RAD51L3 - RAD51L3

RAD51D
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KZ3
Identifikátory
Aliasy	RAD51D, BROVCA4, R51H3, RAD51L3, TRAD, RAD51 paralog D
Externí ID	OMIM: 602954 MGI: 1261809 HomoloGene: 2156 Genové karty: RAD51D
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	35,121,522 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba nukleotidů; • Aktivita ATPázy závislá na DNA; • aktivita rekombinázy; • jednořetězcová vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba čtyřcestného spojení DNA; • vazba gama-tubulinu; • dvouřetězcová vazba DNA; • aktivita endodeoxyribonukleázy; • ATP vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • centrosome; • replikační vidlice; • chromozóm; • organizační centrum mikrotubulů; • chromozom, telomerická oblast; • Komplex Rad51B-Rad51C-Rad51D-XRCC2; • cytoskelet; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• invaze pramenů; • reakce na ionizující záření; • oprava nukleotidovou excizí; • reciproční meiotická rekombinace; • DNA rekombinace; • oprava křížového propojení mezi řetězci; • organizace chromozomů; • regulace buněčného cyklu; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • mitotická rekombinace; • údržba telomer; • Oprava DNA; • shromáždění meiotické DNA rekombinázy; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí homologní rekombinace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	5892
	19364
	ENSG00000185379
	ENSMUSG00000018841
	O75771
	O55230
NM_001142571; NM_002878; NM_133627; NM_133628; NM_133629;
	NM_133630
	NM_001277938; NM_001277939; NM_001277941; NM_001277942; NM_011235
	NP_001136043; NP_002869; NP_598332
	NP_001264867; NP_001264868; NP_001264870; NP_001264871; NP_035365
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

DNA opravný protein RAD51 homolog 4 je protein že u lidí je kódován RAD51L3 gen.^[4]^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je členem rodiny proteinů RAD51. Členové rodiny RAD51 jsou velmi podobní bakteriálním RecA a Saccharomyces cerevisiae Rad51, o nichž je známo, že se účastní homologní rekombinace a opravy DNA. Tento protein tvoří komplex s několika dalšími členy rodiny RAD51, včetně RAD51L1, RAD51L2 a XRCC2. Ukázalo se, že proteinový komplex vytvořený s tímto proteinem katalyzuje homologní párování mezi jednořetězcovou a dvouvláknovou DNA a předpokládá se, že hraje roli v rané fázi rekombinační opravy DNA. Bylo popsáno několik alternativně sestřižených variant transkriptu tohoto genu, ale biologická platnost některých z nich nebyla stanovena.^[5]

Interakce

RAD51L3 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185379 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Pittman DL, Weinberg LR, Schimenti JC (červen 1998). "Identifikace, charakterizace a genetické mapování Rad51d, nového myšího a lidského genu souvisejícího s RAD51 / RecA". Genomika. 49 (1): 103–11. doi:10.1006 / geno.1998.5226. PMID 9570954.
^ ^A ^b „Entrez Gene: RAD51L3 RAD51-like 3 (S. cerevisiae)“.
^ ^A ^b Braybrooke JP, Li JL, Wu L, Caple F, Benson FE, Hickson ID (listopad 2003). "Funkční interakce mezi Bloomovým syndromem helikázy a RAD51 paralogem, RAD51L3 (RAD51D)". J. Biol. Chem. 278 (48): 48357–66. doi:10,1074 / jbc.M308838200. hdl:10026.1/10297. PMID 12975363.
^ ^A ^b Liu N, Schild D, poslanec Thelen, Thompson LH (únor 2002). „Zapojení Rad51C do dvou odlišných proteinových komplexů paralogů Rad51 v lidských buňkách“. Nucleic Acids Res. 30 (4): 1009–15. doi:10.1093 / nar / 30.4.1009. PMC 100342. PMID 11842113.
^ Miller KA, Yoshikawa DM, McConnell IR, Clark R, Schild D, Albala JS (březen 2002). „RAD51C interaguje s RAD51B a je ústřední pro větší proteinový komplex in vivo bez RAD51“. J. Biol. Chem. 277 (10): 8406–11. doi:10,1074 / jbc.M108306200. PMID 11744692.
^ Schild D, Lio YC, Collins DW, Tsomondo T, Chen DJ (červen 2000). "Důkazy pro současné proteinové interakce mezi lidskými paralogy Rad51". J. Biol. Chem. 275 (22): 16443–9. doi:10,1074 / jbc.M001473200. PMID 10749867.
^ Hussain S, Wilson JB, Medhurst AL, Hejna J, Witt E, Ananth S, Davies A, Masson JY, Moses R, West SC, de Winter JP, Ashworth A, Jones NJ, Mathew CG (červen 2004). „Přímá interakce FANCD2 s BRCA2 v dráhách reakce na poškození DNA“. Hučení. Mol. Genet. 13 (12): 1241–8. doi:10,1093 / hmg / ddh135. PMID 15115758.

