PARP2 - PARP2

PARP2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3KCZ, 3KJD, 4PJV, 4TVJ, 4ZZX, 4ZZY, 5DSY, 5D5K
Identifikátory
Aliasy	PARP2, ADPRT2, ADPRTL2, ADPRTL3, ARTD2, PARP-2, pADPRT-2, poly (ADP-ribóza) polymeráza 2
Externí ID	OMIM: 607725 MGI: 1341112 HomoloGene: 4004 Genové karty: PARP2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	20,357,905 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	50,821,301 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita DNA ligázy (ATP); • aktivita transferázy, přenos glykosylových skupin; • Aktivita NAD + ADP-ribosyltransferázy; • aktivita proteinu ADP-ribosylázy; • Aktivita NAD DNA ADP-ribosyltransferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Ligace DNA zapojená do opravy DNA; • prodlužování pramene; • proteinová ADP-ribosylace; • Oprava DNA; • vnější apoptotická signální cesta; • oprava základní excize; • peptidyl-serin ADP-ribosylace; • pozitivní regulace buněčného růstu podílející se na vývoji buněk srdečního svalu; • negativní regulace neuronové smrti; • oprava dvojitého vlákna; • proteinová poly-ADP-ribosylace; • DNA ADP-ribosylace; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10038
	11546
	ENSG00000129484
	ENSMUSG00000036023
	Q9UGN5
	O88554
	NM_001042618; NM_005484
	NM_009632
	NP_001036083; NP_005475
	NP_033762
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Poly [ADP-ribóza] polymeráza 2 je enzym že u lidí je kódován PARP2 gen.^[5]^[6]^[7] Je to jeden z PARP rodina enzymů.

Funkce

Tento gen kóduje poly (ADP-ribosyl) transferázu podobnou 2 protein, který obsahuje a katalytické doména a je schopná katalyzovat poly (ADP-ribosyl) -ationovou reakci. Tento protein má katalytickou doménu, která je homologní s doménou poly (ADP-ribosyl) transferáza, ale postrádá N-koncovou DNA vazebnou doménu, která aktivuje C-koncovou katalytickou doménu poly (ADP-ribosyl) transferázy. Základní zbytky v N-koncové oblasti tohoto proteinu mohou nést potenciální vlastnosti vázání DNA a mohou se podílet na jaderný a / nebo nukleolární cílení na protein. Byly nalezeny dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[7]

U rostlinných druhů Arabidopsis thaliana„PARP2 hraje významnější roli než PARP1 v ochranných reakcích na poškození DNA a bakteriální patogenezi.^[8] Rostlinná PARP2 nese spíše N-koncové vazebné motivy pro DNA DNA než Zn-prstové DNA vazebné motivy rostlinných a živočišných proteinů PARP1.^[8]

Léky inhibitory PARP

Nějaký Inhibitor PARP protinádorová léčiva (primárně zaměřená na PARP1) také inhibují PARP2, např. niraparib.

Interakce

PARP2 bylo prokázáno komunikovat s XRCC1.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129484 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036023 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Johansson M (květen 1999). "Lidská poly (ADP-ribóza) polymerázová genová rodina (ADPRTL): cDNA klonování dvou nových homologů poly (ADP-ribóza) polymerázy". Genomika. 57 (3): 442–5. doi:10.1006 / geno.1999.5799. PMID 10329013.
^ Yélamos J, Schreiber V, Dantzer F (duben 2008). "Směrem ke specifickým funkcím poly (ADP-ribóza) polymerázy-2". Trendy v molekulární medicíně. 14 (4): 169–78. doi:10.1016 / j.molmed.2008.02.003. PMID 18353725.
^ ^A ^b „Entrez Gene: PARP2 poly (ADP-ribose) polymerase family, member 2“.
^ ^A ^b Song J, Keppler BD, Wise RR, Bent AF (květen 2015). „PARP2 je převládající poly (ADP-ribóza) polymeráza při poškození DNA Arabidopsis a imunitní odpovědi“. Genetika PLoS. 11 (5): e1005200. doi:10.1371 / journal.pgen.1005200. PMC 4423837. PMID 25950582.
^ Schreiber V, Amé JC, Dollé P, Schultz I, Rinaldi B, Fraulob V, Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (červen 2002). „Poly (ADP-ribóza) polymeráza-2 (PARP-2) je vyžadována pro efektivní opravu DNA excize báze ve spojení s PARP-1 a XRCC1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (25): 23028–36. doi:10,1074 / jbc.M202390200. PMID 11948190.

