Zinek-závislá fosfolipáza C. - Zinc-dependent phospholipase C

Zinek závislá fosfolipáza C.
1olp opm.png
Alfa toxin z Clostridium ukazující doménu fosfolipázy závislou na zinku červeně a doménu PLAT žlutě
Identifikátory
SymbolZn_dep_PLPC
PfamPF00882
InterProIPR001531
STRÁNKAPDOC00357
SCOP21ah7 / Rozsah / SUPFAM
OPM nadčeleď81
OPM protein1olp
CDDcd11009

v molekulární biologie, fosfolipázy závislé na zinku C. je rodina bakterií fosfolipázy C. enzymy, z nichž některé jsou známé také jako alfa toxiny.

Bacillus cereus obsahuje monomerní fosfolipázu C ES 3.1.4.3 (PLC) 245 aminokyselinových zbytků. Ačkoli PLC raději jedná fosfatidylcholin, také vykazuje slabou katalytickou aktivitu s sfingomyelin a fosfatidylinositol.[1] Sekvenční studie ukázaly, že protein je podobný jak alfa toxinu z Clostridium perfringens a Clostridium bifermentans fosfolipáza C podílející se na hemolýze a prasknutí buněk,[2] a do lecitináza z Listeria monocytogenes, který napomáhá šíření mezi buňkami rozbitím vakuol se 2 membránami, které obklopují bakterii během přenosu.[3]

Každý z těchto proteinů je enzym závislý na zinku, který váže 3 ionty zinku na molekulu.[4] Enzymy katalyzují přeměnu fosfatidylcholinu a vody na 1,2-diacylglycerol a cholin fosfát.[1][2][4]

v Bacillus cereusje známo, že se na vazbě iontů zinku podílí devět zbytků: 5 His, 2 Asp, 1 Glu a 1 Trp. Všechny tyto zbytky jsou konzervovány v Clostridium alfa-toxin.

Některé příklady tohoto enzymu obsahují prodloužení C-terminální sekvence, které obsahuje a PLAT doména o kterém se předpokládá, že se podílí na lokalizaci membrány.[5][6]

Reference

  1. ^ A b Nakamura S, Yamada A, Tsukagoshi N, Udaka S, Sasaki T, Makino S, Little C, Tomita M, Ikezawa H (1988). "Nukleotidová sekvence a exprese v Escherichia coli genu kódujícího sfingomyelinázu z Bacillus cereus". Eur. J. Biochem. 175 (2): 213–220. doi:10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14186.x. PMID  2841128.
  2. ^ A b Titball RW, Rubidge T, Hunter SE, Martin KL, Morris BC, Shuttleworth AD, Anderson DW, Kelly DC (1989). "Molekulární klonování a nukleotidová sekvence alfa-toxinu (fosfolipáza C) z Clostridium perfringens". Infikovat. Immun. 57 (2): 367–376. doi:10.1128 / IAI.57.2.367-376.1989. PMC  313106. PMID  2536355.
  3. ^ Kocks C, Dramsi S, Ohayon H, Geoffroy C, Mengaud J, Cossart P, Vazquez-Boland JA (1992). "Nukleotidová sekvence lecitinázového operonu Listeria monocytogenes a možná role lecitinázy v šíření mezi buňkami ". Infikovat. Immun. 60 (1): 219–230. doi:10.1128 / IAI.60.1.219-230.1992. PMC  257526. PMID  1309513.
  4. ^ A b Titball RW, Rubidge T (1990). "Úloha histidinových zbytků v alfa toxinu Clostridium perfringens". FEMS Microbiol. Lett. 56 (3): 261–265. doi:10.1111 / j.1574-6968.1988.tb03188.x. PMID  2111259.
  5. ^ Bateman A, Sandford R (1999). Msgstr "Doména PLAT: nový kousek skládačky PKD1". Curr. Biol. 9 (16): R588–90. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80380-7. PMID  10469604. S2CID  15018010.
  6. ^ Ponting CP, Hofmann K, Bork P (srpen 1999). "Latrofilinová / CL-1 podobná GPS doména v polycystinu-1". Curr. Biol. 9 (16): R585–8. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80379-0. PMID  10469603. S2CID  17252179.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR001531