UBE2D2 - UBE2D2
Enzym konjugující s ubikvitinem E2 D2 je protein že u lidí je kódován UBE2D2 gen.[5][6]
Funkce
Modifikace proteinů ubikvitinem je důležitým buněčným mechanismem pro zacílení abnormálních nebo krátkodobých proteinů na degradaci. Ubikvitinace zahrnuje alespoň tři třídy enzymů: enzymy aktivující ubikvitin nebo El, enzymy konjugující ubikvitin nebo E2 a ligandy ubikvitin-protein nebo E3. Tento gen kóduje člena rodiny enzymů konjugujících s E2 ubikvitinem. Tento enzym funguje při ubikvitinaci tumor-supresorového proteinu p53, který je indukován ligandem E3 ubikvitin-protein. Pro tento gen byly nalezeny dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu, které kódují odlišné izoformy.[6]
Interakce
UBE2D2 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000131508 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000091896 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Jensen JP, Bates PW, Yang M, Vierstra RD, Weissman AM (prosinec 1995). „Identifikace rodiny blízce příbuzných enzymů konjugujících s lidským ubikvitinem“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (51): 30408–14. doi:10.1074 / jbc.270.51.30408. PMID 8530467.
- ^ A b „Entrez Gene: UBE2D2 ubikvitin-konjugující enzym E2D 2 (UBC4 / 5 homolog, kvasnice)“.
- ^ Mace PD, Linke K, Feltham R, Schumacher FR, Smith CA, Vaux DL, Silke J, Day CL (listopad 2008). „Struktury domény cIAP2 RING odhalují konformační změny spojené s náborem enzymu konjugujícího ubikvitin (E2)“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (46): 31633–40. doi:10,1074 / jbc.M804753200. PMID 18784070.
- ^ A b Anan T, Nagata Y, Koga H, Honda Y, Yabuki N, Miyamoto C, Kuwano A, Matsuda I, Endo F, Saya H, Nakao M (listopad 1998). „Lidský ubikvitin-protein ligáza Nedd4: exprese, subcelulární lokalizace a selektivní interakce s enzymy konjugujícími ubikvitin“. Geny do buněk. 3 (11): 751–63. doi:10.1046 / j.1365-2443.1998.00227.x. PMID 9990509. S2CID 1653536.
- ^ A b Hatakeyama S, Jensen JP, Weissman AM (červen 1997). „Subcelulární lokalizace a interakce s ubikvitinem konjugujícím enzymem (E2) ubiquitinových proteinových ligáz savčí rodiny HECT“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (24): 15085–92. doi:10.1074 / jbc.272.24.15085. PMID 9182527.
- ^ A b Yu P, Chen Y, Tagle DA, Cai T (červen 2002). „PJA1, kódující ubikvitinovou ligázu prstu RING-H2, je nový gen lidského X chromozomu hojně exprimovaný v mozku“. Genomika. 79 (6): 869–74. doi:10.1006 / geno.2002.6770. PMID 12036302.
Další čtení
- Rolfe M, Beer-Romero P, Glass S, Eckstein J, Berdo I, Theodoras A, Pagano M, Draetta G (duben 1995). „Rekonstituce p53-ubikvitinylačních reakcí z purifikovaných složek: role lidského ubikvitin-konjugujícího enzymu UBC4 a proteinu asociovaného s E6 (E6AP)“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 92 (8): 3264–8. doi:10.1073 / pnas.92.8.3264. PMC 42146. PMID 7724550.
- Scheffner M, Huibregtse JM, Howley PM (září 1994). „Identifikace lidského enzymu konjugujícího s ubikvitinem, který zprostředkovává ubikvitinaci p53 závislou na E6-AP“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 91 (19): 8797–801. doi:10.1073 / pnas.91.19.8797. PMC 44693. PMID 8090726.
- Hatakeyama S, Jensen JP, Weissman AM (červen 1997). „Subcelulární lokalizace a interakce s ubikvitinem konjugujícím enzymem (E2) ubiquitinových proteinových ligáz savčí rodiny HECT“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (24): 15085–92. doi:10.1074 / jbc.272.24.15085. PMID 9182527.
- Anan T, Nagata Y, Koga H, Honda Y, Yabuki N, Miyamoto C, Kuwano A, Matsuda I, Endo F, Saya H, Nakao M (listopad 1998). „Lidský ubikvitin-protein ligáza Nedd4: exprese, subcelulární lokalizace a selektivní interakce s enzymy konjugujícími ubikvitin“. Geny do buněk. 3 (11): 751–63. doi:10.1046 / j.1365-2443.1998.00227.x. PMID 9990509. S2CID 1653536.
