UBE2V2 - UBE2V2

UBE2V2
Protein UBE2V2 PDB 1j74.png
Dostupné struktury
PDBHledání ortologu: PDBe RCSB
Identifikátory
AliasyUBE2V2, DDVIT1, DDVit-1, EDAF-1, EDPF-1, EDPF1, MMS2, UEV-2, UEV2, enzym konjugující s ubikvitinem E2 V2
Externí IDOMIM: 603001 MGI: 1917870 HomoloGene: 55739 Genové karty: UBE2V2
Umístění genu (člověk)
Chromozom 8 (lidský)
Chr.Chromozom 8 (lidský)[1]
Chromozom 8 (lidský)
Genomické umístění pro UBE2V2
Genomické umístění pro UBE2V2
Kapela8q11.21Start48,008,415 bp[1]
Konec48,064,708 bp[1]
Exprese RNA vzor
PBB GE UBE2V2 209096 na fs.png
Další údaje o referenčních výrazech
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

7336

70620

Ensembl

ENSG00000169139

ENSMUSG00000022674

UniProt

Q15819

Q9D2M8

RefSeq (mRNA)

NM_003350

NM_001159351
NM_023585

RefSeq (protein)

NP_003341

NP_001152823
NP_076074

Místo (UCSC)Chr 8: 48,01 - 48,06 MbChr 16: 15,55 - 15,6 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Ubiquitin konjugující enzym E2 varianta 2 je protein že u lidí je kódován UBE2V2 gen.[5][6] Ubiquitin konjugující enzym E2 variantní proteiny tvoří odlišnou podrodinu v rámci rodiny proteinů E2.

Struktura

UBE2V2 má podobnost sekvence s jinými enzymy konjugující s ubikvitinem ale postrádají konzervovaný cysteinový zbytek, který je kritický pro katalytickou aktivitu E2. Protein kódovaný tímto genem také sdílí homologii s ubikvitinem konjugujícím enzymem E2 varianta 1 a kvasinkovým genovým produktem MMS2.[7]

Funkce

UBE2V2 byl také implikován jako intracelulární senzor reaktivních elektrofilních druhů, které jsou přítomny ve vysokých hladinách během období patogenního a / nebo environmentálního stresu.[8] Zbytek C69 UBE2V2 je schopen vázat se s různými RES. Ukázalo se, že vazba RES na UBE2V2 podporuje UBE2V2 zprostředkovanou aktivaci Ube2N, dalšího proteinu E2, který se komplexuje s UBE2V2. Ukázalo se, že aktivovaný Ube2N hraje hlavní roli při podpoře odpovědí na poškození DNA. UBE2V2 tedy může podporovat integritu genomu přímým snímáním RES a prováděním odpovědí na poškození DNA.[9] Může se také podílet na diferenciaci monocytů a enterocytů.[7]

Interakce

UBE2V2 bylo prokázáno komunikovat s HLTF.[10] Ačkoli UBE2V2 sám postrádá aktivitu konjugující s ubikvitinem, může interagovat s různými Enzymy konjugující s ubikvitinem k usnadnění jejich katalytických aktivit.[11] Například UBE2V2 se může komplexovat s UBE2N za vzniku heterodimeru schopného syntetizovat polyubikvitinové řetězce spojené s Lys-63.[12] UBE2V2 může usnadnit aktivitu UBE2N koordinací umístění UBE2N za účelem podpory tvorby ubikvitinového řetězce konkrétně na Lys-63, protože molekula ubikvitinu má několik potenciálních vazebných míst pro lysin.[13] Podobně se ukázalo, že UBE2V2 interaguje s ubikvitinem konjugujícím enzymem Ubc13, aby přiměl Ubc13 přijmout aktivní konformaci, která může vytvářet polyysituční řetězce Lys-63 na různých substrátech.[14]

