UBE1DC1 - UBE1DC1

UBA5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3GUC, 3H8V, 5 HKH
Identifikátory
Aliasy	UBA5, THIFP1, UBE1DC1, enzym aktivující modifikátor podobný ubikvitinu 5, SCAR24, EIEE44
Externí ID	OMIM: 610552 MGI: 1913913 HomoloGene: 11738 Genové karty: UBA5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	132,678,097 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	104,063,134 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ubikvitinový modifikátor aktivující aktivitu enzymu; • ATP vazba; • vazba kovových iontů; • Aktivita enzymu aktivující UFM1;
Buněčná složka	• cytoplazma; • intracelulární membránou vázaná organela; • buněčné jádro; • cytosol; • Golgiho aparát;
Biologický proces	• regulace signální dráhy intracelulárního estrogenového receptoru; • ufmylace spojená s proteinem K69; • reakce na stres endoplazmatického retikula; • proteinová ufmylace; • neuromuskulární proces; • modifikace proteinu malou proteinovou konjugací;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79876
	66663
	ENSG00000081307
	ENSMUSG00000032557
	Q9GZZ9
	Q8VE47
	NM_024818; NM_198329; NM_001320210; NM_001321238; NM_001321239
	NM_025692
	NP_001307139; NP_001308167; NP_001308168; NP_079094; NP_938143
	NP_079968
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Enzym aktivující modifikátor podobný ubikvitinu 5 je protein že u lidí je kódován UBA5 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje člena rodiny aktivujících enzymů podobných El. Pro tento gen byly nalezeny dvě alternativně sestříhané varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000081307 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032557 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
^ Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, Iemura S, Tanida I, Okazaki N, Ueno T, Kominami E, Natsume T, Tanaka K (květen 2004). „Nový systém konjugující protein pro Ufm1, modifikátor skládání ubikvitinu“. EMBO J.. 23 (9): 1977–86. doi:10.1038 / sj.emboj.7600205. PMC 404325. PMID 15071506.
^ ^A ^b "Entrez Gene: UBE1DC1 ubikvitin aktivující enzym E1 doména obsahující 1".

Další čtení

Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě interakční sítě lidský protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Dou T, Gu S, Liu J a kol. (2006). "Izolace a charakterizace ubiquitin aktivujícího enzymu E1 doména obsahující 1, UBE1DC1". Mol. Biol. Rep. 32 (4): 265–71. doi:10.1007 / s11033-005-4822-r. PMID 16328888. S2CID 24569517.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9GZZ9 (Enzym aktivující modifikátor 5 podobný lidskému ubikvitinu (UBE1DC1)) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000081307 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032557 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11230166-5] Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.

[pmid15071506-6] Komatsu M, Chiba T, Tatsumi K, Iemura S, Tanida I, Okazaki N, Ueno T, Kominami E, Natsume T, Tanaka K (květen 2004). „Nový systém konjugující protein pro Ufm1, modifikátor skládání ubikvitinu“. EMBO J.. 23 (9): 1977–86. doi:10.1038 / sj.emboj.7600205. PMC 404325. PMID 15071506.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: UBE1DC1 ubikvitin aktivující enzym E1 doména obsahující 1".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]