- Gonen H, Bercovich B, Orian A, Carrano A, Takizawa C, Yamanaka K, Pagano M, Iwai K, Ciechanover A (květen 1999). „Identifikace proteinů nosiče ubikvitinu, E2, zapojených do konjugace indukované signálem a následné degradace IkappaBalpha“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (21): 14823–30. doi:10.1074 / jbc.274.21.14823. PMID 10329681.
- Joazeiro CA, Wing SS, Huang H, Leverson JD, Hunter T, Liu YC (říjen 1999). "Negativní regulátor tyrosinkinázy c-Cbl jako ubikvitin-protein ligáza typu RING, E2 závislá". Věda. 286 (5438): 309–12. doi:10.1126 / science.286.5438.309. PMID 10514377.
- Tongaonkar P, Chen L, Lambertson D, Ko B, Madura K (červenec 2000). „Důkazy o interakci mezi enzymy konjugujícími ubiquitin a proteasomem 26S“. Molekulární a buněčná biologie. 20 (13): 4691–8. doi:10.1128 / MCB.20.13.4691-4698.2000. PMC 85887. PMID 10848595.
- Strack P, Caligiuri M, Pelletier M, Boisclair M, Theodoras A, Beer-Romero P, Glass S, Parsons T, Copeland RA, Auger KR, Benfield P, Brizuela L, Rolfe M (červenec 2000). „SCF (beta-TRCP) a ubikvitinace I kappa B alfa závislá na fosforylaci katalyzovaná Ubc3 a Ubc4“. Onkogen. 19 (31): 3529–36. doi:10.1038 / sj.onc.1203647. PMID 10918611.
- Fang S, Ferrone M, Yang C, Jensen JP, Tiwari S, Weissman AM (prosinec 2001). „Receptorový faktor faktoru autokrinní motility, gp78, je ubikvitinová proteinová ligáza podílející se na degradaci z endoplazmatického retikula“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 98 (25): 14422–7. doi:10.1073 / pnas.251401598. PMC 64697. PMID 11724934.
- Yu P, Chen Y, Tagle DA, Cai T (červen 2002). „PJA1, kódující ubikvitinovou ligázu prstu RING-H2, je nový gen lidského X chromozomu hojně exprimovaný v mozku“. Genomika. 79 (6): 869–74. doi:10.1006 / geno.2002.6770. PMID 12036302.
- Xia Y, Pao GM, Chen HW, Verma IM, Hunter T (únor 2003). „Zlepšení aktivity ubikvitinové ligázy BRCA1 E3 přímou interakcí s proteinem BARD1“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (7): 5255–63. doi:10,1074 / jbc.M204591200. PMID 12431996.
- Takeyama K, Aguiar RC, Gu L, He C, Freeman GJ, Kutok JL, Aster JC, Shipp MA (červen 2003). „BAL vázající protein BBAP a příbuzní členové rodiny Deltex vykazují aktivitu isopeptidové ligázy ubikvitin-protein“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (24): 21930–7. doi:10,1074 / jbc.M301157200. PMID 12670957.
- Xu L, Yang L, Moitra PK, Hashimoto K, Rallabhandi P, Kaul S, Meroni G, Jensen JP, Weissman AM, D'Arpa P (srpen 2003). „BTBD1 a BTBD2 se kolokalizují na cytoplazmatická těla pomocí RBCC / tripartitního motivového proteinu, TRIM5delta“. Experimentální výzkum buněk. 288 (1): 84–93. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00187-3. PMID 12878161.
- Subramaniam V, Li H, Wong M, Kitching R, Attisano L, Wrana J, Zubovits J, Burger AM, Seth A (říjen 2003). „Protein RING-H2 RNF11 je nadměrně exprimován u rakoviny prsu a je cílem ligázy Smurf2 E3“. British Journal of Cancer. 89 (8): 1538–44. doi:10.1038 / sj.bjc.6601301. PMC 2394340. PMID 14562029.
- Shimura H, Schwartz D, Gygi SP, Kosik KS (únor 2004). „Komplex CHIP-Hsc70 ubikvitinuje fosforylovaný tau a zvyšuje přežití buněk“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (6): 4869–76. doi:10,1074 / jbc.M305838200. PMID 14612456.
- Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM (leden 2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
- Winkler GS, Albert TK, Dominguez C, Legtenberg YI, Boelens R, Timmers HT (březen 2004). „Altered-specificity ubiquitin-konjugující enzym / ubiquitin-protein ligase pair“. Journal of Molecular Biology. 337 (1): 157–65. doi:10.1016 / j.jmb.2004.01.031. PMID 15001359.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |