PSMF1 - PSMF1

PSMF1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2VT8, 4OUH
Identifikátory
Aliasy	PSMF1, PI31, podjednotka inhibitoru proteazomu 1
Externí ID	OMIM: 617858 MGI: 1346072 HomoloGene: 38231 Genové karty: PSMF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	1,189,415 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	151,744,186 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba proteazomu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita inhibitoru endopeptidázy; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita heterodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • nukleoplazma; • endoplazmatické retikulum; • komplex proteazomu; • komplexní komplex proteazomu; • perinukleární oblast cytoplazmy;
Biologický proces	• regulace buněčného metabolismu aminokyselin; • zpracování antigenu a prezentace exogenního peptidového antigenu prostřednictvím MHC třídy I, TAP-dependentní; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • regulace stability mRNA; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • polyubikvitinace bílkovin; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • Kaskáda MAPK; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • Signalizace NIK / NF-kappaB; • negativní regulace katabolického procesu proteinu proteinu; • komplexně závislý katabolický proces podporující anafázu; • Signální dráha receptoru T buněk; • negativní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • Signální dráha Wnt, dráha polarity planárních buněk; • negativní regulace aktivity endopeptidázy; • negativní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • deubikvitinace bílkovin; • SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • transmembránová doprava; • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II v reakci na hypoxii; • posttranslační modifikace; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk; • interleukin-1 zprostředkovaná signální dráha; • regulace fázového přechodu mitotického buněčného cyklu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9491
	228769
	ENSG00000125818
	ENSMUSG00000032869
	Q92530; Q5QPM9
	Q8BHL8
NM_006814; NM_178578; NM_178579; NM_001323407; NM_001323408;
	NM_001323409; NM_001323410
	NM_144889; NM_212446; NM_001305244
NP_001310336; NP_001310337; NP_001310338; NP_001310339; NP_006805;
	NP_848693
	NP_001292173; NP_997611
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka inhibitoru proteazomu PI31 je protein že u lidí je kódován PSMF1 gen.^[5]^[6]

Funkce

26S proteazom je multikatalytický proteináza komplex s vysoce uspořádanou strukturou složenou ze 2 komplexů, jádra 20S a regulátoru 19S. Jádro 20S se skládá ze 4 kruhů po 28 neidentických podjednotkách; 2 kruhy se skládají ze 7 alfa podjednotek a 2 kruhy se skládají ze 7 beta podjednotek. Regulátor 19S se skládá ze základny, která obsahuje 6 ATPáza podjednotky a 2 podjednotky jiné než ATPázy a víko, které obsahuje až 10 podjednotek jiných než ATPázy. Proteazomy jsou distribuovány v eukaryotických buňkách ve vysoké koncentraci a štěpí peptidy v an ATP /ubikvitin -závislý proces v non-lysozomální cesta. Základní funkcí modifikovaného proteazomu, imunoproteasomu, je zpracování třídy I. MHC peptidy. Tento gen kóduje protein, který inhibuje aktivaci proteazomu regulátory 11S a 19S. Pro tento gen byly identifikovány alternativní varianty transkriptu.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125818 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032869 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Tanahashi N, Kawahara H, Murakami Y, Tanaka K (duben 1999). „Proteolytický systém závislý na proteazomu“. Zprávy o molekulární biologii. 26 (1–2): 3–9. doi:10.1023 / A: 1006909522731. PMID 10363639. S2CID 38305744.
^ ^A ^b "Entrez Gene: PSMF1 proteazom (prosom, makropain) inhibitor podjednotka 1 (PI31)".

