FANCL - FANCL

FANCL
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3ZQS, 4CCG
Identifikátory
Aliasy	FANCLFAAP43, PHF9, POG, komplementární skupina L anémie Fanconi, FA komplementační skupina L
Externí ID	OMIM: 608111 MGI: 1914280 HomoloGene: 9987 Genové karty: FANCL
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	58,241,372 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita transferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • buněčné jádro; • jaderný obal; • Jaderný komplex anémie Fanconi; • nukleoplazma; • jaderné těleso; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• ubikvitinace bílkovin; • generace gamet; • regulace buněčné proliferace; • oprava křížového propojení mezi řetězci; • monoubikvitinace bílkovin; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • Oprava DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55120
	67030
	ENSG00000115392
	ENSMUSG00000004018
	Q9NW38
	Q9CR14
	NM_001114636; NM_018062; NM_001374615
	NM_001277273; NM_025923
	NP_001108108; NP_060532; NP_001361544
	NP_001264202; NP_080199
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

E3 ubikvitin-protein ligáza FANCL je enzym že u lidí je kódován FANCL gen.^[4]

Funkce

Rekombinační oprava poškození dvouřetězcových DNA - některé klíčové kroky. bankomat (ATM) je a protein kináza který je přijat a aktivován uživatelem Dvouřetězcové zlomy DNA. Poškození dvouřetězcových DNA také aktivuje Komplex jádra anémie Fanconi (FANCA / B / C / E / F / G / L / M).^[5] Základní komplex FA monoubiquitinates navazující cíle FANCD2 a FANCI.^[6] ATM se aktivuje (fosforyluje) CHEK2 a FANCD2^[7] CHEK2 fosforyluje BRCA1.^[8] Ubiquinated FANCD2 komplexy s BRCA1 a RAD51.^[9] Protein PALB2 funguje jako rozbočovač,^[10] sdružuje BRCA1, BRCA2 a RAD51 v místě dvouřetězcového zlomu DNA a také se váže na RAD51C, člena komplexu paralogů RAD51 RAD51B -RAD51C -RAD51D -XRCC2 (BCDX2). Komplex BCDX2 je zodpovědný za nábor nebo stabilizaci RAD51 na místech poškození.^[11] RAD51 hraje hlavní roli v homologní rekombinace oprava DNA během opravy dvouvláknového zlomu. V tomto procesu probíhá ATP závislá výměna řetězců DNA, ve které jedno vlákno napadá řetězce párů bází homologních molekul DNA. RAD51 se podílí na hledání homologie a fází párování řetězců procesu.

Klinický fenotyp mutačních defektů u všech Fanconiho anémie (FA) doplňkové skupiny jsou podobné. Tento fenotyp je charakterizován progresivním selháním kostní dřeně, náchylností k rakovině a typickými vrozenými vadami.^[12] Hlavním buněčným fenotypem je zejména přecitlivělost na poškození DNA mezivláknové zesíťování DNA.^[13] Proteiny FA interagují prostřednictvím multiproteinové dráhy. Meziřetězcová křížová propojení DNA jsou velmi škodlivá poškození, která jsou opravována homologní rekombinace zahrnující koordinaci proteinů FA a gen 1 pro citlivost na rakovinu prsu (BRCA1 ).

Cesta opravy DNA Fanconiho anémie (FA) je nezbytná pro rozpoznávání a opravu mezilidských křížových vazeb DNA (ICL). Kritickým krokem na cestě je monoubiquitination of FANCD2 ligandem RING E3 FANCL. FANCL zahrnuje 3 domény, a PRSTEN doména, která interaguje s E2 konjugujícími enzymy, centrální doména potřebná pro interakci se substrátem, a N-terminální E2-like fold (ELF) doména, která interaguje s FANCB.^[14] ELF doména FANCL je také nutná pro zprostředkování nekovalentní interakce mezi FANCL a ubikvitin. Je vyžadována doména ELF, aby se podpořila účinná poškození DNA indukovaná FANCD2 monoubikvitinace v buňkách obratlovců, což naznačuje důležitou funkci vazby FANCB a ubikvitinu pomocí FANCL in vivo.^[15]

