BpuJI - BpuJI

BpuJI N koncová doména
Identifikátory
SymbolBpuJI_N
PfamPF11564
InterProIPR021108

V molekulární biologii BpuJI je typu II restrikční endonukleáza který uznává asymetrický sekvence 5'-CCCGT a řezy na více místech v okolní oblasti cílové sekvence. Protein BpuJI se skládá ze dvou odlišných modulů; N-koncová rozpoznávací doména DNA a C-koncová dimerizační a katalýza doména. N-terminální doména se skládá ze dvou okřídlená spirála subdomény a subdoména přerušeného linkeru. K rozpoznávání cílové sekvence dochází prostřednictvím kontaktů hlavní drážky aminokyseliny v subdoménách s křídlovou šroubovicí.[1]

Reference

  1. ^ Sukackaite R, Grazulis S, Bochtler M, Siksnys V (květen 2008). "Rozpoznávací doména restrikční endonukleázy BpuJI v komplexu s příbuznou DNA v rozlišení 1,3-A". J. Mol. Biol. 378 (5): 1084â – 93. doi:10.1016 / j.jmb.2008.03.041. PMID  18433771.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR021108