UBE2V1 - UBE2V1 - Wikipedia

UBE2V1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2A4D, 2C2V, 2 HLW
Identifikátory
Aliasy	UBE2V1, CIR1, CROC-1, CROC1, UBE2V, UEV-1, UEV1, UEV1A, enzym konjugující s ubikvitinem E2 V1
Externí ID	OMIM: 602995 MGI: 1913839 HomoloGene: 81888 Genové karty: UBE2V1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	50,115,959 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	167,632,095 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita enzymu konjugujícího ubikvitin;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • komplex enzymu konjugujícího ubikvitin; • Komplex UBC13-UEV1A; • komplex ubikvitin ligázy; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• polyubikvitinace bílkovin; • Signální dráha receptoru Fc-epsilon; • ubikvitinace spojená s proteinem K63; • oligomerizační doména vázající nukleotidy obsahující signální cestu; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • stimulační signální dráha lektinového receptoru typu C; • regulace opravy DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • Signální dráha receptoru T buněk; • diferenciace buněk; • postreplikační oprava; • pozitivní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • aktivace aktivity MAPK; • JNK kaskáda; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • interleukin-1 zprostředkovaná signální dráha;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7335
	66589
	ENSG00000244687
	ENSMUSG00000078923
	Q13404
	Q9CZY3
NM_001032288; NM_001257393; NM_001257394; NM_001257395; NM_001257396;
	NM_001257397; NM_001257398; NM_001257399; NM_001282575; NM_001282576; NM_001282577; NM_001282578; NM_001282579; NM_001282580; NM_021988; NM_022442; NM_199144
	NM_023230; NM_001311131; NM_001311146
NP_001027459; NP_001244322; NP_001244323; NP_001244324; NP_001244325;
	NP_001244326; NP_001244327; NP_001244328; NP_001269504; NP_001269505; NP_001269506; NP_001269507; NP_001269508; NP_001269509; NP_068823; NP_071887; NP_954595; NP_954673
	NP_001298060; NP_001298075; NP_075719
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin konjugující enzym E2 varianta 1 je protein že u lidí je kódován UBE2V1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Ubiquitin konjugující proteiny E2 enzymové varianty tvoří odlišnou podrodinu v rámci rodiny proteinů E2. Mají sekvenční podobnost s jinými enzymy konjugujícími s ubikvitinem, ale postrádají konzervovaný cysteinový zbytek, který je kritický pro katalytickou aktivitu E2. Protein kódovaný tímto genem je umístěn v jádře a může způsobit transkripční aktivaci lidského FOS protoonkogenu. Předpokládá se, že je zapojen do řízení diferenciace změnou chování buněčného cyklu. Pro tento gen bylo popsáno několik alternativně sestřižených transkriptů kódujících různé izoformy. Byl identifikován pseudogen, který je také umístěn na chromozomu 20. Společná transkripce tohoto genu a sousedního upstream genu generuje vzácný transkript (Kua-UEV), který kóduje fúzní protein sestávající ze identity sdílející sekvenci s každým jednotlivým genovým produktem.^[7]

Interakce

UBE2V1 bylo prokázáno komunikovat s UBE2N.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000244687 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000078923 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Sancho E, Vilá MR, Sánchez-Pulido L, Lozano JJ, Paciucci R, Nadal M, Fox M, Harvey C, Bercovich B, Loukili N, Ciechanover A, Lin SL, Sanz F, Estivill X, Valencia A, Thomson TM ( Ledna 1998). „Role UEV-1, neaktivní varianty enzymů konjugujících s E2 ubikvitinem, in vitro diferenciace a chování buněčného cyklu střevních mukosekrečních buněk HT-29-M6“. Mol Cell Biol. 18 (1): 576–89. doi:10,1128 / mcb.18.1.576. PMC 121525. PMID 9418904.
^ Rothofsky ML, Lin SL (říjen 1997). „CROC-1 kóduje protein, který zprostředkovává transkripční aktivaci lidského promotoru FOS“. Gen. 195 (2): 141–9. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00097-8. PMID 9305758.
^ ^A ^b „Entrez Gene: UBE2V1 ubikvitin konjugující enzym E2 varianta 1“.
^ Deng L, Wang C, Spencer E, Yang L, Braun A, You J, Slaughter C, Pickart C, Chen ZJ (říjen 2000). „Aktivace komplexu IkappaB kinázy pomocí TRAF6 vyžaduje dimerní komplex enzymu konjugujícího s ubikvitinem a jedinečný polyubikvitinový řetězec“. Buňka. 103 (2): 351–61. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00126-4. PMID 11057907. S2CID 18154645.

