Inhibitor růstu vaskulárního endotelu - Vascular endothelial growth inhibitor

TNFSF15
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2O0O, 2QE3, 2RE9, 2RJK, 2RJL, 3K51, 3MI8
Identifikátory
Aliasy	TNFSF15, TL1, TL1A, VEGI, VEGI192A, inhibitor vaskulárního endoteliálního růstu, TNLG1B, člen nadrodiny faktoru nekrotizující nádor 15, člen nadrodiny TNF 15
Externí ID	OMIM: 604052 MGI: 2180140 HomoloGene: 3755 Genové karty: TNFSF15
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	114,806,039 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na receptor faktoru nekrotizující nádory; • aktivita cytokinů; • vazba na receptory; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • extracelulární oblast; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • membrána; • intracelulární; • extracelulární;
Biologický proces	• metabolický proces cytokinů; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • aktivace aktivity endopeptidázy cysteinového typu zapojené do apoptotického procesu; • aktivace aktivity kinázy indukující NF-kappaB; • imunitní odpověď; • apoptotický proces; • signální transdukce; • regulace aktivity receptoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9966
	326623
	ENSG00000181634
	ENSMUSG00000050395
	O95150
	Q5UBV8
	NM_005118; NM_001204344
	NM_177371
	NP_001191273; NP_005109
	NP_796345
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Inhibitor růstu vaskulárního endotelu (VEGI), také známý jako Ligand podobný TNF 1A (TL1A) a Člen nadrodiny TNF 15 (TNFSF15), je protein že u lidí je kódován TNFSF15 gen. VEGI je antiangiogenní protein.^[4] Patří to faktor nekrózy nádorů (ligand) nadčeleď, kde je členem 15.^[5] Je to jediný známý ligand pro receptor smrti 3,^[6] a může to být také rozpoznáno návnadový receptor 3.

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je cytokin, který patří do faktor nekrózy nádorů (TNF) rodina ligandů. Tento protein je hojně exprimován v endoteliální buňky, ale není vyjádřen ani v jednom B nebo T buňky. Exprese tohoto proteinu je indukovatelná TNF-alfa a IL-1 alfa. Tento cytokin je ligandem pro receptor TNFRSF25 (receptor smrti 3) a TNFRSF6B (receptor návnady 3). Může aktivovat jak NF-kB a MAPK signální dráhy a působí jako autokrinní faktor vyvolat apoptóza v endotelových buňkách. Bylo také zjištěno, že tento cytokin inhibuje proliferaci endoteliálních buněk, a proto může fungovat jako angiogeneze inhibitor. Byla hlášena další izoforma kódovaná alternativně sestříhanou variantou transkriptu, ale sekvence tohoto transkriptu nebyla stanovena.^[5]

Klinický význam

Několik TNFSF15 SNP bylo zjištěno, že jsou silně spojeni s zánětlivé onemocnění střev.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181634 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hoffmann R, Valencia A (červenec 2004). „Genová síť pro navigaci v literatuře“. Genetika přírody. 36 (7): 664. doi:10.1038 / ng0704-664. PMID 15226743.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TNFSF15 tumor nekrotizující faktor (ligand) nadčeleď, člen 15".
^ Wang EC (září 2012). „Na receptoru smrti 3 a jeho ligandech…“. Imunologie. 137 (1): 114–116. doi:10.1111 / j.1365-2567.2012.03606.x. PMC 3449252. PMID 22612445.
^ Picornell Y, Mei L, Taylor K, Yang H, Targan SR, Rotter JI (listopad 2007). „TNFSF15 je etnicky specifický gen IBD“. Zánětlivá onemocnění střev. 13 (11): 1333–8. doi:10.1002 / ibd.20223. PMC 2552994. PMID 17663424.
^ Kakuta Y, Kinouchi Y, Negoro K, Takahashi S, Shimosegawa T (říjen 2006). „Asociační studie polymorfismů TNFSF15 u japonských pacientů se zánětlivým onemocněním střev“. Střevo. 55 (10): 1527–8. doi:10.1136 / gut.2006.100297. PMC 1856432. PMID 16966713.

