ADP-ribosylace - ADP-ribosylation

ADP ribóza

ADP-ribosylace je přidání jednoho nebo více ADP-ribóza skupiny na a protein.[1][2] Je to reverzibilní posttranslační modifikace který se účastní mnoha buněčných procesů, včetně buněčná signalizace, Oprava DNA, genová regulace a apoptóza.[3][4]Nesprávná ADP-ribosylace se podílí na některých formách rakoviny.[5] Je také základem pro toxicitu bakteriálních sloučenin, jako jsou toxin cholery, toxin záškrtu, a další.[6]

Dějiny

První návrh ADP-ribosylace se objevil na počátku 60. let. V tuto chvíli, Pierre Chambon a spolupracovníci pozorovali začlenění ATP do extraktu z jader slepičích jater.[7] Po rozsáhlých studiích o kyselině nerozpustné frakci dokázalo identifikovat několik různých výzkumných laboratoří ADP-ribóza, odvozený od NAD + jako začleněná skupina. O několik let později byly identifikovány enzymy odpovědné za toto zabudování a dostaly název poly (ADP-ribóza) polymeráza. Původně byla tato skupina považována za lineární sekvenci ADP-ribózových jednotek kovalentně vázaných přes glykosidovou vazbu ribózy. Později bylo oznámeno, že rozvětvení může nastat každých 20 až 30 zbytků ADP.[8]

První výskyt mono-ADP-ribosylace se objevil o rok později během studie toxinů: corynebacterium diphtheria Bylo prokázáno, že difterický toxin je závislý na NAD +, aby byl zcela účinný, což vedlo k objevu enzymatické konjugace jedné skupiny ADP-ribózy mono-ADP-ribosyltransferázou.

Původně se předpokládalo, že ADP-ribosylace je a posttranslační modifikace podílí se výhradně na regulaci genů. Jak však bylo objeveno více enzymů se schopností ADP-ribosylátových proteinů, byla zřejmá multifunkční povaha ADP-ribosylace. První savčí enzym s aktivitou poly-ADP-ribóza transferázy byl objeven koncem 80. let. Pro příštích 15 let se předpokládalo, že je to jediný enzym schopný přidat řetězec ADP-ribózy do savčích buněk.[9] Na konci 80. let se objevily ADP-ribosylcyklázy, které katalyzují přidání cyklická-ADP-ribóza skupiny proteinů. Konečně, sirtuiny Bylo zjištěno, že rodina enzymů, které také mají deacitační aktivitu závislou na NAD +, mají také aktivitu mono-ADP-ribosyltransferázy.[10][11]

Katalytický mechanismus

Mechanismus pro ADP-ribosylaci se zbytky katalyzujícího enzymu zobrazenými modře.[sporný – diskutovat]

Zdrojem ADP-ribózy pro většinu enzymů, které provádějí tuto modifikaci, je redoxní kofaktor NAD+. V této přenosové reakci je N-glykosidová vazba NAD+ který přemosťuje molekulu ADP-ribózy a nikotinamidová skupina se odštěpí a následuje nukleofilní útok cílovým aminokyselinovým postranním řetězcem. ADP-ribosyltransferázy mohou provádět dva typy modifikací: mono-ADP ribosylaci a poly-ADP ribosylaci.

Mono-ADP-ribosylace

Mono-ADP ribosyltransferázy běžně katalyzují přidání ADP-ribóza na arginin postranní řetězce využívající vysoce konzervovaný R-S-EXE motiv enzymu.[12] Reakce probíhá přerušením vazby mezi nimi nikotinamid a ribóza tvoří oxoniový ion. Argininový postranní řetězec cílového proteinu poté působí nukleofilně a útočí na elektrofilní uhlík sousedící s oxoniovým iontem. Aby k tomuto kroku mohlo dojít, je argininový nukleofil deprotonovaný podle a glutamát zbytek na katalyzujícím enzymu[sporný – diskutovat]. Další konzervovaný glutamátový zbytek tvoří vodíkovou vazbu s jednou z hydroxylových skupin na ribózovém řetězci, aby dále usnadnil tento nukleofilní útok. V důsledku štěpné reakce se uvolňuje nikotinamid. Modifikaci lze zvrátit pomocí ADP-ribosylhydroláz, které štěpí N-glykosidová vazba mezi argininem a ribózou k uvolnění ADP-ribózy a nemodifikovaného proteinu; NAD + se neobnoví reverzní reakcí.

