UBE2L6 - UBE2L6

UBE2L6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 WZV, 1 WZW, 2KJH
Identifikátory
Aliasy	UBE2L6, RIG-B, UBCH8, ubikvitin konjugující enzym E2 L6
Externí ID	OMIM: 603890 MGI: 1914500 HomoloGene: 3112 Genové karty: UBE2L6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	57,568,284 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita protein-transferázy podobná ubikvitinu; • aktivita transferázy; • Aktivita ISG15 transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • ubikvitinová vazba; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita enzymu konjugujícího ubikvitin;
Buněčná složka	• cytosol; • nukleoplazma; • komplex ubikvitin ligázy;
Biologický proces	• buněčný proteinový metabolický proces; • Konjugace ISG15-protein; • syntéza překladů; • negativní regulace produkce interferonu typu I.; • modifikace-závislý proteinový katabolický proces; • proces modifikace buněčného proteinu; • ubikvitinace bílkovin; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9246
	56791
	ENSG00000156587
	ENSMUSG00000027078
	O14933
	Q9QZU9
	NM_198183; NM_004223
	NM_019949
	NP_004214; NP_937826
	NP_064333
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin / ISG15-konjugující enzym E2 L6 je protein že u lidí je kódován UBE2L6 gen.^[4]^[5]

Modifikace proteinů pomocí ubikvitin je důležitý buněčný mechanismus pro zacílení na degradaci abnormálních nebo krátkodobých proteinů. Ubikvitinace zahrnuje nejméně tři třídy enzymy: enzymy aktivující ubikvitin (E1S ), enzymy konjugující s ubikvitinem (E2S ) a ligázy ubikvitin-protein (E3s). Tento gen kóduje člena rodiny enzymů konjugujících s E2 ubikvitinem.

Tento enzym je velmi podobný v primární struktuře enzymu kódovanému UBE2L3 gen. Dvě alternativně sestříhané varianty přepisu kódující odlišné izoformy byly nalezeny pro tento gen.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156587 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kumar S, Kao WH, Howley PM (červenec 1997). „Fyzická interakce mezi specifickými enzymy E2 a Hect E3 určuje funkční kooperativitu“. J Biol Chem. 272 (21): 13548–54. doi:10.1074 / jbc.272.21.13548. PMID 9153201.
^ ^A ^b „Entrez Gene: UBE2L6 ubikvitin-konjugující enzym E2L 6“.

Další čtení

Kang HY, Yeh S, Fujimoto N, Chang C (1999). „Klonování a charakterizace lidského prostatického koaktivátoru ARA54, nového proteinu, který se asociuje s androgenovým receptorem“. J. Biol. Chem. 274 (13): 8570–6. doi:10.1074 / jbc.274.13.8570. PMID 10085091.
Moynihan TP, Ardley HC, Nuber U a kol. (1999). „Enzymy konjugující s ubikvitinem UbcH7 a UbcH8 interagují s doménami HHARI a H7-AP1 obsahujícími motiv RING prst / IBR“. J. Biol. Chem. 274 (43): 30963–8. doi:10.1074 / jbc.274.43.30963. PMID 10521492.
Huang L, Kinnucan E, Wang G a kol. (1999). „Struktura komplexu E6AP-UbcH7: pohledy na ubikvitinaci pomocí enzymové kaskády E2-E3“. Věda. 286 (5443): 1321–6. doi:10.1126 / science.286.5443.1321. PMID 10558980.
Nyman TA, Matikainen S, Sareneva T a kol. (2000). „Proteomová analýza odhaluje, že enzymy konjugující s ubikvitinem jsou novou rodinou genů regulovaných interferonem alfa“. Eur. J. Biochem. 267 (13): 4011–9. doi:10.1046 / j.1432-1327.2000.01433.x. PMID 10866800.
Ardley HC, Rose SA, Tan N a kol. (2000). "Genomická organizace genu pro lidský ubiquitin konjugující enzym, UBE2L6 na chromozomu 11q12". Cytogenet. Cell Genet. 89 (1–2): 137–40. doi:10.1159/000015593. PMID 10894956. S2CID 502452.
Zhang Y, Gao J, Chung KK a kol. (2001). „Parkin funguje jako ligand ubikvitin-protein závislý na E2 a podporuje degradaci proteinu spojeného se synaptickými vezikuly, CDCrel-1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (24): 13354–9. doi:10.1073 / pnas.240347797. PMC 27228. PMID 11078524.
Niwa J, Ishigaki S, Doyu M a kol. (2001). „Nový centrosomální protein prstového prstu, dorfin, zprostředkovává aktivitu ubikvitin ligázy“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 281 (3): 706–13. doi:10.1006 / bbrc.2001.4414. PMID 11237715.
Wheeler TC, Chin LS, Li Y a kol. (2002). „Regulace degradace synaptofyzinu savčími homology sedmi v nepřítomnosti“. J. Biol. Chem. 277 (12): 10273–82. doi:10,1074 / jbc.M107857200. PMID 11786535.
Urano T, Saito T, Tsukui T a kol. (2002). „EFF se zaměřuje na 14-3-3 sigma pro proteolýzu a podporuje růst nádoru prsu“. Příroda. 417 (6891): 871–5. doi:10.1038 / nature00826. PMID 12075357. S2CID 4348545.
Chin LS, Vavalle JP, Li L (2002). „Staring, nová E3 ubikvitin-protein ligáza, která se zaměřuje na degradaci syntaxinu 1“. J. Biol. Chem. 277 (38): 35071–9. doi:10,1074 / jbc.M203300200. PMID 12121982.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Chuang TH, Ulevitch RJ (2004). „Triad3A, ligáza ubikvitin-protein E3 regulující receptory podobné Toll“. Nat. Immunol. 5 (5): 495–502. doi:10.1038 / ni1066. PMID 15107846. S2CID 39773935.
Zhao C, Beaudenon SL, Kelley ML a kol. (2004). „Enzym UbcH8 ubikvitin E2 je také enzym E2 pro ISG15, protein podobný ubikvitinu podobný IFN-alfa / beta“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (20): 7578–82. doi:10.1073 / pnas.0402528101. PMC 419648. PMID 15131269.
Tripathi MK, Chaudhuri G (2005). „Down-regulace UCRP a UBE2L6 v BRCA2 sražených lidských buňkách prsu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 328 (1): 43–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.12.142. PMC 3085986. PMID 15670748.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Li J, Wang J, Yang X a kol. (2007). „Spen homolog Msx2 interagující jaderný cílový protein interaguje s E2 ubikvitin-konjugujícím enzymem UbcH8.“ Mol. Buňka. Biochem. 288 (1–2): 151–7. doi:10.1007 / s11010-006-9131-9. PMID 16583136. S2CID 24935755.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000156587 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9153201-4] Kumar S, Kao WH, Howley PM (červenec 1997). „Fyzická interakce mezi specifickými enzymy E2 a Hect E3 určuje funkční kooperativitu“. J Biol Chem. 272 (21): 13548–54. doi:10.1074 / jbc.272.21.13548. PMID 9153201.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: UBE2L6 ubikvitin-konjugující enzym E2L 6“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]