Další čtení

Cartwright R, Dunn AM, Simpson PJ, Tambini CE, Thacker J (1998). „Izolace nových lidských a myších genů rodiny genů rekombinačních a reparačních rekombinací recA / RAD51“. Nucleic Acids Res. 26 (7): 1653–9. doi:10.1093 / nar / 26.7.1653. PMC 147465. PMID 9512535.
Kawabata M, Saeki K (1999). "Několik alternativních transkriptů lidského homologu myšího genu TRAD / R51H3 / RAD51D, člena rodiny genů rec A / RAD51". Biochem. Biophys. Res. Commun. 257 (1): 156–62. doi:10.1006 / bbrc.1999.0413. PMID 10092526.
Schild D, Lio YC, Collins DW, Tsomondo T, Chen DJ (2000). "Důkazy pro současné proteinové interakce mezi lidskými paralogy Rad51". J. Biol. Chem. 275 (22): 16443–9. doi:10,1074 / jbc.M001473200. PMID 10749867.
Braybrooke JP, Spink KG, Thacker J, Hickson ID (2000). „Člen rodiny RAD51, RAD51L3, je ATPáza stimulovaná DNA, která tvoří komplex s XRCC2“. J. Biol. Chem. 275 (37): 29100–6. doi:10,1074 / jbc.M002075200. PMID 10871607.
Miller KA, Yoshikawa DM, McConnell IR, Clark R, Schild D, Albala JS (2002). „RAD51C interaguje s RAD51B a je ústřední pro větší proteinový komplex in vivo bez RAD51“. J. Biol. Chem. 277 (10): 8406–11. doi:10,1074 / jbc.M108306200. PMID 11744692.
Masson JY, Tarsounas MC, Stasiak AZ, Stasiak A, Shah R, McIlwraith MJ, Benson FE, West SC (2001). "Identifikace a čištění dvou odlišných komplexů obsahujících pět paralogů RAD51". Genes Dev. 15 (24): 3296–307. doi:10.1101 / gad.947001. PMC 312846. PMID 11751635.
Sigurdsson S, Van Komen S, Bussen W, Schild D, Albala JS, Sung P (2001). „Mediátorová funkce lidského komplexu Rad51B-Rad51C při výměně řetězců DNA katalyzované Rad51 / RPA“. Genes Dev. 15 (24): 3308–18. doi:10,1101 / gad. 935501. PMC 312844. PMID 11751636.
Kurumizaka H, Ikawa S, Nakada M, Enomoto R, Kagawa W, Kinebuchi T, Yamazoe M, Yokoyama S, Shibata T (2002). „Homologní párování a aktivity tvorby struktury prstenců a vláken lidského komplexu Xrcc2 * Rad51D“. J. Biol. Chem. 277 (16): 14315–20. doi:10,1074 / jbc.M105719200. PMID 11834724.
Wiese C, Collins DW, Albala JS, Thompson LH, Kronenberg A, Schild D (2002). „Interakce zahrnující paralogy Rad51 Rad51C a XRCC3 v lidských buňkách“. Nucleic Acids Res. 30 (4): 1001–8. doi:10.1093 / nar / 30.4.1001. PMC 100332. PMID 11842112.
Liu N, Schild D, poslanec Thelen, Thompson LH (2002). „Zapojení Rad51C do dvou odlišných proteinových komplexů paralogů Rad51 v lidských buňkách“. Nucleic Acids Res. 30 (4): 1009–15. doi:10.1093 / nar / 30.4.1009. PMC 100342. PMID 11842113.
Godthelp BC, Artwert F, Joenje H, Zdzienicka MZ (2002). „Narušená tvorba jaderných ložisek Rad51 způsobená poškozením DNA jedinečně charakterizuje Fanconiho anemickou skupinu D1“. Onkogen. 21 (32): 5002–5. doi:10.1038 / sj.onc.1205656. PMID 12118380.
Braybrooke JP, Li JL, Wu L, Caple F, Benson FE, Hickson ID (2003). "Funkční interakce mezi Bloomovým syndromem helikázy a RAD51 paralogem, RAD51L3 (RAD51D)". J. Biol. Chem. 278 (48): 48357–66. doi:10,1074 / jbc.M308838200. hdl:10026.1/10297. PMID 12975363.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2004). „Nedoceněná role pro dohled nad RNA“. Genome Biol. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Tarsounas M, Davies AA, West SC (2004). "RAD51 lokalizace a aktivace po poškození DNA". Philos. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 359 (1441): 87–93. doi:10.1098 / rstb.2003.1368. PMC 1693300. PMID 15065660.
Tarsounas M, Muñoz P, Claas A, Smiraldo PG, Pittman DL, Blasco MA, West SC (2004). "Údržba telomer vyžaduje rekombinační / opravný protein RAD51D". Buňka. 117 (3): 337–47. doi:10.1016 / S0092-8674 (04) 00337-X. PMID 15109494. S2CID 16478454.
Hussain S, Wilson JB, Medhurst AL, Hejna J, Witt E, Ananth S, Davies A, Masson JY, Moses R, West SC, de Winter JP, Ashworth A, Jones NJ, Mathew CG (2004). „Přímá interakce FANCD2 s BRCA2 v dráhách reakce na poškození DNA“. Hučení. Mol. Genet. 13 (12): 1241–8. doi:10,1093 / hmg / ddh135. PMID 15115758.
Rodríguez-López R, Osorio A, Ribas G, Pollán M, Sánchez-Pulido L, de la Hoya M, Ruibal A, Zamora P, Arias JI, Salazar R, Vega A, Martínez JI, Esteban-Cardeñosa E, Alonso C, Letón R, Urioste Azcorra M, Miner C, Armengod ME, Carracedo A, González-Sarmiento R, Caldés T, Díez O, Benítez J (2004). „Varianta E233G genu RAD51D by mohla být alelou s nízkou penetrací v rodinách s vysokým rizikem rakoviny prsu bez mutací BRCA1 / 2.“ Int. J. Cancer. 110 (6): 845–9. doi:10.1002 / ijc.20169. PMID 15170666. S2CID 6309119.
Loveday C, Turnbull C, Ramsay E, Hughes D, Ruark E, Frankum JR, Bowden G, Kalmyrzaev B, Warren-Perry M, Snape K, Adlard JW, Barwell J, Berg J, Brady AF, Brewer C, Brice G, Chapman C, Cook J, Davidson R, Donaldson A, Douglas F, Greenhalgh L, Henderson A, Izatt L, Kumar A, Lalloo F, Miedzybrodzka Z, Morrison PJ, Paterson J, Porteous M, Rogers MT, Shanley S, Walker L , Eccles D, Evans DG, Renwick A, Seal S, Lord CJ, Ashworth A, Reis-Filho JS, Antoniou AC, Rahman N (2011-08-07). „Germinální mutace v RAD51D propůjčují náchylnost k rakovině vaječníků“. Nat. Genet. 43 (9): 879–82. doi:10,1038 / ng,893. PMC 4845885. PMID 21822267.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000185379 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9570954-4] Pittman DL, Weinberg LR, Schimenti JC (červen 1998). "Identifikace, charakterizace a genetické mapování Rad51d, nového myšího a lidského genu souvisejícího s RAD51 / RecA". Genomika. 49 (1): 103–11. doi:10.1006 / geno.1998.5226. PMID 9570954.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: RAD51L3 RAD51-like 3 (S. cerevisiae)“.

