FUT8 - FUT8

FUT8
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2DE0
Identifikátory
Aliasy	FUT8, fukosyltransferáza 8, CDGF, CDGF1
Externí ID	OMIM: 602589 MGI: 1858901 HomoloGene: 9650 Genové karty: FUT8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	65,744,121 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	77,476,338 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita transferázy, přenos glykosylových skupin; • Vazba domény SH3; • aktivita glykoproteinu 6-alfa-L-fukosyltransferázy; • aktivita alfa- (1-> 6) -fukosyltransferázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Golgiho aparát; • membrána; • Golgiho membrána; • Golgiho cisterna membrána; • extracelulární exosom; • cytosol;
Biologický proces	• Metabolický proces GDP-L-fukózy; • regulace buněčné reakce na oxidační stres; • N-glykan fukosylace; • Zpracování N-glykanu; • v embryonálním vývoji dělohy; • respirační plynná výměna; • glykosylace proteinů; • oligosacharidový biosyntetický proces; • glykosylace proteinů v Golgi; • regulace genové exprese; • integrinem zprostředkovaná signální dráha; • glykosylace spojená s N proteinem; • signální dráha transformujícího růstového faktoru beta receptoru; • migrace buněk; • Katabolický proces L-fukózy; • metabolický proces receptoru; • glykosylace spojená s N proteinem pomocí asparaginu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	2530
	53618
	ENSG00000033170
	ENSMUSG00000021065
	Q9BYC5
	Q9WTS2
NM_004480; NM_178154; NM_178155; NM_178156; NM_178157;
	NM_001371533; NM_001371534; NM_001371536
	NM_001252614; NM_001252615; NM_001252616; NM_016893
NP_004471; NP_835368; NP_835369; NP_001358462; NP_001358463;
	NP_001358465
	NP_001239543; NP_001239544; NP_001239545; NP_058589
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Alfa- (1,6) -fukosyltransferáza je enzym že u lidí je kódován FUT8 gen.^[5]^[6]

Tento enzym patří do rodiny fukosyltransferáz. Produkt tohoto genu katalyzuje přenos fukózy z GDP-fukózy na glykopeptidy komplexu N-vázaného typu. Tento enzym je odlišný od ostatních fukosyltransferáz, které katalyzují přidání alfa1-2, alfa1-3 a alfa1-4 fukózy. Exprese tohoto genu může přispívat k malignitě rakovinných buněk a k jejich invazivním a metastatickým schopnostem. Alternativně byly identifikovány sestřihané varianty kódující různé izoformy.^[6]

Kyowa Hakko Kirin Platforma "Potelligent" používá a Buněčná linie CHO ve kterém FUT8 byl vyřazen, aby se afukosylované monoklonální protilátky.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000033170 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021065 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Costache M, Apoil PA, Cailleau A, Elmgren A, Larson G, Henry S, Blancher A, Iordachescu D, Oriol R, Mollicone R (prosinec 1997). „Vývoj genů fukosyltransferázy u obratlovců“. J Biol Chem. 272 (47): 29721–8. doi:10.1074 / jbc.272.47.29721. PMID 9368041.
^ ^A ^b „Entrez Gene: FUT8 fukosyltransferáza 8 (alfa (1,6) fukosyltransferáza)“.
^ Yu, X; Marshall, MJE; Cragg, MS; Crispin, M (červen 2017). „Zlepšení protirakovinných terapeutik proti rakovině pomocí glykanového inženýrství“ (PDF). BioDrugs: Clinical Immunotherapeutics, Biopharmaceuticals and Gene Therapy. 31 (3): 151–166. doi:10.1007 / s40259-017-0223-8. PMID 28466278. S2CID 3722081.