Jaderný komplex obsahující FANCL (stejně jako FANCA, FANCB, FANCC, FANCE, FANCF, FANCG a FANCM ) je nezbytný pro aktivaci FANCD2 protein do mono-ubikvitinovaný izoforma.^[5] U normálních nemutantních buněk jsou buňky FANCD2 mono-ubichinovány v reakci na poškození DNA. Aktivovaný protein FANCD2 se lokalizuje společně s BRCA1 (protein náchylný k rakovině prsu) při ionizující radiace -indukované ohniska a dovnitř synaptonemální komplexy z meiotický chromozomy (viz obrázek: Rekombinační oprava poškození dvouřetězcových vláken).

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115392 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: FANCL Fanconiho anémie, komplementační skupina L“.
^ ^A ^b D'Andrea AD (2010). „Dráhy citlivosti u Fanconiho anémie a rakoviny prsu“. N. Engl. J. Med. 362 (20): 1909–19. doi:10.1056 / NEJMra0809889. PMC 3069698. PMID 20484397.
^ Sobeck A, Stone S, Landais I, de Graaf B, Hoatlin ME (2009). „Fanconiho anemický protein FANCM je řízen FANCD2 a ATR / ATM cestami“. J. Biol. Chem. 284 (38): 25560–8. doi:10,1074 / jbc.M109,007690. PMC 2757957. PMID 19633289.
^ Castillo P, Bogliolo M, Surralles J (2011). "Koordinovaný účinek drah Fanconiho anémie a ataxie telangiektázie v reakci na oxidační poškození". Oprava DNA (Amst.). 10 (5): 518–25. doi:10.1016 / j.dnarep.2011.02.007. PMID 21466974.
^ Stolz A, Ertych N, Bastians H (2011). "Nádorový supresor CHK2: regulátor odezvy poškození DNA a mediátor stability chromozomů". Clin. Cancer Res. 17 (3): 401–5. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-1215. PMID 21088254.
^ Taniguchi T, Garcia-Higuera I, Andreassen PR, Gregory RC, Grompe M, D'Andrea AD (2002). „Interakce specifické pro S-fázi proteinu anémie Fanconi, FANCD2, s BRCA1 a RAD51“. Krev. 100 (7): 2414–20. doi:10.1182 / krev-2002-01-0278. PMID 12239151.
^ Park JY, Zhang F, Andreassen PR (2014). „PALB2: centrum sítě nádorových supresorů zapojených do odpovědí na poškození DNA“. Biochim. Biophys. Acta. 1846 (1): 263–75. doi:10.1016 / j.bbcan.2014.06.003. PMC 4183126. PMID 24998779.
^ Chun J, Buechelmaier ES, Powell SN (2013). „Paralogenové komplexy Rad51 BCDX2 a CX3 působí v různých fázích homologní rekombinační dráhy závislé na BRCA1-BRCA2“. Mol. Buňka. Biol. 33 (2): 387–95. doi:10.1128 / MCB.00465-12. PMC 3554112. PMID 23149936.
^ Walden, Helen; Deans, Andrew J. (2014). „Cesta opravy Fanconiho anémie DNA: strukturální a funkční pohledy na komplexní poruchu“. Roční přehled biofyziky. 43: 257–278. doi:10.1146 / annurev-biophys-051013-022737. ISSN 1936-1238. PMID 24773018.
^ Deans, Andrew J .; West, Stephen C. (2011-06-24). „DNA cross -rand crosslink repair and cancer“. Recenze přírody. Rakovina. 11 (7): 467–480. doi:10.1038 / nrc3088. ISSN 1474-1768. PMC 3560328. PMID 21701511.