Další čtení

Bashford CL, Chance B, Lloyd D, Poole RK (leden 1980). „Oscilace redoxních stavů v synchronně se dělících kulturách Acanthamoeba castellanii a Schizosaccharomyces pombe“. Biofyzikální deník. 29 (1): 1–11. Bibcode:1980BpJ .... 29 ... 1B. doi:10.1016 / S0006-3495 (80) 85114-9. PMC 1328658. PMID 7260241.
Berghammer H, Ebner M, Marksteiner R, Auer B (duben 1999). „pADPRT-2: nový gen savčí polymerující (ADP-ribosyl) transferázy příbuzný zkráceným homologům pADPRT v rostlinách a Caenorhabditis elegans“. FEBS Dopisy. 449 (2–3): 259–63. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 00448-2. PMID 10338144.
Amé JC, Rolli V, Schreiber V, Niedergang C, Apiou F, Decker P, Muller S, Höger T, Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (červen 1999). „PARP-2, nová savčí DNA závislá na poly (ADP-ribóza) polymeráze“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (25): 17860–8. doi:10.1074 / jbc.274.25.17860. PMID 10364231.
Stále IH, Vince P, Cowell JK (prosinec 1999). „Identifikace nového genu (ADPRTL1) kódujícího potenciální protein Poly (ADP-ribosyl) transferázy“. Genomika. 62 (3): 533–6. doi:10.1006 / geno.1999,6024. PMID 10644454.
Schreiber V, Amé JC, Dollé P, Schultz I, Rinaldi B, Fraulob V, Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (červen 2002). „Poly (ADP-ribóza) polymeráza-2 (PARP-2) je vyžadována pro efektivní opravu DNA excize báze ve spojení s PARP-1 a XRCC1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (25): 23028–36. doi:10,1074 / jbc.M202390200. PMID 11948190.
Saxena A, Wong LH, Kalitsis P, Earle E, Shaffer LG, Choo KH (září 2002). „Poly (ADP-ribóza) polymeráza 2 se lokalizuje na savčí aktivní centromery a interaguje s PARP-1, Cenpa, Cenpb a Bub3, ale ne Cenpc“. Lidská molekulární genetika. 11 (19): 2319–29. doi:10,1093 / hmg / 11,19,2319. PMID 12217960.
Malanga M, Althaus FR (únor 2004). „Poly (ADP-ribóza) reaktivuje zastavenou DNA topoizomerázu I a indukuje opětovné uzavření řetězce DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (7): 5244–8. doi:10.1074 / jbc.C300437200. PMID 14699148.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Maeda Y, Hunter TC, Loudy DE, Davé V, Schreiber V, Whitsett JA (duben 2006). „PARP-2 interaguje s TTF-1 a reguluje expresi surfaktantového proteinu-B“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (14): 9600–6. doi:10,1074 / jbc.M510435200. PMID 16461352.
Chevanne M, Calia C, Zampieri M, Cecchinelli B, Caldini R, Monti D, Bucci L, Franceschi C, Caiafa P (červen 2007). „Oprava poškození oxidační DNA a exprese parp 1 a parp 2 v buňkách B lymfocytů imortalizovaných virem Epstein-Barrové od mladých subjektů, starých subjektů a stoletých lidí“. Omlazovací výzkum. 10 (2): 191–204. doi:10.1089 / rej.2006.0514. PMID 17518695.
Liang YC, Hsu CY, Yao YL, Yang WM (únor 2013). „PARP-2 reguluje geny související s buněčným cyklem prostřednictvím histonové deacetylace a methylace nezávisle na poly (ADP-ribosyl) anaci“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 431 (1): 58–64. doi:10.1016 / j.bbrc.2012.12.092. PMID 23291187.
Song J, Keppler BD, Wise RR, Bent AF (květen 2015). „PARP2 je převládající poly (ADP-ribóza) polymeráza při poškození DNA Arabidopsis a imunitní odpovědi“. Genetika PLoS. 11 (5): e1005200. doi:10.1371 / journal.pgen.1005200. PMC 4423837. PMID 25950582.

externí odkazy

PARP2 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
PARP2 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000129484 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000036023 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10329013-5] Johansson M (květen 1999). "Lidská poly (ADP-ribóza) polymerázová genová rodina (ADPRTL): cDNA klonování dvou nových homologů poly (ADP-ribóza) polymerázy". Genomika. 57 (3): 442–5. doi:10.1006 / geno.1999.5799. PMID 10329013.

[pmid18353725-6] Yélamos J, Schreiber V, Dantzer F (duben 2008). "Směrem ke specifickým funkcím poly (ADP-ribóza) polymerázy-2". Trendy v molekulární medicíně. 14 (4): 169–78. doi:10.1016 / j.molmed.2008.02.003. PMID 18353725.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: PARP2 poly (ADP-ribose) polymerase family, member 2“.

[Song2015-8] A ^b Song J, Keppler BD, Wise RR, Bent AF (květen 2015). „PARP2 je převládající poly (ADP-ribóza) polymeráza při poškození DNA Arabidopsis a imunitní odpovědi“. Genetika PLoS. 11 (5): e1005200. doi:10.1371 / journal.pgen.1005200. PMC 4423837. PMID 25950582.

[pmid11948190-9] Schreiber V, Amé JC, Dollé P, Schultz I, Rinaldi B, Fraulob V, Ménissier-de Murcia J, de Murcia G (červen 2002). „Poly (ADP-ribóza) polymeráza-2 (PARP-2) je vyžadována pro efektivní opravu DNA excize báze ve spojení s PARP-1 a XRCC1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (25): 23028–36. doi:10,1074 / jbc.M202390200. PMID 11948190.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]