B3GAT2 - B3GAT2

B3GAT2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D0J
Identifikátory
Aliasy	B3GAT2, GLCATS, beta-1,3-glukuronyltransferáza 2
Externí ID	OMIM: 607497 MGI: 2389490 HomoloGene: 50574 Genové karty: B3GAT2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	70,957,060 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba kovových iontů; • aktivita galaktosylgalaktosylxylosylproteinu 3-beta-glukuronosyltransferázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Golgiho aparát; • membrána; • Golgiho membrána;
Biologický proces	• metabolický proces glykosaminoglykanu; • glykosylace proteinů; • proces biosyntézy chondroitin sulfátu proteoglykanu; • metabolický proces chondroitin sulfátu; • metabolický proces sacharidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	135152
	280645
	ENSG00000112309
	ENSMUSG00000026156
	Q9NPZ5
	P59270
	NM_080742
	NM_172124
	NP_542780
	NP_742122
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Galaktosylgalaktosylxylosylprotein 3-beta-glukuronosyltransferáza 2 je enzym že u lidí je kódován B3GAT2 gen.^[4]^[5]

Produktem tohoto genu je transmembránový protein patřící do rodiny glukuronyltransferáz a katalyzuje přenos beta-1,3 vázané kyseliny glukuronové na terminální galaktózu v různých glykoproteinech nebo glykolipidech obsahujících Gal-beta-1-4GlcNAc nebo Gal- zbytek beta-1-3GlcNAc. Kódovaný protein se účastní syntézy uhlohydrátového epitopu lidského zabijáka-1 (HNK-1), sulfatovaného trisacharidu, který se podílí na buněčné migraci a adhezi v nervovém systému.^[5]

Využití protilátky HNK-1 pro výzkum neurální lišty

Protilátky vytvořené proti epitopu HNK-1 hrály velkou roli ve studiích neurální lišta, zejména u ptačího embrya.^[6] První protilátka vytvořená proti tomuto epitopu byla NC-1,^[7] což umožňovalo mnohem jednodušší analýzy migračních cest neurální lišty. U ptáků, a zejména u jiných obratlovců, je třeba výsledky barvení HNK-1 interpretovat opatrně, protože epitop není pro neurální lištu jedinečný.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112309 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Imiya K, Ishizaki T, Seiki T, Saito F, Inazawa J, Oka S, Kawasaki T (říjen 2002). "cDNA klonování, genomová struktura a chromozomální mapování myší glukuronyltransferázy-S zapojené do biosyntézy HNK-1 uhlohydrátového epitopu". Gen. 296 (1–2): 29–36. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00840-5. PMID 12383500.
^ ^A ^b „Entrez Gene: B3GAT2 beta-1,3-glukuronyltransferáza 2 (glukuronosyltransferáza S)“.
^ Bronner-Fraser M (květen 1986). „Analýza raných stádií migrace kmenového nervového hřebenu u ptačích embryí pomocí monoklonální protilátky HNK-1“. Dev. Biol. 115 (1): 44–55. doi:10.1016/0012-1606(86)90226-5. PMID 3516760.
^ Vincent M, Thiery JP (červen 1984). "Buněčný povrchový marker pro neurální lišty a placodalové buňky: další vývoj v periferním a centrálním nervovém systému". Dev. Biol. 103 (2): 468–81. doi:10.1016/0012-1606(84)90334-8. PMID 6202575.

externí odkazy

Člověk B3GAT2 umístění genomu a B3GAT2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
PDBe-KB poskytuje přehled všech strukturních informací dostupných v PDB pro lidskou galaktosylgalaktosylxylosylprotein 3-beta-glukuronosyltransferázu 2 (B3GAT2)

Další čtení

Nagase T, Kikuno R, Ohara O (2002). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XXII. Kompletní sekvence 50 nových klonů cDNA, které kódují velké proteiny“. DNA Res. 8 (6): 319–27. doi:10.1093 / dnares / 8.6.319. PMID 11853319.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Marcos I, Galán JJ, Borrego S, Antiñolo G (2003). "Klonování, charakterizace a mapování chromozomů lidského genu GlcAT-S". J. Hum. Genet. 47 (12): 677–80. doi:10,1007 / s100380200103. PMID 12522689.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Kakuda S, Oka S, Kawasaki T (2004). „Čištění a charakterizace dvou rekombinantních lidských glukuronyltransferáz zapojených do biosyntézy sacharidů HNK-1 v Escherichia coli“. Protein Expr. Purif. 35 (1): 111–9. doi:10.1016 / j.pep.2003.12.021. PMID 15039073.
Kakuda S, Sato Y, Tonoyama Y a kol. (2005). „Různé akceptorové specificity dvou glukuronyltransferáz zapojených do biosyntézy sacharidů HNK-1“. Glykobiologie. 15 (2): 203–10. doi:10.1093 / glycob / cwi001. PMID 15470230.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Shiba T, Kakuda S, Ishiguro M a kol. (2006). „Krystalová struktura GlcAT-S, lidské glukuronyltransferázy, která se podílí na biosyntéze uhlohydrátového epitopu HNK-1“. Proteiny. 65 (2): 499–508. doi:10.1002 / prot.21118. PMID 16897771. S2CID 31290955.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000112309 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12383500-4] Imiya K, Ishizaki T, Seiki T, Saito F, Inazawa J, Oka S, Kawasaki T (říjen 2002). "cDNA klonování, genomová struktura a chromozomální mapování myší glukuronyltransferázy-S zapojené do biosyntézy HNK-1 uhlohydrátového epitopu". Gen. 296 (1–2): 29–36. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00840-5. PMID 12383500.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: B3GAT2 beta-1,3-glukuronyltransferáza 2 (glukuronosyltransferáza S)“.

[6] Bronner-Fraser M (květen 1986). „Analýza raných stádií migrace kmenového nervového hřebenu u ptačích embryí pomocí monoklonální protilátky HNK-1“. Dev. Biol. 115 (1): 44–55. doi:10.1016/0012-1606(86)90226-5. PMID 3516760.

[7] Vincent M, Thiery JP (červen 1984). "Buněčný povrchový marker pro neurální lišty a placodalové buňky: další vývoj v periferním a centrálním nervovém systému". Dev. Biol. 103 (2): 468–81. doi:10.1016/0012-1606(84)90334-8. PMID 6202575.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]