Další čtení

Miyoshi E, Noda K, Yamaguchi Y a kol. (2000). "Gen alfa1-6-fukosyltransferázy a jeho biologický význam". Biochim. Biophys. Acta. 1473 (1): 9–20. doi:10.1016 / s0304-4165 (99) 00166-x. PMID 10580126.
Kalyanaraman VS, Rodriguez V, Veronese F a kol. (1990). "Charakterizace vylučovaného nativního gp120 a gp160 viru lidské imunodeficience typu 1". AIDS Res. Hučení. Retroviry. 6 (3): 371–80. doi:10.1089 / podpora.1990.6.371. PMID 2187500.
Pal R, Hoke GM, Sarngadharan MG (1989). „Úloha oligosacharidů při zpracování a zrání obalových glykoproteinů viru lidské imunodeficience typu 1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (9): 3384–8. Bibcode:1989PNAS ... 86.3384P. doi:10.1073 / pnas.86.9.3384. PMC 287137. PMID 2541446.
Dewar RL, Vasudevachari MB, Natarajan V, Salzman NP (1989). „Biosyntéza a zpracování obalových glykoproteinů viru lidské imunodeficience typu 1: účinky monensinu na glykosylaci a transport“. J. Virol. 63 (6): 2452–6. doi:10.1128 / jvi.63.6.2452-2456.1989. PMC 250699. PMID 2542563.
Kozarsky K, Penman M, Basiripour L, et al. (1989). "Glykosylace a zpracování obalového proteinu viru lidské imunodeficience typu 1". J. Acquir. Imunitní deficit. Syndr. 2 (2): 163–9. PMID 2649653.
Robinson WE, Montefiori DC, Mitchell WM (1988). „Důkazy, že manosylové zbytky se účastní patogeneze viru lidské imunodeficience typu 1 (HIV-1)“. AIDS Res. Hučení. Retroviry. 3 (3): 265–82. doi:10.1089 / podpora.1987.3.265. PMID 2829950.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Yanagidani S, Uozumi N, Ihara Y a kol. (1997). „Čištění a klonování cDNA GDP-L-Fuc: N-acetyl-beta-D-glukosaminid: alfa1-6 fukosyltransferáza (alfa1-6 FucT) z lidských buněk karcinomu žaludku MKN45“. J. Biochem. 121 (3): 626–32. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a021631. PMID 9133635.
Yamaguchi Y, Fujii J, Inoue S a kol. (1999). "Mapování genu alfa-1,6-fukosyltransferázy, FUT8, na lidský chromozom 14q24.3". Cytogenet. Cell Genet. 84 (1–2): 58–60. doi:10.1159/000015215. PMID 10343104. S2CID 85305954.
Takahashi T, Ikeda Y, Tateishi A a kol. (2000). „Motiv sekvence zapojený do vazby donorového substrátu alfa1,6-fukosyltransferázou: role konzervovaných argininových zbytků“. Glykobiologie. 10 (5): 503–10. doi:10.1093 / glycob / 10.5.503. PMID 10764839.
Yamaguchi Y, Ikeda Y, Takahashi T a kol. (2000). „Genomická struktura a analýza promotoru lidského genu alfa1,6-fukosyltransferázy (FUT8)“. Glykobiologie. 10 (6): 637–43. doi:10.1093 / glycob / 10.6.637. PMID 10814706.
Takahashi T, Ikeda Y, Miyoshi E a kol. (2000). „alfa1,6-fukosyltransferáza je vysoce a specificky exprimována v lidských ovariálních serózních adenokarcinomech“. Int. J. Cancer. 88 (6): 914–9. doi:10.1002 / 1097-0215 (20001215) 88: 6 <914 :: AID-IJC12> 3.0.CO; 2-1. PMID 11093814.
Roos C, Kolmer M, Mattila P, Renkonen R (2002). „Složení proteomu Drosophila melanogaster podílejícího se na metabolismu fukosylovaného glykanu“. J. Biol. Chem. 277 (5): 3168–75. doi:10,1074 / jbc.M107927200. PMID 11698403.
Coullin P, Crooijmans RP, Groenen MA a kol. (2003). "Přiřazení FUT8 ku kuřecímu chromozomovému pásmu 5q1.4 a k lidskému chromozomu 14q23.2 → q24.1 hybridizací in situ. Zachováno a porovnáno synteny mezi člověkem a kuřetem". Cytogenet. Genome Res. 97 (3–4): 234–8. doi:10.1159/000066611. PMID 12438718. S2CID 27532607.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Martinez-Duncker I, Michalski JC, Bauvy C a kol. (2004). "Aktivita a tkáňová distribuce sestřihových variant alfa6-fukosyltransferázy v lidské embryogenezi". Glykobiologie. 14 (1): 13–25. doi:10.1093 / glycob / cwh006. PMID 14514715.
Ito Y, Miyauchi A, Yoshida H a kol. (2003). „Exprese alfa1,6-fukosyltransferázy (FUT8) v papilárním karcinomu štítné žlázy: její vazba na biologickou agresivitu a anaplastickou transformaci“. Cancer Lett. 200 (2): 167–72. doi:10.1016 / S0304-3835 (03) 00383-5. PMID 14568171.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9BYC5 (Human FUT8) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000033170 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021065 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9368041-5] Costache M, Apoil PA, Cailleau A, Elmgren A, Larson G, Henry S, Blancher A, Iordachescu D, Oriol R, Mollicone R (prosinec 1997). „Vývoj genů fukosyltransferázy u obratlovců“. J Biol Chem. 272 (47): 29721–8. doi:10.1074 / jbc.272.47.29721. PMID 9368041.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: FUT8 fukosyltransferáza 8 (alfa (1,6) fukosyltransferáza)“.

[Yu2017-7] Yu, X; Marshall, MJE; Cragg, MS; Crispin, M (červen 2017). „Zlepšení protirakovinných terapeutik proti rakovině pomocí glykanového inženýrství“ (PDF). BioDrugs: Clinical Immunotherapeutics, Biopharmaceuticals and Gene Therapy. 31 (3): 151–166. doi:10.1007 / s40259-017-0223-8. PMID 28466278. S2CID 3722081.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]