[pmid12975363-6] A ^b Braybrooke JP, Li JL, Wu L, Caple F, Benson FE, Hickson ID (listopad 2003). "Funkční interakce mezi Bloomovým syndromem helikázy a RAD51 paralogem, RAD51L3 (RAD51D)". J. Biol. Chem. 278 (48): 48357–66. doi:10,1074 / jbc.M308838200. hdl:10026.1/10297. PMID 12975363.

[pmid11842113-7] A ^b Liu N, Schild D, poslanec Thelen, Thompson LH (únor 2002). „Zapojení Rad51C do dvou odlišných proteinových komplexů paralogů Rad51 v lidských buňkách“. Nucleic Acids Res. 30 (4): 1009–15. doi:10.1093 / nar / 30.4.1009. PMC 100342. PMID 11842113.

[pmid11744692-8] Miller KA, Yoshikawa DM, McConnell IR, Clark R, Schild D, Albala JS (březen 2002). „RAD51C interaguje s RAD51B a je ústřední pro větší proteinový komplex in vivo bez RAD51“. J. Biol. Chem. 277 (10): 8406–11. doi:10,1074 / jbc.M108306200. PMID 11744692.

[pmid10749867-9] Schild D, Lio YC, Collins DW, Tsomondo T, Chen DJ (červen 2000). "Důkazy pro současné proteinové interakce mezi lidskými paralogy Rad51". J. Biol. Chem. 275 (22): 16443–9. doi:10,1074 / jbc.M001473200. PMID 10749867.

[pmid15115758-10] Hussain S, Wilson JB, Medhurst AL, Hejna J, Witt E, Ananth S, Davies A, Masson JY, Moses R, West SC, de Winter JP, Ashworth A, Jones NJ, Mathew CG (červen 2004). „Přímá interakce FANCD2 s BRCA2 v dráhách reakce na poškození DNA“. Hučení. Mol. Genet. 13 (12): 1241–8. doi:10,1093 / hmg / ddh135. PMID 15115758.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]