Poly ADP-ribosylace

Poly- (ADP-ribóza) polymerázy (PARP) se nacházejí většinou v eukaryoty a katalyzují přenos více molekul ADP-ribózy na cílové proteiny. Stejně jako u mono-ADP ribosylace je zdrojem ADP-ribózy NAD+. PARP používají a katalytická triáda His-Tyr-Glu k usnadnění vazby NAD+ a umístění konce existujícího poly-ADP ribózového řetězce na cílový protein; Glu usnadňuje katalýzu a tvorbu (1-> 2) O-glykosidové vazby mezi dvěma molekulami ribózy. Existuje několik dalších enzymů, které rozpoznávají poly-ADP ribózové řetězce, hydrolyzovat nebo tvoří větve; více než 800 proteinů bylo anotováno, aby obsahovaly volně definovaný poly ADP-ribosový vazebný motiv; proto kromě této modifikace, která mění konformaci a strukturu cílového proteinu, může být také použita jako značka pro nábor dalších proteinů nebo pro regulaci cílového proteinu.[13]

Specifičnost aminokyselin

Mnoho různých aminokyselina boční řetězy byly popsány jako akceptory ADP-ribózy. Z chemického hlediska tato modifikace představuje protein glykosylace: k přenosu ADP-ribózy dochází na postranních řetězcích aminokyselin s nukleofilním kyslíkem, dusíkem nebo sírou, což vede k N-, O- nebo S-glykosidové vazbě na ribózu ADP-ribózy.[14] Původně kyselé aminokyseliny (glutamát a aspartát ) byly popsány jako hlavní místa ADP-ribosylace. Mnoho dalších ADP-ribózových akceptorových míst, jako je serin,[15][16] arginin,[17] cystein,[18] lysin,[19] difthamid,[20] fosfoserin,[21] a asparagin[22] byly identifikovány v následujících pracích.

Funkce

Apoptóza

V době Poškození DNA nebo jsou aktivovány buněčné stresové PARP, což vede ke zvýšení množství poly-ADP-ribózy a ke snížení množství NAD +.[23] Již více než deset let se předpokládá, že PARP1 je jedinou polymerázou poly-ADP-ribózy v buňkách savců, proto byl tento enzym nejvíce studován. Kaspázy jsou rodinou cysteinu proteázy o kterých je známo, že hrají v programovaná buněčná smrt. Tato proteáza štěpí PARP-1 na dva fragmenty, takže je zcela neaktivní, aby se omezila produkce poly-ADP-ribózy. Jeden z jeho fragmentů migruje z jádra do cytoplazmy a je považován za cíl autoimunity.

Během kaspázy nezávislé apoptóza, nazývané také parthanatos, může dojít k akumulaci poly-ADP-ribózy v důsledku aktivace PARP nebo inaktivace poly (ADP-ribóza) glykohydroláza enzym, který hydrolyzuje poly (ADP-ribóza) k výrobě volné ADP-ribózy. Studie ukázaly, že poly-ADP-ribóza pohání translokaci proteinu faktoru indukujícího apoptózu do jádra, kde bude zprostředkovat Fragmentace DNA. Bylo navrženo, že pokud by došlo k selhání aktivace kaspázy za stresových podmínek, došlo by k nekroptóze. Nadměrná aktivace PARP vedla k smrt nekrotických buněk regulováno protein faktoru nekrózy nádorů. Ačkoli tento mechanismus dosud není znám, bylo prokázáno, že inhibitory PARP ovlivňují nekroptózu.[24]

Regulace genů

ADP-ribosylace může ovlivnit genová exprese na téměř všech úrovních regulace, včetně organizace chromatinu, náboru a vazby transkripčních faktorů a zpracování mRNA.