Další čtení

Tan KB, Harrop J, Reddy M, Young P, Terrett J, Emery J, Moore G, Truneh A (prosinec 1997). „Charakterizace nového ligandu podobného TNF a nedávno popsané geny nadrodiny TNF ligandů a TNF receptorů a jejich konstitutivní a indukovatelná exprese v hematopoetických a nehematopoetických buňkách“. Gen. 204 (1–2): 35–46. doi:10.1016 / s0378-1119 (97) 00509-x. PMID 9434163.
Zhai Y, Ni J, Jiang GW, Lu J, Xing L, Lincoln C, Carter KC, Janat F, Kozak D, Xu S, Rojas L, Aggarwal BB, Ruben S, Li LY, Gentz R, Yu GL (leden 1999 ). „VEGI, nový cytokin z rodiny faktorů nekrotizujících nádory, je inhibitor angiogeneze, který potlačuje růst karcinomů tlustého střeva in vivo.“ FASEB Journal. 13 (1): 181–9. doi:10.1096 / fasebj.13.1.181. PMID 9872942. S2CID 26066673.
Yue TL, Ni J, Romanic AM, Gu JL, Keller P, Wang C, Kumar S, Yu GL, Hart TK, Wang X, Xia Z, DeWolf WE, Feuerstein GZ (leden 1999). „TL1, nový cytokin podobný faktoru nekrotizujícímu nádory, indukuje apoptózu v endotelových buňkách. Zapojení aktivace stresových proteinových kináz (proteinová kináza aktivovaná stresem a proteinová kináza aktivovaná mitogenem p38) a proteázy podobné kaspáze-3“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (3): 1479–86. doi:10.1074 / jbc.274.3.1479. PMID 9880523.
Haridas V, Shrivastava A, Su J, Yu GL, Ni J, Liu D, Chen SF, Ni Y, Ruben SM, Gentz R, Aggarwal BB (listopad 1999). „VEGI, nový člen rodiny TNF, aktivuje nukleární faktor-kappa B a c-Jun N-koncovou kinázu a moduluje buněčný růst“. Onkogen. 18 (47): 6496–504. doi:10.1038 / sj.onc.1203059. PMID 10597252.
Yu J, Tian S, Metheny-Barlow L, Chew LJ, Hayes AJ, Pan H, Yu GL, Li LY (prosinec 2001). "Modulace zastavení růstu endoteliálních buněk a apoptózy inhibitorem vaskulárního endoteliálního růstu". Výzkum oběhu. 89 (12): 1161–7. doi:10,1161 / hh2401,101909. PMID 11739281.
Migone TS, Zhang J, Luo X, Zhuang L, Chen C, Hu B, Hong JS, Perry JW, Chen SF, Zhou JX, Cho YH, Ullrich S, Kanakaraj P, Carrell J, Boyd E, Olsen HS, Hu G , Pukac L, Liu D, Ni J, Kim S, Gentz R, Feng P, Moore PA, Ruben SM, Wei P (březen 2002). „TL1A je ligand podobný TNF pro DR3 a TR6 / DcR3 a funguje jako kostimulátor T buněk“. Imunita. 16 (3): 479–92. doi:10.1016 / S1074-7613 (02) 00283-2. PMID 11911831.
Chew LJ, Pan H, Yu J, Tian S, Huang WQ, Zhang JY, Pang S, Li LY (květen 2002). "Nová sekretovaná varianta sestřihu inhibitoru růstu vaskulárních endoteliálních buněk". FASEB Journal. 16 (7): 742–4. doi:10.1096 / fj.01-0757fje. PMID 11923219. S2CID 34749634.
Wen L, Zhuang L, Luo X, Wei P (říjen 2003). „Aktivace NF-kappaB indukovaná TL1A a produkce c-IAP2 zabraňují apoptóze zprostředkované DR3 v buňkách TF-1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (40): 39251–8. doi:10,1074 / jbc.M305833200. PMID 12882979.
Bamias G, Martin C, Marini M, Hoang S, Mishina M, Ross WG, Sachedina MA, Friel CM, Mize J, Bickston SJ, Pizarro TT, Wei P, Cominelli F (listopad 2003). „Exprese, lokalizace a funkční aktivita TL1A, nového Th1-polarizačního cytokinu při zánětlivém onemocnění střev“. Journal of Immunology. 171 (9): 4868–74. doi:10,4049 / jimmunol. 171,9,4868. PMID 14568967.
Prehn JL, Mehdizadeh S, Landers CJ, Luo X, Cha SC, Wei P, Targan SR (červenec 2004). „Potenciální role TL1A, nového člena rodiny TNF a silného kostimulátoru IFN-gama, při zánětu sliznice“. Klinická imunologie. 112 (1): 66–77. doi:10.1016 / j.clim.2004.02.007. PMID 15207783.
