PARP3 - PARP3 - Wikipedia

PARP3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EOC, 3C49, 3C4H, 3CE0, 3FHB, 4GV0, 4GV2, 4GV4, 4L6Z, 4L70, 4L7L, 4L7N, 4L7O, 4L7P, 4L7R, 4L7U
Identifikátory
Aliasy	PARP3, ADPRT3, ADPRTL2, ADPRTL3, ARTD3, IRT1, PADPRT-3, člen rodiny polymerázy poly (ADP-ribóza) 3
Externí ID	OMIM: 607726 MGI: 1891258 HomoloGene: 4005 Genové karty: PARP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	51,948,867 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	106,476,949 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita transferázy, přenos glykosylových skupin; • katalytická aktivita; • Aktivita NAD + ADP-ribosyltransferázy; • Aktivita DNA ligázy (ATP); • aktivita proteinu ADP-ribosylázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita NAD DNA ADP-ribosyltransferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • místo dvouvláknového zlomu; • centriole; • cytoskelet; • buněčné jádro; • organizační centrum mikrotubulů; • jádro; • chromozóm;
Biologický proces	• lokalizace proteinu do místa dvouvláknového zlomu; • Ligace DNA zapojená do opravy DNA; • prodlužování pramene; • regulace organizace mitotického vřetena; • pozitivní regulace ligace DNA; • údržba telomer; • oprava dvojitého vlákna; • proteinová ADP-ribosylace; • Oprava DNA; • negativní regulace aktivity reverzní transkriptázy telomerázy RNA; • proteinová poly-ADP-ribosylace; • DNA ADP-ribosylace; • negativní regulace přepínání izotypů; • proteinová auto-ADP-ribosylace; • mono-ADP-ribosylace proteinu; • pozitivní regulace opravy dvouvláknového zlomu prostřednictvím nehomologního spojování konců; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10039
	235587
	ENSG00000041880
	ENSMUSG00000023249
	Q9Y6F1
	Q3ULW8
	NM_001003931; NM_001003935; NM_005485; NM_001370239; NM_001370240
	NM_145619; NM_001311150
	NP_001003931; NP_005476; NP_001357168; NP_001357169
	NP_001298079; NP_663594
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Poly [ADP-ribóza] polymeráza 3 je enzym že u lidí je kódován PARP3 gen.^[5]^[6]

The protein kódovaný tímto genem patří do rodiny PARP. Tyto enzymy se modifikují jaderné proteiny podle poly-ADP-ribosylace, který je vyžadován pro Oprava DNA, regulace z apoptóza a udržování genomové stability. Tento gen kóduje poly (ADP-ribosyl) transferázu 3, která je přednostně lokalizována pro dceru centriole skrze buněčný cyklus. Alternativně sestříhané varianty přepisu kódující různé izoformy byl identifikován.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000041880 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023249 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Johansson M (srpen 1999). "Lidská poly (ADP-ribóza) polymerázová genová rodina (ADPRTL): cDNA klonování dvou nových homologů poly (ADP-ribóza) polymerázy". Genomika. 57 (3): 442–5. doi:10.1006 / geno.1999.5799. PMID 10329013.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PARP3 poly (ADP-ribose) polymerase family, member 3“.

Další čtení

Bashford CL, Chance B, Lloyd D, Poole RK (1981). „Oscilace redoxních stavů v synchronně se dělících kulturách Acanthamoeba castellanii a Schizosaccharomyces pombe“. Biophys. J. 29 (1): 1–11. Bibcode:1980BpJ .... 29 ... 1B. doi:10.1016 / S0006-3495 (80) 85114-9. PMC 1328658. PMID 7260241.
Borggrefe T, Wabl M, Akhmedov AT, Jessberger R (1998). „Komplex rekombinace DNA specifický pro B-buňky“. J. Biol. Chem. 273 (27): 17025–35. doi:10.1074 / jbc.273.27.17025. PMID 9642267.
Berghammer H, Ebner M, Marksteiner R, Auer B (1999). „pADPRT-2: nový gen savčí polymerující (ADP-ribosyl) transferázy příbuzný zkráceným homologům pADPRT v rostlinách a Caenorhabditis elegans“. FEBS Lett. 449 (2–3): 259–63. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00448-2. PMID 10338144. S2CID 3251763.
Stále IH, Vince P, Cowell JK (2000). „Identifikace nového genu (ADPRTL1) kódujícího potenciální protein Poly (ADP-ribosyl) transferázy“. Genomika. 62 (3): 533–6. doi:10.1006 / geno.1999,6024. PMID 10644454.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. Bibcode:2000PNAS ... 97.3491D. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Glowacki G, Braren R, Cetkovic-Cvrlje M a kol. (2001). "Struktura, chromozomální lokalizace a exprese genu pro myší ekto-mono (ADP-ribosyl) transferázu ART5". Gen. 275 (2): 267–77. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00608-4. PMID 11587854.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK a kol. (2002). „Vyjádřená analýza sekvenčních značek lidského RPE / choroidu pro projekt NEIBank: více než 6000 neredundantních transkriptů, nových genů a variant sestřihu“. Mol. Vis. 8: 205–20. PMID 12107410.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Augustin A, Spenlehauer C, Dumond H a kol. (2004). „PARP-3 se přednostně lokalizuje do dceřiného centriolu a interferuje s progresí buněčného cyklu G1 / S“. J. Cell Sci. 116 (Pt 8): 1551–62. doi:10.1242 / jcs.00341. PMID 12640039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Rouleau M, McDonald D, Gagné P a kol. (2007). „PARP-3 se asociuje s těly skupin polycombů a se součástmi strojů na opravu poškození DNA“. J. Cell. Biochem. 100 (2): 385–401. doi:10.1002 / jcb.21051. PMID 16924674. S2CID 25618577.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
Lehtiö L, Jemth AS, Collins R a kol. (2009). "Strukturální základ pro specifičnost inhibitoru v lidské poly (ADP-ribóza) polymeráze-3". J. Med. Chem. 52 (9): 3108–3111. doi:10.1021 / jm900052j. PMID 19354255.

externí odkazy

PARP3 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
PARP3 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000041880 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023249 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10329013-5] Johansson M (srpen 1999). "Lidská poly (ADP-ribóza) polymerázová genová rodina (ADPRTL): cDNA klonování dvou nových homologů poly (ADP-ribóza) polymerázy". Genomika. 57 (3): 442–5. doi:10.1006 / geno.1999.5799. PMID 10329013.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: PARP3 poly (ADP-ribose) polymerase family, member 3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]