Organizace nukleosomy je klíčem k regulaci genové exprese: rozmístění a organizace nukleosomů mění to, pro které oblasti DNA jsou k dispozici transkripce mechanismy vázání a přepisu DNA. PARP1 Bylo prokázáno, že polymeráza poly-ADP ribózy ovlivňuje strukturu chromatinu a podporuje změny v organizaci nukleosomů modifikací histony.

Krystalová struktura zinkové prstové domény PARP1 navázaná na DNA (fialová). PDB: 4AV1

Bylo prokázáno, že PARP ovlivňují transkripční faktor struktura a způsobují nábor mnoha transkripčních faktorů za vzniku komplexů na DNA a vyvolávají transkripci. Ukázalo se také, že mono ADP-ribosyltransferázy ovlivňují vazbu transkripčního faktoru na promotorech. Například bylo prokázáno, že ovlivňuje PARP14, mono ADP-ribosyltransferáza STAT transkripční faktor vazba.

Ukázalo se, že jiné ADP-ribosyltransferázy modifikují proteiny, které se vážou mRNA, což může způsobit umlčení tohoto přepisu genu.[25]

Oprava DNA

Poly-ADP-ribózové polymerázy (PARP) mohou fungovat Oprava DNA jednořetězcových zlomů i dvouřetězcových zlomů. Při jednopramenné opravě (oprava základní excize ) PARP může buď usnadnit odstranění oxidovaného cukru nebo štěpení vlákna. PARP1 váže jednovláknové zlomy a přitahuje všechny blízké meziprodukty opravy excize blízko. Mezi tyto meziprodukty patří XRCC1 a APLF a mohou být získávány přímo nebo prostřednictvím PBZ domény APLF.[26] To vede k syntéze poly-ADP ribózy. Doména PBZ je přítomna v mnoha proteinech podílejících se na opravě DNA a umožňuje navázání PARP a tedy ADP-ribosylace, která získává opravné faktory k interakci v místě zlomu. PARP2 je sekundární reagující na poškození DNA, ale slouží k zajištění funkční redundance při opravě DNA.[27]

Oprava DNA usnadněná náborem opravných enzymů PARP1. Oprava zlomení jednoho řetězce DNA je zahájena navázáním PARP1. PARP1 váže jednořetězcové zlomy a táhne meziprodukty opravy excize báze blízko, což vede k syntéze poly-ADP ribózy. XRCC1 je rentgenová opravná křížově se doplňující bílkovina 1. Komplexy XRCC1 s polynukleotidkinázou (PNK), která zpracovává konce DNA. PCNA je nukleární antigen proliferujících buněk, který slouží jako DNA svorka, která napomáhá aktivitě DNA polymerázy (DNA pol). FEN1 (Flap endonukleáza 1) je poté rekrutován, aby odstranil převislou 5 'klapku. Poslední krok opravy DNA zahrnuje DNA ligázu, která spojuje konečné řetězce DNA ve fosfodiesterové vazbě.

Existuje mnoho mechanismů pro opravu poškozené dvouvláknové DNA. PARP1 může fungovat jako a synapse faktor v alternativním nehomologním spojování konců. Kromě toho bylo navrženo, že PARP1 je vyžadován ke zpomalení replikačních vidlic po poškození DNA a propagaci homologní rekombinace na replikační vidlice které mohou být nefunkční. Je možné, že PARP1 a PARP3 spolupracovat při opravě dvouvláknové DNA a ukázalo se, že PARP3 je rozhodující pro rozlišení dvouvláknového zlomu. Existují dvě hypotézy, kterými se PARP1 a PARP3 shodují. První hypotéza uvádí, že dvě ADP-ribosyltransferázy slouží k vzájemné funkci nečinnosti. Pokud dojde ke ztrátě PARP3, bude to mít za následek jednořetězcové zlomy, a tedy nábor PARP1. Druhá hypotéza naznačuje, že tyto dva enzymy spolupracují; PARP3 katalyzuje mono-ADP ribosylaci a krátkou poly-ADP ribosylaci a slouží k aktivaci PARP1.[27]

PARP mají mnoho proteinových cílů v místě poškození DNA. KU protein a DNA-PKcs jsou obě dvouvláknové opravné komponenty zlomu s neznámými místy ADP-ribosylace. Histony jsou dalším proteinovým cílem PARP. Všechny základní histony a linkerový histon H1 jsou po poškození DNA ADP-ribosylovány. Funkce těchto modifikací je stále neznámá, ale bylo navrženo, že ADP-ribosylace moduluje vyšší řád chromatin Struktura ve snaze usnadnit přístupnější místa pro migraci opravných faktorů na poškození DNA.