^ van Twest, Sylvie; Murphy, Vincent J .; Hodson, Charlotte; Tan, Winnie; Swuec, Paolo; O'Rourke, Julienne J .; Heierhorst, Jörg; Crismani, Wayne; Deans, Andrew J. (2017-01-19). „Mechanismus ubikvitinace a deubikvitinace na cestě anémie Fanconi“. Molekulární buňka. 65 (2): 247–259. doi:10.1016 / j.molcel.2016.11.005. ISSN 1097-4164. PMID 27986371.
^ Miles JA, Frost MG, Carroll E, Rowe ML, Howard MJ, Sidhu A, Chaugule VK, Alpi AF, Walden H (2015). „Cesta pro opravu DNA anémie Fanconi je regulována interakcí mezi ubikvitinem a složenou doménou FANCL podobnou E2“. J. Biol. Chem. 290 (34): 20995–1006. doi:10,1074 / jbc.M115,675835. PMC 4543658. PMID 26149689.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Agoulnik AI, Lu B, Zhu Q a kol. (2003). „Nový gen, Pog, je nezbytný pro proliferaci prvotních zárodečných buněk u myši a je základem mutace deficitu zárodečných buněk, gcd“. Hučení. Mol. Genet. 11 (24): 3047–53. doi:10,1093 / hmg / 11,24,3047. PMID 12417526.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Lu B, Bishop CE (2003). „Myší GGN1 a GGN3, dva proteiny specifické pro zárodečné buňky z jediného genu Ggn, interagují s myší POG a hrají roli ve spermatogenezi“. J. Biol. Chem. 278 (18): 16289–96. doi:10,1074 / jbc.M211023200. PMID 12574169.
Lu B, Bishop CE (2004). „Pozdní nástup spermatogeneze a zvýšení plodnosti u myší s deficitem POG naznačuje, že POG není nutný pro proliferaci spermatogonie“. Biol. Reprod. 69 (1): 161–8. doi:10.1095 / biolreprod.102.014654. PMID 12606378.
Meetei AR, Sechi S, Wallisch M a kol. (2003). „Multiproteinový nukleární komplex spojuje anémii Fanconi a Bloomův syndrom“. Mol. Buňka. Biol. 23 (10): 3417–26. doi:10.1128 / MCB.23.10.3417-3426.2003. PMC 164758. PMID 12724401.
Meetei AR, de Winter JP, Medhurst AL a kol. (2003). „Nová ubikvitinová ligáza má nedostatek Fanconiho anémie.“ Nat. Genet. 35 (2): 165–70. doi:10.1038 / ng1241. PMID 12973351. S2CID 10149290.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Meetei AR, Levitus M, Xue Y a kol. (2004). „X-vázaná dědičnost skupiny B pro doplnění anémie Fanconi“. Nat. Genet. 36 (11): 1219–24. doi:10.1038 / ng1458. PMID 15502827.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Meetei AR, Medhurst AL, Ling C a kol. (2005). „Lidský ortolog archaealského proteinu pro opravu DNA Hef je defektní ve skupině pro doplnění anémie Fanconi.“. Nat. Genet. 37 (9): 958–63. doi:10.1038 / ng1626. PMC 2704909. PMID 16116422.
Gurtan AM, Stuckert P, D'Andrea AD (2006). „Opakování WD40 FANCL je vyžadováno pro sestavu jádrového komplexu anémie Fanconi“. J. Biol. Chem. 281 (16): 10896–905. doi:10,1074 / jbc.M511411200. PMID 16474167.
Zhang J, Wang X, Lin CJ a kol. (2007). „Změněná exprese FANCL propůjčuje senzitivitu mitomycinu C v buňkách rakoviny plic Calu-6“. Cancer Biol. Ther. 5 (12): 1632–6. doi:10,4161 / cbt. 5.12.3351. PMID 17106252.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115392 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] „Entrez Gene: FANCL Fanconiho anémie, komplementační skupina L“.