Přidání polyubikvitinových řetězců Lys-63 k intracelulárním cílům se liší od kanonických polyysikitinových řetězců Lys-48 tím, že řetězce Lys-63 nezprostředkují proteazomální degradaci jeho substrátu.[15] I když jejich funkce zůstává špatně charakterizovaná, ukázalo se, že řetězce Lys-63 regulují signální dráhy buď aktivací, nebo inhibicí jeho funkce cílového proteinu.[16] Například, TRIM5alfa omezení retrovirové reverzní transkripce závisí na polybibiquitinaci zprostředkované UBE2V2 / UBE2N.[17] Ukázalo se, že UBE2V2 reguluje TRIM21 antivirovou aktivitu analogickým způsobem.[18]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169139 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022674 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ Sancho E, Vilá MR, Sánchez-Pulido L, Lozano JJ, Paciucci R, Nadal M, Fox M, Harvey C, Bercovich B, Loukili N, Ciechanover A, Lin SL, Sanz F, Estivill X, Valencia A, Thomson TM ( Ledna 1998). „Role UEV-1, neaktivní varianty enzymů konjugujících s E2 ubikvitinem, in vitro diferenciace a chování buněčného cyklu střevních mukosekrečních buněk HT-29-M6“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (1): 576–89. doi:10,1128 / mcb.18.1.576. PMC  121525. PMID  9418904.
  6. ^ Fritsche J, Rehli M, Krause SW, Andreesen R, Kreutz M (červen 1997). "Molekulární klonování 1alfa, 25-dihydroxyvitamin D3-indukovatelného transkriptu (DDVit 1) v lidských krevních monocytech". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 235 (2): 407–12. doi:10.1006 / bbrc.1997.6798. PMID  9199207.
  7. ^ A b „Entrez Gene: UBE2V2 ubikvitin konjugující enzym E2 varianta 2“.
  8. ^ Farmář EE, Davoine C (srpen 2007). "Reaktivní elektrofilní druhy". Aktuální názor na biologii rostlin. 10 (4): 380–6. doi:10.1016 / j.pbi.2007.04.019. PMID  17646124.
  9. ^ Zhao Y, Long MJ, Wang Y, Zhang S, Aye Y (únor 2018). „Ube2V2 je Rosetta Stone překlenující redoxní a ubikvitinové kódy, koordinující reakce na poškození DNA“. ACS Central Science. 4 (2): 246–259. doi:10,1021 / acscentsci.7b00556. PMC  5833000. PMID  29532025.
  10. ^ Unk I, Hajdú I, Fátyol K, Hurwitz J, Yoon JH, Prakash L, Prakash S, Haracska L (březen 2008). „Lidská HLTF funguje jako ubikvitinová ligáza pro polyubikvitinaci proliferujícího buněčného jaderného antigenu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 105 (10): 3768–73. doi:10.1073 / pnas.0800563105. PMC  2268824. PMID  18316726.
  11. ^ Stewart MD, Ritterhoff T, Klevit RE, Brzovic PS (duben 2016). „E2 enzymy: více než jen střední muži“. Cell Research. 26 (4): 423–40. doi:10.1038 / cr.2016.35. PMC  4822130. PMID  27002219.
  12. ^ Fletcher AJ, Christensen DE, Nelson C, Tan CP, Schaller T, Lehner PJ, Sundquist WI, Towers GJ (srpen 2015). „TRIM5α vyžaduje Ube2W k ukotvení ubikvitinových řetězců vázaných na Lys63 a omezení reverzní transkripce“. Časopis EMBO. 34 (15): 2078–95. doi:10.15252 / embj.201490361. PMC  4551353. PMID  26101372.
  13. ^ Eddins MJ, Carlile CM, Gomez KM, Pickart CM, Wolberger C (říjen 2006). „Mms2-Ubc13 kovalentně navázaný na ubikvitin odhaluje strukturální základ tvorby polyubikvitinového řetězce specifického pro vazbu“. Přírodní strukturní a molekulární biologie. 13 (10): 915–20. doi:10.1038 / nsmb1148. PMID  16980971. S2CID  6757737.
  14. ^ Branigan E, Plechanovová A, Jaffray EG, Naismith JH, Hay RT (srpen 2015). "Strukturální základ pro RING katalyzovanou syntézu K63 vázaných ubikvitinových řetězců". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 22 (8): 597–602. doi:10.1038 / nsmb.3052. PMC  4529489. PMID  26148049.
  15. ^ Fletcher AJ, Christensen DE, Nelson C, Tan CP, Schaller T, Lehner PJ, Sundquist WI, Towers GJ (srpen 2015). „TRIM5α vyžaduje Ube2W k ukotvení ubikvitinových řetězců vázaných na Lys63 a omezení reverzní transkripce“. Časopis EMBO. 34 (15): 2078–95. doi:10.15252 / embj.201490361. PMC  4551353. PMID  26101372.
  16. ^ „UBE2N - enzym konjugující ubikvitin E2 N - Homo sapiens (člověk) - gen a protein UBE2N“. www.uniprot.org. Citováno 2018-04-06.
  17. ^ Fletcher AJ, Christensen DE, Nelson C, Tan CP, Schaller T, Lehner PJ, Sundquist WI, Towers GJ (srpen 2015). „TRIM5α vyžaduje Ube2W k ukotvení ubikvitinových řetězců vázaných na Lys63 a omezení reverzní transkripce“. Časopis EMBO. 34 (15): 2078–95. doi:10.15252 / embj.201490361. PMC  4551353. PMID  26101372.
  18. ^ Fletcher AJ, Mallery DL, Watkinson RE, Dickson CF, James LC (srpen 2015). "Sekvenční ubikvitinační a deubikvitační enzymy synchronizují funkce duálního senzoru a efektoru TRIM21". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (32): 10014–9. doi:10.1073 / pnas.1507534112. PMC  4538650. PMID  26150489.

Další čtení