Degradace bílkovin

Ubiquitin-proteazomový systém (UPS) figuruje prominentně v degradaci proteinů. The 26S proteazom sestává z katalytické podjednotky (základní částice 20S) a regulační podjednotky (čepice 19S).[28] Poly-ubikvitin Řetězce označují proteiny pro degradaci proteazomem, což způsobuje hydrolýzu označených proteinů na menší peptidy.

Tankyráza (TNKS), ADP-ribosyltransferáza, interaguje s regulátorem proteazomu PI31. Důkazy v Drosophila a člověk buněčné linie ukazují, že ankyrinová doména (ANK) TNKS usnadňuje interakci s N-terminálním TNKS-vazebným motivem a C-terminální HbYX doménou PI31.[29] To podporuje ADP-ribosylaci PI31 doménou PARP TNKS. Kromě toho bylo prokázáno, že léčba Drosophila buňky s inhibitorem TNKS, XAV939, oslabily aktivitu proteasomu 26S. Kromě toho bylo prokázáno, že ADP-ribosylace PI31 blokuje PI31-zprostředkovanou inhibici a-podjednotek částice 20S. Pracovní hypotéza tedy spočívá v tom, že tankyrasou zprostředkovaná ADP-ribosylace snižuje aktivitu PI31, což zase snižuje degradaci proteinu prováděnou proteazomem.[29]

Klinický význam

Rakovina

PARP1 je zapojen do oprava základní excize (BER), jedno- a dvouvláknová oprava zlomení a chromozomální stabilita. Rovněž se podílí na transkripční regulace prostřednictvím jeho usnadnění interakce protein-protein. Použití PARP1 NAD + aby mohl plnit svoji funkci při apoptóze. Pokud dojde k nadměrné aktivitě PARP, buňka bude mít snížené hladiny kofaktoru NAD + i snížené hladiny ATP a tak podstoupí nekróza. To je důležité v karcinogeneze protože by to mohlo vést k selekci buněk s deficitem PARP1 (ale ne vyčerpaných) kvůli jejich výhodě přežití během růstu rakoviny.[30]

Náchylnost ke karcinogenezi při deficitu PARP1 významně závisí na typu vzniklého poškození DNA. Existuje mnoho důsledků, že různé PARP jsou zapojeny do prevence karcinogeneze. Jak již bylo uvedeno výše, PARP1 a PARP2 se účastní BER a chromozomální stability. PARP3 je zapojen do centrosome nařízení. Tankyráza je další ADP-ribózová polymeráza, které se účastní telomer regulace délky.[5]

Inhibice PARP1 byla také široce studována v protinádorových terapeutikách. Mechanismus účinku inhibitoru PARP1 spočívá ve zvýšení poškození způsobeného chemoterapií na rakovinné DNA tím, že nedovolí reparativní funkci PARP1 u jedinců s nedostatkem BRCA1 / 2.

PARP14 je další ADP-ribosylační enzym, který byl dobře studován, pokud jde o cíle léčby rakoviny; je to převodník signálu a aktivátor Protein interagující s transkripcí STAT6 a bylo prokázáno, že je spojena s agresivitou B-buněčných lymfomů.[30]

Bakteriální toxiny

Bakteriální ADP-ribosylační exotoxiny (bAREs) kovalentně přenášejí ADP-ribózovou část NAD + na cílové proteiny infikovaných eukaryot, čímž se získá nikotinamid a volný vodíkový ion. bARE jsou vyráběny jako prekurzory enzymů, skládající se z domén „A“ a „B“: doména „A“ je zodpovědná za aktivitu ADP-ribosylace; a doména „B“ pro translokaci enzymu přes membránu buňky. Tyto domény mohou existovat ve třech formách: zaprvé jako jednotlivé polypeptidové řetězce s doménami A a B kovalentně spojenými; zadruhé, v komplexech více proteinů s doménami A a B vázanými nekovalentními interakcemi; a za třetí, v komplexech více proteinů s doménami A a B, které přímo neinteragují, před zpracováním.[6]