Další čtení

Goff SP (srpen 2003). „Smrt deaminací: nový systém omezení hostitele pro HIV-1“. Buňka. 114 (3): 281–3. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00602-0. PMID 12914693. S2CID 16340355.
Minghetti L, Visentin S, Patrizio M, Franchini L, Ajmone-Cat MA, Levi G (květen 2004). „Několikanásobné působení proteinu Tat viru lidské imunodeficience typu 1 na funkce mikrogliálních buněk“. Neurochemický výzkum. 29 (5): 965–78. doi:10.1023 / B: NERE.0000021241.90133.89. PMID 15139295. S2CID 25323034.
Liou LY, Herrmann CH, Rice AP (září 2004). "Infekce HIV-1 a regulace funkce Tat v makrofágech". International Journal of Biochemistry & Cell Biology. 36 (9): 1767–75. doi:10.1016 / j.biocel.2004.02.018. PMID 15183343.
Bannwarth S, Gatignol A (leden 2005). „HIV-1 TAR RNA: cíl molekulárních interakcí mezi virem a jeho hostitelem“. Současný výzkum HIV. 3 (1): 61–71. doi:10.2174/1570162052772924. PMID 15638724.
Gibellini D, Vitone F, Schiavone P, Re MC (duben 2005). „HIV-1 tat protein a buněčná proliferace a přežití: krátký přehled“. Nová mikrobiologie. 28 (2): 95–109. PMID 16035254.
Hetzer C, Dormeyer W, Schnölzer M, Ott M (říjen 2005). „Dekódování Tat: biologie posttranslačních modifikací HIV Tat“. Mikrobi a infekce / Institut Pasteur. 7 (13): 1364–9. doi:10.1016 / j.micinf.2005.06.003. PMID 16046164.
Peruzzi F (2006). „Mnohočetné funkce HIV-1 Tat: proliferace versus apoptóza“. Frontiers in Bioscience. 11: 708–17. doi:10.2741/1829. PMID 16146763.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (březen 1997). „HIV-1 tat inhibuje proteasom 20 S a jeho aktivaci zprostředkovanou regulátorem 11 S“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (13): 8145–8. doi:10.1074 / jbc.272.13.8145. PMID 9079628.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Madani N, Kabat D (prosinec 1998). „Endogenní inhibitor viru lidské imunodeficience v lidských lymfocytech je překonán virovým proteinem Vif“. Journal of Virology. 72 (12): 10251–5. doi:10.1128 / JVI.72.12.10251-10255.1998. PMC 110608. PMID 9811770.
Simon JH, Gaddis NC, Fouchier RA, Malim MH (prosinec 1998). "Důkaz pro nově objevený buněčný fenotyp anti-HIV-1". Přírodní medicína. 4 (12): 1397–400. doi:10.1038/3987. PMID 9846577. S2CID 25235070.
McCutchen-Maloney SL, Matsuda K, Shimbara N, Binns DD, Tanaka K, Slaughter CA, DeMartino GN (červen 2000). „cDNA klonování, exprese a funkční charakterizace PI31, inhibitoru proteazomu bohatého na prolin“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (24): 18557–65. doi:10,1074 / jbc.M001697200. PMID 10764772.
Mulder LC, Muesing MA (září 2000). „Degradace HIV-1 integrázy cestou N-end pravidla“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (38): 29749–53. doi:10,1074 / jbc.M004670200. PMID 10893419.
Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (srpen 2002). „Izolace lidského genu, který inhibuje infekci HIV-1 a je potlačena virovým proteinem Vif“. Příroda. 418 (6898): 646–50. Bibcode:2002 Natur.418..646S. doi:10.1038 / nature00939. PMID 12167863. S2CID 4403228.
Zaiss DM, Standera S, Kloetzel PM, Sijts AJ (říjen 2002). „PI31 je modulátor tvorby proteazomu a zpracování antigenu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 99 (22): 14344–9. Bibcode:2002PNAS ... 9914344Z. doi:10.1073 / pnas.212257299. PMC 137886. PMID 12374861.
Huang X, Seifert U, Salzmann U, Henklein P, Preissner R, Henke W, Sijts AJ, Kloetzel PM, Dubiel W (listopad 2002). „Místo RTP sdílené proteinem HIV-1 Tat a podjednotkou alfa regulátoru 11S je zásadní pro jejich účinky na funkci proteazomu včetně zpracování antigenu.“ Journal of Molecular Biology. 323 (4): 771–82. doi:10.1016 / S0022-2836 (02) 00998-1. PMID 12419264.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000125818 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032869 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10363639-5] Tanahashi N, Kawahara H, Murakami Y, Tanaka K (duben 1999). „Proteolytický systém závislý na proteazomu“. Zprávy o molekulární biologii. 26 (1–2): 3–9. doi:10.1023 / A: 1006909522731. PMID 10363639. S2CID 38305744.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: PSMF1 proteazom (prosom, makropain) inhibitor podjednotka 1 (PI31)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Komplex proteazomové endopeptidázy podjednotky (ES 3.4.25.1)
A (alfa podjednotky)	PSMA1 PSMA2 PSMA3 PSMA4 PSMA5 PSMA6 PSMA7 PSMA8
B (beta podjednotky)	PSMB1 PSMB2 PSMB3 PSMB4 PSMB5 PSMB6 PSMB7 PSMB8 PSMB9 PSMB10
C (ATPázy)	PSMC1 PSMC2 PSMC3 PSMC4 PSMC5 PSMC6
D (jiné než ATPázy)	PSMD1 PSMD2 PSMD3 PSMD4 PSMD5 PSMD6 PSMD7 PSMD8 PSMD9 PSMD10 PSMD11 PSMD12 PSMD13 PSMD14
E (aktivační podjednotky)	PSME1 PSME2 PSME3 PSME4
F (inhibiční podjednotka)	PSMF1