[Andrea-5] A ^b D'Andrea AD (2010). „Dráhy citlivosti u Fanconiho anémie a rakoviny prsu“. N. Engl. J. Med. 362 (20): 1909–19. doi:10.1056 / NEJMra0809889. PMC 3069698. PMID 20484397.

[pmid19633289-6] Sobeck A, Stone S, Landais I, de Graaf B, Hoatlin ME (2009). „Fanconiho anemický protein FANCM je řízen FANCD2 a ATR / ATM cestami“. J. Biol. Chem. 284 (38): 25560–8. doi:10,1074 / jbc.M109,007690. PMC 2757957. PMID 19633289.

[Castillo-7] Castillo P, Bogliolo M, Surralles J (2011). "Koordinovaný účinek drah Fanconiho anémie a ataxie telangiektázie v reakci na oxidační poškození". Oprava DNA (Amst.). 10 (5): 518–25. doi:10.1016 / j.dnarep.2011.02.007. PMID 21466974.

[pmid21088254-8] Stolz A, Ertych N, Bastians H (2011). "Nádorový supresor CHK2: regulátor odezvy poškození DNA a mediátor stability chromozomů". Clin. Cancer Res. 17 (3): 401–5. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-1215. PMID 21088254.

[pmid12239151-9] Taniguchi T, Garcia-Higuera I, Andreassen PR, Gregory RC, Grompe M, D'Andrea AD (2002). „Interakce specifické pro S-fázi proteinu anémie Fanconi, FANCD2, s BRCA1 a RAD51“. Krev. 100 (7): 2414–20. doi:10.1182 / krev-2002-01-0278. PMID 12239151.

[pmid24998779-10] Park JY, Zhang F, Andreassen PR (2014). „PALB2: centrum sítě nádorových supresorů zapojených do odpovědí na poškození DNA“. Biochim. Biophys. Acta. 1846 (1): 263–75. doi:10.1016 / j.bbcan.2014.06.003. PMC 4183126. PMID 24998779.

[Chun-11] Chun J, Buechelmaier ES, Powell SN (2013). „Paralogenové komplexy Rad51 BCDX2 a CX3 působí v různých fázích homologní rekombinační dráhy závislé na BRCA1-BRCA2“. Mol. Buňka. Biol. 33 (2): 387–95. doi:10.1128 / MCB.00465-12. PMC 3554112. PMID 23149936.

[12] Walden, Helen; Deans, Andrew J. (2014). „Cesta opravy Fanconiho anémie DNA: strukturální a funkční pohledy na komplexní poruchu“. Roční přehled biofyziky. 43: 257–278. doi:10.1146 / annurev-biophys-051013-022737. ISSN 1936-1238. PMID 24773018.

[13] Deans, Andrew J .; West, Stephen C. (2011-06-24). „DNA cross -rand crosslink repair and cancer“. Recenze přírody. Rakovina. 11 (7): 467–480. doi:10.1038 / nrc3088. ISSN 1474-1768. PMC 3560328. PMID 21701511.

[14] van Twest, Sylvie; Murphy, Vincent J .; Hodson, Charlotte; Tan, Winnie; Swuec, Paolo; O'Rourke, Julienne J .; Heierhorst, Jörg; Crismani, Wayne; Deans, Andrew J. (2017-01-19). „Mechanismus ubikvitinace a deubikvitinace na cestě anémie Fanconi“. Molekulární buňka. 65 (2): 247–259. doi:10.1016 / j.molcel.2016.11.005. ISSN 1097-4164. PMID 27986371.

[pmid26149689-15] Miles JA, Frost MG, Carroll E, Rowe ML, Howard MJ, Sidhu A, Chaugule VK, Alpi AF, Walden H (2015). „Cesta pro opravu DNA anémie Fanconi je regulována interakcí mezi ubikvitinem a složenou doménou FANCL podobnou E2“. J. Biol. Chem. 290 (34): 20995–1006. doi:10,1074 / jbc.M115,675835. PMC 4543658. PMID 26149689.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]