Krystalová struktura toxinu záškrtu. PDB: 1 MDT

Po aktivaci BARES ADP-ribosylátuje libovolný počet eukaryotických proteinů; takový mechanismus je zásadní pro podněcování nemocných stavů spojených s ADP-ribosylací. GTP-vazebné proteiny zejména jsou dobře zavedené v patofyziologii BAREs. Například cholera a tepelně labilní enterotoxin cílí na α-podjednotka Gs z heterotrimerní proteiny vázající GTP. Protože a-podjednotka je ADP-ribosylovaná, je trvale v „aktivním“ stavu vázaném na GTP; následná aktivace intracelulární cyklický AMP stimuluje uvolňování tekutiny a iontů ze střevních epiteliálních buněk. Dále C. Botulinum C3 ADP-ribosyláty proteiny vázající GTP Rho a Ras, a Pertussis toxin ADP-ribosyláty Gi Jdi a Gt. Toxin záškrtu Faktor prodloužení ribozomů ADP-ribosyláty EF-2, který tlumí syntézu bílkovin.[6]

Existuje celá řada bakterií, které využívají BARE při infekci: KARTY toxin z Mycoplasma pneumoniae, toxin cholery z vibrio cholera; tepelně labilní enterotoxin z E-coli; Exotoxin A z Pseudomonas aeruginosa; Pertussis toxin z B. Pertussis; Toxin C3 z C. botulinum; a Toxin záškrtu z Corynebacterium diphtheriae.[31]

