)“ (PDF). Silva komplexní databáze ribozomálních RNA. Citováno 2016-03-20.
  4. ^ J.P.Euzéby. "Lentisphaerae". Seznam prokaryotických jmen se Stálým v nomenklatuře (LPSN). Citováno 2016-03-20.
  5. ^ Sayers; et al. "Lentisphaerae". Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI) databáze taxonomie. Citováno 2016-03-20.

Další čtení

Limam, Rim Driss; Bouchez, Theodore; Chouari, Rakia; Li, Tianlun; Barkallah, Insaf; Landoulsi, Ahmed; Sghir, Abdelghani (říjen 2010). „Detekce Lentisphaerae souvisejících s WWE2 pomocí 16S rRNA genového sekvenování a fluorescence in situ hybridizace v výluhu skládky“. Canadian Journal of Microbiology. 56 (10): 846–852. doi:10.1139 / W10-065. PMID  20962908.