Další čtení

Long M (2001). „Nová funkce se vyvinula z fúze genů“. Genome Res. 10 (11): 1655–7. doi:10,1101 / gr. 16700. PMID 11076848.
Thomson TM, Khalid H, Lozano JJ, Sancho E, Ariño J (1998). „Role UEV-1A, homologu tumor supresorového proteinu TSG101, při ochraně před poškozením DNA“. FEBS Lett. 423 (1): 49–52. doi:10.1016 / S0014-5793 (98) 00060-X. PMID 9580084. S2CID 28536857.
Xiao W, Lin SL, Broomfield S, Chow BL, Wei YF (1998). „Produkty kvasinek MMS2 a dvou lidských homologů (hMMS2 a CROC-1) definují strukturně a funkčně konzervovanou rodinu proteinů podobných Ubc“. Nucleic Acids Res. 26 (17): 3908–14. doi:10.1093 / nar / 26.17.3908. PMC 147796. PMID 9705497.
Ma L, Broomfield S, Lavery C, Lin SL, Xiao W, Bacchetti S (1998). "Up-regulace exprese CIR1 / CROC1 po imortalizaci buněk a v lidských buněčných liniích odvozených z nádoru". Onkogen. 17 (10): 1321–6. doi:10.1038 / sj.onc.1202058. PMID 9771976.
Hofmann RM, Pickart CM (1999). "Nekanonický MMS2 kódovaný ubiquitin konjugující enzym funguje při sestavování nových polyubiquitinových řetězců pro opravu DNA". Buňka. 96 (5): 645–53. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80575-9. PMID 10089880. S2CID 17117789.
Deng L, Wang C, Spencer E, Yang L, Braun A, You J, Slaughter C, Pickart C, Chen ZJ (2000). „Aktivace komplexu kinázy IkappaB pomocí TRAF6 vyžaduje dimerní komplex enzymu konjugujícího s ubikvitinem a jedinečný polyubikvitinový řetězec.“ Buňka. 103 (2): 351–61. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00126-4. PMID 11057907. S2CID 18154645.
Thomson TM, Lozano JJ, Loukili N, Carrió R, Serras F, Cormand B, Valeri M, Díaz VM, Abril J, Burset M, Merino J, Macaya A, Corominas M, Guigó R (2001). „Fúze lidského genu pro polyubikvitinační koefektor UEV1 s Kua, nově identifikovaným genem“. Genome Res. 10 (11): 1743–56. doi:10,1101 / gr. GR-1405R. PMC 310942. PMID 11076860.
Ito M, Shichijo S, Tsuda N, Ochi M, Harashima N, Saito N, Itoh K (2001). „Molekulární základ rozpoznávání buněk rakoviny pankreatu zprostředkovaných T buňkami“. Cancer Res. 61 (5): 2038–46. PMID 11280764.
Andersen PL, Zhou H, Pastushok L, Moraes T, McKenna S, Ziola B, Ellison MJ, Dixit VM, Xiao W (2005). „Výrazná regulace funkcí Ubc13 dvěma variantami enzymů konjugujících s ubikvitinem Mms2 a Uev1A“. J. Cell Biol. 170 (5): 745–55. doi:10.1083 / jcb.200502113. PMC 2171356. PMID 16129784.
Hau DD, Lewis MJ, Saltibus LF, Pastushok L, Xiao W, Spyracopoulos L (2006). "Struktura a interakce ubikvitin-konjugujícího enzymového variantního lidského Uev1a: důsledky pro enzymatickou syntézu polyubikvitinových řetězců". Biochemie. 45 (32): 9866–77. doi:10.1021 / bi060631r. PMID 16893187.
Syed NA, Andersen PL, Warrington RC, Xiao W (2007). „Uev1A, varianta enzymu konjugujícího s ubikvitinem, inhibuje apoptózu vyvolanou stresem prostřednictvím aktivace NF-kappaB“. Apoptóza. 11 (12): 2147–57. doi:10.1007 / s10495-006-0197-3. PMID 17041755. S2CID 6078250.
Petroski MD, Zhou X, Dong G, Daniel-Issakani S, Payan DG, Huang J (2007). „Modifikace substrátu s lysinovými 63-vázanými ubikvitinovými řetězci prostřednictvím UBC13-UEV1A ubikvitin-konjugujícího enzymu“. J. Biol. Chem. 282 (41): 29936–45. doi:10,1074 / jbc.M703911200. PMID 17709375.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000244687 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000078923 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9418904-5] Sancho E, Vilá MR, Sánchez-Pulido L, Lozano JJ, Paciucci R, Nadal M, Fox M, Harvey C, Bercovich B, Loukili N, Ciechanover A, Lin SL, Sanz F, Estivill X, Valencia A, Thomson TM ( Ledna 1998). „Role UEV-1, neaktivní varianty enzymů konjugujících s E2 ubikvitinem, in vitro diferenciace a chování buněčného cyklu střevních mukosekrečních buněk HT-29-M6“. Mol Cell Biol. 18 (1): 576–89. doi:10,1128 / mcb.18.1.576. PMC 121525. PMID 9418904.

[pmid9305758-6] Rothofsky ML, Lin SL (říjen 1997). „CROC-1 kóduje protein, který zprostředkovává transkripční aktivaci lidského promotoru FOS“. Gen. 195 (2): 141–9. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00097-8. PMID 9305758.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: UBE2V1 ubikvitin konjugující enzym E2 varianta 1“.

[pmid11057907-8] Deng L, Wang C, Spencer E, Yang L, Braun A, You J, Slaughter C, Pickart C, Chen ZJ (říjen 2000). „Aktivace komplexu IkappaB kinázy pomocí TRAF6 vyžaduje dimerní komplex enzymu konjugujícího s ubikvitinem a jedinečný polyubikvitinový řetězec“. Buňka. 103 (2): 351–61. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00126-4. PMID 11057907. S2CID 18154645.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]