Viz také

Reference

  1. ^ Belenky P, Bogan KL, Brenner C (2007). "NAD + metabolismus ve zdraví a nemoci" (PDF). Trends Biochem. Sci. 32 (1): 12–9. doi:10.1016 / j.tibs.2006.11.006. PMID  17161604.
  2. ^ Ziegler M (2000). "Nové funkce dlouho známé molekuly. Vznikající role NAD v buněčné signalizaci". Eur. J. Biochem. 267 (6): 1550–64. doi:10.1046 / j.1432-1327.2000.01187.x. PMID  10712584.
  3. ^ Berger F, Ramírez-Hernández MH, Ziegler M (2004). "Nový život stého výročí: signalizační funkce NAD (P)". Trends Biochem. Sci. 29 (3): 111–8. doi:10.1016 / j.tibs.2004.01.007. PMID  15003268.
  4. ^ Corda D, Di Girolamo M (2003). „NOVÝ PŘEHLED ČLENŮ EMBO: Funkční aspekty mono-ADP-ribosylace proteinů“. EMBO J.. 22 (9): 1953–8. doi:10.1093 / emboj / cdg209. PMC  156081. PMID  12727863.
  5. ^ A b Scarpa ES, Fabrizio G, Di Girolamo M (2013). "Role v intracelulární mono-ADP-ribosylaci v biologii rakoviny". FEBS Journal. 280 (15): 3551–3562. doi:10.1111 / febs.12290. PMID  23590234.
  6. ^ A b C Krueger, KM; Barbieri, JT (leden 1995). "Rodina bakteriálních exprimátů ribosylace ADP". Recenze klinické mikrobiologie. 8 (1): 34–47. doi:10.1128 / CMR.8.1.34. PMC  172848. PMID  7704894.
  7. ^ Chambon, P; Weill, J. D .; Mandel, P. (1963). „Nikotinamid mononukleotidová aktivace nové DNA závislé polyadenylové kyseliny syntetizující jaderný enzym“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 11: 39–43. doi:10.1016 / 0006-291x (63) 90024-x. PMID  14019961.
  8. ^ Hayaishi, O .; Ueda, K. (2012). Poly- a mono (ADP-ribosyl) ační reakce: jejich význam v molekulární biologii. In ADP-Ribosylation Reactions: Biology and Medicine. New York: Academic Press.
  9. ^ Hassa, P. O .; Haenni, S. S .; Elser, M .; Hottiger, M. O. (2006). „Hassa, P. O .; Haenni, S. S .; Elser, M .; Hottiger, M. O. (2006)„ Nukleární ADP-ribozylační reakce v buňkách savců: Kam dnes jsme a kam jdeme “. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 70 (3): 789–829. doi:10,1 128 / mmbr. 00040-05. PMC  1594587. PMID  16959969.
  10. ^ Frye, RA (24. června 1999). „Charakterizace pěti lidských cDNA s homologií s kvasinkovým genem SIR2: proteiny podobné Sir2 (sirtuiny) metabolizují NAD a mohou mít aktivitu proteinu ADP-ribosyltransferázy“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 260 (1): 273–9. doi:10.1006 / bbrc.1999.0897. PMID  10381378.
  11. ^ Rack, Johannes Gregor Matthias; Morra, Rosa; Barkauskaite, Eva; Kraehenbuehl, Rolf; Ariza, Antonio; Qu, Yue; Ortmayer, Mary; Leidecker, Orsolya; Cameron, David R. (16. července 2015). „Identifikace třídy proteinů ADP-ribosylace sirtuinů v mikrobiálních patogenech“. Molekulární buňka. 59 (2): 309–320. doi:10.1016 / j.molcel.2015.06.013. ISSN  1097-4164. PMC  4518038. PMID  26166706.
  12. ^ Laing, Sabrina; Unger, Mandy; Koch-Nolte, Friedrich; Haag, Friedrich (21. července 2010). "ADP-ribosylace argininu". Aminokyseliny. 41 (2): 257–269. doi:10.1007 / s00726-010-0676-2. PMC  3102197. PMID  20652610.
  13. ^ Žaja, Roko; Mikoč, Andreja; Barkauskaite, Eva; Ahel, Ivan (21. prosince 2012). "Molekulární pohledy na rozpoznávání a zpracování poly (ADP-ribózy)". Biomolekuly. 3 (1): 1–17. doi:10,3390 / biom3010001. PMC  4030884. PMID  24970154.
  14. ^ Liu, Qiang; Florea, Bogdan I .; Filippov, Dmitri V. (2017). „ADP-ribosylace jde normálně: serin jako hlavní místo modifikace“. Cell Chemical Biology. 24 (4): 431–432. doi:10.1016 / j.chembiol.2017.04.003. PMID  28431224.
  15. ^ Leidecker, Orsolya; Bonfiglio, Juan José; Colby, Thomas; Zhang, Qi; Atanassov, Ilian; Zaja, Roko; Palazzo, Luca; Stockum, Anna; Ahel, Ivan; Matic, Ivan (2016). „Serin je nový cílový zbytek pro endogenní ADP-ribosylaci na histonech“. Přírodní chemická biologie. 12 (12): 998–1000. doi:10.1038 / nchembio.2180. PMC  5113755. PMID  27723750.