Kang YJ, Kim WJ, Bae HU, Kim DI, Park YB, Park JE, Kwon BS, Lee WH (březen 2005). „Zapojení TL1A a DR3 do indukce prozánětlivých cytokinů a matrix metaloproteinázy-9 v aterogenezi“. Cytokin. 29 (5): 229–35. doi:10.1016 / j.cyto.2004.12.001. PMID 15760679.
Hou W, Medynski D, Wu S, Lin X, Li LY (srpen 2005). „VEGI-192, nová izoforma TNFSF15, specificky eliminuje vaskulární endoteliální buňky tumoru a potlačuje růst tumoru“. Klinický výzkum rakoviny. 11 (15): 5595–602. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-05-0384. PMID 16061878.
Yamazaki K, McGovern D, Ragoussis J, Paolucci M, Butler H, Jewell D, Cardon L, Takazoe M, Tanaka T, Ichimori T, Saito S, Sekine A, Iida A, Takahashi A, Tsunoda T, Lathrop M, Nakamura Y (Listopad 2005). „Jednonukleotidové polymorfismy v TNFSF15 propůjčují náchylnost k Crohnově nemoci“. Lidská molekulární genetika. 14 (22): 3499–506. doi:10,1093 / hmg / ddi379. PMID 16221758.
Yao JJ, Zhang M, Miao XH, Zhao P, Zhu SY, Ding H, Qi ZT (duben 2006). „Izoforma inhibitoru růstu vaskulárních endoteliálních buněk (VEGI72-251) zvyšuje produkci interleukinu-2 aktivací T lymfocytů“. Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 38 (4): 249–53. doi:10.1111 / j.1745-7270.2006.00155.x. PMID 16604264.
Prehn JL, Thomas LS, Landers CJ, Yu QT, Michelsen KS, Targan SR (duben 2007). „Kostimulátor T buněk TL1A je indukován signalizací FcgammaR v lidských monocytech a dendritických buňkách“. Journal of Immunology. 178 (7): 4033–8. doi:10,4049 / jimmunol.178.7.4033. PMID 17371957.
Cassatella MA, Pereira-da-Silva G, da Silva GP, Tinazzi I, Facchetti F, Scapini P, Calzetti F, Tamassia N, Wei P, Nardelli B, Roschke V, Vecchi A, Mantovani A, Bambara LM, Edwards SW, Carletto A (červen 2007). „Produkce rozpustného cytokinu podobného TNF (TL1A) imunitními komplexy stimulovala monocyty u revmatoidní artritidy“. Journal of Immunology. 178 (11): 7325–33. doi:10,4049 / jimmunol.178.11.7325. PMID 17513783.
Jin T, Guo F, Kim S, Howard A, Zhang YZ (prosinec 2007). „Rentgenová krystalová struktura člena rodiny TNF ligandů TL1A při 2,1 A“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 364 (1): 1–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.09.097. PMID 17935696.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000181634 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] Hoffmann R, Valencia A (červenec 2004). „Genová síť pro navigaci v literatuře“. Genetika přírody. 36 (7): 664. doi:10.1038 / ng0704-664. PMID 15226743.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: TNFSF15 tumor nekrotizující faktor (ligand) nadčeleď, člen 15".

[6] Wang EC (září 2012). „Na receptoru smrti 3 a jeho ligandech…“. Imunologie. 137 (1): 114–116. doi:10.1111 / j.1365-2567.2012.03606.x. PMC 3449252. PMID 22612445.

[pmid17663424-7] Picornell Y, Mei L, Taylor K, Yang H, Targan SR, Rotter JI (listopad 2007). „TNFSF15 je etnicky specifický gen IBD“. Zánětlivá onemocnění střev. 13 (11): 1333–8. doi:10.1002 / ibd.20223. PMC 2552994. PMID 17663424.

[pmid16966713-8] Kakuta Y, Kinouchi Y, Negoro K, Takahashi S, Shimosegawa T (říjen 2006). „Asociační studie polymorfismů TNFSF15 u japonských pacientů se zánětlivým onemocněním střev“. Střevo. 55 (10): 1527–8. doi:10.1136 / gut.2006.100297. PMC 1856432. PMID 16966713.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]