  16. ^ Bonfiglio, Juan José; Fontana, Pietro; Zhang, Qi; Colby, Thomas; Gibbs-Seymour, Ian; Atanassov, Ilian; Bartlett, Edward; Zaja, Roko; Ahel, Ivan; Matic, Ivan (2017). „Serinová ADP-ribosylace závisí na HPF1“. Molekulární buňka. 65 (5): 932–940.e6. doi:10.1016 / j.molcel.2017.01.003. PMID  28190768.
  17. ^ Laing S, Koch-Nolte F, Haag F, Buck F. „Strategies for identification of arginine ADP-ribosylation sites“. Journal of proteomics. 2011; 75: 169–176.
  18. ^ McDonald LJ, Moss J. „Enzymatická a neenzymatická ADP-ribosylace cysteinu“. Mol Cell Biochem. 1994; 138: 221–226.
  19. ^ Messner, Simon; Altmeyer, Matthias; Zhao, Hongtao; Pozivil, Andrea; Roschitzki, Bernd; Gehrig, Peter; Rutishauser, Dorothea; Huang, Danzhi; Caflisch, Amedeo; Hottiger, Michael O. (2010). „PARP1 ADP-ribosyláty lysinových zbytků jádrových histonových ocasů“. Výzkum nukleových kyselin. 38 (19): 6350–6362. doi:10.1093 / nar / gkq463. PMC  2965223. PMID  20525793.
  20. ^ Oppenheimer NJ, Bodley JW. Toxin záškrtu. "Místo a konfigurace ADP-ribosylace difthamidu v elongačním faktoru 2". J Biol Chem. 1981; 256: 8579–8581.
  21. ^ Smith JA, Stocken LA. "Chemické a metabolické vlastnosti adenosindifosfát-ribózových derivátů jaderných proteinů". Biochem J. 1975; 147: 523–529.
  22. ^ Manning DR, Fraser BA, Kahn RA, Gilman AG. „ADP-ribosylace transducinu proteinem aktivujícím ostrůvky. Identifikace asparaginu jako místa ADP-ribosylace“. J Biol Chem. 1984; 259: 749–756.
  23. ^ Scovassi, AI; Denegri, M; Donzelli, M; Rossi, L; Bernardi, R; Mandarino, A; Frouin, I; Negri, C (1998). „Poly (ADP-ribóza) syntéza v buňkách podstupujících apoptózu: pokus čelit smrti před degradací PARP“. European Journal of Histochemistry. 42 (4): 251–8. PMID  10068897.
  24. ^ Aredia, F; Scovassi, AI (1. června 2014). "Zapojení PARP do buněčné smrti". Frontiers in Bioscience. 6 (2): 308–17. doi:10.2741/707. PMID  24896207.
  25. ^ Ryu, Keun Woo; Kim, Dae-Seok; Kraus, W. Lee (9. ledna 2015). „Nové aspekty regulace genové exprese pomocí ADP-ribosylace a poly (ADP-ribóza) polymeráz“. Chemické recenze. 115 (6): 2453–2481. doi:10.1021 / cr5004248. PMC  4378458. PMID  25575290.
  26. ^ Schreiber, V; Amé, JC; Dollé, P; Schultz, I; Rinaldi, B; Fraulob, V; Ménissier-de Murcia, J; de Murcia, G (21. června 2002). „Poly (ADP-ribóza) polymeráza-2 (PARP-2) je vyžadována pro efektivní opravu DNA excize báze ve spojení s PARP-1 a XRCC1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (25): 23028–36. doi:10.1074 / jbc.m202390200. PMID  11948190.
  27. ^ A b Hrušky, Catherine J .; Couto, C. Anne-Marie; Wang, Hong-Yu; Borer, Christine; Kiely, Rhian; Lakin, Nicholas D. (28. října 2014). „Role ADP-ribosylace v regulaci opravy dvouřetězcové DNA přerušení“. Buněčný cyklus. 11 (1): 48–56. doi:10,4161 / cc.11.1.18793. PMC  3272231. PMID  22186780.
  28. ^ Cheng, Yifan (duben 2009). „Směrem k atomovému modelu proteazomu 26S“. Aktuální názor na strukturní biologii. 19 (2): 203–208. doi:10.1016 / j.sbi.2009.02.004. PMC  2743420. PMID  19286367.
  29. ^ A b Cho-Park, Park F .; Steller, Hermann (duben 2013). „Regulace proteazomu pomocí ADP-ribosylace“. Buňka. 153 (3): 614–627. doi:10.1016 / j.cell.2013.03.040. PMC  3676968. PMID  23622245.
  30. ^ A b Boulares HA, Yakovlev AG, Smulson ME (2000). „Degradace genomu pomocí DNAS1L3 endonukleázy: klíčová událost regulovaná PARP-1 v apoptóze“. Databáze biologických věd Madame Curie.
  31. ^ Deng, Qing; Barbieri, Joseph T. (říjen 2008). "Molekulární mechanismy cytotoxicity ADP-ribosylačních toxinů". Výroční přehled mikrobiologie. 62 (1): 271–288. doi:10.1146 / annurev.micro.62.081307.162848. PMID  18785839.